In silico sequence analysis and homology modeling of predicted beta-amylase 7-like protein in Brachypodium distachyon L.

Beta-amylase (β-amylase, EC 3.2.1.2) is an enzyme that catalyses hydrolysis of glucosidic bonds in polysaccharides. In this study, we analyzed protein sequence of predicted beta-amylase 7-like protein in Brachypodium distachyon. pI (isoelectric point) value was found as 5.23 in acidic character, while the instability index (II) was found as 50.28 with accepted unstable protein. The prediction of subcellular localization was revealed that the protein may reside in chloroplast by using CELLO v.2.5. The 3D structure of protein was performed using comparative homology modeling with SWISS-MODEL. The accuracy of the predicted 3D structure was checked using Ramachandran plot analysis showed that 95.4% in favored region. The results of our study contribute to understanding of β-amylase protein structure in grass species and will be scientific base for 3D modeling of beta-amylase proteins in further studies

Interaction between finance, tourism and advertising: evidence from Turkey

The purpose – It is important to emphasize that a research on relationship between tourism, finance and advertisement is very rare. The aim of this study is investigation of causal relationship between these variables. Design – In this paper, the relationship between tourism revenues and variables like tourism index of Istanbul Stock Market (BIST) & tourism advertising durations which have not been used previously in the literature was investigated for Turkey. Methodology – To attain more useful and accurate findings, bootstrap granger causality test of Hacker Hatemi-J (2010) was used which can determine critical values by bootstrap simulation method in order to reduce the possibility of potential non-normal dispersion of errors. Approach – In purpose of contribution to literature, monthly data in the period spanning from Aug 2004 till Dec 2012 and bootstrap causality method were used, thus new findings were tried to be found Findings – While traditional Toda-Yamamoto (1996) causality test has been determined no causality between these three variables, there was observed one-way causality from tourism index to tourism advertisements by the aid of more advanced Hacker Hatemi-J (2010) causality test. As a result of study, one-way causality from tourism indices, which is an important indicator representing all positive and negative performances of businesses in tourism sector, to advertising durations was detected. The originality of this research – In this study, unlike others, variables like tourism index which represents businesses in tourism sector and tourism advertising durations were used. The relationship between tourism index, tourism advertisings and tourism revenue was examined with Hacker Hatemi-J (2010) bootstrap causality test which obtains critical values by bootstrap monte-carlo simulation. By this new test, more reliable and advanced results have been obtained. As a result, tourism index which can be considered as a fundamental performance scale of tourism sector has a vital effect on tourism advertisement

Risk reporting in bist manufacturing sector

Risk raporlama, işletmelerin mevcut ve potansiyel riskleri ile ilgili bilgilerin işletmeyle ilgili kişi ve kurumlara ilan edilmesidir. Yatırımcıların güveninin kazanılması için şirketlerin raporlama uygulamaları önemlidir. Bu kapsamda çalışma, risk raporlamanın işletme düzeyinde belirleyicilerini tespit etmeyi amaçlamaktadır. Bu amaç doğrultusunda Borsa İstanbul’da (BİST) işlem gören 122 adet şirketin 2013-2015 yılları arasındaki verileri incelenmiştir. Şirketlere ilişkin veriler Kamuyu Aydınlatma Platformundan, şirketlerin web sayfalarında yayınladıkları faaliyet raporları, finansal tablo dipnot ve açıklamaları ile kurumsal yönetim uyum raporlarından, www.isyatirim.com.tr web sayfasından ve datastream veri tabanından elde edilmiştir. Çalışmada işletme büyüklüğü, performansı, risk düzeyi, yabancı payı, halka açıklık oranı, ortaklık yapısı ve kurumsal yönetim özellikleri ile risk açıklamaları arasındaki ilişkiler incelenmiştir. Analiz sonuçlarına göre, işletme büyüklüğünün ve yönetim kurulu yapısının risk açıklamaları üzerinde anlamlı ve pozitif bir etkisi olduğu tespit edilmiştir. Bununla birlikte işletme performansı, risk düzeyi ve işletmenin sahiplik yapısı ile risk açıklamaları arasında anlamlı bir ilişki olmadığı ve risk açıklamalarını etkilemediği belirlenmiştir.Risk reporting is the disclosure of information about the current and potential risks of the business to the persons and entities related in the business. It is important for companies to report practices in order to earn the trust of investors. The aim of this work is to determine firm level determinants of risk reporting. For this purpose, 122 firms traded in the Istanbul Stock Exchange (BIST) was examined for the period 2013-2015.The data are compiled from Public Disclosure Platform, company's web pages, firm’s annual reports, the financial statements footnotes and explanations and the corporate governance compliance reports, from the web page www.isinvestment.com and the DataStream database. In the study, the relationship among business size, performance, risk level, foreign share, free float ratio, shareholder structure and corporate governance features and risk explanations are examined. According to the results of the analysis, it has been revealed that business size and board structure have significant and positive impacts on risk disclosures. However, it has been determined that there is no significant relationship between business performance, firm risk level and ownership structure of the company and risk disclosures and it does not affect risk disclosures

