Polimorfismos de relevancia farmacogenética de las familias 1A2, 2C y 3A en población indígena del noroeste de México

En México habitan más de 62 grupos nativos, cuyo fondo genético es diferente a la población Mestiza Mexicana. Por lo tanto, es difícil inferir con claridad su respuesta a fármacos. La distribución de polimorfismos con implicaciones funcionales en las enzimas del CYP450, permitirá determinar el riesgo de toxicidad o falla terapéutica en éstas poblaciones. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de polimorfismos en los genes CYP1A2, CYP2C9/19 y CYP3A4, en ocho poblaciones indígenas del noroeste de México. Se estudiaron 506 indígenas, en los que se determinó la frecuencia de CYP1A2*1F, CYP2C9*2, *3 y *6, CYP2C19*2 y *3 y CYP3A4*1B, mediante PCR-RFLP y PCR en tiempo real. Además, se estimó la ancestría mediante 15 marcadores STR. La frecuencia de CYP1A2*1F fue del 0.53 al 0.92. El alelo CYP2C9*2 solo se presentó en los Seris (0.026) y Mayos (0.057) y fue dependiente del componente ancestral europeo. CYP2C9*3 se presentó con una frecuencia del 0 al 0.104. La variante CYP2C19*2 se presentó con una frecuencia del 0.026 al 0.433. CYP2C9*6 y CYP2C19*3 no se detectaron en este estudio. CYP3A4*1B se observó con una frecuencia del 0 al 0.115. La frecuencia de los polimorfismos genéticos es diferente a la descrita en población Mestiza Mexicana y en población Asiática. Lo anterior tiene implicaciones terapéuticas importantes que deben considerarse para la optimización farmacológica en la población indígena mexicana.In Mexico inhabit more than 62 Native Amerindian groups, whose genetic background is different to the Mexican Mestiza population. Therefore, it is difficult to clearly infer their expected drugs response. The distribution of polymorphisms with functional implications in CYP450 enzymes, will determine the risk of toxicity or therapeutic failure in these populations. The aim of this study was to determine the frequency of polymorphisms in genes CYP1A2, CYP2C9/19 and CYP3A4, in eight indigenous populations from Northwest Mexico. A total of 506 indigenous were genotyped for the CYP1A2*1F, CYP2C9*2, *3 and *6, CYP2C19*2 and *3, and CYP3A4*1B, by PCR-RFLP assay and real-time PCR. Additionally, was to performed molecular evaluation of ancestry by 15 STRs markers. The frequencies for CYP1A2*1F were of 0.53 - 0.92. CYP2C9*2 was found only in Seris (0.026) and Mayos (0.057) indigenous groups, and was dependent on the European ancestral component. The frequency of CYP2C9*3 allele was 0 - 0.104. The CYP2C19*2 variant was found in range of 0.026 - 0.433. CYP2C9*6 and CYP2C19*3 were not detected in this study. CYP3A4*1B was detected with a frequency of 0 - 0.115. The allelic frequencies of CYP450 were different from those described in Mexican Mestizo and Asian population. These results have important therapeutic implications that should be considered for drug optimization in Mexican indigenous population.Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (FONSEC 2009-1.Clave 113063) Cooperación Extremeña de la Junta de Extremadura (9IA006; 11IA002

Polimorfismos de relevancia farmacogenética de las familias 1A2, 2C y 3A en población indígena del noroeste de México

