A computer program for making tables of soil analytical data

3 páginas, 1 figura, 2 referencia.[ES]: Se describe brevemente un programa para elaborar, de forma automática, tablas de datos analíticos de suelos. El programa, implementado en el Centro de Cálculo, Universidad de Sevilla, con el nombre «ALBARlZA», se escribió en FORTRAN IV y procesó en un ordenador UNIVAC 1108.[EN]: This note describes briefly a computer program which was developed to produce printed tables of soil analytical data in conventional form. The program, nominated as «ALBARIZA», was written in FORTRAN IV and processed on an UNIVAC 1108 computer at Centro de Cálculo, Universidad de Sevilla.Peer reviewe

Caracterización genética de ovinos criollos colombianos

ABSTRACT: indigenous breeds are important for poor farmers because of their natural selection against harsh environments and adaptation to regional conditions. However, inbreeding of indigenous sheep populations has increased in Colombia due to indiscriminate cross-breeding with foreign animals and lack of reproductive controls, with subsequent loss in productivity, which poses a great risk for the conservation of valuable genes. Objective: to determine the genetic diversity in Colombian indigenous sheep by using a panel of 10 microsatellite molecular markers. Methods: blood samples from 362 individuals from 43 farms in 11 Colombian provinces were genotyped and analyzed for a panel of 10 microsatellite markers. Results: a total of 134 alleles were found (13.4 alleles/locus on average) with a range of observed and expected heterozygosity of 0.428 to 0.831 and 0.615 to 0.855, respectively, and 0.742 polymorphic information content (PIC). The average Wright F-statistics (FIS ) of the breeds was 0.107, suggesting moderate levels of inbreeding. Colombian sheep showed a low level of genetic differentiation among breeds (FST = 0.054) and STRUCTURE analysis showed complex patterns of admixture in the breeds. Conclusion: overall, Colombian sheep have high genetic variability, which is very important for future conservation programs and genetic improvement.RESUMEN: las razas animales autóctonas son importantes para los agricultores de escasos recursos a causa de su selección natural contra el duro ambiente y su adaptación a condiciones regionales. Sin embargo en Colombia, debido al cruce indiscriminado con razas foráneas y a la falta de control de la reproducción, ha aumentado la consanguinidad en las poblaciones de ovinos criollos y por lo tanto la pérdida en la productividad, lo que supone un gran riesgo para la conservación de genes valiosos. Objetivo: determinar la diversidad genética en razas criollas de ovinos colombianos utilizando análisis por microsatélites. Métodos: se visitaron 43 granjas localizadas en 11 departamentos del país, en las cuales se tomaron muestras de sangre a 362 individuos. Las muestras fueron genotipadas y analizadas para un panel de 10 marcadores microsatélites. Resultados: un total de 134 alelos fueron encontrados (13,4 alelos/locus en promedio), con un rango de heterocigocidad observada y esperada de 0,428 a 0,831 y 0,615 a 0,855, respectivamente, y un contenido de información polimórfica (PIC) promedio de 0,742. El Wright F-statistics (FIS) promedio de las razas evaluadas fue 0,107, lo cual sugiere que las razas tienen niveles moderados de consanguinidad. Las ovejas colombianas presentaron un bajo grado de diferenciación genética entre las distintas razas (FST = 0,054) y el análisis de STRUCTURE mostro complejos patrones de mezcla en las razas estudiadas. Conclusión: en términos generales, las ovejas colombianas presentan una alta variabilidad genética lo cual es muy importante para futuros programas de conservacion y mejoramiento genetico

Los pequeños productores están limitados para adoptar nuevos cultivos. el caso de las hierbas aromáticas en la región de sumapaz, cundinamarca

La región de Sumapaz fue pionera en la producción comercial de hierbas aromáticas en Colombia. A pesar de los varios intentos por establecer y difundir estos cultivos desde mediados de 1990 hasta comienzos de 2008, la meta no se cumplió. Basada en el estudio de cinco casos de adopción, esta investigación definió como su principal objetivo determinar las causas de la no adopción del cultivo de hierbas aromáticas por parte de los pequeños agricultores de la región-provincia del Sumapaz. La información se recogió mediante entrevistas con cuestionarios semiestructurados, dirigidas a productores y expertos. De las 13 causales de no adopción detectadas por el estudio, las siguientes fueron consideradas críticas: tecnología de producción y asistencia técnica inapropiadas, aplicación inadecuada de la tecnología, escasez o ausencia total de información de mercado, y finalmente, deficiencias en logística, en la organización de la producción, y en calidad y cantidad de la oferta. Este último factor, unido a la falta de organización de la producción y la escasez de recursos de los pequeños productores, ha limitado la adopción de las especies aromáticas introducidas. Como consecuencia, los pequeños productores no han logrado sostener su cumplimiento de las exigencias del mercado de exportación de aromáticas de consumo en fresco, lo que también ha determinado su salida del negocio

