Evaluation of average growth curve of goats using random regression model.

Polynomial functions for modeling growth curves of 946 Anglo-Nubiano goats, born from 1980 to 2005, and their effect on genetic parameter estimates were evaluated. Growth trajectories were fitted by fixed regression of weights on orthogonal polynomial of age, considering polynomials from second to seventh orders. For fixed regression, polynomial models were compared using the following criteria: mean square errors, absolute average residual error, square percent bias and goodness of fit. Akaike"s information criterion, Bayesian information criterion and likelihood ratio test criteria were used to evaluate the effect of different polynomial order of fixed regression on genetic parameters estimates. An expressive improvement was found using higher order polynomials and those of fourth order were sufficient for modeling the average growth curve of goats. No influences on genetic parameter estimates were observed adopting higher than cubic order polynomial functions. The direct heritability showed an increasing pattern until 84th day of age, while the maternal one had a constant pattern for the whole period. Polynomial functions are efficient tools for modeling growth curve and polynomials of at least fourth order should be used for modeling the average growth curve of goat in random regression models.Avaliou-se a utilização de funções polinomiais com ordem de ajuste variando de dois a sete na descrição da curva média de crescimento (Regressão Fixa) e sua influência sobre os parâmetros genéticos de 946 caprinos da raça Anglo-Nubiana, criados entre 1980 e 2005. Para modelar a regressão fixa, os modelos polinomiais da idade foram comparados quanto à adequação do ajuste da curva média de crescimento empregando-se os seguintes critérios: quadrado médio do resíduo, desvio médio absoluto, percentagem quadrada de viés e coeficiente de determinação. Os critérios de informação de Akaike, Bayesiano de Schwarz e logaritmo da função de máxima verossimilhança foram utilizados para verificar a influência das diferentes ordens de ajustes da regressão fixa sobre a estimativa dos parâmetros genéticos. A melhoria mais expressiva no ajuste ocorreu até a ordem quatro, sugerindo que esta foi suficiente para modelar a curva média de crescimento da população em estudo. Pouca influência sobre a estimativa dos parâmetros genéticos foi observada com adoção de funções superiores à cúbica. A herdabilidade direta apresentou comportamento crescente até 84 dias de idade, enquanto que a materna manteve-se praticamente constante durante todo período analisado. Com base nos resultados do conjunto de critérios utilizados, os polinômios ortogonais da idade mostraram-se bastante eficientes e polinômios com pelo menos ordem quatro devem ser empregados para representar a curva média de crescimento em modelos de regressão aleatória

Interação genótipo x ambiente e estimativas de parâmetros genéticos dos pesos aos 205 e 365 dias de idade de bovinos Nelore Genotype by environment interaction and genetic parameter estimates for 205 and 365 body weight of Nelore cattle

Dados de pesos aos 205 (P205) e 365 (P365) dias de idade, de 46.408 animais Nelore, nascidos entre 1976 e 2000, provenientes de 530 rebanhos dos diversos estados brasileiros, foram utilizados para avaliar as interações genótipo x ambiente (IGA) e estimar herdabilidades direta e materna dos pesos pelo método da máxima verossimilhança restrita. O modelo estatístico utilizado incluiu efeitos fixos de grupo contemporâneo, idade da vaca ao parto (covariável) e efeitos aleatórios genéticos aditivo direto e materno. As correlações genéticas, estimadas para as características P205 e P365, cada uma considerada como característica distinta em cada uma das regiões Sul (S), Sudeste (SE), Centro-Oeste (CO), Norte (N) e Nordeste (NE), foram, respectivamente, 0,86 e 0,84, 0,64 e 0,35, 0,75 e 0,42, 0,79 e 0,86, 0,92 e 0,81, 0,95 e 0,83, 0,83 e 1,00, 0,88 e 0,81, 0,33 e 0,85, 0,63 e 0,99 para S e SE, S e CO, S e N, S e NE, SE e CO, SE e N, SE e NE, CO e N, CO e NE e N e NE. As baixas correlações genéticas indicaram que há efeito da interação genótipo x ambiente nas combinações que envolvem as regiões S/CO, S/N, S/NE, CO/NE e N/NE para P205 dias de idade e S/CO e S/N para P365 dias de idade, havendo, portanto, necessidade de avaliação genética regional quando se consideram regiões bastante distintas.<br>Body weight records at 205 (205BW) and 365 (365BW) days of age of 46,408 Nelore animals, born from 1976 to 2000 period in 530 Nelore herds of several states of Brazil, were used to evaluate genotype by environment interactions and to estimate genetic and maternal heritability by restricted maximum likelihood methodology. The statistical model included the fixed effects of contemporary group and age of cow (covariate), and the random direct and maternal additive genetic effects. The genetic correlation for 205BW and 365BW, each one considered as different traits in each of the South (S), Southeast (SE), Central west (CO), North (N) and Northeast (NE) regions were 0.86 and 0.84, 0.64 and 0.35, 0.75 and 0.42, 0.79 and 0.86, 0.92 and 0.81, 0.95 and 0.83, 0.83 and 1.00, 0.88 and 0.81, 0.33 and 0.85, 0.63 and 0.99 for S/SE, S/CO, S/N, S/NE, SE/CO, SE/N, SE/NE, CO/N, CO/NE and N/NE, respectively. There is a significant genotype by environment interaction for 205BW in the combination involving the S/CO, S/N, S/NE, CO/NE, and N/NE regions. There are significant genotype by environment interaction effects in the combination involving the S/CO and S/N regions for 365BW. Based on genetic x environment interaction results, regional genetic evaluation is recommend for the very distinct regions

