Análise do método ogawa-kudoh e comparação com o método lowenstein-jensen para diagnóstico da tuberculose no estado de Rondônia

Dissertação apresentada ao Curso de Pós-Graduação – Mestrado em Biologia Experimental do Núcleo de Saúde da Universidade Federal de Rondônia/UNIR, como requisito para obtenção do Grau de Mestre em Biologia Experimental.A tuberculose é uma doença infecciosa crônica que acompanha a humanidade desde os primórdios da História. Hoje, ela se apresenta como um dos problemas que mais preocupa as autoridades sanitárias de todo o mundo, devido à sua crescente incidência em diferentes grupos populacionais. Entre os países com maior número de casos de tuberculose, o Brasil ocupa o 15º lugar entre os 22 países responsáveis por 80% do total de casos de tuberculose no mundo. A incidência nacional de casos é de 50/100.000 habitantes. Em Rondônia, em 2006 foram registrados 454 casos novos de tuberculose com incidência de 46/100.000. O Programa Nacional de Controle da Tuberculose prioriza a cultura para os casos de baciloscopia negativa com suspeita clínica, tuberculose extrapulmonares e HIV positivos. Este estudo comparou o método de descontaminação e cultura Ogawa-Kudoh com o método de descontaminação Lauril Sulfato de Sódio com semeadura em Lowentein Jensen. Foram analisadas 80 amostras de culturas, para diagnóstico e controle de tratamento de pacientes. Verificou-se que nas 25 amostras com culturas positivas, 23 (92%) cresceram pelo método Ogawa-Kudoh e 10 (40%) cresceram pelo método Lauril Sulfato de Sódio com semeadura em Lowenstein Jensen. Observou-se um alto índice de contaminação 11,2% na técnica Lauril Sulfato de SódioLowenstein Jensen, já na técnica Ogawa-Kudoh o índice foi de 5%. Comparando a baciloscopia com a cultura nos dois métodos, das 19 amostras com baciloscopias positivas, 16 (84,21%) culturas foram positivas no meio Ogawa-Kudoh e 6 (31,57%) positivas no Lauril Sulfato de Sódio-Lowenstein Jensen; 2 (10,53%) culturas foram negativas no meio OgawaKudoh e 5 ( 26,31%) negativas para o método Lauril Sulfato de Sódio-Lowenstein Jensen. Nas amostras paucibacilares, o método Ogawa-Kudoh apresentou maior sensibilidade, 7 (11,47%) enquanto no Lauril Sulfato de Sódio-Lowenstein Jensen 4 (6,56%). O sexo masculino prevaleceu com 67,53%, quanto à faixa etária predominaram os indivíduos a partir dos 40 anos com 66,65% dos casos. Os resultados obtidos neste experimento reforçam que o método simplificado Ogawa-Kudoh pode substituir o método Lauril Sulfato de SódioLowenstein Jensen sem prejuízos para a busca de casos no Programa Nacional de Controle da Tuberculose em nosso Estado, principalmente em laboratórios com baixos recursos financeiros e tecnológicos

Genomic diversity of the human pathogen Paracoccidioides across the South American continent

