Diagnosis of de novo 17p11.2 microduplication - potocki-lupski syndrome identified by chromosomal microarray analysis: a case report / Diagnóstico de novo 17p11.2 microduplicação - potocki-lupski síndrome identificada por análise de microarray chromosomal: um relatório de caso

Potocki-Lupski Syndrome is a continuous gene syndrome caused by the microduplication of 3.7 Mb segment at 17p11.2 characterized by developmental delay, intellectual disability, the developmental deficit for psychomotor and expressive speech, autistic features, obsessive-compulsive behaviors, and attention deficit. Using CMA, we detected the first de novo 3.7 Mb microduplication at 17p11.2 in a boy with an intellectual disability from Central Brazil

Diagnostic of Chormosome 7Q11,23 Duplication Syndrome - a case report

Resumo: a Síndrome da Duplicação do Cromossomo 7q11.23, também conhecida como Síndrome da duplicação de WBS, é uma desordem rara causada pela duplicação de um segmento de 1.5 Mb e caracterizada por deficiência intelectual, dificuldade na fala e anomalias craniofaciais moderadas. Ao realizar a técnica de CMA em amostras de uma família que tem uma criança com deficiência intelectual, foi observado uma microduplicação de novo de 1.428,9 Kbp no cromossomo 7q11.3. Palavras-chave: CNV. Deficiência Intelectual. Microarranjo. Síndrome da Duplicação de Williams-Beuren

Efeito do polimorfismo rs1143634 (+3954 C > T) e de fatores ambientais na suscetibilidade à doença periodontal crônica / Effect of rs1143634 (+3954 CT) polymorphism and environmental factors on susceptibility to chronic periodontal disease

As doenças periodontais compreendem a um grupo de patologias orais infecciosas, inflamatórias e comuns: incluindo gengivite e periodontite, sendo altamente prevalentes na população humana. No caso da periodontite, caracteriza-se pela a perda progressiva de inserção conjuntiva, ocasionando-se o detrimento do elemento dentário. Dentre os diversos fatores envolvidos, destaca-se a atividade de agentes patológicos primários gram-negativos que desencadeiam os processos inflamatórios mediante a resposta imunológica do hospedeiro por meio da liberação de citocinas como a IL-1?, a qual participa da imunidade inata. Contudo, tem se discutido a interferência de fatores genéticos, uma vez que muitas citocinas possuem genes polimórficos, o que levanta a hipótese de que a variabilidade genética estaria relacionada com a suscetibilidade para o desenvolvimento da periodontite, atuando em conjunto com os fatores ambientais. O objetivo deste estudo foi investigar a relação do polimorfismo genético rs1143634 (IL1B), além de diferentes fatores ambientais na suscetibilidade à doença periodontal crônica. No presente estudo, foram avaliados 94 indivíduos, destes, 35 apresentavam a condição e 59 eram saudáveis. O DNA extraído foi submetido à técnica de PCR-RFLP para amplificação da região de interesse e tratamento posterior com a enzima de restrição específica, permitindo a obtenção dos fragmentos de restrição (genotipagem). Os genótipos se demonstraram em concordância com a hipótese de equilíbrio de Hardy-Weinberg. Foram detectadas diferenças significativas (p ? 0,05) entre os grupos considerando os genótipos e a frequência de consultas odontológicas, constatando-se o aumento do risco e predição para ambas as variáveis. Os resultados reforçam a participação de fatores genéticos e ambientais na suscetibilidade à doença periodontal crônica

Leucemia linfóide aguda na infância: A Importância do diagnóstico citogenético convencional como fator prognóstico

