Étude hydrochimique et microbiologique des eaux de source de l’ouest montagneux de la Côte d’Ivoire : Cas du village de Mangouin-Yrongouin (souspréfecture de Biankouman).

Objectif : Évaluer la qualité physico-chimique et microbiologique des eaux de source du village de Mangouin-Yrongouin dans la localité de Biankouman (Côte d’Ivoire). Méthodologie et résultats : Pour la réalisation de cette étude, la méthode utilisée repose sur des relevés piézométriques de la nappe phréatique, des analyses physico-chimiques et microbiologiques des eaux. Les résultats issus de ces analyses ont été traités à l’aide de techniques hydrochimiques (diagramme de Piper). L’analyse statistique multivariée dont l’Analyse en Composantes Principales (ACP) et la Classification Hiérarchique Ascendante (CHA) a également été utilisée pour la mise en évidence des phénomènes de minéralisation des eaux de ladite localité. L’étude piézométrique montre que le niveau statique de la nappe phréatique varie de 0,48 m à 4,52 m, avec une moyenne de 1,24 m. Les eaux sont acides, avec un pH qui varie de 4,85 à 6,01. Elles sont faiblement minéralisées, avec une conductivité électrique moyenne de 152,90 μS/cm. Dans la zone d’étude, les eaux sont chlorurées calciques. Les analyses chimiques révèlent que les eaux de Mangouin-Yrongouin sont dépourvues d’iode. L’analyse des métaux lourds montre qu’en dehors du fer et du Ni qui présentent des teneurs supérieures à la valeur guide OMS qui est respectivement de 0,3 mg/L et 0,07 mg/L, les autres métaux étudiés sont pratiquement inexistants dans les eaux. Sur le plan microbiologique, les eaux de source contiennent de forts taux d’Escherichia coli (400 à 500 ufc/100 ml) et de Clostridium perfringens (100 ufc/20 ml à 1500 ufc/20 ml). La minéralisation des eaux est contrôlée par les phénomènes tels que le pluviolessivage des sols, l’hydrolyse acide des roches et l’apport lié aux activités anthropiques. Conclusion et applications : Cette étude montre que les ressources en eau de Mangouin-Yrongouin sont soumises à une pression anthropique importante. La consommation de ces eaux en dehors de tout traitement présente des risques sanitaires pour les populations. Mot clés : Assainissement, eaux de source, pollution, Hydrochimie, Environnement, Éléments Traces Métalliques

Caractérisation hydrogéochimique et microbiologique des ressources en eau du site d’un Centre d’Enfouissement Technique (CET) de Côte d’Ivoire: Cas du CET de Kossihouen dans le District d’Abidjan (Côte d’Ivoire)

Le site de Kossihouen qui est la zone d’étude est le secteur de la construction du futur Centre d’Enfouissement Technique (CET) du District d’Abidjan. Durant cette étude, les ressources en eau de la zone ont été caractérisées afin de mettre en évidence leur relation avec les environnements humain et naturel. Pour sa réalisation, une série d’analyses a été réalisée sur les ressources en eaux de la zone. Il s’agit des analyses physico-chimiques et microbiologiques effectuées sur des échantillons prélevés dans les rivières, les marigots, les puits et les forages sur le site et dans ses environs. Les résultats de ces analyses ont été traités à partir d’une méthode hydrochimique qui utilise le diagramme triangulaire de Piper et des méthodes statistiques multivarieés dont l’Analyse en Composantes Principales (ACP) et la Classification Hiérarchique Ascendante (CHA). Les résultats de cette étude montrent que la température des eaux de la région varie entre 25,60 et 28,20 °C, avec une moyenne de 26,57 ± 0,32 °C. Les eaux sont agressives, avec un pH qui varie entre 5,21 et 6,98 unités pH, pour une moyenne de 6,19 ± 0,24. Elles sont faiblement minéralisées, avec une conductivité électrique qui varie entre 38,40 et 247 μS.cm-1,, pour une valeur moyenne de 104,81 ± 27,57 μS.cm-1. Celles-ci sont douces, avec une dureté moyenne de 4,17 °F. Les eaux du site sont riches en fer et ont des teneurs qui varient entre 0,40 et 3,60 mg.L-1,, pour une moyenne de 1,59 mg.L-1,;. Les eaux de la zone d’étude se répartissent en trois grandes familles. Il s’agit des eaux bicarbonatées calciques et magnésiennes qui sont les plus importantes (57,14%), les eaux chlorurées calciques et magnésiennes (28,57%) et les eaux chlorurées sodi-potassiques (14,29%). L’Analyse en Composantes Principales et la Classification Ascendante Hiérarchique indiquent que la minéralisation des eaux du site du CET de Kossihouen est contrôlée par trois grands phénomènes: la minéralisation temps de séjour qui se traduit par l’hydrolyse des minéraux silicatés pour les eaux souterraines (forages et puits), le pluviolessivage des sols pour les eaux superficielles (eaux de surface) et l’influence des activités humaines dans la production des déchets polluants. Cette étude montre également que les ressources en eau du site de Kossihouen sont fortement influencées par les activités anthropiques, avec la présence des coliformes fécaux de type Escherichia coli et de streptocoques fécaux qui sont la conséquence d’une pollution d’origine humaine récente.Mots clés: Analyse en composantes principales, Classification hiérarchique Ascendante, Diagramme de Piper, Hydrochimie et Environnemen

