First-Line Molecular Genetic Evaluation of Autosomal Recessive Non-Syndromic Hearing Loss

Objective:The aim of this study is to investigate the efficiency of a first-line molecular genetic evaluation approach, in children with deafness.Methods:Patients who were found to have sensorineural hearing loss by age-appropriate audiological tests were selected for the molecular genetic evaluation. The molecular genetic evaluation was carried out with GJB2 gene sequence analysis and mtDNA m.1555A>G mutation Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) analysis. Additionally, in a small group of patients, hearing loss Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) analysis was done out to identify the possible role of copy number changes.Results:In this Turkish cohort, which included 104 index patients and 78 relatives, 33 (31.7%) had Pathogenic/Likely Pathogenic variants. One or more GJB2 sequence variants were identified in 46 (44.1%) of the 104 index patients. The homozygous c.35delG mutation by itself explained the etiology in 24% of our ARSNHL group. In one (5%) of the 20 patients of MLPA group, a hemizygous deletion in POU3F4 gene was detected.Conclusion:In our Turkish cohort, we applied a first-line molecular genetic evaluation approach using GJB2 gene sequence analysis and mtDNA m.1555A>G RFLP analysis. This approach revealed the genetic etiology of 44.1% of our index patients. Additionaly, the results of hearing loss MLPA analysis revealed the limited role of copy number changes in this patient group. Furthermore, with a detailed genotype-phenotype association workup, 2 rare cases of Deafness with Palmoplantar Hyperkeratosis and Keratitis-Ichthyosis-Deafness syndrome were reported

Detection of chromosomal rearrangements in familial or non-familial schizophrenia patients by using conventional cytogenetic and molecular cytogenetic techniques

Aile, ikiz ve evlatlık çalısmaları, sizofreni gelisimi için en önemli risk faktörünün bireyin yakınlarında sizofeni hastalığının bulunması olduğunu göstermistir. Bu tip çalısmalar genetik faktörlerin sizofreni etiyolojisinde ne kadar etkin olduğu göstermektedir. Özellikle idiyopatik zeka geriliği olan hastaların önemli bir kısmına (%5) tanı koydurması sebebiyle yaygınlasan subtelomerik FISH uygulamasının baska hastalıklar açısından da önemli olabileceğini düsünmek anlamlıdır. Çünkü subtelomerik bölgeler, gen içeriği bakımından çok zengin olup santral sinir sisteminin gelisimiyle iliskili genleri içeriyor olabilirler. Yakın zamanda yapılan, sizofreni tanısına eslik eden subtelomerik delesyonu olan olgu bildirimleri, bu hasta grubunda subtelomerik yeniden düzenlenimleri arastırmamızı sağlamıstır. Yine FISH çalısması ile tanısı konulabilen, sizofreni ile iliskili 22q11.2 delesyon sendromunu teshis edebilmek için, bu sendroma özgü prob da çalısmamızda kullanılmıstır. Ailesel sizofreni olgularının katıldığı çalısmamızda, hastaların ve 1. derece akrabalarının dismorfik muayeneleri ve HRB analizleri yapılmıs, ayrıca hastalara subtelomerik ve 22q11.2’ye özgü problarla FISH uygulanmıstır. FISH çalısmasına konu olan ilgili bölgelerde yeniden düzenlenimle karsılasılmamıstır. Hastaların klinik değerlendirmesinde literatürle uyumlu olarak obezite, kulak, damak anomalilerinin nispeten sık olması dikkat çekmistir. Bu bulgulara ek olarak hastaların bir bölümünde daha önceden bildirilmemis olan açık/soluk ten renginin görülmesi dopamin yolakları ve pigmentasyon iliskisi düsünüldüğünde ilgi çekicidir. Hastalarımızdan sizofreni tanısı olan bir anne ve kızında mozaik tipte Turner Sendromu ve trizomi X tespit edilmesi, ve literatürde bildirilen sizofreninin eslik ettiği Turner Sendromu olgularının neredeyse tamamının mozaik karyotipe sahip olması dikkate değerdir. Çalısmamız sizofreni hastalarında temel genetik yaklasımın gerekliliğini göstermistir. Subtelomerik yeniden düzenlenim ve sizofreninin iliskili olduğunu veya olmadığını gösterebilmek için daha genis çaplı çalısmalara gerek vardır.The family, twins and adoption studies concerning schizophrenia revealed that the main risk factor for the schizophrenia is the presence of a relative with schizophrenia. As the possible rich gene content which are important for central nervous system development, it is logical to consider the subtelomeric FISH studies in the investigation of neuropsychiatric disorders. In recent years, the case reports with subtelomeric rearrangement and schizophrenia are published and lead us to hypothesize that if there is a relation between subtelomeric rearrangements and schizophrenia. Besides, deletion of an another region, the 22q11.2, has been related with schizophrenia. 22q11.2 is a suitable target for FISH study with its specific probe and included in this project. The familial schizophrenia cases and their first degree relatives were the objects of this study. Dysmorphic examination and karyotyping (HRB) of all objects have been done. FISH studies were restricted to probands. The dysmorphic examination revealed the increased frequency of obesity, ear, and palate abnormalities among schizophrenia patients which was consistent with previous reports. Although our study also revealed the increased frequency of pallor among patients which is not mentioned before. In one of our family we have identified a girl wtih trisomy X and her mother with mosaic Turner syndrome. Although the subtelomeric and VCFS specific FISH studies ended with normal results; more studies including large number of patients and more sensitive technics are needed to clarify or to exclude the association between subtelomeric rearrangements and schizophrenia

