Proline dehydrogenase from Thermus thermophilus does not discriminate between FAD and FMN as cofactor

Flavoenzymes are versatile biocatalysts containing either FAD or FMN as cofactor. FAD often binds to a Rossmann fold, while FMN prefers a TIM-barrel or flavodoxin-like fold. Proline dehydrogenase is denoted as an exception: it possesses a TIM barrel-like fold while binding FAD. Using a riboflavin auxotrophic Escherichia coli strain and maltose-binding protein as solubility tag, we produced the apoprotein of Thermus thermophilus ProDH (MBP-TtProDH). Remarkably, reconstitution with FAD or FMN revealed that MBP-TtProDH has no preference for either of the two prosthetic groups. Kinetic parameters of both holo forms are similar, as are the dissociation constants for FAD and FMN release. Furthermore, we show that the holo form of MBP-TtProDH, as produced in E. coli TOP10 cells, contains about three times more FMN than FAD. In line with this flavin content, the crystal structure of TtProDH variant ¿ABC, which lacks helices aA, aB and aC, shows no electron density for an AMP moiety of the cofactor. To the best of our knowledge, this is the first example of a flavoenzyme that does not discriminate between FAD and FMN as cofactor. Therefore, classification of TtProDH as an FAD-binding enzyme should be reconsidered

Riesgo dietético para la presencia de dislipidemias en escolares

La asociación del consumo de alimentos con la presencia de enfermedades crónicas , en particular con las enfermedades cardiovasculares en niños es limitada . Los factores de riesgo cardiovascular como las dislipidemias, han sido descritos recientemente a edades cada vez más tempranas en los que los niños en edad escolar no han sido la excepción. La dieta de baja calidad es un factor de riesgo que debe ser intervenido y modificado en la población, sobre todo en edades tempranas.Objetivo: Identificar el riesgo dietético por el consumo de alimentos con elevado contenido de azúcares refinados, ácidos grasos saturados y colesterol para la presencia de dislipidemias en escolares. Materiales y métodos: Se diseñó y aplicó una encuesta de frecuencia de consumo de alimentos de riesgo, se calculó el riesgo dietético y se identificaron alteraciones lipídicas en niños. Se utilizó la razón de momios con intervalos de confianza al 95% para la medición del riesgo entre la dieta y las dislipidemias. Resultados: 17% de los escolares de la escuela privada presentaron consumo elevado de colesterol; en la escuela pública 59% presentaron elevado consumo de azúcares refinados, y 29% consumo elevado de ácidos grasos saturados. Las cifras de riesgo de colesterol sérico, triglicéridos y colesterol-LDL se identificaron con mayor frecuencia en los escolares de la institución privada, mientras que las cifras bajas de colesterol-HDL se identificaron con mayor frecuencia en los niños de la escuela pública. 64 escolares con riesgo dietético presentaron al menos un tipo de dislipidemia OR= 0.94; IC 95%, 0.59-1.50. Conclusiones: En ésta población, el consumo elevado de azúcares refinados es el factor de riesgo dietético de mayor frecuencia para la presencia de dislipidemias. La dieta de baja calidad es un factor de riesgo que debe ser modificado en la población, sobre todo en edades temprana

HPV molecular detection from urine versus cervical samples: an alternative for HPV screening in indigenous populations

Background Cervical cancer (CC) is the fourth leading cause of death from neoplasms in women and is caused by the human papilloma virus (HPV). Several methods have been developed for the screening of cervical lesions and HPV; however, some socio-cultural factors prevent women from undergoing gynecological inspection, which results in a higher risk of mortality from cervical cancer in certain population groups as indigenous communities. This study aimed to compare the concordance in HPV detection from urine and cervical samples, to propose an alternative to cervical scraping, which is commonly used in the cervical cancer screening. Methodology The DNA from cervical scrapings and urine samples was extracted using the proteinase K method followed by precipitation with alcohol, phenol andchloroform; a modification of the proteinase K method was developed in the management of urine sediment. Viral genotyping was performed using INNOLipa. Results The study population consisted of 108 patients from an indigenous population at southern Mexico, 32 without squamous intraepithelial lesions (NSIL) and 76 with low squamous intraepithelial lesions (LSIL). The majority of NSIL cervical scrapes were negative for HPV (90.63%), whereas more than half of LSIL cases were high-risk HPV positive (51.32%), followed by multiple infection by HR-HPV (17.11%), and multiple infection by LR- and HR-HPV (9.21%). No statistically significant relationship between the cytological diagnosis and the HPV genotypes detected in the urine samples was observed. A concordance of 68.27% for HPV positivity from urine and cervical samples was observed. Similarly, a concordance of 64.52% was observed in the grouping of HPVs by oncogenic risk. HR-HPV was detected in 71% of the urine samples from women with LSIL diagnosis, which suggests that HR-HPV detected in a urine sample could indicate the presence or risk of developing SIL. Conclusion HR-HPV detection in urine samples could be an initial approach for women at risk of developing LSIL and who, for cultural reasons, refuse to undergo a gynecological inspection