Caractérisation hydrogéochimique et microbiologique des ressources en eau du site d’un Centre d’Enfouissement Technique (CET) de Côte d’Ivoire: Cas du CET de Kossihouen dans le District d’Abidjan (Côte d’Ivoire)

Le site de Kossihouen qui est la zone d’étude est le secteur de la construction du futur Centre d’Enfouissement Technique (CET) du District d’Abidjan. Durant cette étude, les ressources en eau de la zone ont été caractérisées afin de mettre en évidence leur relation avec les environnements humain et naturel. Pour sa réalisation, une série d’analyses a été réalisée sur les ressources en eaux de la zone. Il s’agit des analyses physico-chimiques et microbiologiques effectuées sur des échantillons prélevés dans les rivières, les marigots, les puits et les forages sur le site et dans ses environs. Les résultats de ces analyses ont été traités à partir d’une méthode hydrochimique qui utilise le diagramme triangulaire de Piper et des méthodes statistiques multivarieés dont l’Analyse en Composantes Principales (ACP) et la Classification Hiérarchique Ascendante (CHA). Les résultats de cette étude montrent que la température des eaux de la région varie entre 25,60 et 28,20 °C, avec une moyenne de 26,57 ± 0,32 °C. Les eaux sont agressives, avec un pH qui varie entre 5,21 et 6,98 unités pH, pour une moyenne de 6,19 ± 0,24. Elles sont faiblement minéralisées, avec une conductivité électrique qui varie entre 38,40 et 247 μS.cm-1, pour une valeur moyenne de 104,81 ± 27,57 μS.cm-1. Celles-ci sont douces, avec une dureté moyenne de 4,17 °F. Les eaux du site sont riches en fer et ont des teneurs qui varient entre 0,40 et 3,60 mg.L-1, pour une moyenne de 1,59 ± 0,46 mg.L-1. Les eaux de la zone d’étude se répartissent en trois grandes familles. Il s’agit des eaux bicarbonatées calciques et magnésiennes qui sont les plus importantes (57,14%), les eaux chlorurées calciques et magnésiennes (28,57%) et les eaux chlorurées sodi-potassiques (14,29%). L’Analyse en Composantes Principales et la Classification Hiérarchique Ascendante indiquent que la minéralisation des eaux du site du CET de Kossihouen est contrôlée par trois grands phénomènes: la minéralisation temps de séjour qui se traduit par l’hydrolyse des minéraux silicatés pour les eaux souterraines (forages et puits), le pluviolessivage des sols pour les eaux superficielles (eaux de surface) et l’influence des activités humaines dans la production des déchets polluants. Cette étude montre également que les ressources en eau du site de Kossihouen sont fortement influencées par les activités anthropiques, avec la présence des coliformes fécaux de type Eschérichia coli et de streptocoques fécaux qui sont la conséquence d’une pollution d’origine humaine récente.Mots clés: Analyse en composantes principales, Classification Hiérarchique Ascendante, Diagramme de Piper, Hydrochimie et Environnemen

Étude des caractéristiques chimiques et microbiologiques des ressources en eau du bassin versant du N’zi : cas de la commune de N’zianouan (Sud de la Côte d’Ivoire)

