Isolation of bis-indole alkaloids with antileishmanial and antibacterial activities from Peschiera van heurkii (syn. Tabernaemontana van heurkii)

Des extraits de feuilles et d'écorces de tiges de #Peschiera van heurkii (Muell. Arg.) L. Allorge, (Syn. #Tabernaemontana van heurkii Muell. Arg.) ont montré une activité antileishmanienne et antibactérienne significative. Les activités étaient concentrées dans les fractions alcaloïdiques, desquelles ont été isolés et identifiés 20 alcaloïdes indoliques et bis-indoliques. La plus forte activité leishmanicide et antibactérienne fut observée avec les alcaloïdes dimères conodurine (1), N-démethyle - conodurine (=gabunine) et conoduramine. Les deux premiers composés se sont avérés faiblement toxiques vis-à-vis des cellules hôtes les macrophages, tout en présentant une forte toxicité pour les formes intracellulaires du parasite. #In vitro$, l'alcaloïde (1) s'est avéré moins actif que le médicament de référence, le glucantime (=N-methylglucamine antimonate). (Résumé d'auteur

Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples

Funder: NCI U24CA211006Abstract: The Cancer Genome Atlas (TCGA) and International Cancer Genome Consortium (ICGC) curated consensus somatic mutation calls using whole exome sequencing (WES) and whole genome sequencing (WGS), respectively. Here, as part of the ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium, which aggregated whole genome sequencing data from 2,658 cancers across 38 tumour types, we compare WES and WGS side-by-side from 746 TCGA samples, finding that ~80% of mutations overlap in covered exonic regions. We estimate that low variant allele fraction (VAF < 15%) and clonal heterogeneity contribute up to 68% of private WGS mutations and 71% of private WES mutations. We observe that ~30% of private WGS mutations trace to mutations identified by a single variant caller in WES consensus efforts. WGS captures both ~50% more variation in exonic regions and un-observed mutations in loci with variable GC-content. Together, our analysis highlights technological divergences between two reproducible somatic variant detection efforts