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:39:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LYSA BERNARDES MINASI.pdf: 541313 bytes, checksum: 5a4220856b565e6951c969b984acd390 (MD5) Previous issue date: 2009-03-16The acute lymphoblastic leukemia (ALL) is considered the result of abnormalities occurring in a progenitor cell of the lympho hematopoietic system. The abnormalities modify the program of cell differentiation, determining a proliferative advantage of leukemic clone on the other cells of hematopoietic tissue. The leukemia-free survival for more than five years, which is considered as criterion of cure for the disease in recent years has been approximately 80%. In the infant population the ALL is five times more incidents than the LMA, and is the cause of approximately 3/4 of all children diagnosed with leukemia. In ALL, 60% to 75% of patients present numerical abnormalities on the chromosomal batch, such as hiperdiploidia or hipodiploidia, or structural, such as translocations and deletions. Karyotypic changes are associated with recurrent clinical characteristics and prognostic measures. In this study, the cytogenetic evaluation was performed for all 22 patients included in the study. These patients were diagnosed at Hospital Araújo Jorge / ACCG and the Santa Casa de Misericórdia de Goiânia, in the period of March to December of 2008. Samples of bone marrow or peripheral blood were sent to the Laboratory of Human Cytogenetics and Molecular Genetics (Lagen) of SuLeide / SES / GO for cytogenetic analysis. Cytogenetic evaluation in 58% of karyotypes that was carried out had changed. We observed the presence of numerical changes, as hyperdiploid, near-haploid and trisomy of chromosome 21 and structural which are represented as follows: 46,XX,4q+/46,XX,t(q1;q4), 46,XX,t(10;14)(q22;q32), 46,XY,del(16q22)/46,XY,del(6q26)/Hyperdiploid, 46,XX/46,XX,del(8)(q21.2-22)/ Hyperdiploid, 46,XY,t(7;12)(q34;q22);del(10qter)/46,XY,t(7;12)(q34;q22)/46,XY,t(4;8)(q31.2;q23)/4 6,XY,t(12;16)(q24.1;q23)/Near-haploid, 46,XX,del(17q25), 46,XY,t(7;12)(q35;p11),+21. The morphologic remission of patients studied in twenty eighth day of induction treatment (D+28) was obtained in all cases. A Minimal Residual Disease (MRD) was positive in 14% of the cases. The patients were stratified into two groups at risk of relapse according to the protocol GBTL1 ALL-99: low risk of relapse (55%) and high risk of relapse (45%). Most of the chromosomal changes have not been described so far, therefore there is a certain limitation on the definition of the prognosis. The correlation between the cytogenetic findings and clinical and laboratory characteristics was established, demonstrating the importance of doing it to infer about the prognosis.A leucemia linfóide aguda é considerada o resultado de anormalidades ocorrendo em uma célula progenitora do sistema linfo-hematopoético. As anormalidades modificam o programa de diferenciação celular, determinando uma vantagem proliferativa do clone leucêmico sobre as demais células do tecido hematopoético. A sobrevida livre de leucemia por mais de cinco anos, que é considerada como critério de cura para a doença, nos últimos anos, tem sido de aproximadamente 80%. Na população infantil a LLA é cinco vezes mais incidente do que a LMA, sendo a causa de aproximadamente 3/4 de todo o diagnóstico de leucemia infantil. Na LLA, entre 60% a 75% dos pacientes apresentam anormalidades numéricas do lote cromossômico, como a hiperdiploidia ou hipodiploidia, ou estruturais, como translocações e deleções. As alterações cariotípicas recorrentes estão associadas a características clínicas e prognósticas específicas. Neste estudo, a avaliação citogenética foi realizada para todos os 22 pacientes incluídos no estudo. Tais pacientes foram diagnosticados no Hospital Araújo Jorge/ACCG e na Santa Casa de Misericórdia de Goiânia, no período de março a dezembro de 2008. As amostras de medula óssea ou sangue periférico foram enviadas ao Laboratório de Citogenética Humana e Genética Molecular (LaGene) da SuLeide/SES/GO para análise citogenética. Na avaliação citogenética 58% dos cariótipos realizados apresentavam-se alterados. Foram observadas a presença de alterações numéricas, como hiperdiploidias, near-haploidia e trissomia do cromossomo 21 e estruturais representadas a seguir: 46,XX,4q+/46,XX,t(q1;q4), 46,XX,t(10;14)(q22;q32), 46,XY,del(16q22)/46,XY,del(6q26)/Hiperdiploidia, 46,XX/46,XX,del(8)(q21.2-22)/ Hiperdiploidia 46,XY,t(7;12)(q34;q22);del(10qter)/46,XY,t(7;12)(q34;q22)/46,XY,t(4;8)(q31.2;q23)/4 6,XY,t(12;16)(q24.1;q23)/Near-haploidia, 46,XX,del(17q25), 46,XY,t(7;12)(q35;p11),+21. A remissão morfológica dos pacientes estudados no vigésimo oitavo dia da indução do tratamento (D+28) foi obtida em todos os casos. A Doença Residual Mínima (DRM) foi positiva em 14% dos casos. Os pacientes foram estratificados em dois grupos de risco de recaída de acordo com o protocolo GBTL1 LLA-99: baixo risco de recaída (55%) e alto risco de recaída (45%). A maioria das alterações cromossômicas ainda não foram descritas até o momento, havendo portanto uma certa limitação quanto a definição do prognóstico. A correlação entre os achados citogenéticos e características clínico-laboratórias foi estabelecida, demonstrando a importância de fazê-la para inferir a respeito do prognóstico