Cette etude traite de la caracterisation chimique et microbiologique des eaux de la commune Nfzianouan. Cette commune, depourvue dfun systeme dfassainissement adequat et correctement fonctionnelest confrontee a un probleme de protection de ses ressources en eaux. Cfest pour mettre en evidence lfinfluence de la pression anthropique sur les eaux de la riviere Nfzi aux droits de cette localite et egalement sur les eaux souterraines que cette etude a ete initiee. La methode utilisee pour atteindre cet objectif repose sur des mesures de niveaux piezometriques de la nappe souterraine, des analyses physico-chimiques et microbiologiques des eaux. Les resultats de ces analyses ont ete traites a lfaide de la classification hydrochimique basee sur le diagramme de Piper et de lfanalyse statistique multivariee. La methode statistique a fait intervenir la Classification Hierarchique Ascendante (CHA) pour lfidentification des phenomenes responsables de la mineralisation des eaux de la region. Lfetude piezometrique montre que le niveau piezometrique de la nappe varie de 0,48 m a 4,52 m, avec une moyenne de 1,24 m. La temperature des eaux varie de 27,6 ‹C a 30 ‹C,avec une moyenne de 28,48 ‹C. La forte valeur de conductivite a ete observee au niveau des eaux souterraines (2487 ƒÊS/cm). Les plus forts taux de matieres en suspension sont observes dans les eaux de la riviere Nfzi (16 mg/L). Elles presentent une bonne saturation en oxygene dissous. Les eaux etudiees se classent en deux grands groupes. Il sfagit des eaux bicarbonatees calciques pour les eaux de la riviere Nfzi et des eaux chlorurees sodipotassiques pour les eaux souterraines. Dans ces eaux, sont egalement presentes des teneurs elevees en Elements Traces Metalliques (ETM) tels que : lfarsenic, le plomb, le chrome et le cuivre. Sur le plan microbiologique, ces eaux contiennent un fort taux de coliformes fecaux principalement lfEcherichia coli (15000 ; 12200 ; et 14500 Echerichia coli pour 100ml dfeau). Cette etude signale egalement la presence de streptocoques fecaux, de Clostridiums Perfringens et de coliformes Thermo tolerants dans les ressources en eau. Les coliformes Thermo tolerants sont les plus importants dans le milieu, avec des quantites de 24600 et de 112700 pour les eaux de la zone. Les teneurs sont plus importants au niveau des eaux souterraines (112700coliformes Thermo tolerants/100ml) qufau niveau des eaux de surface. Lfensemble des resultats obtenus montre que les ressources en eau de Nfzianouan sont generalement soumises a une pression anthropiqueimportante

Application des réseaux de neurones formels pour la prévision des débits mensuels du Bandama blanc à la station de Tortiya (Nord de la Côte d’Ivoire)

Plusieurs travaux témoignent de la capacité des réseaux de neurones à modéliser les débits des rivières. Malheureusement on ignore actuellement si ces modèles neuronaux sont performants pour la prévision du binôme pluie-débit en régime tropical humide en général et particulièrement sur le Bandama Blanc dans le Nord de la Côte d‟Ivoire. Ce travail de recherche permettra de vérifier l‟efficacité des réseaux de neurones formels pour la prévision des débits mensuels du Bandama Blanc à partir de la relation pluie-débit qui est non-linéaire. Trois modèles de réseaux de neurones ont donc été optimisés afin d‟atteindre cet objectif. Une base de données composée du débit, de la pluie, de la température et de  l‟Evapotranspiration Potentiel (ETP) au pas de temps mensuel à été utilisée comme entrée de ces modèles.Ces données ont été normalisées entre 0 et 1 et subdivisées en deux blocs : un premier bloc composé des 2/3 des données (1971-1988) pour l‟apprentissage et un second bloc composé du 1/3 des données (1989- 1997) pour la validation. Ces modèles ont été optimisés avec l‟apprentissage supervisé. Le critère de Nash-Sutcliffe et le coefficient de corrélation (R) ont été utilisés pour tester la performance de ces modèles. Les résultats obtenus montrent que tous les modèles expriment plus de 70% de la variation des débits du Bandama Blanc à Tortiya. Pour tous ces modèles, les valeurs du critère de Nash-Sutcliffe calculées sont nettement supérieures à 70% et les coefficients de corrélation de Pearson sont très élevés et supérieurs à 0,80. Mais, malgré ces bonnes performances, les débits extrêmes sont généralement mal modélisés.Mots-clés : modélisation, apprentissage, perceptron multicouches, rivière

Integration of hydro-climatic data and land use in neural networks for modeling river flows: Case of Lobo river in the southwest of Cote d’ivoire

In a context of climate disruption due to uncontrolled human activities, the classical models of rainfall - runoff modeling are almost unusable. In addition on the Lobo River (Southwest of Côte d’Ivoire), no simulation study has been carried out yet despite that, this river has flooded fields and villages causing huge losses in September 2007. Neural networks appear in this case as a solution for simulating flows in the context of non-linearity between rainfall and flow of this river. Climatic data (rainfall, temperature and PET) and land use will be phased in neural models to simulate monthly flows of the river Lobo. Four (4) neuronal model variants were constructed from three (3) hydro-climatic parameters (rainfall, potential evapotranspiration and flow) and the land acquired from Landsat ETM + 1990 and ETM + 2000. Two types of models have been created: the unguided model and the guided model. The simulation with the unguided model did not provide a satisfactory result. In effect, the value of Nash is only 22.90%. However, the NASH value of the guided model is much better than the previous one (85.01, 83.38 and 84.05%). These results help to highlight the importance of land use on the performance of neural networks. This study also demonstrated the ability of artificial neural networks to simulate the nongauged river flows in the context of climate disruption.Key words: Côte d’Ivoire, Lobo, multilayer perception, remote sensing, simulation, hydrology, model, neuron, flow

Copy number variation analysis based on AluScan sequences

BACKGROUND: AluScan combines inter-Alu PCR using multiple Alu-based primers with opposite orientations and next-generation sequencing to capture a huge number of Alu-proximal genomic sequences for investigation. Its requirement of only sub-microgram quantities of DNA facilitates the examination of large numbers of samples. However, the special features of AluScan data rendered difficult the calling of copy number variation (CNV) directly using the calling algorithms designed for whole genome sequencing (WGS) or exome sequencing. RESULTS: In this study, an AluScanCNV package has been assembled for efficient CNV calling from AluScan sequencing data employing a Geary-Hinkley transformation (GHT) of read-depth ratios between either paired test-control samples, or between test samples and a reference template constructed from reference samples, to call the localized CNVs, followed by use of a GISTIC-like algorithm to identify recurrent CNVs and circular binary segmentation (CBS) to reveal large extended CNVs. To evaluate the utility of CNVs called from AluScan data, the AluScans from 23 non-cancer and 38 cancer genomes were analyzed in this study. The glioma samples analyzed yielded the familiar extended copy-number losses on chromosomes 1p and 9. Also, the recurrent somatic CNVs identified from liver cancer samples were similar to those reported for liver cancer WGS with respect to a striking enrichment of copy-number gains in chromosomes 1q and 8q. When localized or recurrent CNV-features capable of distinguishing between liver and non-liver cancer samples were selected by correlation-based machine learning, a highly accurate separation of the liver and non-liver cancer classes was attained. CONCLUSIONS: The results obtained from non-cancer and cancerous tissues indicated that the AluScanCNV package can be employed to call localized, recurrent and extended CNVs from AluScan sequences. Moreover, both the localized and recurrent CNVs identified by this method could be subjected to machine-learning selection to yield distinguishing CNV-features that were capable of separating between liver cancers and other types of cancers. Since the method is applicable to any human DNA sample with or without the availability of a paired control, it can also be employed to analyze the constitutional CNVs of individuals.published_or_final_versio

Gene expression drives the evolution of dominance.

Dominance is a fundamental concept in molecular genetics and has implications for understanding patterns of genetic variation, evolution, and complex traits. However, despite its importance, the degree of dominance in natural populations is poorly quantified. Here, we leverage multiple mating systems in natural populations of Arabidopsis to co-estimate the distribution of fitness effects and dominance coefficients of new amino acid changing mutations. We find that more deleterious mutations are more likely to be recessive than less deleterious mutations. Further, this pattern holds across gene categories, but varies with the connectivity and expression patterns of genes. Our work argues that dominance arises as a consequence of the functional importance of genes and their optimal expression levels

The Rearing and Biology of the Desert Beetle, Microdera punctipennis, Under Laboratory Conditions

Microdera punctipennis Kasz (Coleoptera: Tenebrionidae) is a unique species that lives in the desert region of Central Asia and has adopted a nocturnal habit to survive the desert environment. Female adults are larger in size than male adults. The female/male ratio was 1.04:1. A rearing method using reused plastic bottles was used. The rearing conditions were 30 ± 0.5°C, 30 ± 6% relative humidity (RH), and 16:8 L:D photoperiod. Cabbage was provided as food. Cannibalism was avoided by rearing one larva in a bottle. A complete life cycle was obtained under these conditions. The viability of eggs, larvae, prepupae, pupae, and teneral adults was 93.54%, 83.71%, 84.76%, 87.64%, and 93.59%, respectively. Embryogenesis took 7.35 days on average. The larval duration in each instar was 2.25 days. The mean duration of the larvae, prepupae, pupae, and teneral adult was 49.27, 7.05, 9.95, and 10.12 days, respectively. The coloration of each developmental stage gradually changed from creamy white to light brownish or black. Females commenced oviposition when their body color became black. On average, each female produced 568 eggs