En México habitan más de 62 grupos nativos, cuyo fondo genético es diferente a la población Mestiza Mexicana. Por lo tanto, es difícil inferir con claridad su respuesta a fármacos. La distribución de polimorfismos con implicaciones funcionales en las enzimas del CYP450, permitirá determinar el riesgo de toxicidad o falla terapéutica en éstas poblaciones. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de polimorfismos en los genes CYP1A2, CYP2C9/19 y CYP3A4, en ocho poblaciones indígenas del noroeste de México. Se estudiaron 506 indígenas, en los que se determinó la frecuencia de CYP1A2*1F, CYP2C9*2, *3 y *6, CYP2C19*2 y *3 y CYP3A4*1B, mediante PCR-RFLP y PCR en tiempo real. Además, se estimó la ancestría mediante 15 marcadores STR. La frecuencia de CYP1A2*1F fue del 0.53 al 0.92. El alelo CYP2C9*2 solo se presentó en los Seris (0.026) y Mayos (0.057) y fue dependiente del componente ancestral europeo. CYP2C9*3 se presentó con una frecuencia del 0 al 0.104. La variante CYP2C19*2 se presentó con una frecuencia del 0.026 al 0.433. CYP2C9*6 y CYP2C19*3 no se detectaron en este estudio. CYP3A4*1B se observó con una frecuencia del 0 al 0.115. La frecuencia de los polimorfismos genéticos es diferente a la descrita en población Mestiza Mexicana y en población Asiática. Lo anterior tiene implicaciones terapéuticas importantes que deben considerarse para la optimización farmacológica en la población indígena mexicana.In Mexico inhabit more than 62 Native Amerindian groups, whose genetic background is different to the Mexican Mestiza population. Therefore, it is difficult to clearly infer their expected drugs response. The distribution of polymorphisms with functional implications in CYP450 enzymes, will determine the risk of toxicity or therapeutic failure in these populations. The aim of this study was to determine the frequency of polymorphisms in genes CYP1A2, CYP2C9/19 and CYP3A4, in eight indigenous populations from Northwest Mexico. A total of 506 indigenous were genotyped for the CYP1A2*1F, CYP2C9*2, *3 and *6, CYP2C19*2 and *3, and CYP3A4*1B, by PCR-RFLP assay and real-time PCR. Additionally, was to performed molecular evaluation of ancestry by 15 STRs markers. The frequencies for CYP1A2*1F were of 0.53 - 0.92. CYP2C9*2 was found only in Seris (0.026) and Mayos (0.057) indigenous groups, and was dependent on the European ancestral component. The frequency of CYP2C9*3 allele was 0 - 0.104. The CYP2C19*2 variant was found in range of 0.026 - 0.433. CYP2C9*6 and CYP2C19*3 were not detected in this study. CYP3A4*1B was detected with a frequency of 0 - 0.115. The allelic frequencies of CYP450 were different from those described in Mexican Mestizo and Asian population. These results have important therapeutic implications that should be considered for drug optimization in Mexican indigenous population.Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (FONSEC 2009-1.Clave 113063) Cooperación Extremeña de la Junta de Extremadura (9IA006; 11IA002

Micronuclei and nuclear anomalies in Mexico’s indigenous population

Objective. To determine the number of micronuclei and nuclear anomalies in Mexico’s indigenous population. Materials and methods. One hundred twenty indigenous individuals were evaluated, including thirty from the ethnicities Cora, Huichol, Tarahumara and Tepehuano. The number of micronuclei (MN) and any nuclear abnormality (NA) in oral mucosa cells, including cells with nuclear buds, binucleated cells, cells with karyolysis, karyorrhetic, condensed chromatin and pyknotic cells were determined for each participant. Results. Tepehuano and Tarahumaras showed the greatest damage to DNA. The Tepehuano group presented the highest number of MN and NA, this being a significant difference (p < 0.05) compared with the rest of the studied groups. This group also presented the highest herbicide exposure (46.7%). In relation to the smoking and drinking habits, these were more frequent in the Tarahumara group (33.3 and 50% respectively). Conclusion. The ethnic diversity, habits and customs may influence the DNA nuclear integrity in the Amerindian groups

Influence of CYP1A1*2C on High Triglyceride Levels in Female Mexican Indigenous Tarahumaras

Background and Aims High triglyceride levels are closely related to cardiovascular disease. Its development lays on age, diet, physical activity, ethnicity and genetic factors. Among the last, the CYP1A1*2C allele has an influence on the metabolism of cholesterol and other fatty acids. We undertook this study to determine the frequency of CYP1A1*2C and its association with triglyceride levels in Mexican indigenous Tarahumaras and Tepehuanos. Methods Anthropometric and biochemical data were recorded. Genotyping of CYP1A1*2C by RT-PCR was done in 110 Tepehuano, 69 Tarahumara and 64 Mestizo. Results Significant differences in age, waist diameter, BMI, creatinine, glucose, cholesterol, triglycerides, HDL and VLDL measurements were found between Tarahumaras and Tepehuanos (p <0.05). Additionally, Tarahumara women showed the highest values of waist diameter, BMI and triglycerides (p <0.05). It was found that Tarahumaras showed a significant association between high triglyceride levels and CYP1A1*2C allele (OR = 2.57; 95% CI 1.12–5.88, p = 0.024) under a recessive inheritance model. However, the Tepehuano group showed a significant protective association between normal triglyceride levels and CYP1A1*2C polymorphism (OR = 0.28; 95% CI 0.10–0.80, p = 0.015) following a dominant inheritance model. The same pattern was observed after analysis with females of both ethnicities. Conclusion A significant association between CYP1A1*2C and high triglyceride levels in Amerindian Tarahumaras from Chihuahua has been found; this allele was significantly associated with normal triglyceride levels in Tepehuanos from Durango, Mexico. Further studies are needed to elucidate the genetic role of CYP1A1 in cardiovascular disease susceptibility

