Molecular heterogeneity and CXorf67 alterations in posterior fossa group A (PFA) ependymomas

Of nine ependymoma molecular groups detected by DNA methylation profiling, the posterior fossa type A (PFA) is most prevalent. We used DNA methylation profiling to look for further molecular heterogeneity among 675 PFA ependymomas. Two major subgroups, PFA-1 and PFA-2, and nine minor subtypes were discovered. Transcriptome profiling suggested a distinct histogenesis for PFA-1 and PFA-2, but their clinical parameters were similar. In contrast, PFA subtypes differed with respect to age at diagnosis, gender ratio, outcome, and frequencies of genetic alterations. One subtype, PFA-1c, was enriched for 1q gain and had a relatively poor outcome, while patients with PFA-2c ependymomas showed an overall survival at 5 years of > 90%. Unlike other ependymomas, PFA-2c tumors express high levels of OTX2, a potential biomarker for this ependymoma subtype with a good prognosis. We also discovered recurrent mutations among PFA ependymomas. H3 K27M mutations were present in 4.2%, occurring only in PFA-1 tumors, and missense mutations in an uncharacterized gene, CXorf67, were found in 9.4% of PFA ependymomas, but not in other groups. We detected high levels of wildtype or mutant CXorf67 expression in all PFA subtypes except PFA-1f, which is enriched for H3 K27M mutations. PFA ependymomas are characterized by lack of H3 K27 trimethylation (H3 K27-me3), and we tested the hypothesis that CXorf67 binds to PRC2 and can modulate levels of H3 K27-me3. Immunoprecipitation/mass spectrometry detected EZH2, SUZ12, and EED, core components of the PRC2 complex, bound to CXorf67 in the Daoy cell line, which shows high levels of CXorf67 and no expression of H3 K27-me3. Enforced reduction of CXorf67 in Daoy cells restored H3 K27-me3 levels, while enforced expression of CXorf67 in HEK293T and neural stem cells reduced H3 K27-me3 levels. Our data suggest that heterogeneity among PFA ependymomas could have clinicopathologic utility and that CXorf67 may have a functional role in these tumors

Le sentier des rives

Terminus, tout le monde descend, nous sommes à l’arrêt de bus ‘‘la place des pêcheurs’’, ligne 68, situé sur la commune de Bouaye. Non loin de là, la rue du port nous mène au fond d’une impasse, des maisons d’habitation, une voie étroite est séparée d’un large parking par une allée d’arbustres. Quelques aînés jouent à la pétanque à l’ombre des feuilles d’un grand chêne. Rien ne laisse deviner la présence de l’Acheneau. Pourtant, c’est en ce point précis que Bouaye rentre en contact avec sa fr..

Un vocabulaire maritime

La rue du port, la place des pêcheurs, le port de la Morinière, le port Hamoneau, le port de la Castière, le vieux port - et j’en passe -, l’ex bâtiment du service des phares et balises, mais aussi les arrêts de bus - Caboteurs, Terra Neuvas, Bélouga…-. Nous ne sommes ni à Boulogne-Sur-Mer, ni à Douarnenez ni même aux Sables d’Olonne, mais bien à Bouaye, Brains, Port-Saint-Père, Cheix-en-Retz, Rouans… Pourtant, ici flotte un vocabulaire maritime inattendu alors même que nous sommes en territo..

L’Attiko monopati de Jordi Ballesta

Jordi Ballesta est géographe, chercheur et photographe. En novembre 2000, il s’installe à Athènes dans le but de travailler sur la part de l’espace urbain qui échappe à la main des urbanistes. Cependant, une question se pose : comment produire de la connaissance sans savoir parler un mot de la langue du pays dans lequel il se trouve ? Pour cela, il met en place une stratégie qui lui permet de contourner ses lacunes en faisant usage de la voie graphique. Et plus spécialement de la photographie..

Terminus, tout le monde descend

Prendre les terminus des bus de la métropole nantaise comme points de parcours du sentier métropolitain. Pourquoi choisir les terminus ? Car ce sont les marqueurs de la ville accessible, où au-delà, il n’est plus possible de se déplacer sans l’usage d’un véhicule personnel. En cela, marcher entre ces points et jouer de la frontière de ce territoire accessible soulève de nombreuses interrogations : comment la métropole arbitre entre les territoires connectés et ceux qui ne le sont pas ? Qu’..