Three-Year Evaluation of Nosocomial Infection Rates of the ICU

AbstractBackground and objectivesEvaluating the incidence of nosocomial and invasive device-related infections enables the comparison of the health care associated infection (HAI) between the intensive care units of different hospitals and different units in the same hospital.Material and methodsA retrospective surveillance study was performed to identify nosocomial infections, device-related infections rates, and causal agents from January 2007 through December 2010 in the Anesthesiology Intensive care unit (ICU). HAI were defined according to the CDC (Centers for Disease Control and Prevention) criteria, and invasive device-related infections were defined according to National Nosocomial Infection Surveillance System (NNIS) criteria.ResultsDuring a two-year period, 939 patients were analyzed throughout a total of 7,892 patientdays. The rates of HAI were 53% in 2007, 29.15% in 2008, 28.85% in 2009 while 16.62% in 2010. Most common HAI was blood stream infection. The rate of soft tissue and skin infection was the second most common. Overall, the most common agents were Gram(−) 56.68%, Gram(+) 31.02% and Candida spp 12.3% among patients with nosocomial infections.ConclusionsThe incidence of HAI in the ICU of our hospital was high, compared to the Turkish overall rates obtained at the Refik Saydam Center in 2007. When the rates of device-related infections between 2007 and 2008 were compared, they were higher in 2007. The rates of devicerelated infections were diminished in 2008 to below-national mean rates by infection control measures. Since the rate of urinary catheter-related infections are still high, we should exert continuous efforts for infection control

Fırm level determinants of earning management: evidence from borsa İstanbul

Son yıllarda yaşanan şirket skandalları finansal bilgi kullanıcılarının finansal raporlamanın doğruluğu konusunda şüphe duymasına yol açmıştır. Bu kapsamda kazanç yönetimi uygulamaları bilgi kullanıcıları, akademisyenler ve düzenleyici kurumlar için daha önemli hale gelmiştir. Zira kazanç yönetimi uygulamaları finansal tabloların şeffaflığına ve kalitesine olan zararlarından dolayı bu skandalların en önemli nedenlerinden biri olarak gösterilmiştir. Kazanç yönetimi, firmanın veya üst düzey yöneticilerin çıkarlarına hizmet etmek amacı ile kullandıkları bir araç olup en genel anlamda finansal bilgi kullanıcılarının firmanın performansı hakkında yanıltılması amacıyla muhasebe sonuçlarının manipüle edilmesi faaliyeti olarak ifade edilmektedir. Kazanç yönetimi uygulamalarının firma düzeyinde belirleyicilerini tespit etmeyi amaçlayan bu çalışmada Borsa İstanbul’da (BİST) işlem gören 127 imalat sanayi işletmesinin 2004-2014 yılları arasındaki verileri incelenmiştir. Veriler datastream veri tabanı ve Kamuyu Aydınlatma Platformundan ayrıca firmaların yayınladıkları faaliyet raporları, finansal tablo dipnot ve açıklamaları ile kurumsal yönetim uyum raporlarından elde edilmiştir. Çalışmada kazanç yönetiminin tespitinde “Düzeltilmiş Jones Modelinden” yararlanılmıştır. Çalışmada büyüklük, risk, işletme grubu ilişkisi, yabancı payı, piyasa değeri, yatırım harcamaları, dört büyük denetçi ve ortaklık yapısı gibi faktörlerin kazanç yönetimi uygulamalarını ne kadar açıkladığı tespit edilmeye çalışılmıştır. Analiz sonuçlarına göre büyüklük, yatırım harcamaları, Tobin Q oranı, dört büyük denetçi tarafından denetlenme, işletme grubu ilişkisi ve halka arz oranı kazanç yönetimi uygulamalarını etkilemektedir.In recent years’ corporate scandals has led to doubts about the accuracy of financial reporting of financial information users. In this context, earnings management practices have become increasingly important for financial information users, academicians, and regulatory agencies. Earnings management practices have been shown to be one of the major causes of this scandal because of damage to the transparency and quality of financial statements. Earnings management, which is instrument of executives to serve their self-interests, can be defined, accounting results manipulation activities in order to mislead financial information users about company's financial performance. In this article, it is aimed to determine firm level determinants of earning management practices. In this framework data for 127 manufacturing firms from the Istanbul Stock Exchange (BIST) examined for the period 2004-2014. Data collected from DataStream database and from the Public Disclosure Platform. Also firms annual reports, financial statements and disclosures, the corporate governance compliance reports are collected for the study. In this article, to determine earnings management practice we used “Modified Jones Model”. Also in this study, we analyzed effect of some factors on earnings management such as; size, risk, business group relations, foreign share, the market value, investment expenditures, the four biggest auditors and the ownership structure. Our results suggest that size, capital expenditures, Tobin Q ratio, four big auditors, business group affiliation and free float rate effect earnings management practices of firms

