Genetic variation in the E6 and E7 genes of human papillomavirus type 16 in northeastern Argentina

The province of Misiones is considered a region with a high mortality rate due to cervical cancer (CC). To gain insight into this problem, we explored the association between genetic variation in the E6 and E7 oncogenes of HPV16 and the risk of CC. We studied 160 women with cytological diagnoses of negative for intraepithelial lesion or malignity, low-grade squamous intraepithelial lesion, and high-grade squamous intraepithelial lesion/CC and a positive test for HPV16 infection. The genetic characterization of E6 and E7 genes was undertaken through PCR amplification and direct Sanger sequencing. Phylogenetic classification was conducted using Bayesian methods. To estimate the odds ratio (OR) for an association between genetic variants in the E6 and E7 genes and the risk of CC, we used ordinal logistic regression adjusted by age. The final data set comprised 112 samples. Diagnostic single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and phylogenetic trees confirmed the presence of Lineage A (95.5%) and D (4.5%) in the samples. For the E6 gene, we identified eleven different sequences, with the most common ones being Lineage A E6 350G (58.9%) and E6 350T (37.5%). The E6 350G was associated with progression to HSIL/CC, with an OR of 19.41 (4.95–76.10). The E7 gene was more conserved than E6, probably due to the functional constraints of this small protein. Our results confirmed the association of the E6 350G SNP with a higher risk of developing CC. These data will contribute to understanding the biological bases of CC incidence in this region.Fil: Totaro, María Elina. Universidad Nacional de Misiones; ArgentinaFil: Gili, Juan Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Centro de Educación Médica e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno"; ArgentinaFil: Liotta, Domingo Javier. Universidad Nacional de Misiones; Argentina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación.Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; ArgentinaFil: Schurr, Theodore. University of Pennsylvania; Estados UnidosFil: Picconi, María Alejandra. Dirección Nacional de Instituto de Investigación.Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"; ArgentinaFil: Badano, Ines. Universidad Nacional de Misiones; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentin

Detección del virus papiloma humano (HPV) y citología de Papanicolaou en mujeres de bajos recursos de la ciudad de Posadas, Misiones, Argentina

El objetivo de este estudio fue determinar la prevalencia de la infección por HPV y de lesiones cervicales en mujeres asistidas en un centro de salud situado en un área de bajos recursos de la ciudad de Posadas, Misiones, Argentina. Las muestras (n = 163) fueron examinadas mediante las pruebas de Papanicolaou y de PCR para HPV. Los factores socio-culturales de riesgo fueron identifcados mediante el cálculo de la odds ratio (OR, IC 95 %). Se detectaron lesiones cervicales en el 14,7 % de las mujeres. La prevalencia de infección por HPV fue de 38 %. Los tipos más frecuentes en la población total fueron HPV-16 (9,8 %) y HPV-33 (9,3 %). El HPV-16 se detectó asociado al 29,2 % y al 6,5 % de las mujeres con lesiones del cuello uterino y sin ellas, respectivamente, con un OR de 5,3 (1,8-15,8). Los factores de riesgo para la infección por HPV-16 fueron el hábito de fumar y el antecedente de enfermedades de transmisión sexual. Estos datos son importantes para la ejecución de los programas de prevención, incluyendo una introducción adecuada de la vacunación y la línea de base para la vigilancia virológica en la era de la vacuna.The objective of this study was to determine the prevalence of HPV infection and cervical lesions present in women who attended a health center in a low-resource area of the city of Posadas, Misiones, Argentina. Cervical cell samples (n = 163) were processed for Papanicolaou cytology and HPV-PCR tests. Socio-cultural risk factors were estimated using the odds ratio (OR, CI 95 %). Cervical lesions were detected in 14.7 % of women. The general prevalence of HPV infection was of 38 %. The most common types among the total population were HPV-16 (9.8 %) and HPV-33 (9.3 %). HPV-16 was detected in association with 29.2 % and 6.5 % of women with and without cervical lesions, respectively, the OR being 5.3 (1.8-15.8). Risk factors for HPV-16 infection were a smoking habit and a history of previous sexually-transmitted diseases. These data are important for the implementation of prevention programs, including an appropriate introduction of vaccination and the baseline for virological surveillance in the vaccine era.Fil: Badano, Ines. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Pedrozo, Rene W.. Provincia de Misiones. Ministerio de Salud de la Provincia de Misiones; ArgentinaFil: Ruiz Diaz, Laura S.. Provincia de Misiones. Ministerio de Salud de la Provincia de Misiones; ArgentinaFil: Galuppo, Juan A.. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Picconi, María A.. Direccion Nacional de Instituto de Investigacion. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbran". Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Virologia; ArgentinaFil: Campos, Rodolfo Hector. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; ArgentinaFil: Liotta, Domingo Javier. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; Argentin

