Mapping the entire functionally active endometrial microbiota

STUDY QUESTION Does endometrium harbour functionally active microorganisms and whether the microbial composition differs between proliferative and mid-secretory phases? SUMMARY ANSWER Endometrium harbours functionally alive microorganisms including bacteria, viruses, archaea and fungi whose composition and metabolic functions change along the menstrual cycle. WHAT IS KNOWN ALREADY Resident microbes in the endometrium have been detected, where microbial dysfunction has been associated with reproductive health and disease. Nevertheless, the core microorganismal composition in healthy endometrium is not determined and whether the identified bacterial DNA sequences refer to alive/functionally active microbes is not clear. Furthermore, whether there are cyclical changes in the microbial composition remains an open issue. STUDY DESIGN, SIZE, DURATION RNA sequencing (RNAseq) data from 14 endometrial paired samples from healthy women, 7 samples from the mid-secretory phase and 7 samples from the consecutive proliferative phase were analysed for the microbial RNA sequences. PARTICIPANTS/MATERIALS, SETTING, METHODS The raw RNAseq data were converted into FASTQ format using SRA Toolkit. The unmapped reads to human sequences were aligned to the reference database Kraken2 and visualised with Krona software. Menstrual phase taxonomic differences were performed by R package metagenomeSeq. The functional analysis of endometrial microbiota was obtained with HUMANn2 and the comparison between menstrual phases was conducted by one-way ANOVA. Human RNAseq analysis was performed using miARma-Seq and the functional enrichment analysis was carried out using gene set enrichment analysis (GSEA; HumanCyc). The integration of metabolic pathways between host and microbes was investigated. The developed method of active microbiota mapping was validated in independent sample set. MAIN RESULTS AND THE ROLE OF CHANCE With the novel metatranscriptomic approach, we mapped the entire alive microbiota composing of >5300 microorganisms within the endometrium of healthy women. Microbes such as bacteria, fungi, viruses and archaea were identified. The validation of three independent endometrial samples from different ethnicity confirmed the findings. Significant differences in the microbial abundances in the mid-secretory vs. proliferative phases were detected with possible metabolic activity in the host-microbiota crosstalk in receptive phase endometrium, specifically in the prostanoid biosynthesis pathway and L-tryptophan metabolism. LARGE SCALE DATA The raw RNAseq data used in the current study are available at GEO GSE86491 and at BioProject PRJNA379542. LIMITATIONS, REASONS FOR CAUTION These pioneering results should be confirmed in a bigger sample size. WIDER IMPLICATIONS OF THE FINDINGS Our study confirms the presence of active microbes, bacteria, fungi, viruses and archaea in the healthy human endometrium with implications in receptive phase endometrial functions, meaning that microbial dysfunction could impair the metabolic pathways important for endometrial receptivity. The results of this study contribute to the better understanding of endometrial microbiota composition in healthy women and its possible role in endometrial functions. In addition, our novel methodological pipeline for analysing alive microbes with transcriptional and metabolic activities could serve to inspire new analysis approaches in reproductive medicine.This work is supported by the Spanish Ministry of Economy, Industry and Competitiveness (MINECO) and European Regional Development Fund (FEDER): grants RYC-2016-21199 and ENDORE SAF2017-87526- R; FEDER/Junta de Andalucía-Consejería de Economía y Conocimiento: MENDO (B-CTS-500-UGR18) and by the University of Granada Plan Propio de Investigacio ́n 2016 - Excellence actions: Unit of Excellence on Exercise and Health (UCEES) (SOMM17/6107/UGR). A.S.-L. and N.M.M. are funded by the Spanish Ministry of Science, Innovation and Universities (PRE2018-0854409 and FPU19/01638). S.A. has received honoraria for lectures from Merck. The funder had no role in this study

