Global analysis of estrogen receptor beta binding to breast cancer cell genome reveals an extensive interplay with estrogen receptor alpha for target gene regulation

Background: Estrogen receptors alpha (ERa) and beta (ERb) are transcription factors (TFs) that mediate estrogen signaling and define the hormone-responsive phenotype of breast cancer (BC). The two receptors can be found co-expressed and play specific, often opposite, roles, with ERb being able to modulate the effects of ERa on gene transcription and cell proliferation. ERb is frequently lost in BC, where its presence generally correlates with a better prognosis of the disease. The identification of the genomic targets of ERb in hormone-responsive BC cells is thus a critical step to elucidate the roles of this receptor in estrogen signaling and tumor cell biology. Results: Expression of full-length ERb in hormone-responsive, ERa-positive MCF-7 cells resulted in a marked reduction in cell proliferation in response to estrogen and marked effects on the cell transcriptome. By ChIP-Seq we identified 9702 ERb and 6024 ERa binding sites in estrogen-stimulated cells, comprising sites occupied by either ERb, ERa or both ER subtypes. A search for TF binding matrices revealed that the majority of the binding sites identified comprise one or more Estrogen Response Element and the remaining show binding matrixes for other TFs known to mediate ER interaction with chromatin by tethering, including AP2, E2F and SP1. Of 921 genes differentially regulated by estrogen in ERb+ vs ERb- cells, 424 showed one or more ERb site within 10 kb. These putative primary ERb target genes control cell proliferation, death, differentiation, motility and adhesion, signal transduction and transcription, key cellular processes that might explain the biological and clinical phenotype of tumors expressing this ER subtype. ERb binding in close proximity of several miRNA genes and in the mitochondrial genome, suggests the possible involvement of this receptor in small non-coding RNA biogenesis and mitochondrial genome functions. Conclusions: Results indicate that the vast majority of the genomic targets of ERb can bind also ERa, suggesting that the overall action of ERb on the genome of hormone-responsive BC cells depends mainly on the relative concentration of both ERs in the cell

Zawartosc mikroelementow w czarnych ziemiach wroclawskich

Analizowano zawartość mikroelementów (Fe, Cu, Zn, Mn, Ni) w podtypach czarnych ziem wrocławskich zróżnicowanych gatunkowo. Wykazano wpływ części spławialnych oraz składu frakcyjnego związków próchnicznych w kształtowaniu ilości mikroelementów w poziomach orno-próchnicznych. Wysoką korelację dodatnią wykazała zawartość części spławialnych z ilością Cu, Fe, Zn, Ni, podobnie udział kwasów huminowyoh związanych z Ca wykazał korelację z Cu i Fe.Microelement contents (Fe, Cu, Zn, Mn, Ni) were analyzed in Wroclaw's black earth subtypes of diversified soil textural groups. The influence of < 0.02 mm soil fractions and fractional composition of humus compounds on the amount of microelements at forming the topsoil horizons was proved. The < 0.02 mm soil fraction content showed a high positive correlation with Cu, Fe, Zn, Ni amounts, similarly the share of humic acids bound with Ca showed correlation with Cu and Fe

Zagrozenia srodowiska w rejonie skladowiska pomiotu kurzego

Prowadzono badania właściwości gleb oraz chemizmu wód drenarskich, gruntowych i powierzchniowych na obszarze przylegającym do składowiska pomiotu kurzego. Stwierdzono, że jego lokalizacja na zboczu oraz niewłaściwe uszczelnienie są przyczynami eutrofizacji wód. W glebie terenów przyległych do składowiska zachodzą zmiany właściwości fizykochemicznych i chemicznych, wyrażające się wzrostem próchniczności gleb, zasobności w makro- i mikroelementy oraz bardzo wysoką zasobnością form przyswajalnych potasu, powodujące zachwianie równowagi w kompleksie sorpcyjnym.The properties of soils and chemical composition of ground water, drainage water and surface water in the area of adjoining areas to chicken droppings storage were studied. It was found that localization of chicken droppings storage on the slope and its unsuitable tightening ave the reasons of water eutrophication. In the studied soils from areas adjoining to the chicken dropping storage undergo the changes of physico-chemical and chemical properties such as: increasing of humus in the soil, content of macro- and microelements and very high contents of available forms of potassium disturbing the balance in sorption complex