Alteration on gene expression profile of childhood acute lymphoblastic leukemia: at diagnosis and at the end of the induction phase of chemotherapy

Submitted by Luciana Ferreira ([email protected]) on 2014-11-27T14:15:31Z No. of bitstreams: 2 Tese - Lysa Bernardes Minasi - 2013.pdf: 3405021 bytes, checksum: 8697a199b1d732fc69f73a28ed8848a2 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)Approved for entry into archive by Luciana Ferreira ([email protected]) on 2014-11-27T14:17:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Lysa Bernardes Minasi - 2013.pdf: 3405021 bytes, checksum: 8697a199b1d732fc69f73a28ed8848a2 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)Made available in DSpace on 2014-11-27T14:17:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Lysa Bernardes Minasi - 2013.pdf: 3405021 bytes, checksum: 8697a199b1d732fc69f73a28ed8848a2 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-01-13The ALL is a malignant disorder that originates from a precursor cell lympho-hematopoietic system compromised for the development of B or T lymphocyte lineage.The precursor cell acquisition by a series of genetic abnormalities alters the normal process of maturation leading to cellular differentiation arrest and leukemic clone proliferative advantage on cells of hematopoietic tissue. More than 50 recurrent genetic alterations have been identified in the ALL. These often involve genes known or putative role in the development of lymphocytes and in the case of leukemogenesis.In this study, the variation in the expression of molecular markers was analyzed using PCR methodology array on 16 children with ALL before treatment and at the end of induction chemotherapy (D +28). These patients were diagnosed in HAJ and SCMG, from May 2012 to January 2013. Samples of bone marrow or peripheral blood were sent to NPReplicon-PUC-GO. In the present study we observed a negative correlation between gender and immunophenotype (p = 0.016), females have a greater association with immunophenotype B and less associated with immunophenotype T. We also observed a positive correlation between immunophenotype and age (p = 0.04), immunophenotype and marker CD10 + (p = 0.03), immunophenotype and risk group (p = 0.015) and marker CD10 + and risk group (p = 0.043). Before treatment the gene RUNX1 met with increased expression by 5.0 times compared to the control group and after induction chemotherapy was observed a reduction in its expression. The expression pattern of the gene TAL1 showed significant decrease, with the exception of post-treatment analysis showed that an increase in its expression. A positive correlation was observed between the expression of BAX and BCL2 (r = 0.94 and p <0.0001. We demonstrated a significant difference in gene expression pattern of ALL at diagnosis and after induction therapy. We conclude our observation regarding the gene expression profile in patients with ALL enrolled in this study, but to define a panel of molecular markers is necessary to evaluate several other genes involved in the process of leukemogenesis in ALL with the help of other methodologies.A LLA é uma desordem maligna que origina de uma célula precursora do sistema linfo-hematopoético comprometida para o desenvolvimento da linhagem de linfócitos B ou T. A aquisição pela célula precursora de uma série de anormalidades genéticas, altera seu processo normal de maturação, conduzindo a parada na diferenciação celular e vantagem proliferativa do clone leucêmico sobre as células do tecido hematopoético. Mais de 50 alterações genéticas recorrentes tem sido identificadas na LLA. Estas frequentemente envolvem genes com papel conhecido ou putativo no desenvolvimento dos linfócitos e no processo da leucemogênese.Neste estudo, a variação da expressão dos marcadores moleculares, foi analisada utilizando a metodologia de PCR array, em 16 crianças com LLA ao diagnóstico e no final da quimioterapia de indução. Tais pacientes foram diagnosticados no HAJ e na SCMG, no período de maio de 2012 a janeiro de 2013. As amostras de medula óssea ou sangue periférico foram enviadas ao NPReplicon-PUC-GO. No presente estudo foi possível observar uma correlação negativa entre as variáveis sexo e o imunofenótipo (p = 0.016), ou seja, pacientes do sexo feminino tem uma maior associação com o imunofenótipo B e menor associação com o imunofenótipo T. Foi observado também uma correlação positiva entre imunofenótipo e idade (p = 0.04), imunofenótipo e marcador CD10+ (p = 0.03), imunofenótipo e grupo de risco (p = 0.015) e marcador CD10+ e grupo de risco (p = 0.043). Antes do tratamento o geneRUNX1 encontrou-se com um aumento da expressão em 5,0 vezes em relação ao grupo controle e após a quimioterapia de indução foi observado uma redução na sua expressão. O padrão de expressão do gene TAL1apresentou significativa diminuição, com exceção da análise pós tratamento que demonstrou um aumento da sua expressão. Uma correlação positiva foi observada entre a expressão de BAX e BCL2 (r = 0,94 e p < 0,0001). A partir do perfil de expressão de cada gene analisado, demonstramos no presente estudo uma diferença significativa no padrão de expressão gênico da LLA ao diagnóstico e após a terapia de indução. Concluímos nossa observação com relação ao perfil de expressão gênica nos pacientes com LLA incluídos neste estudo, mas para definirmos um painel de marcadores moleculares é necessário a avaliação de diversos outros genes que participam do processo da leucemogênese na LLA com auxílio de outras metodologias