Genetic mapping of microsatellite markers around the arcelin bruchid resistance locus in common bean

The deployment in common beans (Phaseolus vulgaris L.) of arcelin-based bruchid resistance could help reduce post-harvest storage losses to the Mexican bean weevil [(Zabrotes subfasciatus (Boheman)]. Arcelin is a member of the arcelin-phytohemagglutinin-α-amylase inhibitor (APA) family of seed proteins, which has been extensively studied but not widely used in bean breeding programs. The purpose of this study was to evaluate microsatellite markers for genetic analysis of arcelin-based bruchid resistance and to determine the orientation of markers and the rate of recombination around the APA locus. A total of 10 previously developed microsatellites and 22 newly developed markers based on a sequenced BAC from the APA locus were screened for polymorphism and of these 15 were mapped with an F(2) population of 157 individuals resulting from a susceptible × resistant cross of SEQ1006 × RAZ106 that segregated for both the arcelin 1 allele and resistance to the bruchid, Z. subfasciatus. Microsatellites derived from APA gene sequences were linked within 0.8 cM of each other and were placed relative to the rest of the b04 linkage group. In a comparison of genetic to physical distance on the BAC sequence, recombination was found to be moderate with a ratio of 125 kb/cM, but repressed within the APA locus itself. Several markers were predicted to be very effective for genetic studies or marker-assisted selection, based on their significant associations with bruchid resistance and on low adult insect emergence and positions flanking the arcelin and phytohemagglutinin genes

Caracterización genética de las razas Hartón del Valle, Angus, Brangus, Holstein y Senepol en Colombia, usando 10 marcadores microsatélites

ABSTRACT: The objective of this paper is to establish a genetic characterization of the Senepol (S, n=49), Holstein (H, n= 60), Hartón del Valle (HV, n=60), Angus (A, n=61) and Brangus (Br, n=60) cattle breeds in Colombia, by using the following microsatellite markers: SPS115, INRA64, ETH225, ETH10, BM1824, INRA37, TGLA122, TGLA126, INRA32, and BM2113. A total of 142 alleles were obtained for ten analyzed loci, considering the five cattle breeds as a whole. The number of alleles per locus ranged from 9 (INRA64 and 1824) to 22 (TGLA122). The expected heterozygosity was between 0.79 (INRA32) and 0.90 (INRA37) in all the cattle breeds, respectively; and medium heterozygosity was 0.84. The average number of alleles per breed varied from 9.2 in the Senepol breed to 10.3 in the Holstein breed. The expected heterozygosity range varied from 0.75 in the Hartón del Valle breed and 0.82 in the Holstein breed, with an average of 0.79. Hardy Wienberg disequilibrium was observed (p>0.05) when the populations were analyzed with all the markers. All the populations presented a heterozygote deficit, which could be the result of a strong endogamy tendency within all the herds. The markers used in this study allowed a genetic characterization of the analyzed populations. The microsatellites panel in the Hartón del Valle breed should be increased in order to increase the reliability value. Microsatellite panels could solve parenthood cases for the remainder breeds.RESUMEN: El objetivo de este trabajo fue caracterizar genéticamente las razas bovinas Senepol (S, n=49), Holstein (H, n= 60), Hartón del Valle (HV, n=60), Angus (A, n=61) y Brangus (Br, n=60) en Colombia, con los marcadores microsatélites SPS115, INRA64, ETH225, ETH10, BM1824, INRA37, TGLA122, TGLA126, INRA32 y BM2113. En total, 142 alelos fueron encontrados en los diez loci analizados, considerando las cinco razas como un todo. El número de alelos por locus estuvo entre 9 (INRA64 y BM1824) y 22 (TGLA122). La Heterocigosidad esperada a través de todas las razas varió entre 0.79 (INRA32) y 0,90 (INRA37) y heterocigosidad media esperada de 0.84. El número promedio de alelos por raza varió de 9.2 en la raza S a 10.3 en la raza H. El rango de la Heterocigosidad esperada entre las razas varió entre 0.75 en la raza HV y 0.82 en la raza H, con una media de 0.79. Al analizar las poblaciones con el total de marcadores, todas se encontraron en desequilibrio de Hardy Weinberg (p>0.05). Todas las poblaciones presentaron un déficit de heterocigotos, para todas las poblaciones, lo que podría ser el resultado de la fuerte tendencia a la endogamia dentro de los diferentes hatos. Los resultados indicaron que los marcadores utilizados en este estudio permitieron caracterizar genéticamente las poblaciones analizadas. En el caso de la Raza HV, se debe aumentar el panel de microsatélites para aumentar el valor de confiabilidad. Para las demás razas el panel de microsatélites permitiría resolver casos de filiación

