Combinación de herramientas moleculares para la identificación de estirpes comerciales de Bradirhizobios para la soja

La soja es una planta exótica en la Argentina en donde los suelos carecen de los simbiontes específicos que nodulan esta leguminosa. A partir de la introducción de su cultivo en la Argentina se establecieron en los suelos poblaciones naturales que habitualmente compiten con los rizobios incorporados por medio de los inoculantes. De esta manera se ve comprometido el éxito de un proceso clave como es el de la inoculación, para que la planta desarrolle nódulos fijadores de N con las estirpes de rizobios seleccionados. En la Argentina, Brasil y Uruguay se utilizan distintas cepas para la formulación de inoculantes comerciales, por lo que es importante disponer de herramientas que permitan diferenciar rápidamente a estas estirpes de Bradyrhizobios. Por ello el objetivo de este trabajo fue desarrollar un conjunto de reacciones que permitan discriminar a los Bradyrhizobios de los inoculantes comerciales. Es decir, que permitan controlar la calidad de un inoculante comercial en lo que hace a su contenido. Para tal fin se combinaron reacciones de amplificación utilizando REP-PCR, BOX-PCR, multiplex-PCR y la amplificación de un fragmento interno de RS alfa. Los inoculantes comerciales que se utilizan en Brasil, Uruguay y Argentina se formulan preferentemente con cinco cepas, tres Bradyrhizobium japonicum (E109, SEMIA5079 y SEMIA5080) y dos Bradyrhizobium elkanii (SEMIA587 y SEMIA5019). La combinación de las reacciones mencionadas permite diferenciar a estas cepas en cultivos puros y a partir de colonias

Closely related strains of <i>Bradyrhizobium</i> contained in commercial inoculates of soybean are identified by a set of PCR reactions

The aim of this work was to identify closely related rhizobia, used to formulate commercial inoculants, using polymerase chain reaction (PCR). Repetitive extra-genic palindromic (REP) and BOX fingerprints hardly discriminate among a set of commercial strains. PCR targeted at repetitive RSα successfully allow discriminating within representatives of Bradyrhizobium. These fingerprints clustered isolates at a higher level of similarity and proved to be an important tool to complement the information provided by the other markers. The results suggest that mutants occur along the bacterial culture, during inoculant production. However, independently of the number of amplification reactions used to characterize and identify organisms, mispriming always generates artifactual diversity. In addition to this, it seems that combining reactions such as BOX or REP fingerprinting with reactions targeted at the RSα sequence, generates a more reliable identification tool to characterize closely related bradyrhizobia.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Temporal dynamics of revision during the writing of reviews at university

En este estudio analizamos desde un enfoque cognitivo la distribución temporal de las actividades de revisión de estudiantes universitarios en el proceso de producción de reseñas académicas. El supuesto de partida es que la distribución temporal de las actividades de revisión tiene impacto en la calidad textual. Con la finalidad de indagar tal supuesto, estudiamos mediante técnicas online cómo se distribuyen a lo largo del proceso de escritura dos actividades de revisión: “leer el texto escrito hasta el momento” y “modificar el propio texto”. Indagamos tal distribución temporal atendiendo a tres momentos (inicio, medio y fin) y consideramos la relación de la distribución en el tiempo con la calidad de la reseña escrita (calidad baja y alta). Los resultados obtenidos sugieren la existencia de diferencias en la distribución temporal de la revisión en función de la calidad textual. Así, mientras que los escritores de textos de calidad baja incrementan más notoriamente al final el tiempo dedicado a la revisión, los escritores de textos de calidad alta aumentan la revisión progresivamente de principio a fin. En relación con las dos actividades de revisión, los resultados muestran que los escritores de textos de calidad alta, hacia el final del proceso, dan prioridad a la lectura de su propio escrito frente a la modificación del mismo, al contrario de lo que sucede con los escritores de textos de calidad baja.The present study aims to analyze the orchestration of revision activities in reviews written by university students. On the basis of a cognitive approach, we use online techniques to collect data. We assume that temporal distribution of revision activities impacts on text quality. In this study we considered two revision activities: text reading and text modification. These activities were identified by students during the writing process. We have evaluated how the orchestration of the revision activities alters the text quality (either high or low text quality), according to three temporal intervals of equal length (beginning , middle and end). The obtained results suggest differences in the temporary distribution of texts’ revision based on the text quality. Thus, while low quality texts writers increase the amount of time spent on texts’ revision, high quality texts writers conspicuously increase their review progressively from beginning to end. In relation to the two revision activities, the results show that high quality writers prioritize reading their own texts over modifying them towards the end of the process, contrary to what low quality text writers do.Fil: Aguirre, Luis Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Filosofía y Letras; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ingeniería; ArgentinaFil: Negri, Silvina Analía. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Filosofía y Letras; ArgentinaFil: López, Silvina Marianela Yanil. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad del Aconcagua; Argentin

