Lang leve het virus!

“Dat virussen ziekten kunnen veroorzaken, in allerlei organismen, weet iedereen. Maar dat virussen ook gunstige effecten kunnen hebben is veel minder bekend.” Dit artikel geeft een gesprek weer met Marilyn Roossinck van Pennsylvania State University, die in Wageningen was voor het geven van de tweede Rob Goldbach Virology Lecture. “Naast pathogene virussen is er een enorm scala aan virussen met juist een gunstig effect op de plant. Voorbeelden daarvan zijn een verbeterde droogtetolerantie, hitte- of koudetolerantie of zouttolerantie. Ook bepaalde stammen van pathogene soorten kunnen deze effecten veroorzaken. Van verreweg de meeste soorten weten we simpelweg niet wat ze doen.

Waterquality research in the Reeuwijk Lakes 1983-1985

In de periode 1983-1985 werd in de plassen Elfhoeven en Nieuwenbroek onderzoek gedaan om de uitgangssituatie te beschrijven voordat de fosfaatbelasting werd verlaagd. Vastgesteld werd dat: de twee plassen verschillend reageren op de fosfaatbelasting ; - de hoogste belasting niet gepaard gaat met de grootste algenbloei [D ; - de fluctuatie in de algenbiomassa een duidelijk verband vertoont met de fluctuatie in de weersgesteldheid ; - de hogere trofische niveaus van veel invloed zijn op de algenbloei [D ; de ontwikkeling van een "eenvoudig" dynamisch planktonmodel broodnodig is.Abstract not availableDGHM/BWS-W

Epilepsie: een aanval op het geheugen?

Item does not contain fulltext0ntbrkt

A pipeline for copy number profiling of single circulating tumour cells to assess intrapatient tumour heterogeneity

Intrapatient tumour heterogeneity is likely a major determinant of clinical outcome in cancer patients. To assess heterogeneity in a minimally invasive manner, methods to perform single circulating tumour cell (CTC) genomics at high resolution are necessary. However, due to the rarity of CTCs, development of such methods is challenging. Here, we developed a modular single CTC analysis pipeline to assess intrapatient heterogeneity by copy number (CN) profiling. To optimize this pipeline, spike-in experiments using MCF-7 breast cancer cells were performed. The VyCAP puncher system was used to isolate single cells. The quality of whole genome amplification (WGA) products generated by REPLI-g and Ampli1™ methods, as well as the results from the Illumina Truseq and the Ampli1™ LowPass library preparation techniques, was compared. Moreover, a bioinformatic pipeline was designed to generate CN profiles from single CTCs. The optimal combination of Ampli1™ WGA and Illumina Truseq library preparation was successfully validated on patient-derived CTCs. In conclusion, we developed a novel modular pipeline to isolate single CTCs and subsequently generate detailed patient-derived CN profiles that allow assessment of intrapatient heterogeneity in future studies