Introducción a R y RStudio

Se muestra como instalar R y RStudio y una introducción básica de su uso. 1. Introducción a R, 2. Instalación de R y RStudio 3. Instalación de paquetes 8 4. Introduciendo ordenes por consola y códigosSe muestra como instalar R y RStudio y una introducción básica de su uso. 1. Introducción a R, 2. Instalación de R y RStudio 3. Instalación de paquetes 8 4. Introduciendo ordenes por consola y código

Contribución del Bosque en Cerro Pelado a la Mitigación del Cambio Climático: Almacenamiento y Secuestro de Carbono

This study deals with the estimation of the carbon associated to the Above Ground Biomass, in a permanent plot of measurement located in the Cerro Pelado Tropical Hydrology Observatory in Gamboa, Panama. The objective is to highlight the contribution made by one-hectare of this forest to the local Climate Change mitigation. We employed a relation to carbon storage and sequestration, based on the important species of the tree community with diameter at breast height equal to or greater than 10 cm. It was found an increase in the Above Ground Biomass at the plot, with values of: 193 Mg*ha-1, 218 Mg*ha-11 and 225 Mg*ha-1, for the 2008, 2012 and 2015 censuses, respectively. The net growth in Above Ground Biomass is eliminating approximately 7 to 8 Mg de CO2*ha-1year-1 from the atmosphere, which means that it is acting as a sink and sequestrator of CO2. In this habitat, it is recognizable the important contribution of the Pera arborea species in terms of sustaining carbon sequestration in the Above Ground Biomass.Keywords: Gamboa, Panama, Above Ground Biomass, Climate Change, CO

Estimación de las distribuciones del tamaño de partícula del suelo a partir de mediciones de hidrómetro

El presente texto trata sobre el análisis de datos provenientes de ensayos de suelo por el método del hidrómetro para determinar las texturas con respecto a la clasificación USDA. Un primer aspecto del análisis de datos granulométricos de suelo usando herramientas informáticas creadas en R se presentó en el documento Funciones de R para graficar, clasificar y explorar los datos de textura del suelo (Jiménez 2019). Allíe explicó el uso del paquete de R soiltexture (Moeys 2018). El motivo de realizar estos materiales educativos, es el de dar mayor visibilidad a las técnicas informáticas libres y gratuitas que son útiles en las tareas que realizan nuestros estudiantes, técnicos, docentes e investigadores en ingeniería.El presente texto trata sobre el análisis de datos provenientes de ensayos de suelo por el método del hidrómetro para determinar las texturas con respecto a la clasificación USDA. Un primer aspecto del análisis de datos granulométricos de suelo usando herramientas informáticas creadas en R se presentó en el documento Funciones de R para graficar, clasificar y explorar los datos de textura del suelo (Jiménez 2019). Allíe explicó el uso del paquete de R soiltexture (Moeys 2018). El motivo de realizar estos materiales educativos, es el de dar mayor visibilidad a las técnicas informáticas libres y gratuitas que son útiles en las tareas que realizan nuestros estudiantes, técnicos, docentes e investigadores en ingeniería

Funciones de R para graficar, clasificar y explorar los datos de textura del suelo

Buena parte de este documento es extraído y editado de Julien Moeys, 2018. Se presenta el uso de algunas de las funciones del paquete soiltexture. El paquete soiltexture proporciona una caja de herramientas para analizar los datos de textura del suelo en R. El análisis de textura del suelo se enfoca en las partículas que tienen menos de dos milímetros de diámetro que incluyen arena, limo y arcilla. 1. Introducción 2. Textura del suelo, triángulos de textura y clases de textura 3. Instalación del paquete 4. Trazado de triángulos de textura del suelo y sistemas de clasificación 5. Gráficas sobrepuestas de dos sistemas de clasificación de textura del suelo 6. Graficando datos de textura del suelo 7. Gráficas de burbujas de los datos de textura de suelo y una 3ra variable 8. Ejemplo con datos reales de textura de suelo 9. Tipo textural de suelo como otra variableBuena parte de este documento es extraído y editado de Julien Moeys, 2018. Se presenta el uso de algunas de las funciones del paquete soiltexture. El paquete soiltexture proporciona una caja de herramientas para analizar los datos de textura del suelo en R. El análisis de textura del suelo se enfoca en las partículas que tienen menos de dos milímetros de diámetro que incluyen arena, limo y arcilla. 1. Introducción 2. Textura del suelo, triángulos de textura y clases de textura 3. Instalación del paquete 4. Trazado de triángulos de textura del suelo y sistemas de clasificación 5. Gráficas sobrepuestas de dos sistemas de clasificación de textura del suelo 6. Graficando datos de textura del suelo 7. Gráficas de burbujas de los datos de textura de suelo y una 3ra variable 8. Ejemplo con datos reales de textura de suelo 9. Tipo textural de suelo como otra variabl