Análisis de variantes de HPV-16 como marcador molecular antropólogico

El Virus Papiloma Humano tipo 16 (HPV16) es el principal responsable del desarrollo del cáncer de cuello uterino. Además de su significado clínico, el estudio de la variación genética en las regiones E6, L1 y LCR de este virus ha permitido identificar variantes específicas de diferentes áreas geográficas. Este descubrimiento sugiere una antigua propagación del HPV16 y su coevolución con el género humano. En este contexto, las variantes podrían servir como marcador molecular antropológico, aportando nuevos datos al análisis de patrones migratorios humanos. El objetivo del trabajo fue determinar las variantes de HPV16 en las regiones genéticas E6 y L1 que infectan mujeres guaraníes de Misiones. Para ello se analizaron 39 muestras de cepillados cervicales de mujeres guaraníes infectadas con HPV16. Las variantes en E6 y L1 se identificaron por PCR e hibridación en dot blot. Los resultados obtenidos fueron: el 77% de las variantes Europeas, 20% Africanas y 3% Asiático Americanas. La baja prevalencia de variantes Asiático Americanas coincide con lo reportado por Picconi y col, 2002 para mujeres quechuas, y haría suponer una limitada diseminación del HPV16 durante la época prehispánica. El predominio de las variantes Europeas podría ser resultado de la colonización española y la inmigración europea, mientras que el tráfico de esclavos negros explicaría la presencia de variantes Africanas. Por otra parte, la hipótesis de competencia viral tampoco puede ser descartada.Sesión de posterAsociación de Antropología Biológica de la República Argentina (AABRA

Análisis de variantes de HPV-16 como marcador molecular antropólogico

El Virus Papiloma Humano tipo 16 (HPV16) es el principal responsable del desarrollo del cáncer de cuello uterino. Además de su significado clínico, el estudio de la variación genética en las regiones E6, L1 y LCR de este virus ha permitido identificar variantes específicas de diferentes áreas geográficas. Este descubrimiento sugiere una antigua propagación del HPV16 y su coevolución con el género humano. En este contexto, las variantes podrían servir como marcador molecular antropológico, aportando nuevos datos al análisis de patrones migratorios humanos. El objetivo del trabajo fue determinar las variantes de HPV16 en las regiones genéticas E6 y L1 que infectan mujeres guaraníes de Misiones. Para ello se analizaron 39 muestras de cepillados cervicales de mujeres guaraníes infectadas con HPV16. Las variantes en E6 y L1 se identificaron por PCR e hibridación en dot blot. Los resultados obtenidos fueron: el 77% de las variantes Europeas, 20% Africanas y 3% Asiático Americanas. La baja prevalencia de variantes Asiático Americanas coincide con lo reportado por Picconi y col, 2002 para mujeres quechuas, y haría suponer una limitada diseminación del HPV16 durante la época prehispánica. El predominio de las variantes Europeas podría ser resultado de la colonización española y la inmigración europea, mientras que el tráfico de esclavos negros explicaría la presencia de variantes Africanas. Por otra parte, la hipótesis de competencia viral tampoco puede ser descartada.Sesión de posterAsociación de Antropología Biológica de la República Argentina (AABRA

Evolutionary analysis of JC polyomavirus in Misiones’ population yields insight into the population dynamics of the early human dispersal in the Americas

Background: JC polyomavirus (JCV) has an ethno-geographical distribution across human populations. Objective: Study the origins of the population of Misiones (Argentina) by using JCV as genetic marker. Methods: Viral detection and characterization was conducted by PCR amplification and evolutionary analysis of the intergenic region sequences. Results: 22 out of 121 samples were positive for JCV, including 5 viral lineages: MY (n = 8), Eu-a (n = 7), B1-c (n = 4), B1-b (n = 2) and Af2 (n = 1). MY sequences clustered within a branch of Native American origin that diverged from its Asian counterpart about 21,914 years ago (HPD 95% interval 15,383–30,177), followed by a sustained demographic expansion around 5000 years ago. Conclusions: JCV in Misiones reflects the multiethnic origin of the current population, with an important Amerindian contribution. Analysis of the MY viral lineage shows a pattern consistent with the arrival of early human migrations to the Americas and a population expansion by the pre-Columbian native societies.Fil: Pereson Moschen, Matias Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; ArgentinaFil: Sanabria, Daiana Jimena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; ArgentinaFil: Liotta, Domingo Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación.Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"; ArgentinaFil: Campos, Rodolfo Hector. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; ArgentinaFil: Schurr, Theodore. University of Pennsylvania; Estados UnidosFil: Di Lello, Federico Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; ArgentinaFil: Badano, Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; Argentin

