Tendance temporelle de la tuberculose dans la communauté d’ongulés du Parc National de Doñana

Trabajo presentado al 35º Encuentro GEEFSM (Groupe d’Etudes sur l’Eco-pathologie de la Faune Sauvage de Montagne), celebrado en Cofrentes, Muela de Cortes (España) del 1 al 4 de junio de 2017.[ES]: El control de las enfermedades infecciosas compartidas entre la fauna silvestre y el ganado es complejo debido al escaso conocimiento de los procesos epidemiológicos que determinan la transmisión y persistencia de patógenos en la comunidad de hospedadores. La tuberculosis animal (TB) causada por la infección crónica del Complejo Mycobacterium tuberculosis (CMT) es endémica en jabalí (Sus scrofa), ciervo (Cervus elaphus) y gamo (Dama dama) en el centro-sur de España. En este contexto es clave conocer la dinámica temporal de la infección y los factores que modulan el mantenimiento de la TB en el medio natural y, consecuentemente, en el ganado en extensivo. Así, en este estudio utilizamos datos de seguimiento sanitario de ungulados silvestres y de bovino del Parque Nacional de Doñana (PND) para evaluar la tendencia temporal en la prevalencia de TB e identificar sus determinantes. Entre 2006 y 2016 se ha realizado la necropsia, el diagnóstico clínico- lesional y confirmación por cultivo microbiológico en un total de 852 jabalíes, 356 ciervos y 338 gamos dentro del plan de vigilancia sanitaria del PND. Por otro lado, la información sanitaria de 1139 cabezas de ganado bovino ha sido facilitada por los servicios veterinarios oficiales. El análisis espacio-temporal de la infección y sus principales factores de riesgo se ha realizado usando sistemas de información geográfica y modelos lineales generalizados. Los resultados muestran prevalencias de TB más elevadas en jabalí (69,44%), seguido de ciervo (43,38%) y gamo (19,88%); mientras que la incidencia en bovino es del 9%. La tendencia temporal de la infección durante el período estudiado es creciente en ungulados silvestres y se mantiene estable en el ganado bovino, a pesar de los intensos esfuerzos de erradicación en esta especie. En general, varios factores individuales, poblacionales, climatológicos y geográficos están involucrados en la dinámica de la enfermedad. Los individuos adultos muestran una prevalencia elevada respecto a los jóvenes en todas las especies, como se ha sugerido previamente en enfermedades de carácter crónico. En cuanto a la distribución espacial de la infección, se mantiene un marcado gradiente Norte- Sur descrito previamente en 2008, observándose valores superiores de prevalencia en aquellas áreas situadas al norte del PND. Esta situación podría estar mediada por las diferencias en la densidad de hospedadores y en el uso de los recursos. Por ejemplo, se aprecia un mayor riesgo relativo de TB en la cercanía a zonas de elevada agregación de individuos, como es el húmedo borde de la marisma. Estos resultados sobre la dinámica de la TB son fundamentales para comprender la epidemiología de la enfermedad en la comunidad de hospedadores y permitirán ayudar en el diseño de futuras estrategias de control.[IT]: Il controllo delle malattie infettive condivise tra la fauna selvatica e il bestiame è complesso a causa della scarsa conoscenza dei processi epidemiologici che determinano la trasmissione e la persistenza dei patogeni nella comunità di animali ospiti. La tubercolosi animale (TB) causata dall’infezione cronica da parte del Complesso Mycobacterium tuberculosis (CMT) è endemica nel cinghiale (Sus scrofa), cervo (Cervus elaphus) e daino (Dama dama) nel centro- sud della Spagna. In questo contesto è essenziale conoscere la dinamica temporale dell’infezione e i fattori che modulano il mantenimento della TB nell’ambiente naturale e, di conseguenza, nell’allevamento estensivo. In questo studio vengono utilizzati dati di controllo sanitario di ungulati silvestri e bovini nel Parco Nazionale della Dognana (PND), per valutare l’evoluzione temporale nella prevalenza della TB e identificarne i fattori determinanti. Tra il 2006 e il 2016 sono stati realizzati necroscopia, diagnosi clinico-lesionale e conferma tramite coltura microbiologica su un totale di 852 cinghiali, 356 cervi e 338 daini nell’ambito del piano di vigilanza sanitaria del PND. Le informazioni relative a 1139 teste di bestiame (bovino) sono state fornite invece dai servizi sanitari veterinari ufficiali. L’analisi