Tecnología y globalización en el pronóstico de pacientes con cáncer rectal

Desde el siglo XX hasta la fecha, el proceso de globalización ha caracterizado el desarrollo de la economía mundial. En este contexto los países desarrollados son los que tienen directamente el manejo y dominio tecnológico, mientras que los subdesarrollados han sido afectados con la introducción acelerada de las nuevas tecnologías y su alto costo. El desarrollo tecnológico en la sociedad actual es un factor importante en el manejo de enfermedades como el cáncer. El tumor de localización rectal constituye el tercer tipo de cáncer más comúnmente diagnosticado y la tercera causa de muerte por cáncer para ambos sexos. Para su estadificación se han desarrollado varios medios diagnósticos, dentro de estos, la elastografía por ultrasonido endoscópico es una técnica de elevado impacto. En Cuba se cuenta con esta tecnología de avanzada, a disposición de todos los pacientes, lo cual demuestra que es posible enfrentar los desafíos que la globalización impone al desarrollo tecnológico. En este trabajo se exponen las opiniones de los autores, relacionadas con la influencia que tiene la política de globalización en el desarrollo tecnológico y su repercusión en el pronóstico de los pacientes con cáncer de recto

Matemáticas en contexto

El libro compila estrategias didácticas derivadas del programa de formación complementario escritas por instructores técnicos de diferentes regionales del país, describe la forma en que se incorpora el conocimiento matemático en campos específicos de diferentes áreas de formación laboral basado en las teorías didácticas y reflexiones pedagógicas de instructores.The book compiles the didactic strategies derived from the complementary training program by the technical instructors of the regional media of the country, describes the way in which mathematical knowledge is incorporated in the fields of different areas of work training based on theories didactic and pedagogical reflections of instructors.Consideraciones frente al aprendizaje de las matemáticas -- Perspectiva constructivista -- Teoría de las situaciones didácticas -- Modelación matemática -- Mediación tecnológica -- Pensamiento numérico variacional -- Pensamiento numérico -- Pensamiento variacional -- Diseño de modelo matemático con aplicación de costos de producción -- Modelo matemático del consumo de gas en un artefacto afectado por su presión de trabajo -- Planeación de la producción agrícola: Caso plan óptimo de siembra que permita alcanzar la máxima rentabilidad del cultivo -- Estudio del Álgebra de Boole -- Diseño de un modelo de inventarios para una pequeña empresa de calzado de dotación -- Estudio de la Ley de Ohm mediante herramienta interactiva -- Pensamiento métrico-geométrico -- Pensamiento geométrico -- Pensamiento métrico -- Caso de optimización de recursos en el sector industrial de la confección -- Optimización de espacios para huertas urbanas -- Optimización de los costos del espacio de almacenamiento en microempresas y pequeñas empresas de acuerdo con las normas de seguridad vigentes -- Unidad de medida métrica para confección de ropa exterior femenina -- Optimización de recursos aplicando el proceso administrativo -- Pensamiento aleatorio -- Estadística Básica para Articulación con la Media -- Evaluación del impacto de la accidentalidad en la implementación del Sistema de Gestión de Seguridad y Salud en el Trabajo (sg-sst) por medio de indicadores -- Identificar los aspectos de la declaración de renta para una persona natural no obligada a llevar contabilidad -- Fortalecimiento de la estadística: caso de las unidades productivas del Centro de Biotecnología Agropecuaria -- Estadística dinámica -- Resultados preliminaresna[270 páginas

Structural Basis for the Limited Response to Oxidative and Thiol-Conjugating Agents by Triosephosphate Isomerase From the Photosynthetic Bacteria Synechocystis

In plants, the ancestral cyanobacterial triosephosphate isomerase (TPI) was replaced by a duplicated version of the cytosolic TPI. This isoform acquired a transit peptide for chloroplast localization and functions in the Calvin-Benson cycle. To gain insight into the reasons for this gene replacement in plants, we characterized the TPI from the photosynthetic bacteria Synechocystis (SyTPI). SyTPI presents typical TPI enzyme kinetics profiles and assembles as a homodimer composed of two subunits that arrange in a (β-α)8 fold. We found that oxidizing agents diamide (DA) and H2O2, as well as thiol-conjugating agents such as oxidized glutathione (GSSG) and methyl methanethiosulfonate (MMTS), do not inhibit the catalytic activity of SyTPI at concentrations required to inactivate plastidic and cytosolic TPIs from the plant model Arabidopsis thaliana (AtpdTPI and AtcTPI, respectively). The crystal structure of SyTPI revealed that each monomer contains three cysteines, C47, C127, and C176; however only the thiol group of C176 is solvent exposed. While AtcTPI and AtpdTPI are redox-regulated by chemical modifications of their accessible and reactive cysteines, we found that C176 of SyTPI is not sensitive to redox modification in vitro. Our data let us postulate that SyTPI was replaced by a eukaryotic TPI, because the latter contains redox-sensitive cysteines that may be subject to post-translational modifications required for modulating TPI's enzymatic activity

Semilleros de Investigación 2013, n.° 28

"Unijus promueve y apoya el desarrollo e implementación de programas y proyectos de investigación que aporten al conocimiento de la realidad nacional e internacional, de las instituciones jurídicas, políticas y sociales, así como de las teorías jurídicas y políticas que contribuyan a la construcción de nuevas propuestas para la solución de las problemáticas que aquejan la sociedad. Por tal motivo, es fundamental el apoyo constante a la formación de semilleros de investigación en la Facultad de Derecho, Ciencias Políticas y Sociales de la Sede Bogotá, así como la consolidación de los semilleros ya existentes. En el año 2013, se desarrollaron las Convocatorias No. 01 y 02 de 2013 para la Selección de Semilleros de Investigación de la Facultad de Derecho, Ciencias Políticas y Sociales. Como resultado de dicho proceso fueron seleccionadas trece propuestas de investigación integradas por un total de 47 estudiantes, quienes a su vez se encontraban vinculados a 7 grupos de investigación.""Presentación Acercamiento a la reforma del Consejo de Seguridad de las Naciones Unidas: Una mirada a las propuestas de México, Argentina y Brasil Reflections on Legal Education: an Approach to the Escuela de Derecho Propio Laureano Inampués Cuatín Iliana Jineth Yepes Acuña, Simón Camilo Hernández Gaona, Paula Alejandra Poveda Cocuy, Francisco Javier Quito Córdoba, Sonia Catalina Villamizar Almeyda Grupo de investigación en Relaciones Internacionales y Asuntos Globales - RIAG Intervención en el Bronx: Análisis descriptivo de una apuesta alternativa en política pública de seguridad humana Intervention in the Bronx: Descriptive Analysis of an alternative bet on Public Policy and human security Ana María Tarazona Galvis, Carolina Cristancho Zarco, Andrés Felipe Espinosa Zuluaga, Fredy Hernando Caro y Sergio Iván González Machetá Grupo de Investigación en Seguridad y Defensa -GISDE Conflictos socioterritoriales en la región Andina Oriental de Colombia: una mirada al campesinado y a las formas contemporáneas de la lucha por la tierra y el territorio Socio-territorial Conflicts in the East Andes Region of Colombia: A glance at the Peasantry and Contemporary Ways of Struggle for Land and Territory Catherine Moore Torres, Julián Eduardo Naranjo Vasco Grupo Interdisciplinario de Estudios Políticos y Sociales - Theseus Territorios, resistencias y espacialidad en la geopolítica de la globalización Territory, Strength and Spatiality in the Geopolitics of Globalization Sindy Katherine Castro Herrera, Camila Andrea Galindo Martínez, Paula Andrea Ricaurte Ávila, Natalia Briceño Hernández, John Freddy Gómez Celi, Ángela Beatriz Torres Tamayo Grupo Interdisciplinario de Estudios Políticos y Sociales - Theseus Territorio y construcción de subjetividades en Bogotá. Transferencias entre lo rural y lo urbano en las localidades de Chapinero, Usme y Ciudad Bolívar Territory and construction of subjectivities in Bogotá. Transfers between the rural and the urban in the localities of Chapinero, Usme and Ciudad Bolívar Javier Alejandro Jiménez González, David Fernando Salamanca Paternina, Diana Paola López Bojacá Grupo de Investigación Presidencialismo y Participación Los jóvenes y la paz: la incógnita de La Habana Young People and Peace: the Unknown of Havana Sara Camila Arias Castañeda, Reina Alejandra Jiménez Díaz, Brahiam Fernando Quintana Martínez, Fernando Villada Agudelo Grupo de investigación Presidencialismo y Participación Análisis jurídico-crítico de la producción normativa en materia ambiental en el período 2003-2013 con énfasis en el Proyecto de reforma al Código Nacional de Recursos Naturales Renovables Legal-Critical Analysis of Legislation Production in Environmental Law in the Period of 2003-2013 with an Emphasis on the National Code of Renewable Natural Resources Diana Sofía Díaz Castro, Natalia Alejandra Rodríguez Vargas, Adriana María Guerrero Arias Grupo de Investigación en Derechos Colectivos y Ambientales - GIDCA Conflictividad ambiental por monocultivos de palma aceitera en Tibú, Norte de Santander Environmental Conflict for Oil Palm Plantations in Tibú, North of Santander José Agustín Labrador Forero, Carlos Eduardo Olaya Díaz Grupo de Investigación en Derechos Colectivos y Ambientales - GIDCA Campañas electorales: lo que se puede y lo que se debería comunicar Electoral Campaigns: what can be communicated and what should be communicated Daniela Alvarado Rincón, Freddy Leonardo González Araque y Augusto Federico Padilla Grupo de investigación Cultura Jurídico Política, Instituciones y Globalización Tratamiento jurídico-social de la obscenidad en Colombia: Aproximación desde la jurisprudencia de la Corte Constitucional Legal and social treatment of obscenity in Colombia: Approximation from the jurisprudence of the Constitutional Court Germán Darío Rodríguez González, Luisa Fernanda Ortiz Rodríguez, Diego Ricardo Cárdenas Nonsoque Grupo de investigación Cultura Jurídico Política, Instituciones y Globalización Mujeres indígenas y prácticas de justicia Indigenous Women and Practices of Justice Luisa María Ocaña Muñoz, Sibelys Katina Mejía Rodríguez, Viviana Patricia López Rubio, Damaris Alejandra Quintero Leyva Grupo de investigación Escuela de Justicia Comunitaria de la Universidad Nacional (EJCUN) Justicia en red: Caminando hacia el empoderamiento y la construcción de ciudadanía para Bogotá Justice in Network: towards the Empowerment and the Construction of Citizenship in Bogotá Alejandra Méndez Molano, Jenny Alejandra Tamayo Tamayo Grupo de investigación Escuela de Justicia Comunitaria de la Universidad Nacional (EJCUN) Reflexiones sobre la educación legal: Una aproximación a la Escuela de Derecho Propio Laureano Inampués Cuatín Reflections on Legal Education: an Approach to the Escuela de Derecho Propio Laureano Inampués Cuatín Krisly Tatiana Amaya Osorio, Juan Sebastián Urdaneta Forero, Miguel Ángel Salas Dorado Grupo de investigación Escuela de Justicia Comunitaria de la Universidad Nacional (EJCUN)

