The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus

We report the sequence and analysis of the 814-megabase genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus, a model for developmental and systems biology. The sequencing strategy combined whole-genome shotgun and bacterial artificial chromosome (BAC) sequences. This use of BAC clones, aided by a pooling strategy, overcame difficulties associated with high heterozygosity of the genome. The genome encodes about 23,300 genes, including many previously thought to be vertebrate innovations or known only outside the deuterostomes. This echinoderm genome provides an evolutionary outgroup for the chordates and yields insights into the evolution of deuterostomes

Case Report: Relapsing pleural effusions and coated aorta revealing Erdheim–Chester disease

Erdheim–Chester disease (ECD) is a rare histiocytic disorder with localized presentations or multisystem disease. Clinical presentations of ECD are usually non-specific and depends on the site of involvement. ECD can involve one or several organs. Clinical manifestations range from asymptomatic lesions to severe and life-threatening organ dysfunction. Hence, accurate and timely diagnosis is challenging given the rarity and varied presentation of ECD. The most common clinical manifestations are bone pain related to osteosclerosis, usually in the lower limbs. We report here a case with no obvious clinical manifestation of ECD preceding initial recurrent pleural effusions. The diagnosis of ECD was suggested based on pleural thickening revealed by relapsing pleural effusions combined with radiological finding of a coated aorta and slight perirenal infiltrate. Pleural biopsy revealed collagen fibrosis, and immunohistochemistry with the anti-CD163 antibody showed an important infiltration by histiocytes, strong cytoplasmic phosphorylated ERK in the lesional cells, and positive factor XIIIa staining. A cell-free DNA from peripheral blood revealed negative BRAF mutation and the presence of MAP2K1 mutation, a key driver mutation in ECD. The diagnosis is often suggested based on clinic-radiological presentation but requiring histopathology to establish a final diagnosis of ECD. Plasma cell-free DNA is a promising and non-invasive tool to detect key driver mutations

How I manage pulmonary Langerhans cell histiocytosis

Pulmonary Langerhans cell histiocytosis (PLCH) is a rare sporadic cystic lung disease of unknown aetiology that is characterised by the infiltration and destruction of the wall of distal bronchioles by CD1a+ Langerhans-like cells. In adults, PLCH is frequently isolated and affects young smokers of both sexes. Recent multicentre studies have led to the more standardised management of patients in clinical practice. Smoking cessation is essential and is occasionally the only suitable intervention. Serial lung function testing is important because a significant proportion of patients may experience an early decline in forced expiratory volume in 1 s and develop airflow obstruction. Cladribine was reported to dramatically improve progressive PLCH in some patients. Its efficacy and tolerance are currently being evaluated. Patients who complain of unexplained dyspnoea with decreased diffusing capacity of the lung for carbon monoxide should be screened for pulmonary hypertension by Doppler echocardiography, which must be confirmed by right heart catheterisation. Lung transplantation is a therapeutic option for patients with advanced PLCH. The identification of the BRAFV600E mutation in approximately half of Langerhans cell histiocytosis lesions, including PLCH, and other mutations of the mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway in a subset of lesions has led to targeted treatments (BRAF and MEK (MAPK kinase) inhibitors). These treatments need to be rigorously evaluated because of their potentially severe side-effects

Aspergillose pulmonaire invasive chez les adultes atteints d'hémopathie maligne

Analyse de la prise en charge de l'aspergillose pulmonaire invasive chez des adultes atteints d'hémopathie maligne. Etude rétrospective unicentrique de l'ensemble de 23 cas diagnostiquées entre janvier 2000 et août 2007. Dix cas surviennent après allogreffe de cellules souches hématopoïétiques et 13 après diverses chimiothérapies. Vingt-deux patients recoivent un traitement médical antifongique dont 14 nécessitent un traitement de rattrapage. En première intention, le voriconazole est utilisé dans 64% des cas et l'amphotéricine B dans 36 %. Trois patients ont bénéficié d'une résection pulmonaire chirurgicale. A 6 mois d'évolution, 2 patients sur 23 sont décédés. Dans cette série, la mortalité est faible : 8,5%. Le diagnostic plus précoce, les nouveaux traitements antifongiques et le traitement chirurgical préventif des lésions à risque d'hémoptysie ont permis cette amélioration du pronostic comparativement aux résultats publiés auparavant.ST QUENTIN EN YVELINES-BU (782972101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Effets toxiques d'herbicides à base de glyphosate sur la régulation du cycle cellulaire et le développement précoce en utilisant l'embryon d'oursin

L'utilisation du développement précoce de l'oursin nous a permis de mettre en évidence des dysfonctionnements spécifiques du cycle cellulaire et du développement précoce. Nous montrons que le roundup provoque un délai dans l'apparition du premier clivage mitotique ; il retarde l'activation du complexe régulateur de l'entrée en phase M, le complexe CDK/cycline B. La cible moléculaire initiale du roundup est l'activité de synthèse d'ADN. Le mécanisme de surveillance de la transition G2M détecte l'anomalie et provoque le retard du cycle cellulaire. Parallèlement, nous avons mis en évidence que le roundup provoque des dysfonctionnements du développement embryonnaire précoce en affectant le mécanisme de transcription. Les deux effets décrits en présence de roundup sont asociés à des pathologies et leur existence pose problème en terme de santé humaineRENNES1-BU Sciences Philo (352382102) / SudocROSCOFF-Observ.Océanol. (292393008) / SudocSudocFranceF

Le facteur d'élongation de la traduction eEF1B (structure macromoléculaire et relation avec le cycle cellulaire)

La synthèse protéique est une étape cruciale dans la régulation de l'expression des gènes. Elle implique l'orchestration de différents facteurs autour de trois phases, l'initiation, l'élongation, et la terminaison, permettant l'expression des protéines de manière ciblée dans le temps et l'espace. Le facteur d'élongation eEF1 regroupe deux éléments : une protéine G nommée eEF1A et un complexe d'échange de GDP/GDP nommé eEF1B dont le rôle fondamentalement reconnu est de réactiver eEF1A. Nos résultats concernent notamment la structure du complexe eEF1B avec la mise en évidence de différentes sous-populations co-exprimées dans la cellule. Par ailleurs, nos résultats mettent en évidence une relocalisation de ces complexes dépendante du cycle cellulaire. Des analyses de séquences nous permettent de suggérer que le complexe est une cible universelle de la kinase CDK1/Cycline B. Ces résultats montrent l'importance des régulations du complexe eEF1B et plus généralement de l'élongation au cours du cycle cellulaire.RENNES1-BU Sciences Philo (352382102) / SudocROSCOFF-Observ.Océanol. (292393008) / SudocSudocFranceF