Integration of artificial intelligence and precision oncology in Latin America

Next-generation medicine encompasses different concepts related to healthcare models and technological developments. In Latin America and the Caribbean, healthcare systems are quite different between countries, and cancer control is known to be insufficient and inefficient considering socioeconomically discrepancies. Despite advancements in knowledge about the biology of different oncological diseases, the disease remains a challenge in terms of diagnosis, treatment, and prognosis for clinicians and researchers. With the development of molecular biology, better diagnosis methods, and therapeutic tools in the last years, artificial intelligence (AI) has become important, because it could improve different clinical scenarios: predicting clinically relevant parameters, cancer diagnosis, cancer research, and accelerating the growth of personalized medicine. The incorporation of AI represents an important challenge in terms of diagnosis, treatment, and prognosis for clinicians and researchers in cancer care. Therefore, some studies about AI in Latin America and the Caribbean are being conducted with the aim to improve the performance of AI in those countries. This review introduces AI in cancer care in Latin America and the Caribbean, and the advantages and promising results that it has shown in this socio-demographic context

BREEDING BEHAVIOR OF A REINTRODUCED PAIR OF ANDEAN CONDOR (VULTUR GRYPHUS) IN THE CENTRAL ANDES OF COLOMBIA

Abstract · Between 1989–2013, 69 Andean Condors (Vultur gryphus) were reintroduced in eight sites in the Andes of Colombia. Due to the lack of monitoring programs, little is known about the ecology and biology of these reintroduced populations. We present the first observations on a reintroduced breeding pair. For 36 months, we examined the breeding behavior of a pair of condors in a nest cave in the central Andes of Colombia. In June 2013, we observed a chick of about 6–7 months of age in the nest cave. The most remarkable outcomes of these observations are (1) that females spend more time guarding the chick whereas (2) males focus on guarding the nest cave. While the chick was in the nest cave (80 h of observations), the female was present in the vicinity of the nest cave and attended the chick for a longer time period than the male. However, in the absence of a chick or eggs (880 h of observations), the male was observed more often in the vicinity of the nest cave than the female. Nevertheless, we found no significant differences in vigilance patterns between the sexes. Intraspecific interactions of the Andean Condor with other raptors in the area were recorded during the observation period of this study. We make some predictions on the timing of reproduction of condors based on this reintroduced pair in Colombia and compare them with those reported elsewhere. Tracking released populations of condors is essential to ensure the positive impact of reintroduction efforts. Resumen · Comportamiento reproductivo de una pareja reintroducida de Cóndor Andino (Vultur gryphus) en la cordillera Central de Colombia Entre 1989–2013, 69 individuos de Cóndor Andino (Vultur gryphus) fueron liberados en ocho núcleos de repoblación en la región andina de Colombia. Debido a la falta de seguimiento de estas liberaciones, se conoce poco sobre la biología y ecología de la especie en esos núcleos de repoblación. Presentamos la primera información de seguimiento del comportamiento reproductivo de una pareja en los núcleos de repoblación. Por un periodo de 36 meses examinamos el comportamiento reproductivo de esa pareja en un nido encontrado en la cordillera Central de Colombia. En junio de 2013 registramos la presencia de un polluelo de aproximadamente seis a siete meses de edad en el nido. Mientras el polluelo estuvo en el nido (80 h de observación), la hembra permaneció dentro de la vecindad e interactuó por más tiempo con el polluelo en comparación con el macho. En ausencia de polluelo o postura (880 h de observación), el macho permaneció dentro del territorio por un mayor número de horas en comparación con la hembra, aunque estas diferencias no fueron estadísticamente significativas. Registramos interacciones interespecíficas directas entre el Cóndor Andino y rapaces que ingresaron a su área de anidación. El seguimiento de las poblaciones de cóndor liberadas es clave para garantizar el impacto positivo de los esfuerzos de reintroducción como herramienta para la conservación

Genetic characterization of Colombian indigenous sheep

Background: indigenous breeds are important for poor farmers because of their natural selection against harsh environments and adaptation to regional conditions. However, inbreeding of indigenous sheep populations has increased in Colombia due to indiscriminate cross-breeding with foreign animals and lack of reproductive controls, with subsequent loss in productivity, which poses a great risk for the conservation of valuable genes. Objective: to determine the genetic diversity in Colombian indigenous sheep by using a panel of 10 microsatellite molecular markers. Methods: blood samples from 362 individuals from 43 farms in 11 Colombian provinces were genotyped and analyzed for a panel of 10 microsatellite markers. Results: a total of 134 alleles were found (13.4 alleles/locus on average) with a range of observed and expected heterozygosity of 0.428 to 0.831 and 0.615 to 0.855, respectively, and 0.742 polymorphic information content (PIC). The average Wright F-statistics (FIS) of the breeds was 0.107, suggesting moderate levels of inbreeding. Colombian sheep showed a low level of genetic differentiation among breeds (FST = 0.054) and STRUCTURE analysis showed complex patterns of admixture in the breeds. Conclusion: overall, Colombian sheep have high genetic variability, which is very important for future conservation programs and genetic improvement