Meibum Lipid Composition in Asians with Dry Eye Disease

10.1371/journal.pone.0024339PLoS ONE610

Perforación profunda en el lago de Chalco: Reporte técnico

En este artículo se presenta un resumen de las actividades realizadas para la recuperación de la totalidad de la secuencia lacustre del lago de Chalco. Mediante estudios geofísicos se determinó la distribución y espesor de los sedimentos lacustres con base en lo cual se seleccionó el sitio de perforación. Con datos de los espectros H/V de sísmica pasiva se hizo un mapa de isofrecuencias que definieron una región con sedimentos lacustres y material volcánico granulado de hasta 300 m de espesor. El uso de métodos electromagnéticos mostró cambios en la resistividad eléctrica relacionados con variaciones en la composición de la columna sedimentaria; entre 100 – 120 m de profundidad hay un primer aumento en la resistividad asociado al incremento de materiales volcaniclásticos, y entre 330 – 400 m de profundidad un segundo aumento asociado a la presencia de coladas de basalto. Fueron perforados tres pozos con recuperación continua, llegando a profundidades de 420 m en el pozo A, 310 m en el B y 520 en el C. Durante el trabajo de perforación se tomaron muestras para el análisis geomicrobiológicos y de metagenómica. Durante el proceso de perforación se recuperó un total de 1152 m de sedimentos con una profundidad máxima de 520 m. El porcentaje de recuperación de la columna sedimentaria varió entre 88 a 92 % en los tres sondeos. Los resultados del análisis de susceptibilidad magnética en las tres secuencias indica que los primeros 260 m son sedimentos lacustres, entre 260 y 300 m los sedimentos son más gruesos y debajo de los 300 m son predominantemente volcaniclásticos. El análisis de la secuencia sedimentaria del lago de Chalco de los últimos ~300000 años, permitirá documentar y ampliar el conocimiento acerca de la variabilidad climática de la zona, la historia paleoambiental, la historia del cierre de la cuenca, el desarrollo del sistema lacustre y la recurrencia de la actividad volcánica en la cuenca. Además, el estudio de las propiedades físicas de esta secuencia sedimentaria es importante para la modelación de la propagación de ondas sísmicas y de la estructura de la cuenca, así como para mejorar la capacidad de modelación del proceso de subsidencia del terreno que experimenta esta región. This paper presents a short description of the coring operations undertaken to recover the full lacustrine sedimentary sequence from Chalco. Geophysical techniques were used to determine the distribution and thickness of the sediments in order to select the drilling site. Resonance frequencies determined from H/V spectral ratios were used to determine an area where lake sediments reached 300 m thickness. Electromagnetic survey showed two changes in electric resistivity which were related to changes in sediment composition, the first from 100 to 120 m, related to an increase in volcanoclastic sediments and the second from 330 to 400 m related to the presence of a basaltic flows. Three wells were drilled with continuous recovery, reaching depths of 420 m in well A, 310 in B and 520 in C. Samples for geomicrobiological and metagenomics studies were collected during drilling operations. A total of 1152 m of core sediments were recovered reaching a maximum depth of 520 m. Recovery percentages were between 88 and 92 % in the three wells. Magnetic susceptibility analyses in the three sequences show that the first 260 m are mostly lake sediments, between 260 and 300 m sediments are coarser and below 300 m they are mostly volcaniclastic. Analysis of the sedimentary sequence of Lake Chalco that covers the last ~300000 years will allow documenting and extending the knowledge of climate variability in area, the paleoenvironmental history, basin closure history, lacustrian system development and volcanic activity recurrence. Studies of the physical properties of this sequence will be important for seismic propagation and basin structure modeling, and also will improve modeling of the subsidence process that this region experiences