HPLC Method for Quantification of Oxidative Stress by Salicilate Hydroxylation in Human Plasma

The aim of the present study was to modify and validate a high-performance liquid chromatographic (HPLC) method for determining 2,3 and 2,5 dihydroxybenzoic acid (2,3-DHBA and 2,5-DHBA) from salicylic acid in human plasma. The mobile phase was a mixture of sodium acetate/citrate (pH 2.5) 30 mM-methanol (93:7, v/v). The injection volume was 10 µL. Retention time for 2,5- DHBA, and 2,3-DHBA was 4.5 ± 0.10 and 5.8 ± 0.15 min, respectively. The detection and quantification limits were 10 and 40 nM for 2,3-DHBA and 8 and 20 nM for 2,5-DHBA. Linearity was evaluated in the range of 40–1600 nM for both metabolites. Inter-and intra-analysis variation coefficient was below 10%. Good recoveries of more than 99% were obtained for both metabolites using this method

Polimorfismos de las superfamilias de transportadores de membrana ABC, SLC y su efecto farmacocinético

La variabilidad interindividual se asocia con la respuesta a fármacos y el fallo terapéutico, por lo cual, los estudios farmacogenómicos se han incrementado en los últimos años. Se realizó una revisión bibliográfica sistemática de artículos científicos en la base de datos PubMed, sobre el efecto de los polimorfismos de los transportadores de membrana sobre la farmacodinamia y farmacocinética en el periodo comprendido de enero de 2005 a noviembre de 2019. Se encontró registro de 15,782 publicaciones sobre estudios farmacogenómicos en humanos, 26,234 publicaciones relacionadas a la familia abc y 416 a la familia slc. Sobre publicaciones en las cuales evaluaron los polimorfismos de los transportadores se obtuvo el registro de 3,895 sobre la familia de transportadores abc y 321 de la familia slc. Los polimorfismos de un solo nucleótido (snp) que presentan los transportadores se asociaron a las modificaciones en la farmacocinética y/o farmacodinamia de los diferentes fármacos. Los investigadores mostraron mayor interés por el estudio de los polimorfismos de la familia de transportadores abc sobre los polimorfismos de la familia slc

Prevalence of Chlamydia trachomatis Infection in Registered Female Sex Workers in Northern Mexico

Background Little is known about the epidemiology of Chlamydia trachomatis infection in female sex workers (FSWs) in Mexico. Goal The goal of the study was to determine the prevalence of C trachomatis infection in registered FSWs from northern Mexico and to determine the sociodemographic characteristics associated with the infection. Study Design An enzyme immunoassay was used to test 354 FSWs in three northern Mexican cities for cervical C trachomatis infection. All participants were registered in a government health office. Recruitment was consecutive and voluntary. The association between clinical and sociodemographic characteristics of FSWs and C trachomatis infection was evaluated. Results The overall prevalence of C trachomatis infection among participants in the three cities was 12.4%. Women of low socioeconomic level and those younger than 25 years were the most frequently infected. Among FSWs in Durango, a higher frequency of C trachomatis infection was found for those who did not use condoms. Conclusion C trachomatis is an important pathogen in the sexually transmitted diseases of registered FSWs in northern Mexico

Determinación del efecto antibacteriano y antimicótico del extracto etanólico de mucílago de nopal