Guía de Introducción a la Dendrología Tropical para Panamá

Para cualquier persona que trabaje con plantas, ya sea en bosques naturales, plantaciones forestales, cultivos vegetales o jardines, le resultará muy conveniente conocer un nombre para cada tipo de planta. Las personas amantes de la bella naturaleza, los jardineros, los dueños de finca; los ingenieros agrónomos, forestales, de manejo de cuencas y ambientales; los biólogos, los ecólogos y los botánicos, tienen mucho interés en en reconocer las plantas en el campo con base en sus características e identificarlas por su nombre. Este documento tiene el objetivo de ayudar a la identificación taxonómica hasta familia o género de muchos árboles nativos de Panamá utilizando las características morfológicas vegetativas (sin la ayuda de las flores o frutos para reconocerlos árboles). El estudio de la identificación de los árboles se conoce como Dendrología. Dendros es una palabra griega que significa árbol. Algunos autores incluyen la identificación de otras plantas leñosas como arbustos y lianas, pero como en los trópicos hay tantas especies de árboles, otros autores, como Holdridge, sugieren que la Dendrología debe restringirse exclusivamente al estudio de la identificación de especies arbóreas. Los bosques tropicales resaltan por su alta diversidad de especies, hay alrededor de 2,300 especies de árboles estrictamente hablando, y otras 700 especies más consideradas plantas arborescentes, reportadas para Panamá. Por otro lado, si consideramos la estructura espacial y composición de la vegetación, en los bosques de Panamá puedes encontrar 200 o más especies de árboles con sólo recorrer unos pocos cientos de metros.Para cualquier persona que trabaje con plantas, ya sea en bosques naturales, plantaciones forestales, cultivos vegetales o jardines, le resultará muy conveniente conocer un nombre para cada tipo de planta. Las personas amantes de la bella naturaleza, los jardineros, los dueños de finca; los ingenieros agrónomos, forestales, de manejo de cuencas y ambientales; los biólogos, los ecólogos y los botánicos, tienen mucho interés en en reconocer las plantas en el campo con base en sus características e identificarlas por su nombre. Este documento tiene el objetivo de ayudar a la identificación taxonómica hasta familia o género de muchos árboles nativos de Panamá utilizando las características morfológicas vegetativas (sin la ayuda de las flores o frutos para reconocerlos árboles). El estudio de la identificación de los árboles se conoce como Dendrología. Dendros es una palabra griega que significa árbol. Algunos autores incluyen la identificación de otras plantas leñosas como arbustos y lianas, pero como en los trópicos hay tantas especies de árboles, otros autores, como Holdridge, sugieren que la Dendrología debe restringirse exclusivamente al estudio de la identificación de especies arbóreas. Los bosques tropicales resaltan por su alta diversidad de especies, hay alrededor de 2,300 especies de árboles estrictamente hablando, y otras 700 especies más consideradas plantas arborescentes, reportadas para Panamá. Por otro lado, si consideramos la estructura espacial y composición de la vegetación, en los bosques de Panamá puedes encontrar 200 o más especies de árboles con sólo recorrer unos pocos cientos de metros

Análisis Prospectivo de la Detección Hiperespectral de Cultivos de Arroz (Oryza Sativa L.)