Deep drilling at the Chalco lake:A technical report

En este artículo se presenta un resumen de las actividades realizadas para la recuperación de la totalidad de la secuencia lacustre del lago de Chalco. Mediante estudios geofísicos se determinó la distribución y espesor de los sedimentos lacustres con base en lo cual se seleccionó el sitio de perforación. Con datos de los espectros H/V de sísmica pasiva se hizo un mapa de isofrecuencias que definieron una región con sedimentos lacustres y material volcánico granulado de hasta 300 m de espesor. El uso de métodos electromagnéticos mostró cambios en la resistividad eléctrica relacionados con variaciones en la composición de la columna sedimentaria; entre 100 – 120 m de profundidad hay un primer aumento en la resistividad asociado al incremento de materiales volcaniclásticos, y entre 330 – 400 m de profundidad un segundo aumento asociado a la presencia de coladas de basalto. Fueron perforados tres pozos con recuperación continua, llegando a profundidades de 420 m en el pozo A, 310 m en el B y 520 en el C. Durante el trabajo de perforación se tomaron muestras para el análisis geomicrobiológicos y de metagenómica. Durante el proceso de perforación se recuperó un total de 1152 m de sedimentos con una profundidad máxima de 520 m. El porcentaje de recuperación de la columna sedimentaria varió entre 88 a 92 % en los tres sondeos. Los resultados del análisis de susceptibilidad magnética en las tres secuencias indica que los primeros 260 m son sedimentos lacustres, entre 260 y 300 m los sedimentos son más gruesos y debajo de los 300 m son predominantemente volcaniclásticos. El análisis de la secuencia sedimentaria del lago de Chalco de los últimos ~300000 años, permitirá documentar y ampliar el conocimiento acerca de la variabilidad climática de la zona, la historia paleoambiental, la historia del cierre de la cuenca, el desarrollo del sistema lacustre y la recurrencia de la actividad volcánica en la cuenca. Además, el estudio de las propiedades físicas de esta secuencia sedimentaria es importante para la modelación de la propagación de ondas sísmicas y de la estructura de la cuenca, así como para mejorar la capacidad de modelación del proceso de subsidencia del terreno que experimenta esta región. This paper presents a short description of the coring operations undertaken to recover the full lacustrine sedimentary sequence from Chalco. Geophysical techniques were used to determine the distribution and thickness of the sediments in order to select the drilling site. Resonance frequencies determined from H/V spectral ratios were used to determine an area where lake sediments reached 300 m thickness. Electromagnetic survey showed two changes in electric resistivity which were related to changes in sediment composition, the first from 100 to 120 m, related to an increase in volcanoclastic sediments and the second from 330 to 400 m related to the presence of a basaltic flows. Three wells were drilled with continuous recovery, reaching depths of 420 m in well A, 310 in B and 520 in C. Samples for geomicrobiological and metagenomics studies were collected during drilling operations. A total of 1152 m of core sediments were recovered reaching a maximum depth of 520 m. Recovery percentages were between 88 and 92 % in the three wells. Magnetic susceptibility analyses in the three sequences show that the first 260 m are mostly lake sediments, between 260 and 300 m sediments are coarser and below 300 m they are mostly volcaniclastic. Analysis of the sedimentary sequence of Lake Chalco that covers the last ~300000 years will allow documenting and extending the knowledge of climate variability in area, the paleoenvironmental history, basin closure history, lacustrian system development and volcanic activity recurrence. Studies of the physical properties of this sequence will be important for seismic propagation and basin structure modeling, and also will improve modeling of the subsidence process that this region experiences

Measuring progress and projecting attainment on the basis of past trends of the health-related Sustainable Development Goals in 188 countries: an analysis from the Global Burden of Disease Study 2016

The UN’s Sustainable Development Goals (SDGs) are grounded in the global ambition of “leaving no one behind”. Understanding today’s gains and gaps for the health-related SDGs is essential for decision makers as they aim to improve the health of populations. As part of the Global Burden of Diseases, Injuries, and Risk Factors Study 2016 (GBD 2016), we measured 37 of the 50 health-related SDG indicators over the period 1990–2016 for 188 countries, and then on the basis of these past trends, we projected indicators to 2030