El mucilago de Opuntia ficus-indica es un compuesto muy complejo que tiene la capacidad de formar redes moleculares y retener fuertemente grandes cantidades de agua, es un biopolímero compuesto por polisacáridos semejantes a las pectinas dentro de los cuales se destacan arabinosa, galactosa, ramnosa, xilosa y ácido galacturónico (Gutiérrez-Cortez, 2011). Existe evidencia de que el extracto metanólico de Opuntia ficus-indica tiene efectos bactericidas en el crecimiento de Campylobacter jejuni, Campylobacter coli y Vibrio cholerae (El-Mostafa et.al., 2014). También existe evidencia de la actividad inhibitoria de los polifenoles contenidos en la planta, contra Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Bacillus cereus, Pseudomonas aeruginosa y Salmonella spp (Dhaouadi et.al., 2013). El objetivo fue determinar la capacidad antimicrobiana del extracto etanólico del mucílago de nopal. Metodología. Se obtuvo mucilago mediante una extracción etanólica de la cual el mucilago fue recolectado y puesto a secar al sol para después ser pulverizado. Para la caracterización de los microorganismos se le realizaron pruebas bioquímicas y tinción de Gram para asegurar que se trataba del microorganismo en cuestión. Se pusieron a prueba Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Bacillus subtilis, Staphylococcus epidermidis, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella sp., Pseudomonas aeruginosa, Candida krusei y Aspergillus niger; mediante un vaciado en placa con cultivos estandarizados a una escala de 0,5 McFarland; se colocaron discos impregnados con diferentes concentraciones del extracto, los cuales se incubaron 24 horas a 37 °C, para las bacterias y la especie levaduriforme, 5 días para A. niger, para posteriormente determinar la concentración inhibitoria mínima (CIM), después se realizaron pruebas con un kit que mide la viabilidad celular para evaluar la supervivencia de las células ante la exposición al extracto. Resultados. Para S. aureus, S. epidermidis y K. pneumoniae la CIM fue de 10 mg/ml, para E. faecalis 15 mg/ml, para B. subtilis de 50 mg/ml, para E. coli 25 mg/ml para Salmonella 5 mg/ml, P. aeuruginosa, Candida krusei y Aspergillus niger presentan resistencia al extracto; la evaluación de viabilidad la CIM se encontró entre 1 y 5 mg/ml para todos las microorganismos. Conclusión. Con los resultados obtenidos en las pruebas realizadas, se puede inferir que los compuestos presentes en el extracto etanólico del mucilago de nopal tienen un efecto antimicrobiano sobre el desarrollo de las bacterias y hongos mencionados, las diferencias de los resultados de CIM entre una metodología y otra pueden deberse a la difusión del extracto en el agar para la primer metodología y a la solubilidad del extracto para la segunda.Trabajo publicado en Acta Bioquímica Clínica Latinoamericana; no. 52, supl. 2, parte I, diciembre de 2018.Universidad Nacional de La Plat

Paternal Determinants in Preeclampsia

Preeclampsia is a condition associated with high rates of maternal-fetal morbidity and mortality. It usually occurs in 3–10% of nulliparous women and 18% of previously affected women. Different lines of evidence have demonstrated the role of the father in the onset of preeclampsia. The placenta is the cornerstone of preeclampsia and poses important paternal genetic determinants; in fact, the existence of a “paternal antigen” has been proposed. Nulliparity is a well-known risk factor. Change of partner to a woman without history of preeclampsia increases the risk; however, this change decreases in women with history of the condition. High interval between pregnancies, short sexual intercourse before pregnancy, and conception by intracytoplasmic sperm injection suggest a limited exposure to the so-called paternal antigen. A man who was born from a mother with preeclampsia also increases the risk to his partner. Not only maternal but also paternal obesity is a risk factor for preeclampsia. Fetal HLA-G variants from the father increased the immune incompatibility with the mother and are also significantly associated with preeclampsia in multigravida pregnancies. An analysis of a group of Swedish pregnant women showed that the risk for preeclampsia is attributable to paternal factors in 13% of cases, which could be related to genetic interactions with maternal genetic factors. This review aimed to evaluate the evidences of the father’s contribution to the onset of preeclampsia and determine the importance of including them in future studies

Estrés oxidativo: promotor de enfermedades

La presencia de enfermedades crónico-degenerativas en la población es un problema de salud pública que ha cobrado mayor relevancia, ya que se están presentando con mayor frecuencia a edades más tempranas, siendo sus complicaciones las principales causas de demanda en centros de atención a la salud en México. En estos casos, como en otras patologías, el estrés oxidativo representa un factor importante que está participando activamente en el desarrollo del proceso salud-enfermedad, por lo que es necesario entonces identificar su origen, desarrollo e impacto en los procesos biológicos que propician los padecimientos y con ello llegar a establecer las medidas de prevención y/o control, que puedan traducirse en mejorar el estado de salud de las personas en donde este tipo de estrés tenga una marcada intervención