The objective of this work is to perform a prospective analysis of the wavelengths that can be used to recognize a rice crop due to its phenological status and variety. For this purpose, field measurements of spectral signature in the 350 nm -1049 nm range were employed. The rice cultivars FCA 616FL and IDIAP 54-05 were used. The study site was located in the Juan Hombrón area in the Coclé province, Panama. A principal component analysis (PCA) was carried out, which resulted in the lengths 728.16, 677.89 and 785.48 nm let phenological differentiation within the cultivar FCA 616FL and IDIAP 54-05, the lengths 729.72, 814.58 and 666.81 nm let distinguish between crop varieties FCA 616FL and IDIAP 54-05 in vegetative phase.Keywords: Rice, reflectance, hyperspectral signature, phonological state

Estadística con R

Este material complementario se preparó con el propósito de ser una guía básica de introducción a la computación estadística y al análisis de datos con el sistema R para el curso de estadística que se dicta a los estudiantes de pregrado de la Universidad Tecnológica de Panamá. Le llamamos material complementario porque sobre R existen muchísimos libros, folletos y guías; además de blogs y tutoriales, que están disponibles en la Internet de manera gratuita. Los objetivos principales de un curso de Estadística con R son: primero, mostrar a los estudiantes cómo se utiliza el razonamiento estadístico en la investigación; segundo, permitir a los estudiantes realizar con confianza análisis estadísticos sencillos e interpretar los resultados; y último, sensibilizar a los estudiantes sobre cuestiones estadísticas básicas en cuanto a la calidad de los datos como: la aleatorización y el que las replicas sean independientes. Los objetivos principales de un curso de Estadística con R son: primero, mostrar a los estudiantes cómo se utiliza el razonamiento estadístico en la investigación; segundo, permitir a los estudiantes realizar con confianza análisis estadísticos sencillos e interpretar los resultados; y último, sensibilizar a los estudiantes sobre cuestiones estadísticas básicas en cuanto a la calidad de los datos como: la aleatorización y el que las replicas sean independientes.Este material complementario se preparó con el propósito de ser una guía básica de introducción a la computación estadística y al análisis de datos con el sistema R para el curso de estadística que se dicta a los estudiantes de pregrado de la Universidad Tecnológica de Panamá. Le llamamos material complementario porque sobre R existen muchísimos libros, folletos y guías; además de blogs y tutoriales, que están disponibles en la Internet de manera gratuita. Los objetivos principales de un curso de Estadística con R son: primero, mostrar a los estudiantes cómo se utiliza el razonamiento estadístico en la investigación; segundo, permitir a los estudiantes realizar con confianza análisis estadísticos sencillos e interpretar los resultados; y último, sensibilizar a los estudiantes sobre cuestiones estadísticas básicas en cuanto a la calidad de los datos como: la aleatorización y el que las replicas sean independientes. Los objetivos principales de un curso de Estadística con R son: primero, mostrar a los estudiantes cómo se utiliza el razonamiento estadístico en la investigación; segundo, permitir a los estudiantes realizar con confianza análisis estadísticos sencillos e interpretar los resultados; y último, sensibilizar a los estudiantes sobre cuestiones estadísticas básicas en cuanto a la calidad de los datos como: la aleatorización y el que las replicas sean independientes

Guía de árboles y plantas arborescentes de la Universidad Tecnológica de Panamá, Extensión Tocumen

