Riqueza de protistas en la presa El Cajón, Querétaro, México: aproximación temporal y espacial

Background. Although protists are important components of aquatic ecosystems and microhabitats, their knowledge in Mexico is scarce, making it relevant to contribute with studies of their diversity in the country. Objective. In this study, protist diversity and its spatial and temporal variation are documented in an urban dam in Querétaro, México. Methods. Superficial samplings were performed each week from August 2015 to July 2016 in two points of the dam: one towards its middle part and another in its posterior part. Richness and composition of taxa, both spatially and temporally, as well as the relationship of the communities with precipitation and atmospheric temperature, were compared using species richness comparison analyses at the same sample coverage and multivariate techniques. Results. 17 taxa were determined, belonging to phyla Amoebozoa, Euglenozoa, Ciliophora and Heliozoa. 11 new records are provided for Querétaro, which is part of the semi-arid areas in the center of the country. The most frequent species in the sampling were Coleps hirtus, Paramecium caudatum, and Stentor coeruleus. The taxon composition between the sampling points was different and showed two richness peaks and two different communities in the year, which corresponded to wet and dry seasons. Conclusions. Seasonality plays an important role in the establishment and development of protist communities in the El Cajón dam.Antecedentes. Pese a que los protistas son componentes importantes en los ecosistemas y microhábitats acuáticos, en México su conocimiento es escaso, por lo que es relevante contribuir con estudios de su diversidad en el país. Objetivo. En este trabajo se documenta la diversidad de protistas y su variación espacial y temporal en una presa urbana en Querétaro, México. Métodos. Se realizaron muestreos superficiales cada semana durante el periodo de julio 2015 a julio 2016 en dos puntos de la presa, uno hacia su parte media y otro en su parte posterior. Se comparó la riqueza y la composición de los taxones tanto espacial como temporalmente, así como la relación de las comunidades con la precipitación y la temperatura atmosférica, con ayuda de análisis de comparación de la riqueza de especies a una misma cobertura de muestra y de técnicas multivariadas. Resultados. Se determinó un total de 17 taxones pertenecientes a los phyla Amoebozoa, Euglenozoa, Ciliophora y Heliozoa. Se aportan 11 registros nuevos para el estado de Querétaro, que es parte de las zonas semiáridas del centro del país. Las especies más frecuentes en los muestreos fueron Coleps hirtus,  Paramecium caudatum y Stentor coeruleus. La composición de los taxones entre los puntos de muestreo fue diferente, y en el año presentaron dos picos de riqueza y dos comunidades diferentes, que correspondieron a las temporadas de lluvias y de sequía. Conclusiones. La estacionalidad juega un papel importante para el desarrollo y establecimiento de las comunidades de protistas en la presa El Cajón

SEASONAL VARIATION IN BIRD ASSEMBLAGE COMPOSITION IN A DRY FOREST OF SOUTHWESTERN MEXICO

Abstract · Tropical dry forests are characterized by a marked seasonality throughout the year. The response of bird assemblages and species abundance to the seasonal changes of dry forests, as evidenced by bird feeding habits, can contribute to a greater understanding of the ecological processes in this ecosystem. In this study, we estimated variations in richness, abundance and composition of bird assemblages as well as their main feeding habits during two seasons of the year (dry and rainy) in a tropical dry forest in southwestern Mexico. Visual and auditory sampling was performed from February 2010 to February 2011 with a fixed-radius point count method (123 point counts distributed across nine transects). A total of 82 bird species belonging to 28 families were recorded in the study area. Although we found more species and a higher abundance in the dry season than in the rainy season, only the abundance of insectivorous-frugivorous and omnivorous birds was significantly higher. According to an ordination analysis, the composition and abundance of bird assemblage changed seasonally. A total of 21 resident birds were found in the dry season (March–June). Some omnivorous and granivorous birds, such as Streak-backed Oriole (Icterus pustulatus) and Blackchested Sparrow (Peucaea humeralis), were the most abundant species in both seasons. Other species, such as Western Kingbird (Tyrannus verticalis) and Golden-cheeked Woodpecker (Melanerpes chrysogenys), both insectivorous-frugivorous, were also abundant in two seasons. The greater diversity of avian feeding guilds in the dry season could be influenced by the reproductive activity that occur during this season and by the presence of Bursera fruits, as confirmed in other studies. Resumen · Variación estacional en la composición de ensambles de aves en un bosque tropical seco del suroeste de México Los bosques tropicales secos se caracterizan por una marcada estacionalidad climática a lo largo del año. Comprender la respuesta de los ensambles de aves y la abundancia de las especies de acuerdo a sus hábitos de alimentación, respecto a los cambios estacionales en el bosque seco, contribuye al conocimiento de los procesos ecológicos en este ecosistema. En este estudio, estimamos la variación de la riqueza, abundancia y composición de las aves y sus tipos de dieta en dos estaciones del año (secas y lluvias) en un bosque tropical seco al suroeste de México. Se realizaron muestreos visuales y auditivos durante un año (febrero de 2010 a febrero de 2011), con el uso de puntos de conteo de radio fijo (123 puntos distribuidos en nueve transectos). Se registró un total de 82 especies de aves que pertenecen a 28 familias. La estación seca presentó mayor riqueza de especies y abundancia de aves que la estación lluviosa, pero solo la abundancia de las aves insectívoro-frugívoras y omnívoras fue significativamente mayor en la estación seca. De acuerdo al análisis de ordenación, la composición y abundancia del ensamble de aves cambió estacionalmente. Se encontró un total de 21 aves residentes en los meses secos del año, que corresponde a la temporada reproductiva (marzo–junio). Algunas aves omnívoras y granívoras como la calandria dorso rayado (Icterus pustulatus) y el zacatonero pecho negro (Peucaea humeralis) fueron las más abundantes en ambas temporadas. Otras especies como tirano pálido (Tyrannus verticalis) y carpintero enmascarado (Melanerpes chrysogenys), ambas insectívoro-frugívoras, también fueron abundantes en las dos estaciones. La mayor diversidad de gremios alimenticios de las aves en la estación seca podría estar influenciada por las actividades reproductivas que transcurren durante esta temporada, y por la presencia de frutos de Bursera spp., como se ha observado en otros estudios

Human papillomavirus type 16 variants in cervical intraepithelial neoplasia and invasive carcinoma in San Luis Potosí City, Mexico

"Background In San Luis Potosí City cervical infection by human papillomavirus type 16 (HPV16) associated to dysplastic lesions is more prevalent in younger women. In this work HPV16 subtypes and variants associated to low-grade intraepithelial lesions (LSIL), high-grade intraepithelial lesions (HSIL) and invasive cervical cancer (ICC) of 38 women residing in San Luis Potosí City were identified by comparing their E6 open reading frame sequences. Results Three European (E) variants (E-P, n = 27; E-T350G, n = 7; E-C188G, n = 2) and one AA-a variant (n = 2) were identified among the 38 HPV16 sequences analyzed. E-P variant sequences contained 23 single nucleotide changes, two of which (A334G, A404T) had not been described before and allowed the phylogenetic separation from the other variants. E-P A334G sequences were the most prevalent (22 cases, 57.9%), followed by the E-P Ref prototype (8 cases, 21.1%) and E-P A404T (1 case, 2.6%) sequences. The HSIL + ICC fraction was 0.21 for the E-P A334G variants and 0.00 for the E-P Ref variants. Conclusion We conclude that in the women included in this study the HPV16 E subtype is 19 times more frequent than the AA subtype; that the circulating E variants are E-P (71.1%) > E-T350G (18.4%) > E-C188G (5.3%); that 71.0% of the E-P sequences carry the A334G single nucleotide change and appear to correspond to a HPV16 variant characteristic of San Luis Potosi City more oncogenic than the E-P Ref prototype.

Nueva información para la avifauna del estado de Querétaro, México

We present new information about 24 species, including 12 noteworthy records for the avifauna of the Mexican state of Queretaro. These data were gathered during fieldwork performed between 1993 to 2007, mainly in the Eje Neovolcánico province. Five species are considered protected under Mexican law NOM-059-SEMARNAT-2001: Buteogallus anthracinus, Buteo albonotatus, Trogon collaris, Turdus infuscatus and Vermivora crissalis. The checklist of birds present in Queretaro is now at least 347 species.Presentamos información nueva de 24 especies, incluyendo 12 nuevos registros de aves para el estado de Querétaro, México. Estos datos fueron obtenidos en diversos estudios de campo de 1993 a 2007, principalmente en la provincia del Eje Neovolcánico. Cinco especies están bajo alguna categoría de riesgo según la NOM-059-SEMARNAT-2001: Buteogallus anthracinus, Buteo albonotatus, Trogon collaris, Turdus infuscatus y Vermivora crissalis. Con estas adiciones el listado de aves de Querétaro se incrementa al menos a 347 especie

Nueva información para la avifauna del estado de Querétaro, México

We present new information about 24 species, including 12 noteworthy records for the avifauna of the Mexican state of Queretaro. These data were gathered during fieldwork performed between 1993 to 2007, mainly in the Eje Neovolcánico province. Five species are considered protected under Mexican law NOM-059-SEMARNAT-2001: Buteogallus anthracinus, Buteo albonotatus, Trogon collaris, Turdus infuscatus and Vermivora crissalis. The checklist of birds present in Queretaro is now at least 347 species.Presentamos información nueva de 24 especies, incluyendo 12 nuevos registros de aves para el estado de Querétaro, México. Estos datos fueron obtenidos en diversos estudios de campo de 1993 a 2007, principalmente en la provincia del Eje Neovolcánico. Cinco especies están bajo alguna categoría de riesgo según la NOM-059-SEMARNAT-2001: Buteogallus anthracinus, Buteo albonotatus, Trogon collaris, Turdus infuscatus y Vermivora crissalis. Con estas adiciones el listado de aves de Querétaro se incrementa al menos a 347 especie

Relationship Between Bird Diversity and Habitat along a Pine- Oak Successional Forest in Southern Mexico

Few studies have related bird species richness and abundance with vegetation structure at different successional stages in pine-oak forests of Mexico. We studied changes in the bird community across three successional stages of pine-oak forest: early, intermediate, and mature. Also, we related bird community attributes—including generalist and specialist birds—with vegetation variables. We analyzed the vegetation and estimated bird abundances in 10-min-count periods in 10 circular plots per successional stage. We recorded a total of 71 bird species: 21 were specialists and 50 were generalists. The completeness of species richness was between 79 and 88% in the sampled habitats. Diversity profiles were consistently larger in the intermediate stage, except for its species richness that was not different between this and the early stage. We found a more richness and a higher number of individuals of generalist in the early and intermediate stages. The abundance of specialists was higher in the mature forest. An ordination analysis showed that generalists were associated to different variables. This suggests that these species can adapt to different forest conditions. Some specialist birds were more abundant in sites with high dominance of trees. Our results confirm the importance of maintaining not only mature forests but also young successional stages in order to conserve the species typical of secondary pine-oak forest bird species

mtDNA Haplogroup A Enhances the Effect of Obesity on the Risk of Knee OA in a Mexican Population

[Abstract] To evaluate the influence of mitochondrial DNA haplogroups on the risk of knee OA in terms of their interaction with obesity, in a population from Mexico. Samples were obtained from (n = 353) knee OA patients (KL grade ≥ I) and (n = 364) healthy controls (KL grade = 0) from Mexico city and Torreon (Mexico). Both Caucasian and Amerindian mtDNA haplogroups were assigned by single base extension assay. A set of clinical and demographic variables, including obesity status, were considered to perform appropriate statistical approaches, including chi-square contingency tables, regression models and interaction analyses. To ensure the robustness of the predictive model, a statistical cross-validation strategy of B = 1000 iterations was used. All the analyses were performed using boot, GmAMisc and epiR package from R software v4.0.2 and SPSS software v24. The frequency distribution of the mtDNA haplogroups between OA patients and healthy controls for obese and non-obese groups showed the haplogroup A as significantly over-represented in knee OA patients within the obese group (OR 2.23; 95% CI 1.22-4.05; p-value = 0.008). The subsequent logistic regression analysis, including as covariate the interaction between obesity and mtDNA haplogroup A, supported the significant association of this interaction (OR 2.57; 95% CI 1.24-5.32; p-value = 0.011). The statistical cross-validation strategy confirmed the robustness of the regression model. The data presented here indicate a link between obesity in knee OA patients and mtDNA haplogroup A.This work is supported by Grants from Fondo de Investigación Sanitaria (PI17/00210, PI16/02124, PI20/00614, RETIC-RIER-RD16/0012/0002 and PRB3-ISCIII-PT17/0019/0014) integrated in the National Plan for Scientific Program, Development and Technological Innovation 2013–2016 and funded by the ISCIII-General Subdirection of Assessment and Promotion of Research-European Regional Development Fund (FEDER) “A way of making Europe” and Grant IN607A2017/11 from Xunta de Galicia. The authors further acknowledge AE CICA-INIBIC (ED431E 2018/03) for financial support. IRP is supported by Contrato Miguel Servet-II Fondo de Investigación Sanitaria (CPII17/00026) and AD-S is supported by Grant IN606A-2018/023 from Xunta de Galicia, Spain. The Biomedical Research Networking Center (CIBER) is an initiative from Instituto de Salud Carlos III (ISCIII)Xunta de Galicia; IN607A2017/11Xunta de Galicia; ED431E 2018/03Xunta de Galicia; IN606A-2018/02

Impact of COVID-19 on cardiovascular testing in the United States versus the rest of the world

Objectives: This study sought to quantify and compare the decline in volumes of cardiovascular procedures between the United States and non-US institutions during the early phase of the coronavirus disease-2019 (COVID-19) pandemic. Background: The COVID-19 pandemic has disrupted the care of many non-COVID-19 illnesses. Reductions in diagnostic cardiovascular testing around the world have led to concerns over the implications of reduced testing for cardiovascular disease (CVD) morbidity and mortality. Methods: Data were submitted to the INCAPS-COVID (International Atomic Energy Agency Non-Invasive Cardiology Protocols Study of COVID-19), a multinational registry comprising 909 institutions in 108 countries (including 155 facilities in 40 U.S. states), assessing the impact of the COVID-19 pandemic on volumes of diagnostic cardiovascular procedures. Data were obtained for April 2020 and compared with volumes of baseline procedures from March 2019. We compared laboratory characteristics, practices, and procedure volumes between U.S. and non-U.S. facilities and between U.S. geographic regions and identified factors associated with volume reduction in the United States. Results: Reductions in the volumes of procedures in the United States were similar to those in non-U.S. facilities (68% vs. 63%, respectively; p = 0.237), although U.S. facilities reported greater reductions in invasive coronary angiography (69% vs. 53%, respectively; p < 0.001). Significantly more U.S. facilities reported increased use of telehealth and patient screening measures than non-U.S. facilities, such as temperature checks, symptom screenings, and COVID-19 testing. Reductions in volumes of procedures differed between U.S. regions, with larger declines observed in the Northeast (76%) and Midwest (74%) than in the South (62%) and West (44%). Prevalence of COVID-19, staff redeployments, outpatient centers, and urban centers were associated with greater reductions in volume in U.S. facilities in a multivariable analysis. Conclusions: We observed marked reductions in U.S. cardiovascular testing in the early phase of the pandemic and significant variability between U.S. regions. The association between reductions of volumes and COVID-19 prevalence in the United States highlighted the need for proactive efforts to maintain access to cardiovascular testing in areas most affected by outbreaks of COVID-19 infection

Diversidad y conservación de aves acuáticas en una zona semiárida del centro de México

Se analizan los patrones espacio – temporales de la diversidad y su posible aplicación a propuestas de conservación de los ensambles de aves acuáticas en un sistema de embalses con diferentes tamaños y condiciones ambientales situado en la zona semiárida del estado de Querétaro. Se analiza el ensamblaje, composición y estructura de los ensambles, así como las preferencias de hábitat de especies y gremios. El muestreo de las aves se realizó mensualmente durante dos ciclos anuales y se obtuvieron datos morfométricos, ambientales y de paisaje de los embalses. Se emplearon diversas técnicas para el análisis estadístico y de la diversidad. La riqueza total encontrada fue de 69 especies, la cual se equipara al conjunto (pool) regional de especies por el alto nivel de eficiencia encontrado para los muestreos. Esto demuestra la importancia de la zona semiárida del centro del país por su alta riqueza de especies. Una tercera parte de las especies son residentes permanentes y al menos 14 de ellas se reproducen en la zona de estudio; otras dos terceras partes son residentes de invierno y migratorias en tránsito y son un elemento importante en la comunidad e indispensable en el análisis de la diversidad de las aves acuáticas del centro de México. En general, alguna de las variables de área, perímetro, forma (cociente área/perímetro), vegetación y poca pendiente del terreno se relacionaron positivamente con las diversidades alfa y beta, con la abundancia total y con el patrón de anidamiento; algunos nutrientes fosfatados lo hicieron con la diversidad alfa y la abundancia; mientras que algunas medidas de nitritos y nitratos se relacionaron negativamente con la diversidad alfa. Se observó una relación especies – área en ambos ciclos, con una pendiente baja y un “efecto de islas pequeñas” que implica que los embalses menores en general a 31,5 ha no hay relación entre la riqueza y el área, sino con otras variables como la vegetación. Los embalses “pequeños” presentan además una mayor diversidad beta y un menor patrón de anidamiento en su riqueza de especies. En el conjunto de los ensambles, las diversidades alfa y beta tuvieron una participación equitativa en gamma y un patrón de anidamiento más elevado pero aún incompleto. En los ensambles se tiende a una homogeneidad en la riqueza de especies por gremio y a una misma estructura (patrón de distribución de las abundancias relativas de las especies); mientras que la composición presentó grandes cambios entre embalses y ciclos. En cuanto los patrones temporales, resalta la homogeneidad (por rarefacción) de la riqueza total de especies por ciclo y la amplia variación de la abundancia total entre un ciclo y otro. Los resultados obtenidos en este estudio son congruentes con los postulados de que el ambiente y la competencia interespecífica tienen un papel importante en la determinación de la estructura de la comunidad. Al conjuntar los resultados con los datos aportados por diferentes estudios, es posible visualizar una dinámica regional donde los embalses con menor riqueza y tamaño debieran tener una mayor inestabilidad relativa mientras que el ensamble de las especies a nivel regional tiende una mayor estabilidad. Esto esta de acuerdo con la propuesta de que las comunidades están organizadas a múltiples escalas y que las interacciones entre dichas escalas determinan los patrones locales y regionales de la riqueza de especies. En esta dinámica se pueden englobar los patrones de diversidad observados y las propuestas de lineamientos para acciones de conservación que se discuten en este trabajo: mayor número de embalses a involucrar, uso de sistemas de embalses, uso de los embalses pequeños y enfoque de cuencas en el manejo de los embalses. El enfoque conceptual, los métodos y resultados de este trabajo se enmarcan en una perspectiva moderna de la investigación ecológica en la cual se reconoce que la biodiversidad de las comunidades locales está profundamente marcada por influencias que provienen de una escala regional, por lo que es necesario adoptar enfoques de estudio a escalas grandes para alcanzar progresos en el entendimiento de los procesos que generan los patrones de la biodiversidad.Programa de Mejoramiento del Profesorado (PROMEP), Secretaría de Educación Pública de México