Türkiye’deki Devlet Üniversitelerinin Lisans Programlarında Yer Alan Denetim Dersi Müfredatının İncelenmesi

Bu çalışmanın amacı, Türkiye’deki devlet üniversitelerinin lisans programlarında yer alan denetim dersi müfredatı kapsamında bulunan temel bilgilerin, haftalık içeriklerin, dersi öğretme ile ölçme ve değerlendirme yöntemlerinin ve dersin öğrenme çıktılarının belirlenerek analiz edilmesidir. Çalışma kapsamında ihtiyaç duyulan veriler, 90 devlet üniversitesinin 132 programının Bologna ders bilgi paketinden elde edilerek, frekans analizi kullanılarak analiz edilmiştir. Analiz sonuçlarına göre, denetim dersinin üniversite müfredatlarında genellikle 3 kredi/5 AKTS şeklinde ve seçmeli ders olarak yer aldığı belirlenmiştir. Dersin yürütülmesi sırasında en fazla öğretim üyesi anlatımı (takrir) yönteminin kullanıldığı; gözlem, beyin fırtınası ile bilgisayarla veri analizi yöntemlerinin dersin öğretilmesi sırasında en az kullanılan yöntemler olduğu tespit edilmiştir. Denetim dersinin içeriği konusunda yapılan müfredat incelemeleri sonucu, bu dersin haftalık konu içeriklerinde temel düzeyde denetim konularının yer aldığı ve denetim süreçlerinde bilgi teknolojilerinin kullanımına yeterince yer verilmediği ortaya konulmuştur. Ders içeriklerinde ve öğretme yöntemlerinde bilgi teknolojilerine yönelik öğretme yöntemlerinin yeterince kullanılmamasına rağmen, üniversiteler tarafından dersin öğrenme çıktıları genellikle uygulamaya dönük olarak belirlenmiştir. Bu durum, dersin öğretiminde daha çok anlatım(takrir) yönteminin kullanılması, uygulamalı veri analizi ile veri analitiği gibi uygulamalar ile bu dersin içeriğinin desteklenmediği programlarda gerçeği çok yansıtmamaktadır

ATXN2 and its neighbouring gene SH2B3 are associated with increased ALS risk in the Turkish population

Expansions of the polyglutamine (polyQ) domain (≥34) in Ataxin-2 (ATXN2) are the primary cause of spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2). Recent studies reported that intermediate-length (27–33) expansions increase the risk of Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) in 1–4% of cases in diverse populations. This study investigates the Turkish population with respect to ALS risk, genotyping 158 sporadic, 78 familial patients and 420 neurologically healthy controls. We re-assessed the effect of ATXN2 expansions and extended the analysis for the first time to cover the ATXN2 locus with 18 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and their haplotypes. In accordance with other studies, our results confirmed that 31–32 polyQ repeats in the ATXN2 gene are associated with risk of developing ALS in 1.7% of the Turkish ALS cohort (p = 0.0172). Additionally, a significant association of a 136 kb haplotype block across the ATXN2 and SH2B3 genes was found in 19.4% of a subset of our ALS cohort and in 10.1% of the controls (p = 0.0057, OR: 2.23). ATXN2 and SH2B3 encode proteins that both interact with growth receptor tyrosine kinases. Our novel observations suggest that genotyping of SNPs at this locus may be useful for the study of ALS risk in a high percentage of individuals and that ATXN2 and SH2B3 variants may interact in modulating the disease pathway