Los árboles son estructuralmente y como hábito de vida lo más extraordinario dentro del reino vegetal. Quién de niño no se ha subido a un árbol para tomar de sus frutos; y en días de calor, quién no ha buscado refugiarse bajo su sombra; intuitivamente desde pequeños reconocemos en los árboles un gran valor por los beneficios que nos proveen y nos sentimos poderosamente cautivados por ellos. Por el rol tan importante que desempeñan en: la protección de las fuentes de agua, como refugio y alimento para la fauna silvestre, la conservación de especies en riesgo, como barrera contra el ruido, el viento y contaminantes; por todo lo que significan ambientalmente, la Universidad Tecnológica de Panamá como institución, sus docentes, investigadores, administrativos y estudiantes mantienen un respeto permanente hacia los árboles, los espacios arborizados y la naturaleza en las distintas sedes a lo largo del país. Es por ese respeto y amor profundo por la naturaleza y con el ánimo de resaltar la diversidad plantas, que el Centro de Investigaciones Hidráulicas e Hidrotécnicas (CIHH) contempló documentar cuáles especies de árboles existen en la Universidad Tecnológica de Panamá, Extensión Tocumen, a través de una pequeña obra escrita. La finalidad de la obra es ser instructiva; los árboles y otras plantas arborescentes cultivadas como elementos del paisaje urbano que vemos a diario despierta la curiosidad de muchas personas, que se muestran interesadas en conocerlos y distinguirlos. Generalmente, la primera distinción que hacen es reconocer su utilidad como: ornamentales, frutales o maderables; pero la curiosidad no queda allí, no. Ese conocimiento de saber cómo se llaman, cuánto crece, cómo se distingue, cuál es su procedencia y que otros usos tiene, nos emociona porque entendemos con mayor profundidad nuestra capacidad de relación con la naturaleza. Es para nosotros un placer presentar este libro que recoge los resultados del inventario de árboles y plantas arborescentes que existen en la Universidad Tecnológica de Panamá, Extensión Tocumen. Sin duda, este será de suma utilidad como información de línea base para los encargados del diseño, mantenimiento y mejoramiento de la arborización y ornato de la extensión universitaria y como apoyo a la docencia en materia de educación ambiental.Los árboles son estructuralmente y como hábito de vida lo más extraordinario dentro del reino vegetal. Quién de niño no se ha subido a un árbol para tomar de sus frutos; y en días de calor, quién no ha buscado refugiarse bajo su sombra; intuitivamente desde pequeños reconocemos en los árboles un gran valor por los beneficios que nos proveen y nos sentimos poderosamente cautivados por ellos. Por el rol tan importante que desempeñan en: la protección de las fuentes de agua, como refugio y alimento para la fauna silvestre, la conservación de especies en riesgo, como barrera contra el ruido, el viento y contaminantes; por todo lo que significan ambientalmente, la Universidad Tecnológica de Panamá como institución, sus docentes, investigadores, administrativos y estudiantes mantienen un respeto permanente hacia los árboles, los espacios arborizados y la naturaleza en las distintas sedes a lo largo del país. Es por ese respeto y amor profundo por la naturaleza y con el ánimo de resaltar la diversidad plantas, que el Centro de Investigaciones Hidráulicas e Hidrotécnicas (CIHH) contempló documentar cuáles especies de árboles existen en la Universidad Tecnológica de Panamá, Extensión Tocumen, a través de una pequeña obra escrita. La finalidad de la obra es ser instructiva; los árboles y otras plantas arborescentes cultivadas como elementos del paisaje urbano que vemos a diario despierta la curiosidad de muchas personas, que se muestran interesadas en conocerlos y distinguirlos. Generalmente, la primera distinción que hacen es reconocer su utilidad como: ornamentales, frutales o maderables; pero la curiosidad no queda allí, no. Ese conocimiento de saber cómo se llaman, cuánto crece, cómo se distingue, cuál es su procedencia y que otros usos tiene, nos emociona porque entendemos con mayor profundidad nuestra capacidad de relación con la naturaleza. Es para nosotros un placer presentar este libro que recoge los resultados del inventario de árboles y plantas arborescentes que existen en la Universidad Tecnológica de Panamá, Extensión Tocumen. Sin duda, este será de suma utilidad como información de línea base para los encargados del diseño, mantenimiento y mejoramiento de la arborización y ornato de la extensión universitaria y como apoyo a la docencia en materia de educación ambiental

Introducción al Uso de LATEX para la Elaboración de Documentos en el Ámbito de la Ingeniería