AVALIAÇÃO DOS BENEFÍCIOS DO PILATES NO SOLO EM MULHERES COM LOMBALGIAS NA FAIXA ETÁRIA DE 40 A 60 ANOS

O objetivo do estudo foi verificar os efeitos e poss&iacute;veis benef&iacute;cios do M&eacute;todo Pilates em solo em mulheres que apresentavam lombalgias. Foram inclu&iacute;dos no estudo 20 mulheres com idade entre 40 e 60 anos e diagn&oacute;stico cl&iacute;nico de lombalgia cr&ocirc;nica. Foram aplicados o question&aacute;rio de identifica&ccedil;&atilde;o OswestryLow BackPainDisability(QO) e de intensidade da dor avaliado pela escala visual anal&oacute;gica da dor. Foi observada uma significativa redu&ccedil;&atilde;o da intensidade de dor lombar de 3,7 para 2,1, o que demonstrou redu&ccedil;&atilde;o da sintomatologia dolorosa das participantes e tamb&eacute;m observamos melhora nas atividades di&aacute;rias e diminui&ccedil;&atilde;o das queixas de lombalgias demonstrando que o M&eacute;todo Pilates tem um importante papel na melhora da dor lombar e da qualidade de vida

Mosaic Tetrasomy of 9p24.3q21.11 postnatally identified in an infant born with multiple congenital malformations: a case report

Abstract Background Supernumerary Marker Chromosomes consist in structurally abnormal chromosomes, considered as an extra chromosome in which around 70% occur as a de novo event and about 30% of the cases are mosaic. Tetrasomy 9p is a rare chromosomal abnormality described as the presence of a supernumerary isochromosome 9p. Clinical features of tetrasomy 9p include a variety of physical and developmental abnormalities. Case presentation Herein, we reported a postnatal case of a newborn who died in early infancy with multiple congenital malformations due to a mosaic de novo tetrasomy 9p detected by Chromosomal Microarray Analysis. Conventional cytogenetics analysis of the proband was 47,XY,+mar[45]/46,XY[5]. The parental karyotypes presented no visible numerical or structural alterations. Microarray Analysis of the proband revealed that the marker chromosome corresponded to a mosaic de novo gain at 9p24.3q21.11. Conclusions Chromosomal Microarray Analysis was helpful to identify the origin of the supernumerary marker chromosome and it was a powerful tool to carry out genetic diagnostic, guiding the medical diagnosis. Furthermore, the CMA allowed observing at the first time in Central Brazil the tetrasomy 9p and partial tetrasomy 9q in mosaic, encompassing a large duplicated region with several morbid genes, in an infant with multiple congenital malformations