Semilleros de Investigación 2013

El Instituto Unidad de Investigaciones Jurídico-Sociales Gerardo Molina (Unijus) promueve y apoya el desarrollo e implementación de programas y proyectos de investigación que aporten al conocimiento de la realidad nacional e internacional, de las instituciones jurídicas, políticas y sociales, así como de las teorías jurídicas y políticas que contribuyan a la construcción de nuevas propuestas para la solución de las problemáticas que aquejan la sociedad. Por tal motivo, es fundamental el apoyo constante a la formación de semilleros de investigación en la Facultad de Derecho, Ciencias Políticas y Sociales de la Sede Bogotá, así como la consolidación de los semilleros ya existentes. En el año 2013, se desarrollaron las Convocatorias No. 01 y 02 de 2013 para la Selección de Semilleros de Investigación de la Facultad de Derecho, Ciencias Políticas y Sociales. Como resultado de dicho proceso fueron seleccionadas trece propuestas de investigación integradas por un total de 47 estudiantes, quienes a su vez se encontraban vinculados a 7 grupos de investigación. La presente publicación está compuesta por los artículos que resultaron de los proyectos aprobados. Grupo de investigación Relaciones Internacionales y Asuntos Globales Acercamiento a la reforma del Consejo de Seguridad de las Naciones Unidas: una mirada a las propuestas de México, Argentina y Brasil Busca identificar los factores por los cuales tres países latinoamericanos (Argentina, Brasil y México) —con características históricas similares, que comparten un origen medianamente común y que participan en los espacios de integración regional de la misma—, divergen en sus posiciones con respecto a la reforma del Consejo de Seguridad de la Organización de las Naciones Unidas (ONU). El semillero de investigación estuvo bajo la dirección del profesor Gustavo Adolfo Puyo