spazio-temporale dell’infezione e dei suoi principali fattori di rischio è stata realizzata utilizzando sistemi di informazione geografica e modelli lineari generalizzati. I risultati mostrano prevalenza di TB più alta nelcinghiale (69,44%), seguito da cervo (43,38%) e daino (19,88%), mentre l’incidenza nel bestiame è del 9%. Durante il periodo studiato l’infezione è andata aumentando negli ungulati selvatici e si è mantenuta stabile nel bestiame, nonostante gli intensi sforzi di eradicazione in questa specie. In generale, vari fattori individuali, demografici, climatologici e geografici sono coinvolti nella dinamica della malattia. Gli individui adulti mostrano una prevalenza più elevata rispetto ai giovani in tutte le specie, come si era già visto precedentemente in altre malattie a carattere cronico. In quanto alla distribuzione spaziale dell’infezione, si mantiene una marcata prevalenza a nord rispetto al sud, già descritta prima nel risultando valori superiori nelle aree situate al nord del PND. Questa situazione potrebbe essere dovuta alle differenze di densità demografica degli ospiti e nell’uso condiviso delle risorse. Per esempio, è stato riscontrato un maggiore rischio relativo di TB nella vicinanza di zone con un alto indice di aggregazione degli individui, come ad esempio i terreni paludosi. Questi risultati sulla dinamica della TB sono fondamentali per comprendere l’epidemiologia della malattia nella comunità degli animali che ne sono ospiti e permetteranno lo sviluppo di future strategie di controllo.[FR]: Le contrôle des maladies infectieuses communes à la faune sauvage et à l’élevage est complexe dû aux faibles connaissances des processus épidémiologiques qui déterminent la transmission et la persistance des pathogènes dans la population d’hôtes. La tuberculose animale (TB) causée par l’infection chronique du Complejo Mycobacterium tuberculosis (CMT) est endémique chez le sanglier (Sus scrofa), le cerf (Cervus elaphus) et le daim (Dama dama) dans le centre-sud de l’Espagne. Dans ce contexte, il est primordial de connaître la dynamique temporelle de l’infection et les facteurs qui modulent le maintien de la TB dans le milieu naturel et, par conséquent, dans l’élevage extensif. Ainsi, dans cette étude, nous utilisons des données de suivi sanitaire des ongulés sauvages et des bovins du Parc National de Doñana (PND) pour évaluer la tendance temporelle dans la prévalence de TB et identifier ses déterminants. Entre 2006 et 2016, il a été réalisé l’autopsie, le diagnostic clinique et la confirmation par culture microbiologique sur un total de 852 sangliers, 356 cerfs et 338 daims dans le plan de vigilance sanitaire du PND. D’autre part, l’information sanitaire de 1139 têtes de bovins a été apportée par les services vétérinaires officiels. L’analyse spatio-temporelle de l’infection et ses principaux facteurs de risque a été réalisée en utilisant ses systèmes d’information géographique et des modèles linéaux généraux. Les résultats indiquent des prévalences de TB plus élevées chez le sanglier (69,44%), suivi du cerf (43,38%) et du daim (19,88%) ; alors que l’incidence chez les bovins es de 9%. La tendance temporelle de l’infection durant la période étudiée est croissante chez les ongulés sauvages et reste stable chez les bovins domestiques, malgré les efforts intenses d’éradication dans cette espèce. En général, plusieurs facteurs individuels, de groupes, climatologiques et géographiques sont impliqués dans la dynamique de la maladie. Les individus adultes présentent une prévalence élevée par rapport aux jeunes et ce dans toutes les espèces, ce qui est généralement le cas pour beaucoup de maladies chroniques. Par rapport à la distribution spatiale de l’infection, elle est surtout située dans le Nord-Sud, comme il a été décrit précédemment en 2008, où des valeurs supérieures de prévalence ont été observées dans les aires situées au nord du PND. Cette situation pourrait être due aux différences dans la densité des hôtes et dans l’utilisation des ressources. Par exemple, on observe un risque plus grand de TB à proximité des zones de densité élevée d’individus, comme le bord humide des marais. Ces résultats sur la dynamique de la TB sont fondamentaux pour comprendre l’épidémiologie de la maladie dans la communauté d’hôte et permettent d’aider pour le développement de futures stratégies de contrôle.Peer reviewe