Incidence and Management of Delayed Epistaxis Following Endoscopic Skull Base Surgery

Objective:Among other complications of endoscopic skull base surgery, delayed epistaxis has not been given much importance. This report presents postoperative delayed nosebleed cases in a large number of patients who underwent an endoscopic endonasal transsphenoidal approach to the sellar region for resection of lesions.Methods:Three hundred and sixty three patients who were reached to the sellar region by endoscopic endonasal transsphenoidal route and operated was included in the study. Retrospective chart reviewing of these patients was performed. The correlation between the duration of nosebleeds, bleeding location, treatment methods and comorbidities of the patients were evaluated.Results:Ten patients (3.6%) reported delayed epistaxis in the postoperative period and were referred to the otolaryngology department. Postoperative epistaxis occurred between days 7th and 33th (mean 16.5) days. The treatment consisted of chemical silver nitrate cauterization in two patients, return to the operating room in three patients, nasal packing in five patients.Conclusion:Delayed postoperative epistaxis often has no obvious etiology, and intervention requires teamworking. Well-coordinated teamworking of the neurosurgeon with other specialities such as neuroradiology and otorhinolaryngology is needed to achieve better results

Study of biopsychosocial effects on family members of patients in intensive care unit

YÖK Tez No: 412757Bu çalışma Yoğun Bakım Ünitesi?ndeki (YBÜ) hastaların ailelerinin davranışsal, duygusal ve bilişsel alanlarda, ayrıca kişilerarası ilişkilerde yaşadıkları psikososyal sorunların değerlendirilmesi ve bu sürecin aileyi ne düzeyde etkilediğini belirlemek amacıyla niteliksel olarak yapılmıştır. Çalışmanın verileri nitel araştırma örnekleme yöntemlerinden benzeşik ve ölçüt örnekleme yöntemi kullanılarak seçilen çoğu birinci derece hasta yakınları olmak üzere toplam 15 aile üyesinden oluşan örneklemden toplanmıştır. Veri toplama yöntemi olarak derinlemesine görüşme tekniği kullanılmıştır. Görüşmelerde Aile Görüşme Formu kullanılmış, görüşmeler ses kayıt cihazına kaydedilmiştir. Görüşme kaydı araştırmacı tarafından deşifre edilmiş, veriler kodlandıktan sonra temalara göre sınıflandırılmış, yorumlanarak rapor haline getirilmiştir. Araştırma sonucunda üç tema belirlenmiştir; Stres Kaynakları teması altında aile üyelerinin hastalarının genel durumu hakkında yeterli bilgiye sahip olmadığı, hastalarının hastalıklarını `zor ve kötü? olarak algıladıkları, hastalarına çok değer verdikleri, sağlık profesyonelleriyle ilişkilerinden genellikle memnun oldukları görülmüştür. Değişimler teması altında kendi sağlıklarında fiziksel ve psikolojik değişimler olduğu, hastalığa korku, öfke, anksiyete, depresif duygulanım gibi pek çok duygusal yanıt verdikleri, hastalarını kaybetme korkusunun en büyük korkuları olduğu, kendilerini zorlayan pek çok faktörle karşı karşıya oldukları, aile dinamiklerinin etkilendiği, kendilerinin ve diğer aile üyelerinin temel ihtiyaçlarını ikinci plana atıldığı, sosyal yaşamlarının ciddi şekilde etkilendiği, hastalığın maddi olarak aileleri zorladığı, iş yaşamlarının etkilendiği belirlenmiştir. Başa Çıkma teması altında ise zihni meşgul eden aktiviteler, sosyal destekler, fiziksel aktiviteler, din inancı ve dine yönelik uygulamalar ile başa çıkmaya çalıştıkları saptanmıştır. Sonuç olarak; ailede bir bireyin hasta olması ve ciddi bir hastalık nedeniyle YBÜ'ne yatırılması bir sistem olarak aileyi etkilemekte dengenin bozulmasına neden olmaktadır. Bu nedenle ailelere humanist, bütüncül ve aile merkezli bir yaklaşım sergilenmelidir.This study has been carried out qualitatively to evaluate the problems of the families of patients in intensive care unit in the fields of behavioral, sensory, cognitive, and psychosocial problems in their interpersonal relationships (ICU) and to determine in which level this process effects the family. In the study has been used simulated and criterion sample methods of qualitative research methods and 15 family members of selected first-degree relatives of the patients have constituted the sample. The data in the study were collected between January 2011 and December 2011.Using the technique of separately depth interview face-to-face interview was conducted with relatives of the patients. Questions have been asked using Family Interview Form and a semi-structured interview has recorded with recorder. Information has been tried to be collected with an approximately 45-60 minutes-interview. After each meeting, the interview record has been decoded and after the data is encoded, they have been classified according to themes and has been converted into a report by being interpreted. As a result of the research, three themes have been identified; Information and Thoughts, that whether the family members have enough information about the general condition of patients, that they perceived the disease of their patients as difficult and bad disease, that they valued their patients greatly, that they see the future ambiguously, they are generally satisfied with relationships with the health care professionals; Changes, that there are physical and psychological changes in their health, that they give many emotional responses to disease, like fear, anger, anxiety and depressive affect, that the biggest fear of them is the fear of losing their patients, that they are face to face with so many compelling factors, that their family dynamics are affected, that the needs of themselves and other family members are been of secondary importance, that their social lives affected severely by the disease, that the disease their forced families financially, and that their working lives are affected, Coping, it was determined that they try to cope with the activities that engage the mind, social supports, physical activities, religious belief and religion oriented practices. According to the results, illness and being in an ICU of a family member because of a serious illness affects the family as a system, it causes to unbalance. For this reason, a humanistic, holistic and family-centered approach should be displayed to the families

