Применение циклоспорина А у пациентов с COVID-19 при неэффективности первичной иммуносупрессии: ретроспективное когортное псевдорандомизированное исследование

АКТУАЛЬНОСТЬ: Терапия пациентов с новой коронавирусной инфекцией (COronaVIrus Disease 2019 — COVID-19) при прогрессирующем поражении легких на фоне применения глюкокортикостероидов (ГКС) и ингибиторов интерлейкина-6 (ИИЛ-6) до сих пор не разработана. ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ: оценка эффективности циклоспорина А у пациентов с COVID-19 при прогрессировании поражения легких и гипоксемической острой дыхательной недостаточностью, получивших патогенетическую терапию ГКС и ИИЛ-6. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ: Ретроспективное когортное псевдорандомизированное моноцентровое исследование (n = 98). Циклоспорин А назначали в первые 72–96 ч после введения ИИЛ-6 при ухудшении состояния пациентов. Пациенты группы сравнения соответствовали основной группе, но не получали терапию циклоспорином А. Первичная конечная точка — госпитальная летальность. Вторичные конечные точки — длительность госпитализации, количество пациентов, поступивших в отделение реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ), потребность в респираторной поддержке. РЕЗУЛЬТАТЫ: Летальность составила 12 (22) % в группе циклоспорина и 27 (61) % в группе сравнения, р = 0,001 (относительный риск (ОР) 2,00 [1,12–3,48], р = 0,018), частота поступления в ОРИТ 14 (26 %) против 29 (66 %), р = 0,001 соответственно. В группе циклоспорина на 7-й день более 75 % поражения легочной ткани, по данным компьютерной томографии, было у 26 % пациентов против 52 % в группе сравнения, р = 0,014, потребность в респираторной поддержке (37 % против 63,6 %, р = 0,011); сатурация 88 (82–93 %) против 80 (70–86 %), р = 0,001 соответственно. Необходимость в респираторной поддержке на 11-й день после применения ИИЛ-6 повышала вероятность летального исхода (ОР 7,12 [2,51–20,10], р = 0,001). Факторы риска летального исхода: возраст старше 57,5 года, индекс массы тела более 30 кг/м2, сатурация ниже 85,5 % в день применения ИИЛ-6. Длительность госпитализации составила 18,5 (14–24) дня против 18 (12–24) дней, р = 0,778. ВЫВОДЫ: Циклоспорин А в дополнение к ГКС и ИИЛ-6 для терапии COVID-19 может способствовать снижению летальности, частоты поступления в ОРИТ и потребности в респираторной поддержке

The next-generation ARC middleware

The Advanced Resource Connector (ARC) is a light-weight, non-intrusive, simple yet powerful Grid middleware capable of connecting highly heterogeneous computing and storage resources. ARC aims at providing general purpose, flexible, collaborative computing environments suitable for a range of uses, both in science and business. The server side offers the fundamental job execution management, information and data capabilities required for a Grid. Users are provided with an easy to install and use client which provides a basic toolbox for job- and data management. The KnowARC project developed the next-generation ARC middleware, implemented as Web Services with the aim of standard-compliant interoperability

Влияние раннего назначения тоцилизумаба на прогрессирование дыхательной недостаточности у пациентов с COVID-19

The optimal interval for initiating tocilizumab therapy in patients with COVID-19 (COronaVIrus Disease 2019) has not been determined. The aim of the study was to evaluate the effectiveness of prescribing tocilizumab depending on the duration of persistent hyperthermia > 38 °С in patients with SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome-related CoronaVirus 2) associated pneumonia who received tocilizumab according to the Interim Guidelines of the Ministry of Health of the Russian Federation (version at the time of inclusion in the study). Methods. A retrospective cohort study was conducted in hospitalized patients (n = 163) with SARS-CoV-2-associated pneumonia from May 2020 to May 2021. Patients were retrospectively divided into 2 groups depending on the time of tocilizumab administration: ≤ 7 days (n = 61) or ≥ 8 days (n = 102) from the disease onset. Results. Patients who received tocilizumab in the first 7 days had the lower need for CPAP (Continuous Positive Airway Pressure) therapy on day 3 after tocilizumab therapy (HR (Hazard Ratio) – 0.129 (0.039 – 0.430); p = 0.001), a higher probability of a decrease in the volume of lung lesions on computed tomography > 25% a week after the use of tocilizumab (HR – 1.065 (1.036 – 1.093); p = 0.001), the lower probability of hemoglobin oxygen saturation below 92% on day 3 (HR – 0.807 (0.750 – 0.869); p = 0.001), and day 7 (HR – 0.825 (0.772 – 0.883); p = 0.001) after tocilizumab therapy. If CPAP therapy was required on day 3 after administration of tocilizumab, each day of delay in prescribing the drug increased the risk of an adverse outcome 18-fold (HR – 18.24 (5.328 – 62.438); p = 0.001). The duration of hospitalization was significantly lower in the early group than in the late group (10 (8.5 – 15) vs 13.5 (10 – 18) days, respectively; p = 0.02). The mortality was similar (5 (8.2%) vs 6 (5.9%) patients, respectively; p = 0.748). Conclusion. The administration of tocilizumab in the first seven days from the onset of the disease in patients with COVID-19 who developed systemic inflammation and lung damage may prevent the need for escalation of respiratory support and accelerate recovery compared with the later tocilizumab administration.Оптимальный интервал для начала терапии тоцилизумабом у пациентов с COVID-19 (COronaVIrus Disease 2019) не определен. Целью исследования явилась оценка эффективности назначения тоцилизумаба в зависимости от продолжительности стойкой гипертермии > 38 °С у пациентов с пневмонией, ассоциированной с SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome-related CoronaVirus 2), получающих терапию тоцилизумабом согласно Временным методическим рекомендациям Министерства здравоохранения Российской Федерации (версия на момент включения в исследование). Материалы и методы. В период с мая 2020 по май 2021 г. проведено ретроспективное когортное исследование с участием госпитализированных пациентов (n = 163) с SARS-CoV-2-ассоциированной пневмонией. Пациенты были ретроспективно распределены на 2 группы в зависимости от времени назначения тоцилизумаба (≤ 7 (n = 61) или ≥ 8 (n = 102) дней от начала заболевания). Результаты. У пациентов, получивших тоцилизумаб в первые 7 дней, ниже необходимость в СРАР-терапии (поддержание постоянного положительного давления в дыхательных путях (Continuous Positive Airway Pressure – СРАР)) (отношение рисков (ОР) – 0,129 (0,039–0,430); р = 0,001) на 3-и сутки после терапии тоцилизумабом; выше вероятность снижения объема поражения легких по данным компьютерной томографии > 25 % через 1 нед. после применения тоцилизумаба (OP – 1,065 (1,036–1,093); р = 0,001); ниже вероятность насыщения гемоглобина кислородом < 92 % на 3-й (OP – 0,807 (0,750–0,869); р = 0,001) и 7-й (OP – 0,825 (0,772–0,883); р = 0,001) дни после терапии тоцилизумабом. При необходимости в СРАР-терапии на 3-й день после введения тоцилизумаба каждый день задержки назначения препарата увеличивал риск неблагоприятного исхода в 18 раз (OP – 18,24 (5,328–62,438); р = 0,001). Продолжительность госпитализации была значимо ниже в группе раннего назначения препарата, чем в группе позднего назначения (10 (8,5–15) дней vs 13,5 (10–18) дня соответственно; р = 0,02). Летальность в группах была одинаковой (5 (8,2 %) vs 6 (5,9 %) пациентов соответственно; р = 0,748). Заключение. У пациентов с COVID-19 при развитии системного воспаления и поражения легких назначение тоцилизумаба в первые 7 дней от начала заболевания по сравнению с более поздним назначением может предотвратить необходимость эскалации респираторной поддержки и ускорить выздоровление

A comparison of segmentation algorithms using laser scanner for robotic arc welding

Произведен сравнительный анализ алгоритмов сегментации данных лазерных сканеров, применяемых в адаптивных роботизированных комплексах сварки по критериям быстродействия, точности и чувствительности. Предложены новые алгоритмы, которые превосходят аналоги по быстродействию не менее чем в пять раз, при этом незначительно уступают по критериям точности и чувствительности.A comparative analysis of data segmentation approaches for laser scanner has been performed with criteria of processing speed, accuracy and sensitiveness. The new approach about five times faster and slightly less accurate and sensitive then analogues is proposed

Crystallization and initial X-ray diffraction analysis of the multi-domain Brucella blue light-activated histidine kinase LOV-HK in its illuminated state

The pathogenic bacterium Brucella abortus codes for a multi-domain dimeric cytoplasmic histidine kinase called LOV-HK, which is a key blue light-activated virulence factor in this microorganism. The structural basis of the light activation mechanism of this protein remains unclear. In this work, full-length LOV-HK was cloned, expressed and purified. The protein was activated by light and crystallized under a controlled illumination environment. The merge of 14 individual native data sets collected on a single crystal resulted in a complete X-ray diffraction data set to a resolution of 3.70 Å with over 2 million reflections. Crystals belong to space group P212121, with unit-cell parameters a = 95.96, b = 105.30, c = 164.49 Å with a dimer in the asymmetric unit. Molecular replacement with Phaser using the individual domains as search models allowed for the reconstruction of almost the whole protein. Very recently, improved LOV-HK crystals led to a 3.25-Å resolution dataset. Refinement and model building is underway. This crystal model will represent one of the very few examples of a multi-domain histidine kinase with known structure. Keywords: Multi-domain protein, Light activation, Signal transduction, Two-component system, Histidine kinas