Implementación en la UCM del Grado en Estudios Europeos / Bachelor in European Studies en el marco de la alianza europea de universidades UNA EUROPA

El presente proyecto de innovación ha tenido por objetivo la implementación en la Universidad Complutense de Madrid del Nuevo Grado en Estudios Europeos / Bachelor of European Studies (BAES) creado en el marco de la nueva alianza europea de universidades UNA EUROPA integrada por la Universidad Complutense de Madrid, la Universidad de la Sorbona (París – I), Universidad Libre de Berlín, Universidad de Bolonia, Universidad Jaguelónica de Cracovia, Universidad de Helsinki, Universidad Católica de Lovaina, y Universidad de Edimburgo

NEOTROPICAL XENARTHRANS: a data set of occurrence of xenarthran species in the Neotropics

Xenarthrans – anteaters, sloths, and armadillos – have essential functions for ecosystem maintenance, such as insect control and nutrient cycling, playing key roles as ecosystem engineers. Because of habitat loss and fragmentation, hunting pressure, and conflicts with 24 domestic dogs, these species have been threatened locally, regionally, or even across their full distribution ranges. The Neotropics harbor 21 species of armadillos, ten anteaters, and six sloths. Our dataset includes the families Chlamyphoridae (13), Dasypodidae (7), Myrmecophagidae (3), Bradypodidae (4), and Megalonychidae (2). We have no occurrence data on Dasypus pilosus (Dasypodidae). Regarding Cyclopedidae, until recently, only one species was recognized, but new genetic studies have revealed that the group is represented by seven species. In this data-paper, we compiled a total of 42,528 records of 31 species, represented by occurrence and quantitative data, totaling 24,847 unique georeferenced records. The geographic range is from the south of the USA, Mexico, and Caribbean countries at the northern portion of the Neotropics, to its austral distribution in Argentina, Paraguay, Chile, and Uruguay. Regarding anteaters, Myrmecophaga tridactyla has the most records (n=5,941), and Cyclopes sp. has the fewest (n=240). The armadillo species with the most data is Dasypus novemcinctus (n=11,588), and the least recorded for Calyptophractus retusus (n=33). With regards to sloth species, Bradypus variegatus has the most records (n=962), and Bradypus pygmaeus has the fewest (n=12). Our main objective with Neotropical Xenarthrans is to make occurrence and quantitative data available to facilitate more ecological research, particularly if we integrate the xenarthran data with other datasets of Neotropical Series which will become available very soon (i.e. Neotropical Carnivores, Neotropical Invasive Mammals, and Neotropical Hunters and Dogs). Therefore, studies on trophic cascades, hunting pressure, habitat loss, fragmentation effects, species invasion, and climate change effects will be possible with the Neotropical Xenarthrans dataset

Anales de Edafología y Agrobiología Tomo 36 Número 9-10

Procesos geoedáficos en la génesis, evolución y desarrollo de la tierra parda meridional. II. Perfiles desarrollados sobre roca plutónica: Características morfológicas y físico-químicas, por A. Guerra Delgado y J. L. Moreno Alvarez.-- Diagnóstico de deficiencias minerales en citrus mediante utilización de actividades enzimáticas, por S. Llorente, A. León y A. Torrecillas.-- Influencia de la distancia al mar en la producción y distribución de las precipitaciones, por J. A. Hernández, E. Hernández, l. F. Sánchez y J. Garmendía.-- Relaciones entre el crecimiento vegetativo y el nitrógeno y fósforo en la planta de fresa, por V. J. Mangas, R. Martínez-Carrasco y L. Sánchez de la Puente.-- Fertilidad de los suelos de cultivo de la comarca de Sayago (Zamora), por Luisa Prat Peret y José Forteza Bonnin.-- Características químicas de los suelos de plátanos de Tenerife, por V. García, A. Diaz, E. Fernández Caldas y C. E. Alvarez.-- Determinación de cloruros en hojas de limonero por fluorescencia de rayos X, por M. Romero, F. Santacruz, M. Caro y F. G. Fernández.-- Retención de DDT y DDE por vermiculita, por l. de D. López González, C. Valenzuela Calahorro y A. Navarrete Guijosa.-- Humificación en los sabinares de la comarca de Somosierra (Segovia), por F. Velasco y J. del Río.-- Estructura de la vegetación de marisma de la reserva biológica de Doñana (Huelva). I. Análisis factorial de datos cualitativos, por F. González Bernáldez, L. Ramírez Díaz, A. Torres Martínez y F. Díaz Pineda.-- Estructura de la vegetación de marisma de la reserva biológica de Doiiana (Huelva). II. Estudio de un gradiente de salinidad, por F. González Bernáldes, L. Ramírez Díaz, A. Torres Martínez y E. Díaz Pineda.-- Evolución de mica potásica en suelos formados sobre material calizo (alfisoles), por Elisa Barragán Landa y Jaime lñiguez Herrero.-- Suelos forestales de la Sierra de la Pila (Murcia). IV. Mineralogía de arcillas, por L. J. Alías P. Linares y R. Ortiz.-- Aridisoles del Campo de Cartagena (Murcia). IV. Argids: Características generales y mineralógicas, por L. J. Alías, R. Ortiz y J. Albadalejo.—Notas.Prof. Dr. H. C. Arthur Primavesi.-- Reunión del Grupo de Trabajo de Normalización de Métodos Analíticos.-- VI Reunión Nacional de Suelos.-- Convocatoria de becas y ayudas para estancias en el extranjero incluidas en convenios de intercambio.-- Sociedad Española de Ciencia del Suelo.-- Duodécimo Congreso de la ISSS.-- Curso sobre suelos salinos y desarrollo vegetal y Seminario sobre biodisponibilidad y toxicidad de metales pesados.-- Coloquio sobre a Biología y Etica: Beneficios y problemas de la investigación ctentífca en Genetica.--III Reunión Nacional del Grupo Español de Trabajo del Cuaternario.-- Actividades del Grupo de Fijación de Nitrógeno de EMBRAPA.-- Conferencia del Dr. Rodríguez-Barrueco en la Fundación Gulbenkiam de Oeiras.-- Notice of International Symposium.-- 50 aniversario de la realización del 1er Congreso de la lSSS.-- Seminario sobre Erosión de los suelos agrícolas en clima no mediterráneo templado.-- Premio Holanda.-- BibliografíaPeer reviewe

Anales de Edafología y Agrobiología Tomo 44 Número 3-4

Suelos-Química. Interacción del ácido 3,6-Dicloro-2-Metoxi-Benzoico (Dicamba) con montmorillonita, por G. Dios Cancela, A. Navarrete Guijosa y A. Jiménez López.-- Estabilidad de Beidellitas en función de su composición, por J. L. Martín de Vidales, R. Jiménez Ballesta, J. Casas y M. A. Hoyos.-- Caracterización de suelos en la Sierra del Pozo (Jaén) sector nor-oeste (Zona I), por J. González Parra, A. López Lafuente y C. González Huecas.-- Caracterización de suelos en la Sierra del Pozo (Jaén) sector central (Zona II), por J. González Parra, A. López Lafuente y C. González Huecas.-- Reacción con el FNa de los suelos de Galicia V. Relación con material de partida y los procesos edafogénesis, por E. García-Rodeja Gayoso, F. Macías Vázquez y F. Guitian Ojea.-- Morfología y propiedades químicas de suelos forestales de Argelia. Suelos bajo A bies numidica y Cedrus atlantica, por M. S. Martín, L. Corral y G. Paneque.-- Morfología y propiedades químicas de suelos forestales de Turquía. Suelos bajo A bies cilicica y Cedrus libani, por M. S. Martín, L. Corral y G. Paneque.-- l. Suelos.-Biología First results of a study of the microbial population of humid zone granitic soils, by M. J. Acea and T. Carballas.-- l. Suelos-Génesis Origen y desarrollo de la topografía en bolsas del material original de los suelos rojos de Aljarafe (Sevilla-Sur de España), por Juan L. de Olmedo Pujol.-- l. Suelos- Fertilidad. El fósforo en los purines de vacuno gallegos: 1) Contenido y distribución de las formas de fósforo, por F. Gil Sotres, F. Diaz-Fierros, Ma C. Leiros, T. Carballas, A. Cabaneiro, M. a C. Villar Celorio y M. Carballas.-- Il. Biología Vegetal-Nutrición Evolución del contenido de flavonoides en hoja de tomate en condiciones óptimas de nutrición, por E. Revilla, J. Serrano y M. J. Sarro.-- Estudio de la posible utilización de micorrizas V A como fertilizantes biológicos en dos suelos, por L. F. Cardona y J. A. Ocampo.-- Incidencia de la salinidad en uva de mesa de la vega media del Vinapolo (Alicante). l. Macronutrientes, por J. Mataix, M. Juárez, J. Sánchez-Andréu y L. Pla.-- Relaciones entre evoluciones de color externo y contenidos de pigmentos en tomate, por F. Martínez-Sánchez, F. R. Romojaro y S. Llorente.-- Tolerancia de las plantas al boro, por A. Cerdá, R. M. Salinas y M. Caro-- II. Biología Vegetal-Fisiología Actividad fotosintética vinculada al fotosistema I de plantas de espinacas cultivadas bajo distintas concentraciones de Cu2+, por A . Chueca, O. Lastra, M. Baez, M. Lachica y J. López Gorge.-- Sistemática de muestreo foliar en plantas de pimiento dulce cultivadas en invernadero bajo riego localizado. l. Tamaño mínimo de muestra, por M. A. Martínez-Cañadas, J. Vera, F. Martínez-Sánchez y C. F. Alcaraz.-- Sistematica de muestreo foliar en plantas de pimiento dulce cultivadas en invernadero bajo riego localizado.II. Influencia de la posición de la hoja en la planta sobre la composición mineral, por M. A. MarUnez-Cañadas, F. Martínez-Sánchez, J. Vera y C. F. Alcaraz.-- Comparación de la producción primaria aérea neta de dos unidades de explotación ("Dehesas") en relación con la topografía, litología y régimen climático, por A. Puerto, M. Rico y J. M. Gómez Gutiérrez.-- Trabajo recapitulativo. Plasmidos de Rhizobium y características simbióticas, por N. Toro y J. OlivaresPeer reviewe

Mutations in TP53 and JAK2 are independent prognostic biomarkers in B-cell precursor acute lymphoblastic leukaemia