Örgüt Kültürünün Örgütsel Bağlılığa Etkisinin İncelenmesi; Kargo İşletmesi Çalışanları Üzerine Bir Araştırma

Örgüt kültürü, bir örgütte geçerliliği kabul gören varsayımların, normların, sembollerin, değerlerin, uygulamaların tamamını içine alır ve örgütün genel kültürünü ifade eder. Örgütlerin aynı toplumlardaki şekli ile bünyelerine has davranış ve tutum kalıpları, inançları ve değerleri söz konusudur. Tüm bunların toplamı örgüt kültürü olarak kabul edilir. Bu kültür, örgütlere yani organizasyona bir kişilik niteliği yüklemektedir. Böylelikle yönetim tarzı oluşmaktadır. Bu çalışmada örgüt kültürünü etkileyen unsurlara ve örgütsel bağlılık ilişkisine yer verilmiştir. Araştırmada kargo işletmesi çalışanları üzerinde örgüt kültürünün örgütsel bağlılık üzerine etkisinin incelenmesi amaçlanmıştır. Araştırma ilişkisel tarama modelinde tasarlanmıştır. Bir kargo şirketinin genel merkezinde çalışanlar üzerine bir araştırma yapılmıştır. Çalışanlara örgüt kültürü ve örgütsel bağlılık ölçeği uygulanmıştır. Araştırma sonucunda kargo çalışanlarının örgütsel bağlılık düzeylerinin orta seviyede ve algılanan örgüt kültürü düzeyinin orta seviyede olduğu saptanmıştır. Örgüt kültürü algısı ile örgütsel bağlılık arasında zayıfta olsa ilişki bulunduğu tespit edilmiştir. Örgüt kültürünün duygusal bağlılık, devam bağlılığı, normatif bağlılık ve genel bağlılık üzerine etkili olduğu bulunmuştur. Kargo şirketi çalışanlarında örgüt kültürü düzeyi örgütsel bağlılık düzeyini pozitif etkilemektedir. Araştırma sonucunda kargo şirketi yöneticilerinin örgüt kültürü modellerini uygulaması önerilmektedir. Ayrıca sonraki araştırmacılar için araştırmayı daha fazla örneklem ve farklı kargo şirketleri üzerinde yapmaları önerilmektedir