Theoretical Frame of Michel Foucault’s “Biopolitics” Concept

Michel Foucault, iktidarı konu ettiği çalışmalarında, iktidarın ne olduğunu cevaplamaya çalışmamıştır. Ona göre iktidar zaten her yerdedir. Esas aradığı iktidarın öznelere ve bireylere nasıl uygulandığıdır. İktidarın özneyle olan ilişkisi, yönetim sorunsalı ve özne, çalışmalarının ana temalarıdır. Kliniğin Doğuşu ve Hapishanenin Doğuşu çalışmalarıyla incelemeye başladığı devletin izleme aygıtı, kapatma araçları, ceza dönüşümleri ve Panoptikon olgusu, Cinselliğin Tarihi isimli eseriyle biyopolitika kavramına dönüşmüştür. Bu çalışmanın amacı, biyopolitika kavramının Michel Foucault’nun düşünce sistemindeki yerinin incelenerek teorik çerçevesinin çizilmesidir.In the works which Michel Foucault debated power, he didn’t try to answer what the power is. For him, power is already in everywhere. He seeks how the powers is applied to individuals and subjects. The relation between power and subject, and governance problematic are main course of his works. The surveillance devices of the states, closure devices, punishment transformations and Panopticon concept which he started to examine with The Birth of the Clinic, Discipline and Punish: The Birth of the Prison, transformed into biopolitics concept with the History of Sexuality. The aim of this study is to analyze the Michel Foucault’s biopolitics concept and draw its theoretical frame

CHP'de "Ortanın Solu" Söylemi ve 1965 Seçimleri

İstanbul Üniversitesi’nde yüksek lisans tezi olarak sunulduktan sonra kitap haline getirdiğimiz bu çalışmanın amacı, Türk Siyasi Tarihi’nin en eski ve en önemli siyasi partilerinden biri olan Cumhuriyet Halk Partisi’nin, 27 Mayıs 1960 Askerî Müdahalesi ve 1961 Anayasası’nın ardından oluşan yeni politik ortamdaki duruşunu ve dönüşümünü inceleyerek, bu dönüşümün sonucunda ortaya çıkan ‘Ortanın Solu’ söyleminin 1965 Genel Seçimleri’ndeki etkilerini değerlendirmektir. Çalışma, CHP’nin tek parti dönemini ve iktidarını, on yıllık muhalefet dönemini ve 1960 sonrası yer aldığı koalisyon hükümetleri dönemini kapsamaktadır. CHP’nin bu dönemlerdeki merkez sola yönelik dönüşüm hareketleri incelenmiş, 1965 yılına gelindiğinde ise İsmet İnönü tarafından resmîleştirilen ‘Ortanın Solu’ söyleminin sebepleri, seçim çalışmalarındaki kullanımı ve 1965 seçimlerindeki yansımaları, parti içerisindeki ve parti dışındaki görüşler de göz önünde bulundurularak analiz edilmiştir. Sonuç olarak 1965 seçim sonuçları ayrıntılı bir şekilde incelenerek 1961 ve 1965 seçim sonuçları karşılaştırılmıştır. Böylece CHP’nin 1965 seçimlerindeki büyük oy kaybında ‘Ortanın Solu’ söyleminin etkili olup olmadığı değerlendirilmiştir