Análisis de inoculantes comerciales

Analisis de inoculantes comerciales, mediante recuento de unidades formadoras de colonias, aislamiento, PCRmultiplex y RS α y REP-PCR

Los suelos con historia del cultivo de soja contienen cepas de Bradyrhizobium que difieren en su capacidad para metabolizar el glifosato

En este estudio se comparan los efectos de aplicar diferentes concentraciones de glifosato, sobre el desarrollo y crecimiento bacteriano de un conjunto de 10 cepas entre las que se incluyen como controles, B. japonicum, cepas E109 y SEMIA5080 y B. elkanii, cepa SEMIA587

Enterobacteria isolated from an agriculturalsoil of Argentina promote plant growth and biocontrol activity of plant pathogens

Bacteria promote growth by different mechanisms like phosphate (Pi) solubilization, Indol Acetic Acid (IAA) synthesis and siderophores production. The purpose of this study was to isolate bacteria that promote the growth of plants and may also act as antagonistic organisms of plant pathogens. Pi solubilizing microorganisms that were isolated from the soils of Tres Arroyos, Buenos Aires; were also able to synthesize IAA and produce siderophores. The ability of these bacteria to solubilize Pi was directly related with the synthesis of organic acids that lowered the pH and was not related with phosphatase activity. The ability of the organisms to solubilize Pi was indirectly related with the amount of soluble Pi present in the media. Though Pi solubilizing microorganisms are mainly associated with the rhizoplane exudates, in this case did not induce Pi solubilization. In addition to promote plant growth, these bacteria proved to be antagonistic of plant pathogens such as Fusarium graminearum and F. solani.Las bacterias que promueven el crecimiento vegetal lo hacen por diferentes mecanismos como la solubilización de fósforo, la síntesis de ácido indolacético y la producción de sideróforos. El objetivo de este trabajo fue aislar bacterias que promuevan el crecimiento de plantas y que también puedan actuar como organismos antagónicos de los hongos fitopatógenos. Los microorganismos fueron aislados de suelos de Tres Arroyos, pcia de Bs As y se encontraron bacterias solubilizadoras de fosfato inorgánico, que también sintetizan ácido indol acético y sideróforos. La capacidad de estas bacterias para solubilizar fosfatos (Pi) podría estar directamente relacionada con la síntesis de ácidos orgánicos que disminuyen el pH y no guardan relación con la actividad de la fosfatasa. La capacidad de los organismos para solubilizar Pi se relacionó indirectamente con la cantidad de Pi soluble presente en los medios. La capacidad de los microorganismos solubilizadores de Pi está principalmente asociada con el efecto de los exudados presentes en el rizoplano, sin embargo, esto no ocurrió en el caso de las bacterias evaluadas en el presente trabajo. Además de promover el crecimiento de las plantas, estas bacterias demostraron ser antagónicas de patógenos de plantas como Fusarium graminearum y F. solani

In silico screening of genes coding for secondary metabolites in the phytopathogenic fungus Stemphylium lycopersici

Secondary metabolites (SMs) are a highly diverse set of low molecular weight bioactive compounds that play different biological roles. They are dispensable when microorganism are cultivated in vitro, but usually play a key role in nature, providing organisms with adaptive advantages in different niches. Among them, toxins produced by phytopathogenic fungi play crucial roles in virulence and host nutrition. We hypothesized that the genome of Stemphylium lycopersici strain CIDEFI-216, an etiological agent of tomato gray leaf spot, contains several gene clusters that code for the synthesis of SMs, such as those involved in the biosynthesis of virulence factors. We searched by means of the bioinformatic tools Secondary Metabolite Unknown Region Finder (SMURF) and Antibiotics and Secondary Metabolite Analysis Shell (antiSMASH) enabling the ClusterFinder algorithm for potential SMs gene clusters within the draft genome sequence of the fungus. This lead to the prediction of 32, 33 and 64 additional SMs gene clusters by SMURF, antiSMASH and ClusterFinder, respectively. They included polyketides synthase (PKS), non-ribosomal peptide synthase (NRPS), terpene synthase, dimethylallyl tryptophan synthase, hybrid PKS-NRPS, lanthipeptide synthase, fatty acid synthase and others gene clusters of unknown nature. This knowledge provides critical information to understand the biological bases of the tomato-S. lycopersici interaction

Draft Genome Sequence and Gene Annotation of <i>Stemphylium lycopersici</i> Strain CIDEFI-216

Stemphylium lycopersici is a plant-pathogenic fungus that is widely distributed throughout the world. In tomatoes, it is one of the etiological agents of gray leaf spot disease. Here, we report the first draft genome sequence of S. lycopersici, including its gene structure and functional annotation.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale