Cartographie de nucléosomes à des gènes régulés par le récepteur à la dioxine (AHR)

Dans les cellules eucaryotes, l’ADN est organisé en une structure nommée la chromatine, qui permet sa compaction dans le noyau principalement grâce à des protéines nommées les histones. Ces hauts niveaux de compaction constituent une barrière à plusieurs processus cellulaires impliquant l’ADN, tel que la transcription. Dans le laboratoire, nous nous intéressons particulièrement à la régulation de la transcription de gènes cibles de AhR, plus particulièrement des gènes CYP1A1 et CYP1B1, dont les enzymes sont impliquées dans le métabolisme de divers polluants environnementaux. Les travaux effectués lors de ma maîtrise sont basés sur l’hypothèse que la dynamique et le positionnement des nucléosomes vont influencer l’expression de CYP1A1 et CYP1B1 en réponse au TCDD. La technique de MNase-seq a permis de visualiser le positionnement putatif de nucléosomes aux promoteurs de ces deux gènes, ainsi que de comparer le positionnement de nucléosomes avant et après induction des gènes en réponse au TCDD. À la lumière de ces résultats, peu de variations dans le positionnement de nucléosomes ont été observées aux deux gènes avant et après induction par le TCDD. Cependant, ceci n’exclut pas que des changements aient lieux, mais ils sont peut-être subtils et la technique utilisée manque de résolution pour nous permettre de les observer. Afin de vérifier les résultats de MNase-seq, nous avons utilisé d’autres techniques pour examiner le positionnement de nucléosomes à CYP1A1 et CYP1B1, ainsi que la présence ou l’absence du variant d’histone H2A.Z. Des expériences de ChIPs et Mono-ChIPs ont été effectués, et les résultats obtenus à CYP1A1 corrèlent avec ceux de MNase-seq. Cependant, ceux obtenus à CYP1B1 ne corrèlent pas avec ceux observés en MNase-seq. En effet, on observe une perte marquée de H3 et H2A.Z aux XREs 2 et 3, ce qui suggère une perte potentielle de nucléosome(s) à cet endroit, qui n’a pas été observé avec le MNase-seq. Les résultats générés lors de mes travaux de maîtrise procurent les premières cartes à haute résolution du positionnement de nucléosomes aux promoteurs des gènes CYP1A1 et CYP1B1. De plus, ils renforcent davantage l’idée que des mécanismes différents sont impliqués dans la régulation de CYP1A1 et CYP1B1. En effet, l’influence de la chromatine et du variant d’histone H2A.Z sur la régulation de la transcription de ces deux gènes s’exerce possiblement par des mécanismes différents, mais plus de travaux sont nécessaires pour approfondir nos connaissances sur ces mécanismes

Utilisation des alliages ferreux dans la construction monumentale du Moyen Age. Etat des lieux de l'avancée des études métallographiques et archéométriques

L'étude métallographique des fers de construction mis en œuvre dans certains grands édifices français des périodes médiévales et modernes apporte de nombreuses informations sur les caractéristiques du matériau utilisé tout comme sur l'histoire de la métallurgie du fer, en même temps qu'elle soulève de nombreuses interrogations. Les résultats accumulés depuis quelques années permettent de mettre en valeur différents points. Tout d'abord, il semble que les grands édifices médiévaux sont pour la plupart renforcés uniquement avec du fer de réduction directe. En région rouennaise, la période de transition identifiée par analyse des inclusions se situe à la fin du XVe siècle, ce qui correspond à l'étude archivistique. Le fer employé, rempli d'inclusions, souvent phosphoreux, et n'ayant pas fait l'objet de traitement spécifique est un matériau standard pour la période médiévale ; de rares exceptions sont cependant à noter. Sont également évoquées les questions relatives aux différentes étapes du travail de forge, et en premier lieu celle de l'utilisation du marteau hydraulique pour faciliter la phase d'épuration de la loupe, opération longue et épuisante d'après les résultats d'archéologie expérimentale. Pour finir, la fréquente homogénéité de certains rapports dans les inclusions semble montrer que les hétérogénéités de la matrice, notamment la diversité des degrés de carburation, sont liées à l'hétérogénéité initiale de la loupe de fer, et non la marque d'une récupération par corroyage.The metallographic study of construction iron used in churches and other buildings during the Middle Ages and the modern period can provide a great deal of information on the characteristics of this material as well as on the history of iron and steel metalwor-king. At the same time the study of construction iron raises many questions. This paper discusses results accumulated from certain French monuments, these include: the cathedrals of Amiens and Rouen, the church Saint-Ouen of Rouen, the basilica of Saint-Denis, the Palais des Papes in Avignon and the dungeon of the Château de Vincennes. The analysis of the composition of slag inclusions entrapped in the metallic matrix allows differentiating iron of the direct process from iron that comes from finery. It seems that all these medieval buildings were essentially reinforced with bars of bloomery iron, and thus didn't really take advantage of the introduction of the blast furnace. In Normandy, where several buildings were studied, the results are compatible with that of the archives: a transition between the direct and indirect processes during the end of the 15thcentury. The metallographic analyses show that in general the iron used in those monuments is very heterogeneous, with no peculiar distribution of the iron and steel parts, numerous slag inclusions, and often a high content of phosphorus. Moreover, no specific forge treatment was observed. This material seems to be a random quality iron for these periods, but whose quality was always fairly sufficient according to its section and role. Certain bars of the Palais des Papes are the only exception to this picture so far. Questions related to the different stages of the smith's work at the forge are then evoked. Results from forge experiments, specifically on the cleansing operation that occurs between the reduction and the forming of the object, have been studied. Two phases have been identified in this stage: first compacting the bloom with a wooden hammer to reduce its porosity, second expelling the slag inclusions that arc still entrapped in the metal by folding the piece of metal and hammering it with a steel hammer. The experiment shows that this phase is particularly long and tiring: more than 4 hours to get an ingot out of a 14 kg bloom. Therefore it brings out the question of the use of hydraulic hammers to help the smith in the second phase of the cleansing. Finally, the analysis of the composition of the slag inclusions reveals that, in more than one case out of two, the ratios of certain elements (Al, Si, Ca) are stable in the whole sample. These elements arc a sort of chemical signature of the object resulting from the reduction. Therefore, it seems that all the heterogeneities seen above arc more likely to be linked to the original heterogeneity of the bloom and not the mark of recuperation by welding pieces of metal from different origins. Therefore brand new metal seems to take an important place in the supply of these monumental buildings. It is also sometimes possible to determine, through the slag inclusion analysis, that sand additions were made during the forging phase

Twenty-five new viruses associated with the drosophilidae (Diptera)

Drosophila melanogaster is an important laboratory model for studies of antiviral immunity in invertebrates, and Drosophila species provide a valuable system to study virus host range and host switching. Here, we use metagenomic RNA sequencing of about 1600 adult flies to discover 25 new RNA viruses associated with six different drosophilid hosts in the wild. We also provide a comprehensive listing of viruses previously reported from the Drosophilidae. The new viruses include Iflaviruses, Rhabdoviruses, Nodaviruses, and Reoviruses, and members of unclassified lineages distantly related to Negeviruses, Sobemoviruses, Poleroviruses, Flaviviridae, and Tombusviridae. Among these are close relatives of Drosophila X virus and Flock House virus, which we find in association with wild Drosophila immigrans. These two viruses are widely used in experimental studies but have not been previously reported to naturally infect Drosophila. Although we detect no new DNA viruses, in D. immigrans and Drosophila obscura, we identify sequences very closely related to Armadillidium vulgare iridescent virus (Invertebrate iridescent virus 31), bringing the total number of DNA viruses found in the Drosophilidae to three.This work was funded by a Wellcome Trust Research Career Development Fellowship (WT085064) to DJO. BL was supported by grants from the UK Natural Environment Research Council (NE/L004232/1) and the European Research Council (281668, Drosophila Infection). SHL was supported by a Natural Environment Research Council Doctoral Training Grant (NERC DG NE/J500021/1). Work in DJO’s laboratory is partly supported by a Wellcome Trust strategic award to the Centre for Immunity, Infection and Evolution (WT095831). The authors confirm that the funder had no influence over the study design, content of the article, or selection of this journal

Le "Traité de Génétique"

L'Héritier Ph. Le "Traité de Génétique". In: Journal d'agriculture tropicale et de botanique appliquée, vol. 1, n°5-6, Mai-juin 1954. pp. 221-223

Aurélie Terrier, "Remploi d’un bloc provenant de la cathédrale dans la reconstruction du château d’Akerentia (Calabre – It)"

Remploi d’un bloc provenant de la cathédrale dans la reconstruction du château d’Akerentia (Calabre – It) Remploi dans la reconstruction du château d’un élément lapidaire provenant de la cathédrale de la ville. Il s’agit d’un bloc en grès avec plusieurs traces de mortiers et sur lequel ont été sculptées en ronde-bosse les armoiries de l’évêque Agazio di Somma, évêque de la ville de 1659 à 1664. © Aurélie Terrier L’intérêt de cet exemple réside dans le fait que la tradition orale voulait que ..

Relevé de décision de la réunion du 8 novembre 2019

Le compte-rendu et relevé de décision de la 2e rencontre du GDR Remarch (8 novembre 2019) a été mis en ligne. Il reprend les différents points suivants : Objectifs du GDR et fonctionnement Les outils collaboratifs (carnet Hypothèse, base biblio Zotero, banque de travail "iconographie", feuille Excel "les événements de remploi", exemplier de textes) Groupes de travail Approche comparatiste : Interview de P. Prunet ACMH en charge de Notre-Dame de Paris Action méthodologique et archéométriq..

Le fer dans l’architecture de Pierre, de l’Antiquité au XVIIIe siècle : usages, techniques et évolutions

International audienc

Entre pression et privilèges. Les relations des hommes du fer avec les chantiers de construction à la fin du Moyen Âge vues par les comptabilités

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