Paracoccidioidomycosis (PCM) is a life-threatening systemic mycosis widely reported in the Gran Chaco ecosystem. The disease is caused by different species from the genus Paracoccidioides, which are all endemic to South and Central America. Here, we sequenced and analyzed 31 isolates of Paracoccidioides across South America, with particular focus on isolates from Argentina and Paraguay. The de novo sequenced isolates were compared with publicly available genomes. Phylogenetics and population genomics revealed that PCM in Argentina and Paraguay is caused by three distinct Paracoccidioides genotypes, P. brasiliensis (S1a and S1b) and P. restrepiensis (PS3). P. brasiliensis S1a isolates from Argentina are frequently associated with chronic forms of the disease. Our results suggest the existence of extensive molecular polymorphism among Paracoccidioides species, and provide a framework to begin to dissect the connection between genotypic differences in the pathogen and the clinical outcomes of the disease.Fil: Teixeira, Marcus de Melo. Universidade do Brasília; BrasilFil: Cattana, Maria Emilia. Universidad Nacional del Nordeste. Instituto de Medicina Regional; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; ArgentinaFil: Matute, Daniel R.. University of North Carolina; Estados UnidosFil: Muñoz, José F.. Broad Institute Of Mit And Harvard; Estados UnidosFil: Arechavala, Alicia. Hospital Francisco J Muñiz; ArgentinaFil: Isbell, Kristin. University of North Carolina; Estados UnidosFil: Schipper, Rafael. Universidade do Brasília; BrasilFil: Santiso, Gabriela Maria. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas "Dr. Francisco Javier Muñiz"; ArgentinaFil: Tracogna, Fernanda. Gobierno de la Provincia de Chaco. Hospital Julio Cecilio Perrando.; ArgentinaFil: Sosa, María de los Ángeles. Universidad Nacional del Nordeste. Instituto de Medicina Regional; ArgentinaFil: Cech, Norma. Hospital 4 de Junio; ArgentinaFil: Alvarado, Primavera. Instituto de Biomedicina Dr. Jacinto Convit; VenezuelaFil: Barreto, Laura. Instituto Superior de Formación Docente Salome Ureña; República DominicanaFil: Chacón, Yone. Provincia de Salta. Ministerio de Salud Pública. Hospital del Milagro; ArgentinaFil: Ortellado, Juana. Universidad Nacional de Asunción; ParaguayFil: Lima, Cleoni Mendes de. Universidade Federal de Rondonia; BrasilFil: Chang, Marilene Rodrigues. Universidade Federal do Mato Grosso do Sul; BrasilFil: Niño Vega, Gustavo. Universidad de Guanajuato; MéxicoFil: Yasuda, Maria Aparecida Shikanai. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Felipe, Maria Sueli Soares. Universidade Catolica de Brasilia; BrasilFil: Negroni, Ricardo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas "Dr. Francisco Javier Muñiz"; ArgentinaFil: Cuomo, Christina A.. Broad Institute of MIT And Harvard; Estados UnidosFil: Barker, Bridget. Tgen Northern Arizona University; Estados UnidosFil: Giusiano, Gustavo Emilio. Universidad Nacional del Nordeste. Instituto de Medicina Regional; Argentina. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Medicina; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentin

Análise do método ogawa-kudoh e comparação com o método lauril sulfato de sódio-lowenstein-jensen para diagnóstico da tuberculose no estado de Rondônia / Ogawa-kudoh method of analysis and a comparison with the sodium lauryl sulfate...

No Brasil o método padrão de digestão e descontaminação para amostras de escarro é o Lauril Sulfato de Sódio (LSS) e o meio de cultura sólido mais utilizado é o Lowestein-Jensen. O presente trabalho teve por objetivo comparar o método de descontaminação e cultura Ogawa-Kudoh com o método de descontaminação Lauril Sulfato de Sódio com semeadura em Lowenstein-Jensen. Foram analisadas 184 amostras de culturas, para diagnóstico e controle de tratamento de pacientes, utilizando o método Ogawa-Kudoh e o método Lauril Sulfato de sódio-Lowenstein Jensen. Comparando a baciloscopia com a cultura nos dois métodos, das 39 amostras com baciloscopias positivas, 34 (84,21%) culturas foram positivas no meio Ogawa-Kudoh e 16 (41,02%) positivas no Lauril Sulfato de Sódio-Lowenstein Jensen; Nas amostras com baciloscopia negativa e culturas positivas, o método Ogawa-Kudoh apresentou maior sensibilidade, 15 (10,34%) enquanto que no Lowenstein-Jensen apenas 6 (4,13%). O método de Ogawa-Kudoh apresentou 5 amostras (2,72%) com contaminação  e 13  (7,06%) amostras apresentaram contaminação pelo método Lowenstein Jensen. Verificou-se que nas amostras com culturas positivas, 45 (26,31%) cresceram pelo método Ogawa-Kudoh e 22 (12,86%) cresceram pelo método Lauril Sulfato de Sódio com semeadura em Lowenstein Jensen. Os resultados obtidos neste experimento reforçam que o método simplificado Ogawa-Kudoh pode substituir o método Lauril Sulfato de Sódio-Lowenstein Jensen sem prejuízos para a busca de casos no Programa Nacional de Controle da Tuberculose em nosso Estado, principalmente em laboratórios com baixos recursos financeiros e tecnológicos.Palavras-chave: Tuberculose. Ogawa-Kudoh. Lauril Sulfato de Sódio. Lowenstein-Jensen.ABSTRACT: In Brazil, the standard method of digestion and decontamination of sputum samples is Sodium Lauryl Sulfate (SLS). The most commonly used solid sodium is Lowenstein-Jensen. This study aimed to compare the method of decontamination and culture with the Ogawa-Kudoh method of decontamination Sodium Lauryl Sulfate plated on Lowenstein-Jensen. 184 samples were analyzed from cultures for diagnosis and the monitoring of  treatment of patients using the Ogawa-Kudoh method together with the Sodium Lauryl Sulfate-Lowenstein Jensen method. Comparing the smear with culture in both methods, 39 samples with positive sputum smears were found 34 (84.21%) cultures were positive in the Ogawa-Kudoh medium and 16 (41.02%) positive in the Sodium Lauryl Sulfate Lowenstein-Jensen; in samples with negative sputum smears and positive cultures, the Ogawa-Kudoh method showed a higher sensitivity, 15 (10.34%) while Lowenstein-Jensen, showed only 6 (4.13%). The Kudoh Ogawa presented 5 contaminated samples (2.72%) while 13 (7.06%) samples were contaminated by the method Lowenstein Jensen. It was found that in samples with positive cultures, 45 (26.31%) had been grown the Ogawa-Kudoh method and 22 (12.86%) grown by the method Sodium Lauryl Sulfate plated on Lowenstein Jensen. The results of this experiment emphasize that the simplified Ogawa-Kudoh method can replace Sodium Lauryl Sulfate Lowenstein-Jensen without harming the search for cases in the National Tuberculosis Control in our state, especially in laboratories with low financial resources and technology.Keywords: Tuberculosis. Ogawa-Kudoh. Sodium Lauryl Sulfate. Lowenstein-Jense

Intestinal Parasites Coinfection Does Not Alter Plasma Cytokines Profile Elicited in Acute Malaria in Subjects from Endemic Area of Brazil

Made available in DSpace on 2015-06-01T19:34:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1914 bytes, checksum: 7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f (MD5) juan_arcilaetal_IOC_2014.pdf: 1663827 bytes, checksum: 38e99a74f44db72db66a4e439c42f531 (MD5) Previous issue date: 2014Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Simulídeos e Oncocercose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto de Infectologia Emílio Ribas. São Paulo, SP, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Agência de Vigilância em Saúde da Secretaria de Estado da Saúde (AGEVISA). Porto Velho, RO, Brasil.Universidade Federal de Rondônia. Centro Interdepartamental de Biologia Experimental e Biotecnologia. Porto Velho, RO, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Bio-Manguinhos. Laboratório de Tecnologia Diagnóstica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Simulídeos e Oncocercose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.In Brazil, malaria is prevalent in the Amazon region and these regions coincide with high prevalence of intestinal parasites but few studies explore the interaction between malaria and other parasites. Therefore, the present study evaluates changes in cytokine, chemokine, C-reactive protein, and nitric oxide (NO) concentrations in 264 individuals, comparing plasma frominfected individualswith concurrentmalaria and intestinal parasites to individualswith eithermalaria infection alone and uninfected. In the studied population 24% of the individuals were infected with Plasmodium and 18%coinfected with intestinal parasites. Protozoan parasites comprised the bulk of the intestinal parasites infections and subjects infected with intestinal parasites were more likely to have malaria. The use of principal component analysis and cluster analysis associated increased levels of IL-6, TNF-, IL-10, and CRPand lowlevels of IL-17Apredominantlywith individuals with malaria alone and coinfected individuals. In contrast, lowlevels of almost all inflammatory mediatorswere associated predominantlywith individuals uninfectedwhile increased levels of IL-17Awere associated predominantly with individuals with intestinal parasites only. In conclusion, our data suggest that, in our population, the infection with intestinal parasites (mainly protozoan) does not modify the pattern of cytokine production in individuals infected with P. falciparum and P. viva

Nontuberculous mycobacteria in respiratory samples from patients with pulmonary tuberculosis in the state of Rondonia, Brazil

The main cause of pulmonary tuberculosis (TB) is infection with Mycobacterium tuberculosis (MTB). We aimed to evaluate the contribution of nontuberculous mycobacteria (NTM) to pulmonary disease in patients from the state of Rondônia using respiratory samples and epidemiological data from TB cases. Mycobacterium isolates were identified using a combination of conventional tests, polymerase chain reaction-based restriction enzyme analysis of hsp65 gene and hsp65 gene sequencing. Among the 1,812 cases suspected of having pulmonary TB, 444 yielded bacterial cultures, including 369 cases positive for MTB and 75 cases positive for NTM. Within the latter group, 14 species were identified as Mycobacterium abscessus, Mycobacterium avium, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium intracellulare, Mycobacterium gilvum, Mycobacterium gordonae, Mycobacterium asiaticum, Mycobacterium tusciae, Mycobacterium porcinum, Mycobacterium novocastrense, Mycobacterium simiae, Mycobacterium szulgai, Mycobacterium phlei and Mycobacterium holsaticum and 13 isolates could not be identified at the species level. The majority of NTM cases were observed in Porto Velho and the relative frequency of NTM compared with MTB was highest in Ji-Paraná. In approximately half of the TB subjects with NTM, a second sample containing NTM was obtained, confirming this as the disease-causing agent. The most frequently observed NTM species were M. abscessus and M. avium and because the former species is resistant to many antibiotics and displays unsatisfactory cure rates, the implementation of rapid identification of mycobacterium species is of considerable importance