1965 GENEL SEÇİMLERİ ÖNCESİNDE “ORTANIN SOLU” SÖYLEMİNİN ORTAYA ÇIKIŞI

DergiPark: 339961klujfeasThe official declaration of Republican People’s Party (RPP) –which has important and long place inthe Turkish History– as left of center just before the General Elections of 1965, was the beginning ofRPP’s center left politics. This was also the first time that a major party in Turkey, representing itselfas left wing. Although the discourse which was said before elections, caused many discussions aboutbasis, cumulations, ideology in both inside of the party and outside of the party for about 2-3 months;can also seem as party’s democratic improvement and also 1960’s period inevitable result. The aimof this study is to investigate the reasons, historical background and introduce basis of left of centerdiscourse which was used before General Elections of 1965. Türk Siyasi Tarihi’nde önemli ve uzun yerlerden birine sahip olan Cumhuriyet Halk Partisi (CHP)’nin1965 Genel Seçimleri’ne çok az bir süre kala kendini resmen ortanın solunda bir parti olaraktanımlaması, CHP’nin merkez sol siyasete geçişinin ilk kıvılcımı olmuştur. Bu aynı zamanda, TürkSiyasi Tarihi’nde bu denli büyük ve köklü bir partinin kendini ilk defa sol siyasette gösterişidir. 1965Genel Seçimleri’nden çok kısa bir süre önce ortaya konulan bu söylemin temelleri, birikimleri,ideolojik yansımaları 2–3 aylık süreçte parti içi ve dışı birçok tartışmaya sebep olsa da; söylem,partinin bu sürece kadarki demokratik gelişiminin ve dönemin etkilerinin de kaçınılmaz bir sonucuolarak görülebilir. Bu çalışmanın amacı, 1965 Genel Seçimleri’ne gelinen süreçte, CHP’de ortanın solusöyleminin ortaya çıkışındaki tarihsel arka planı sunabilmek, söylemin temellerini ve nedenlerinisunabilmektir.&nbsp

A case with mutation in the TNFRSF1A gene

Tumor necrosis factor (TNF) receptor-associated periodic syndrome (TRAPS) is a rare autosomal dominant hereditary diseaseof the group of recurrent autoinflammatory syndromes. Theprognosis is generally good; the main risk is the developmentof amyloidosis. Corticosteroid therapy is usually administeredduring attacks. Severe cases require treatment with biologicalagents. In this study, DNA fragment analysis and next generation sequencing methods were applied to elucidate the patientwith recurrent fever and joint pain. A six-year-old girl with recurrent fever and joint pain was referred to a medical geneticsclinic for a etiologic study on the consideration of autoinflammatory disease. On physical examination, there was no featureexcept bilateral swelling in the knee. Echocardiography andknee magnetic resonance examination were unremarkable. Thesuperficial tissue ultrasonographic examination of the bilateralknee region was observed fluid accumulation 30 mm on the leftand 15mm on the right in the thickest site, at the suprapatellarlevel. Fluid was observed in the joint range. In the sample fromthe joint fluid, the white blood cell was 74000/m³. In the analysisof the peripheral blood, white blood cell count was 17.7x10³/µL,CRP: 31 mg/L, fibrinogen: 4.6g/L, sedimentation: 25 mm/h. The24-hour urine protein/creatinine was 0.27 mg/mg. FMF fragment analysis revealed no mutation and the diagnosis of FMFwas excluded. The next generation sequence analysis revealed alikely pathogenic, heterozygous c.362G&gt;A(R121Q; rs4149584) alteration of the TNFRSF1A gene (ENST00000162749). Then thesegregation analysis was planned. In this study, we pointed outthe TNFRSF1A mutation in periodic fever syndrome cases. Earlydiagnosis by genetic testing can prevent amyloidosis.</p