Mitochondrial DNA ancestry, HPV infection and the risk of cervical cancer in a multiethnic population of northeastern Argentina

Background: Misiones Province in northeastern Argentina is considered to be a region with a high prevalence of HPV infection and a high mortality rate due to cervical cancer. The reasons for this epidemiological trend are not completely understood. To gain insight into this problem, we explored the relationship between mitochondrial DNA (mtDNA) ancestry, HPV infection, and development of cervical lesions/cancer in women from the city of Posadas in Misiones Province. Methods: Two hundred and sixty-one women, including 92 cases of patients diagnosed with cervical lesions and 169 controls, were analyzed. mtDNA ancestry was assessed through HVS1 sequencing, while the detection and typing of HPV infection was conducted through nested multiplex PCR analysis. Multivariate logistic regression was conducted with the resulting data to estimate the odds ratios (ORs) adjusted by socio-demographic variables. Results: The study participants showed 68.6% Amerindian, 26.1% European and 5.3% African mtDNA ancestry, respectively. Multiple regression analysis showed that women with African mtDNAs were three times more likely to develop a cervical lesion than those with Native American or European mtDNAs [OR of 3.8 (1.2–11.5) for ancestry and OR of 3.5 (1.0–12.0) for L haplogroups], although the associated p values were not significant when tested under more complex multivariate models. HPV infection and the development of cervical lesions/cancer were significant for all tested models, with the highest OR values for HPV16 [OR of 24.2 (9.3–62.7)] and HPV-58 [OR of 19.0 (2.4–147.7)]. Conclusion: HPV infection remains a central risk factor for cervical cancer in the Posadas population. The potential role of African mtDNA ancestry opens a new avenue for future medical association studies in multiethnic populations, and will require further confirmation in large-scale studies.Fil: Badano, Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Sanabria, Daiana Jimena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Tótaro, Roxana María. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Rubinstein, Samara. University of Pennsylvania; Estados UnidosFil: Gili, Juan Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET.; ArgentinaFil: Liotta, Domingo Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Picconi, Maria A.. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Campos, Rodolfo Hector. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología; ArgentinaFil: Schurr, Theodore G.. University of Pennsylvania; Estados Unido

Epidemiología molecular y análisis filogenético de la infección por el virus del papiloma humano en mujeres con lesiones cervicales y cáncer en la región litoral del Ecuador

The aim of the present study was to gather information regarding the molecular epidemiology of Human papillomavirus (HPV) and related risk factors in a group of women with low- and high-grade cervical lesions and cancer from the coastal region of Ecuador. In addition, we studied the evolution of HPV variants from the most prevalent types and provided a temporal framework for their emergence, which may help to trace the source of dissemination within the region. We analyzed 166 samples, including 57 CIN1, 95 CIN2/3 and 14 cancer cases. HPV detection and typing was done by PCR-sequencing (MY09/MY11). HPV variants and estimation of the time to most recent common ancestor (tMRCA) was assessed through phylogeny and coalescence analysis. HPV DNA was found in 54.4% of CIN1, 74.7% of CIN2/3 and 78.6% of cancer samples. HPV16 (38.9%) and HPV58 (19.5%) were the most prevalent types. Risk factors for the development of cervical lesions/cancer were the following: three or more pregnancies (OR = 4.3), HPV infection (OR = 3.7 for high-risk types; OR = 3.5 for HPV16), among others. With regard to HPV evolution, HPV16 isolates belonged to lineages A (69%) and D (31%) whereas HPV58 isolates belonged only to lineage A. The period of emergence of HPV16 was in association with human populations (tMRCA = 91. 052 years for HPV16A and 27. 000 years for HPV16D), whereas HPV58A preceded Homo sapiens evolution (322. 257 years). This study provides novel data on HPV epidemiology and evolution in Ecuador, which will be fundamental in the vaccine era.Fil: Bedoya Pilozo, Cesar H.. Escuela Superior Politécnica del Litoral; Ecuador. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Medina Magües, Lex G.. Escuela Superior Politécnica del Litoral; EcuadorFil: Espinosa García, Maylen. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Sánchez, Martha. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Parrales Valdiviezo, Johanna V.. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Molina, Denisse. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Ibarra, María A.. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Quimis Ponce, María. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: España, Karool. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Párraga Macias, Karla E.. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Cajas Flores, Nancy V.. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Solon, Orlando A.. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; Ecuador. Universidad Agraria del Ecuador; EcuadorFil: Robalino Penaherrera, Jorge A.. Instituto Nacional de Investigaciones en Salud Pública; EcuadorFil: Chedraui, Peter. Hospital Gineco-Obstétrico Enrique C. Sotomayor; EcuadorFil: Escobar, Saul. Universidad Católica de Guayaquil; EcuadorFil: Loja Chango, Rita D.. Universidad Católica de Guayaquil; EcuadorFil: Ramirez Morán, Cecibel. Universidad Católica de Guayaquil; EcuadorFil: Espinoza Caicedo, Jasson. Universidad Católica de Guayaquil; EcuadorFil: Sánchez Giler, Sunny. Universidad Especialidades Espíritu Santo. Facultad de Ciencias Médicas; EcuadorFil: Limia, Celia M.. Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri; CubaFil: Alemán, Yoan. Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri; CubaFil: Soto, Yudira. Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri; CubaFil: Kouri, Vivian. Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri; CubaFil: Culasso, Andrés Carlos Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; ArgentinaFil: Badano, Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Secretaría de Educación Superior, Ciencia, Tecnología e Innovación; Ecuador. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; Argentin