Diagnostic yield of patients with undiagnosed intellectual disability, global developmental delay and multiples congenital anomalies using karyotype, microarray analysis, whole exome sequencing from Central Brazil

Intellectual Disability (ID) is a neurodevelopmental disorder that affects approximately 3% of children and adolescents worldwide. It is a heterogeneous and multifactorial clinical condition. Several methodologies have been used to identify the genetic causes of ID and in recent years new generation sequencing techniques, such as exome sequencing, have enabled an increase in the detection of new pathogenic variants and new genes associated with ID. The aim of this study was to evaluate exome sequencing with analysis of the ID gene panel as a tool to increase the diagnostic yield of patients with ID/GDD/MCA in Central Brazil, together with karyotype and CMA tests. A retrospective cohort study was carried out with 369 patients encompassing both sexes. Karyotype analysis was performed for all patients. CMA was performed for patients who did not present structural and or numerical alterations in the karyotype. Cases that were not diagnosed after performing karyotyping and CMA were referred for exome sequencing using a gene panel for ID that included 1,252 genes. The karyotype identified chromosomal alterations in 34.7% (128/369). CMA was performed in 83 patients who had normal karyotype results resulting in a diagnostic yield of 21.7% (18/83). Exome sequencing with analysis of the ID gene panel was performed in 19 trios of families that had negative results with previous methodologies. With the ID gene panel analysis, we identified mutations in 63.1% (12/19) of the cases of which 75% (9/12) were pathogenic variants,8.3% (1/12) likely pathogenic and in 16.7% (2/12) it concerned a Variant of Uncertain Significance. With the three methodologies applied, it was possible to identify the genetic cause of ID in 42.3% (156/369) of the patients. In conclusion, our studies show the different methodologies that can be useful in diagnosing ID/GDD/MCA and that whole exome sequencing followed by gene panel analysis, when combined with clinical and laboratory screening, is an efficient diagnostic strategy

The Identification of Microdeletion and Reciprocal Microduplication in 22q11.2 Using High-Resolution CMA Technology

The chromosome 22q11.2 region has long been implicated in genomic diseases. Some genomic regions exhibit numerous low copy repeats with high identity in which they provide increased genomic instability and mediate deletions and duplications in many disorders. DiGeorge Syndrome is the most common deletion syndrome and reciprocal duplications could be occurring in half of the frequency of microdeletions. We described five patients with phenotypic variability that carries deletions or reciprocal duplications at 22q11.2 detected by Chromosomal Microarray Analysis. The CytoScan HD technology was used to detect changes in the genome copy number variation of patients who had clinical indication to global developmental delay and a normal karyotype. We observed in our study three microdeletions and two microduplications in 22q11.2 region with variable intervals containing known genes and unstudied transcripts as well as the LCRs that are often flanking and within this genomic rearrangement. The identification of these variants is of particular interest because it may provide insight into genes or genomic regions that are crucial for specific phenotypic manifestations and are useful to assist in the quest for understanding the mechanisms subjacent to genomic deletions and duplications

Sensibilidade da PCR de Amplificação de DNA Bovino Diluído

Resumo: A PCR consiste na imitação in vitro do processo de duplicação do DNA, cujo objetivo deste foi de definir o limite da sensibilidade da PCR de amplificar moléculas de DNA bovino diluído seriadamente. Foi extraído e diluído DNA bovino e submetido a PCR e eletroforese. A sensibilidade de amplificação em macho foi em 4x10-12 e nas fêmeas em 8x10-13. Palavras-chave: Diluição seriada. Extração. Quantificação