Effect of herbicide fallow and mulching the tree rows on the soil properties, growth, and yield of apples, var.Elstar

The subject of the present research has been to study the influenceof herbicidal fallow and mulching in the tree-rows on some of the soil properties and yields of apples var.Elstar.In the experiment the following combinations of soil treatmentwere applied:herbicidal fallow, pine bark, black foil and non-woven polyethylene. The applied combinations of treatments affected changes in the physico-chemical and chemical soil properties. These properties varied in the quantity and quality of organic material and intensity of nutrient teaching. The results obtained showed that mulching was a simple treatment that improved yields. In growing var. Elstar apples, mulching with pine hark yielded positive production effects

Sklad frakcyjny prochnicy redzin Polski poludniowo-zachodniej

Badano skład frakcyjny związków próchnicznych w rędzinach Polski południowo-zachodniej obejmujących gleby orne i darniowe wytworzone z wapieni i margli kredowych, triassowych, prekambryjskich. jurajskich, reprezentujące podtypy rędzin: inicjalnych, właściwych, brunatnych i czamoziemnych. Stwierdzono, że rędziny zwłaszcza darniowe można zaliczyć do gleb zasobnych w związki próchniczne. Skład ilościowy i jakościowy związków próchnicznych kształtuje się w nich głównie pod wpływem przebiegających procesów typologicznych, uwarunkowanych charakterem skał macierzystych.Fractional composition of humus in rendzina soils in south-west region of Poland was studied. The objects of investigation represented arable and soddy soils developed from Cretaceous, Triassic, Pre-Cambrion and Jurassic Limestons and belong to following subtypes of rendzina soils: initial, typical, brown and chernozem. It was found that rendzina soils, especially soddy soils belong to very rich in humic compounds. The quantitative and qualitative composition of humus forms in these soils under influence of typological processes, conditioned by parent materials

The influence of long-term application of municipal sewage on selected properties of soils from irrigation fields

W pracy analizowano wpływ czasu i częstości nawadniania gleb ściekami miejskimi na ich wybrane właściwości fizyczne, fizykochemiczne i chemiczne, ze szczególnym uwzględnieniem ilościowych i jakościowych zmian związków próchnicznych. Obiektem badań były gleby pól irygacyjnych wielkiej aglomeracji miejskiej. Przeprowadzone badania wykazały, że irygacja gleb ściekami miejskimi przyczyniła się do zwiększenia zawartości materii organicznej oraz składników biogennych. Zaobserwowano także wyraźną kumulację związków lipidowych i zwiększenie udziału kwasów huminowych w glebach nawadnianych najczęściej. Stwierdzono również, że częsta irygacja ściekami miejskimi gleb lekkich może przyczynić się do degradacji środowiska.The aim of this study was to analyze how variations in time and frequency of soil irrigation with municipal sewage affect some physical, physicochemical and chemical properties of the irrigated soil, including quantitative and qualitative changes of humic substances. Soils from irrigation fields of a large city agglomeration were selected for this study. Results showed increased concentration of organic matter and nutrients in irrigated soils. The accumulation of lipid substances and humic acids were observed in most frequently irrigated soils. It was found that frequent irrigation of light soils with municipal sewage might lead to environmental degradation

Intraclonal variations of resistance and phenotype in Pseudomonas aeruginosa epidemic high-risk clone ST308: A key to success within a hospital?

International audienc

La qualité sanitaire des plages de Marseille: Variabilités et origines de la contamination fécale Eau et Sable

International audienc