[Background]: In B-cell precursor acute lymphoblastic leukaemia (B-ALL), the identification of additional genetic alterations associated with poor prognosis is still of importance. We determined the frequency and prognostic impact of somatic mutations in children and adult cases with B-ALL treated with Spanish PETHEMA and SEHOP protocols. [Methods]: Mutational status of hotspot regions of TP53, JAK2, PAX5, LEF1, CRLF2 and IL7R genes was determined by next-generation deep sequencing in 340 B-ALL patients (211 children and 129 adults). The associations between mutation status and clinicopathological features at the time of diagnosis, treatment outcome and survival were assessed. Univariate and multivariate survival analyses were performed to identify independent prognostic factors associated with overall survival (OS), event-free survival (EFS) and relapse rate (RR). [Results]: A mutation rate of 12.4% was identified. The frequency of adult mutations was higher (20.2% vs 7.6%, P=0.001). TP53 was the most frequently mutated gene (4.1%), followed by JAK2 (3.8%), CRLF2 (2.9%), PAX5 (2.4%), LEF1 (0.6%) and IL7R (0.3%). All mutations were observed in B-ALL without ETV6-RUNX1 (P=0.047) or BCR-ABL1 fusions (P<0.0001). In children, TP53mut was associated with lower OS (5-year OS: 50% vs 86%, P=0.002) and EFS rates (5-year EFS: 50% vs 78.3%, P=0.009) and higher RR (5-year RR: 33.3% vs 18.6% P=0.037), and was independently associated with higher RR (hazard ratio (HR)=4.5; P=0.04). In adults, TP53mut was associated with a lower OS (5-year OS: 0% vs 43.3%, P=0.019) and a higher RR (5-year RR: 100% vs 61.4%, P=0.029), whereas JAK2mut was associated with a lower EFS (5-year EFS: 0% vs 30.6%, P=0.035) and a higher RR (5-year RR: 100% vs 60.4%, P=0.002). TP53mut was an independent risk factor for shorter OS (HR=2.3; P=0.035) and, together with JAK2mut, also were independent markers of poor prognosis for RR (TP53mut: HR=5.9; P=0.027 and JAK2mut: HR=5.6; P=0.036). [Conclusions]: TP53mut and JAK2mut are potential biomarkers associated with poor prognosis in B-ALL patients.This work was supported in part by a grant from the European Union’s Seventh Framework Programme (FP7/2007–2013) under Grant Agreement 306242-NGS-PTL, the Consejeria de Educacion, Junta de Castilla y León (HUS272U13, SA085U16 to JMHR and JCYL-EDU/346/2013 PhD scholarship to MHS), Fundación Castellano Leonesa de Hematología y Hemoterapia (FUCALHH 2013) to JMHR, Proyectos de Investigacion del SACYL, Spain (BIO/SA31/13 and BIO/SA10/14) to RB; The Instituto de Salud Carlos III from Spanish Ministry of Economy and Competitiveness and the European Regional Development Fund (ISCIII-FEDER) ‘‘Una manera de hacer Europa’’ Spanish Cancer Network (RD12/0036/0069 and RD12/0036/0061 to JM) and FIS grants PI15/01471 to JMHR and PI15/00032 to EFR. Universidad Pedagogica y Tecnologica de Colombia—Vicerrectoría de Investigacion y Extension (Grupo de Investigacion en Ciencias Biomedicas UPTC—GICBUPTC, Escuela de Ciencias Biologicas) to MFC.Peer Reviewe

NEOTROPICAL CARNIVORES: a data set on carnivore distribution in the Neotropics

Mammalian carnivores are considered a key group in maintaining ecological health and can indicate potential ecological integrity in landscapes where they occur. Carnivores also hold high conservation value and their habitat requirements can guide management and conservation plans. The order Carnivora has 84 species from 8 families in the Neotropical region: Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Otariidae; Phocidae; Procyonidae; and Ursidae. Herein, we include published and unpublished data on native terrestrial Neotropical carnivores (Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Procyonidae; and Ursidae). NEOTROPICAL CARNIVORES is a publicly available data set that includes 99,605 data entries from 35,511 unique georeferenced coordinates. Detection/non-detection and quantitative data were obtained from 1818 to 2018 by researchers, governmental agencies, non-governmental organizations, and private consultants. Data were collected using several methods including camera trapping, museum collections, roadkill, line transect, and opportunistic records. Literature (peer-reviewed and grey literature) from Portuguese, Spanish and English were incorporated in this compilation. Most of the data set consists of detection data entries (n = 79,343; 79.7%) but also includes non-detection data (n = 20,262; 20.3%). Of those, 43.3% also include count data (n = 43,151). The information available in NEOTROPICAL CARNIVORES will contribute to macroecological, ecological, and conservation questions in multiple spatio-temporal perspectives. As carnivores play key roles in trophic interactions, a better understanding of their distribution and habitat requirements are essential to establish conservation management plans and safeguard the future ecological health of Neotropical ecosystems. Our data paper, combined with other large-scale data sets, has great potential to clarify species distribution and related ecological processes within the Neotropics. There are no copyright restrictions and no restriction for using data from this data paper, as long as the data paper is cited as the source of the information used. We also request that users inform us of how they intend to use the data