Foreign direct investment in european union and the effect of accesion: Empirical analysis

Küreselleşme dünyada oluşturulan iktisadi entegrasyonların önemini arttırmıştır. Bu iktisadi entegrasyonlardan en önemlilerinden biri ortak politikalarıyla üçüncü devletlere karşı tek bir devlet gibi yapılanma gösteren Avrupa Birliği’dir. Bu makalenin temel amacı bölgesel bir iktisadi entegrasyon olan Avrupa Birliği’ne üyeliğin üye ülkelerdeki Doğrudan Yabancı Sermaye Yatırımlarına (DYSY)etkilerini araştırmaktır. Çalışmada ülkelerdeki DYSY yapısının ortaya koyulması amacıyla ülkelerin DYSY potansiyelleri ve performansları karşılaştırılmıştır. Avrupa Birliği’ne üyeliğin DYSY üzerindeki etkilerinin incelendiği model test edilmiş ve elde edilen sonuçlardan hareketle Türkiye gibi bu entegrasyona aday olan ülkelerde olası üyeliğin DYSY’nı nasıl etkileyebileceği tartışılmıştır. Çalışmanın amacına uygun olarak oluşturulan model sonuçları ülkelerdeki ekonomik göstergelerin yanı sıra Avrupa Birliği’ne üyeliğin DYSY’nı olumlu etkilediğini ve üye olunan yıl sayısı arttıkça bu etkinin daha belirgin hale geldiğini göstermektedir.Globalization increases the importance of the economic integrations that are formed all around the world. One of the most important economic integrations is the European Union that displays a single country organization with their common policies against third parties The main objective of this study is to analyze the effect of membership to a regional economic integration, namely the European Union, on Foreign Direct Investment (FDI) inflows in these countries. In order to expose the FDI structure of these countries, a comparison between FDI potential and performance of countries is conducted. The effect of accession to the union is tested by a model and using the test results the effects of a possible membership of a candidate country such as Turkey on FDI inflows is discussed. The results of the model, that is formed appropriate to the objective of the study, show the favorable effects of the economic indicators of the country as well as the membership to the European Union on FDI inflows and this effect becomes apparent as the years of membership to the union increases

Targeted Next-Generation Sequencing of MLH1, MSH2, and MSH6 Genes in Patients with Endometrial Carcinoma under 50 Years of Age

Background: Lynch syndrome is an inherited cancer disorder that causes an increased lifetime risk of various types of cancers. Endometrial cancer is the most common extracolonic cancer in Lynch syndrome. Guidelines recommend that patients with endometrial cancer younger than 50 years of age should be evaluated for Lynch syndrome. Molecular analysis of the mismatch repair genes and EPCAM gene is required for a definitive diagnosis of Lynch syndrome. Aims: To report the mutation analysis of mismatch repair genes using targeted next-generation sequencing in endometrial cancer diagnosed patients <50 years of age. Study Design: Retrospective cross-sectional study. Methods: Seventy-nine endometrial cancer diagnosed patients <50 years of age underwent genetic counseling. They were selected among 1094 consecutive endometrial cancer patients between 2006 and 2017. Molecular analysis of MLH1, MSH2, and MSH6 genes was performed in 79 patients by using next-generation sequencing. Deletion/duplication analysis of mismatch repair genes and EPCAM gene was also performed in 79 patients by using the multiplex ligation-dependent probe amplification method. Results: Germline testing of mismatch repair genes was performed in 79 endometrial cancer patients. Lynch syndrome was confirmed in 4 patients (5%; 4/79). A total of 14 variants (6 in MSH2, 5 in MLH1, 3 in MSH6 genes) were found in 14 patients. Four variants were assessed as pathogenic/likely pathogenic, and 10 variants were assessed as variants of uncertain significance. Conclusion: Lynch syndrome should be investigated in patients diagnosed with endometrial cancer that are less than 50 years of age due to the increased lifetime risk of developing cancer