La razón de plasmar en un documento parte de lo presentado sobre el uso de LATEX en el curso “Práctica de Campo” es dejar un material comprobante y de consulta de la capacitación dictada a los estudiantes de Ingeniería Ambiental. La capacitación se dictó el miércoles 27de enero de 2021. Como parte de nuestro trabajo, tanto en docencia como en investigación, hemos estado preparando documentos en LATEX como artículos, presentaciones, informes técnicos y guías educativas. Esta experiencia ganada, aunque corta, valió para presentar a los estudiantes una introducción básica para el uso de esta herramienta informática para la composición tipográfica de todo tipo de documentos con contenido matemático y científico. Los estudiantes que participaron contaban con su computadora y el acceso a Internet. Se les recomendó a los estudiantes concentrarse solo en esta actividad. Cuando se trabaja con LATEX o se está aprendiendo como funciona es mejor no hacer otras cosas de manera simultánea porque se distraen. Se les recomendó también practicar mucho ya que es la única forma de aprender a trabajar con LATEX a un nivel decente. Se tiene que tratar de usar LATEX para todo lo que sea escribir texto, como hacer: una simple carta, su hoja de vida, los informes de laboratorio, el trabajo de final del curso, una presentación con diapositivas, un afiche, una guía, un libro, un artículo, etc.La razón de plasmar en un documento parte de lo presentado sobre el uso de LATEX en el curso “Práctica de Campo” es dejar un material comprobante y de consulta de la capacitación dictada a los estudiantes de Ingeniería Ambiental. La capacitación se dictó el miércoles 27de enero de 2021. Como parte de nuestro trabajo, tanto en docencia como en investigación, hemos estado preparando documentos en LATEX como artículos, presentaciones, informes técnicos y guías educativas. Esta experiencia ganada, aunque corta, valió para presentar a los estudiantes una introducción básica para el uso de esta herramienta informática para la composición tipográfica de todo tipo de documentos con contenido matemático y científico. Los estudiantes que participaron contaban con su computadora y el acceso a Internet. Se les recomendó a los estudiantes concentrarse solo en esta actividad. Cuando se trabaja con LATEX o se está aprendiendo como funciona es mejor no hacer otras cosas de manera simultánea porque se distraen. Se les recomendó también practicar mucho ya que es la única forma de aprender a trabajar con LATEX a un nivel decente. Se tiene que tratar de usar LATEX para todo lo que sea escribir texto, como hacer: una simple carta, su hoja de vida, los informes de laboratorio, el trabajo de final del curso, una presentación con diapositivas, un afiche, una guía, un libro, un artículo, etc

Relación Entre el Índice de Área Foliar y el Índice Normalizado de Vegetación en el Bosque Húmedo Tropical de Panamá en Gamboa

El índice de área foliar (LAI) es una variable útil para describir la productividad y dinámica de los ecosistemas forestales además de un indicador de la salud y desarrollo del dosel. Se han realizado pocos estudios de esta variable en regiones de bosque húmedo tropical (Bh- T). En este proyecto se desarrolló un modelo empírico para estimar el LAI en el Bh-T, a través de imágenes satelitales y se realizó su validación mediante el desarrollo de campañas de medición con metodología óptica indirecta utilizando el Ceptómetro AccuPAR LP-80. Se utilizaron imágenes de alta resolución del satélite WordView-2 y Quickbird. Este estudio fue de tipo correlacional, relacionando las variables LAI y el Índice normalizado de vegetación (NDVI, por sus siglas en inglés). En estudios previos, se ha demostrado la correlación que existe entre ambos. Los programas Erdas Imagine y Atcor fueron empleados para el análisis de imágenes satelitales y la obtención del NDVI. Las mediciones de campo se desarrollaron en el “Camino del Oleoducto”, en el Área de Avifauna (Gamboa), en donde se ubicaron los puntos de control. Mediciones adicionales fueron tomadas en las parcelas del Instituto Smithsonian de Investigaciones Tropicales (STRI) ubicadas en la Isla de Barro Colorado y en el Parque Nacional Soberanía. El empleo de diferentes sitios permitió estudiar el comportamiento espacial del LAI. Las correlaciones resultantes entre las variables LAI-NDVI para los diferentes conjuntos de datos, presentaron correlaciones positivas de moderadas a bajas. Se utilizó el error cuadrado medio para hacer las comparaciones entre modelos