Semilleros de Investigación 2014, n.° 29

Unijus promueve y apoya el desarrollo e implementación de programas y proyectos de investigación que aporten al conocimiento de la realidad nacional e internacional, de las instituciones jurídicas, políticas y sociales, así como de las teorías jurídicas y políticas que contribuyan a la construcción de nuevas propuestas para la solución de las problemáticas que aquejan la sociedad. Por tal motivo, es fundamental el apoyo constante a la formación de semilleros de investigación en la Facultad de Derecho, Ciencias Políticas y Sociales de la Sede Bogotá, así como la consolidación de los semilleros ya existentes. En el año 2014, se desarrolló la Convocatoria n.° 074 para la selección de Semilleros de Investigación, modalidades I y II. Como resultado de dicho proceso fueron seleccionadas trece propuestas de investigación integradas por un total de 43 estudiantes, quienes a su vez se encontraban vinculados a ocho grupos de investigación adscritos a Unijus."Presentación Sección I ¿Cómo se significan las víctimas del conflicto social y armado colombiano? Reflexiones en el marco de los diálogos de paz de La Habana How are the victims of the Colombian social and armed conflict signified? Lina María López Castillo, Daniela Mahe Soto, Natalia Mosquera Pedreros, Andrés Ignacio Sánchez Zúñiga Grupo de Investigación Seguridad y Defensa Medios de Comunicación, Poder Punitivo y Proceso de paz Mass media, Punitive Power and Peace Dialoges Juan Manuel Bañol Arias, Juanita Camila Triana Quimbaya, Michael Stiven Reyes Barreto Grupo Investigación Cultura Jurídico-Política, Instituciones y Globalización La Cumbre Agraria, Campesina, Étnica y Popular y los diálogos de paz de La Habana The Agrarian, Peasant, Ethnic and Popular Summit and the peace talks of Havana Andrés Felipe Pardo Jiménez, Luisa María Guevara Álvarez Grupo de Investigación Estudios Políticos y Sociales El papel de los politólogos egresados en el marco del Proceso de Paz y un eventual posconflicto The role of political scientists graduates under the peace process and eventually post-conflict María Camila Contreras Becerra, Sergio Alejandro Gómez Velázquez, Juan Sebastián Moncada Casallas Grupo de Investigación Partidos Políticos y Sistemas Electorales Sección II Justicia comunitaria en la zona de reserva campesina de Cabrera, Sumapaz Community Justice in the area of peasant reserve of Cabrera, Sumapaz John Mario Montenegro, Carlos Mauricio Cruz, David Andrés Rodríguez Grupo de Investigación Escuela de Justicia Comunitaria Evaluación del programa de territorios de vida y paz en la upz La Sabana, Bogotá 2012-2014 Evaluation of the Program of Life and Peace Territories in the Upz La Sabana, Bogota 2012-2014 Carolina Cristancho, Ana María Tarazona, Sergio Iván González, Andrés Felipe Espinosa Grupo de Investigación Seguridad y Defensa Una lucha más allá de las fronteras nacionales: el caso del pueblo indígena Awá, 2009-2014 A Fight Beyond National Borders the Case of Indigenous Awa, 2009-2014 Danna Carolina Aguilar Gómez, Jefferson José Cruz Medina, Juan David Sánchez Vargas, Sergio Esteban Torres Chaves Grupo de Investigación Relaciones interétnicas y minorías culturales Derecho a la vivienda, victimas y políticas públicas. Caso: proyecto Usme metro 136 Right to Housing, Victims, and Public Policies. Case: project Usme metro 136 Sebastián Alberto Betancourt Cruz, Iliana Jineth Yepes Acuña, Sara Camila Arias Castañeda Grupo de Investigación presidencialismo y participación Atravesando Fronteras: relatos de Colombianos en el Exterior Crossing Borders: stories of Colombians Abroad Jonathan Daniel Barón Barreto, Gonzalo Andrés Duarte Hurtado, Alejandro Aguirre González Grupo de Investigación Partidos Políticos y Sistemas Electorales Sección III Los paradigmas democráticos y el modelo colombiano: un análisis desde el sujeto, el voto y la representación The democratic Paradigms and the Colombian model: A Perspective from the subject, the vote and the representation Diana Marcela Daza Gacha, Jacobo Díaz Blandón, Laura Cristina Montenegro Sarmiento Grupo de Investigación Derecho Constitucional y Derechos Humanos Balance legislativo sobre el territorio y la identidad raizal en San Andrés, Providencia y Santa Catalina Legislative Assesment About Raizal Territory and Identity in San Andres, Providencia Y Santa Catalina Aixa Tatiana Cordero Romero, Laura Juliana Cortés Buitrago, Brenda Gabriela Muskus González, Silvia Juliana Tello Solano Grupo de Investigación Relaciones interétnicas y minorías culturales La maternidad subrogada en Colombia Surrogacy maternity in Colombia Andrea Carolina Reyes Olmos, David Felipe Morales Martínez, José Nicolás Pulido Nieto Grupo de Investigación vinculado al departamento de Derecho Análisis del comportamiento legislativo del Acto Legislativo 02 de 2015 “Por medio del cual se adopta una reforma de Equilibrio de Poderes y Reajuste Institucional y se dictan otras disposiciones” durante su proceso de aprobación en el Congreso de la República Analysis of legislative behavior of Legislative Act 02 of 2015 where by reform balance of powers and Institutional Readjustment is adopted and other provisions during its approval process in Congress Juan Pablo Garnica Munévar, Isaac Morales Pérez, Andrés Leonardo Villamil Duarte Grupo de Investigación Partidos Políticos y Sistemas Electorales

In and out from the cortex: Development of major forebrain connections

In this review we discuss recent advances in the understanding of the development of forebrain projections attending to their origin, fate determination, and axon guidance. Major forebrain connections include callosal, corticospinal, corticothalamic and thalamocortical projections. Although distinct transcriptional programs specify these subpopulations of projecting neurons, the mechanisms involved in their axonal development are similar. Guidance by short- and long-range molecular cues, interaction with intermediate target populations and activity-dependent mechanisms contribute to their development. Moreover, some of these connections interact with each other showing that the development of these axonal tracts is a well-orchestrated event. Finally, we will recapitulate recent discoveries that challenge the field of neural wiring that show that these forebrain connections can be changed once formed. The field of reprogramming has arrived to postmitotic cortical neurons and has showed us that forebrain connectivity is not immutable and might be changed by manipulations in the transcriptional program of matured cells.E.L.-D. was supported by a CONSOLIDER fellowship from the CSIC. This work was supported by grants from BFU2009-08261, the CONSOLIDER programme CSD2007-00023 and an ERC Grant ERC-2009-StG_20081210. G.L.-B. is an EMBO Young Investigator.Peer reviewe

BRN3-type POU Homeobox Genes Maintain the Identity of Mature Postmitotic Neurons in Nematodes and Mice

Many distinct regulatory factors have been shown to be required for the proper initiation of neuron-type-specific differentiation programs, but much less is known about the regulatory programs that maintain the differentiated state in the adult [1, 2, 3]. One possibility is that regulatory factors that initiate a terminal differentiation program during development are continuously required to maintain the differentiated state. Here, we test this hypothesis by investigating the function of two orthologous POU homeobox genes in nematodes and mice. The C. elegans POU homeobox gene unc-86 is a terminal selector that is required during development to initiate the terminal differentiation program of several distinct neuron classes [4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13]. Through post-developmental removal of unc-86 activity, we show here that unc-86 is also continuously required throughout the life of many neuron classes to maintain neuron-class-specific identity features. Similarly, the mouse unc-86 ortholog Brn3a/POU4F1 has been shown to control the initiation of the terminal differentiation program of distinct neuron types across the mouse brain, such as the medial habenular neurons [14, 15, 16, 17, 18, 19, 20]. By conditionally removing Brn3a in the adult mouse central nervous system, we show that, like its invertebrate ortholog unc-86, Brn3a is also required for the maintenance of terminal identity features of medial habenular neurons. In addition, Brn3a is required for the survival of these neurons, indicating that identity maintenance and survival are genetically linked. We conclude that the continuous expression of transcription factors is essential for the active maintenance of the differentiated state of a neuron across phylogeny.E.S.-S. was funded by a Young Investigator Award from the Brain and Behavior Research Foundation and E.L.-D. was funded by a postdoctoral fellowship from the EMBO. O.H. is an Investigator of the Howard Hughes Medical Institute. This work was supported by NIH U01 MH105924.Peer reviewe