Transcriptomic analysis on freshwater mussels for identification of potential biomarkers to monitor water ecosystems

Stress-specific expression of cellular proteins in responses to exogenous exposure and resulting physiological alteration provides important insight into the field of ecological research. Due to its habitat, feeding, lifestyle and physiologic properties, mussel has become an important indicative measure of aquatic environment pollution in order to assess effect of these pollution in aquatic life. In order to minimize the threats imposed on the aquatic ecosystem and advancement of sustainable lifestyle for human, recent ecological studies are more concern about monitoring different bioindicative properties. In this study, two widely distributed freshwater bivalve mussel species Anodonta anatina and Unio tumidus was used to conduct comparative study on the transcriptome of these species in order to identify and quantify the expressed transcripts on both species and investigate their biomarker properties in mussels for monitoring heavy metal or toxic exposure. mRNA was isolated and converted to cDNA through reverse transcription PCR. Quality and quantity assessments of purity, fragment size and concentration was performed. Each cDNA sample was barcoded and amplified for cDNA library preparation and nanopore sequencing. Basic bioinformatics tools were used to identify the transcripts for transcriptomic analysis. The findings shows some common mitochondrial and ribosomal transcripts along with a wide range of conserved and abundant transcript variants in mussels with important biomarker properties. Some of the transcripts exhibits expression in multiple samples suggesting characteristic bioindicator properties. Also in this study, a pipeline for transcriptomic analysis was generated and critical steps in the procedure were identified and discussed

Sténose de l'artère rénale de l'enfant (à propos de 5 cas)

CAEN-BU Médecine pharmacie (141182102) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Contexte réglementaire applicable au circuit du médicament et avantages présentés par son informatisation

CHATENAY M.-PARIS 11-BU Pharma. (920192101) / SudocSudocFranceF

L'oubli dirigé dans la maladie d'Alzheimer

L'oubli dans la maladie d'Alzheimer fait l'objet de nombreuses recherches en psychologie. Alors qu'il est le plus souvent considéré comme un déficit mnésique, nous pensons qu'il est plutôt la conséquence d'une baisse du contrôle attentionnel. Nous allons nous intéresser à ce contrôle attentionnel au travers le paradigme de l'oubli dirigé (Bjork, 1970). Notre première expérience consiste à observer l'effet de l'oubli dirigé chez des participants malades Alzheimer comparés à (des jeunes, des âgés, des MCI), selon qu'il y ait ou pas un lien sémantique entre les items à mémoriser. Les expériences deux et trois consistent en une étude longitudinale du groupe MCI (6 mois plus tard) selon les conditions sans et avec lien sémantique. L'expérience quatre a pour but d'observer l'oubli dirigé chez des participants MCI et MA avec du matériel autobiographique. Les résultats de ces quatre expériences ont confirmé l'hypothèse selon laquelle les participants Alzheimer présentent bien des déficits exécutifs. Le lien sémantique augmente le degré de contrôle attentionnel. L'autobiographie accentue l'effet d'oubli dirigé chez les MCI, chez les participants Alzheimer elle provoque une inhibition comportementale en rappel, et empêche l'inhibition de la réponse autobiographique en reconnaissance. D'un point de vue pratique ce paradigme pourrait être un bon indicateur pour un diagnostic précoce.Forgetting in Alzheimer's disease is the subject of many researchs in psychology. Then it is seen as a memory deficit, we believe it like the results of a decrease in attentionnal control. We have been interested in this attentionnal control through the paradigm of directed forgetting (Bjork, 1970). Our first experience observes the directed forgetting in Alzheimer subjects compared to other three groups (young, older, MCI) as to wether or not a semantic link between the items to remember. Experiences two and three consist of a longitudinal's study with the MCI (six month later). Under the condition with and without semantic link. Experience four aims to observe the effect of direct forgetting with autobiographical's items. The result of these four experiences have confirmed the hypothesis that the Alzheimer's subjects have many executives deficits. We proposed that the semantic link increases the degree of attentionnal control. While autobiographical accentuates the effect of directed forgetting in MCI, in Alzheimer's disease it causes behavioral inhibition in recall and prevents the inhibition of response autobiographical in recognition. Finally this paradigm could be a good indicator in early diagnosis.MONTPELLIER-BU Lettres (341722103) / SudocSudocFranceF