Efeitos genéticos aditivos e não-aditivos em características de crescimento, reprodutivas e habilidade materna em ovinos das raças Santa Inês, Somalis Brasileira, Dorper e Poll Dorset Additive and non-additive genetic effects on growth, reproductive and maternal traits in sheep of Santa In��s, Brazilian Somali, Dorper and Poll Dorset breeds

Efeitos genético aditivo, de dominância e de recombinação em cruzamentos entre as raças Santa Inês (SI), Somalis Brasileira (So), Dorper (Do) e Poll Dorset (Po) foram estimados para as características de crescimento, reprodutivas e de habilidade materna. Os dados foram obtidos da Gaasa e Alimentos LTDA, uma empresa que participa do Programa de Melhoramento Genético de Caprinos e Ovinos (GENECOC) da Embrapa Caprinos. Inicialmente, 3.573 registros foram analisados por meio do procedimento MIXED do pacote estatístico SAS (1999). As análises foram realizadas considerando os efeitos da diferença genética aditiva entre as raças, de dominância e de recombinação. O peso ao nascer foi influenciado pelos efeitos genéticos aditivos, enquanto o peso ao desmame e o ganho de peso pré-desmame foram influenciados por efeitos genéticos não-aditivos. A estimativa de herdabilidade direta para o peso ao nascer foi moderada, o que indica a existência de variabilidade genética passível de ser explorada por meio da seleção individual. Do mesmo modo, as estimativas de herdabilidade das características idade ao primeiro parto e peso total das crias ao nascer indicaram a existência de variabilidade genética para obter ganhos genéticos por meio da seleção. Os genes das raças Poll Dorset e Dorper tiveram papel importante para melhor desempenho ponderal, portanto, essas raças podem ser indicadas como paternas no cruzamento terminal. A utilização de matrizes F1 Santa Inês x Somalis Brasileira em cruzamentos com reprodutores Poll Dorset pode levar a maior eficiência reprodutiva.<br>Additive genetic, dominance and recombination effects in breedings among Santa Inês (SI), Brazilian Somali (So), Dorper (Do) and Poll Dorset (Po) breeds were estimated for growth, reproductive and maternal hability traits. Data were obtained from Gaasa e Alimentos LTDA, a company that participates on the Programa de Melhoramento Genético de Caprinos e Ovinos (GENECOC) coordinated by Embrapa Caprinos. Initially, 3,573 records were analyzed using the MIXED procedure of the statistical package SAS (1999). The analyses were carried out considering the effects of additive genetic difference among breeds, dominance and recombination effects. Birth weight was mainly influenced by additive genetic effects, while weaning weight and pre-weaning weight gain were influenced by non-additive genetic effects. Direct heritability estimates for birth weight was moderate indicating that there is genetic variability believable to be exploited by individual selection. In the same way, heritability estimates for the traits age at first lambing and litter total weight at birth indicated the existence of genetic variability to obtain genetic gains through selection. Genes of the Poll Dorset and Dorper breeds had an important role for a better growth performance, therefore, these breeds can be indicated as sires in the terminal breeds. The use of F1 Santa Inês x Brazilian Somali females on crossbreeding with Poll Dorset rams can lead to a better reproductive efficiency

Genetic evaluation of European quails by random regression models

The objective of this study was to compare different random regression models, defined from different classes of heterogeneity of variance combined with different Legendre polynomial orders for the estimate of (co)variance of quails. The data came from 28,076 observations of 4,507 female meat quails of the LF1 lineage. Quail body weights were determined at birth and 1, 14, 21, 28, 35 and 42 days of age. Six different classes of residual variance were fitted to Legendre polynomial functions (orders ranging from 2 to 6) to determine which model had the best fit to describe the (co)variance structures as a function of time. According to the evaluated criteria (AIC, BIC and LRT), the model with six classes of residual variances and of sixth-order Legendre polynomial was the best fit. The estimated additive genetic variance increased from birth to 28 days of age, and dropped slightly from 35 to 42 days. The heritability estimates decreased along the growth curve and changed from 0.51 (1 day) to 0.16 (42 days). Animal genetic and permanent environmental correlation estimates between weights and age classes were always high and positive, except for birth weight. The sixth order Legendre polynomial, along with the residual variance divided into six classes was the best fit for the growth rate curve of meat quails; therefore, they should be considered for breeding evaluation processes by random regression models