Studies on human papillomavirus (HPV) in Ecuador, part I

Aprovechando la realización de las XL Jornadas Nacionales de Biología Espol en la ciudad de Guayaquil, se realizó una sesión dedicada a la epidemiología del virus de papiloma humano (VPH) y del cáncer cervical. Esta sesión tuvo la participación de varios investigadores provenientes de diferentes zonas del Ecuador. El presente artículo tiene como objeto presentar un resumen de estas charlas, junto a un análisis de la información mostrada además de una reflexión sobre las preguntas que quedan aún por responder en cuanto al perfil epidemiológico de esta patología en el país.Taking advantage of the realization of the XL National Conference on Espol Biology in the city of Guayaquil, a session was held dedicated to the epidemiology of Human Papilloma Virus (HPV) and cervical cancer. This session was attended by several researchers from different areas of Ecuador. The object of this article is to present a summary of these talks, together with an analysis of the information shown in addition to a reflection on the questions still to be answered regarding the epidemiological profile of this pathology in the country.Fil: Rivera, Angélica. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: De la Plata, Janice. Escuela Superior Politécnica del Litoral. Facultad de Ciencias de la Vida; EcuadorFil: Montiel, Marynes. Escuela Superior Politécnica del Litoral. Facultad de Ciencias de la Vida; EcuadorFil: Romero, Christian. Escuela Superior Politécnica del Litoral. Facultad de Ciencias de la Vida; EcuadorFil: Piedrahíta, Paolo. Escuela Superior Politécnica del Litoral. Facultad de Ciencias de la Vida; EcuadorFil: Sanchez, Eduardo. Escuela Superior Politécnica del Litoral. Facultad de Ciencias de la Vida; EcuadorFil: Moreno, Arturo. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Espinosa, Maylen. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Bedoya, César. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Arreaga, Carlos. Universidad Técnica de Machala; EcuadorFil: España, Karool. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Parrales, Eduardo. Universidad de Guayaquil; EcuadorFil: Zhingre, Alicia. Universidad de Guayaquil; EcuadorFil: Sanchez, Sunny. Universidad de Especialidades Espíritu Santo; EcuadorFil: Campoverde, Alfredo. Universidad de Cuenca; EcuadorFil: Dalgo, Paola. Universidad Técnica Particular de Loja; EcuadorFil: Arévalo, Paulina. Universidad Técnica Particular de Loja; EcuadorFil: García, Gustavo. Sociedad de Lucha Contra el Cáncer. Instituto Oncológico Nacional; EcuadorFil: Mendoza, Marcia. Sociedad de Lucha Contra el Cáncer. Instituto Oncológico Nacional; EcuadorFil: Ruiz, Juan. Sociedad de Lucha Contra el Cáncer. Instituto Oncológico Nacional; EcuadorFil: Sanchez, Martha. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Medina, Lex. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Párraga, Karla. United European Gastroenterology; AustriaFil: Ibarra, Alejandra. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales; ArgentinaFil: Quimís, María. No especifíca;Fil: Parrales, Johana. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Molina, Denisse. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Badano, Ines. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; ArgentinaFil: Orlando, Alberto. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; EcuadorFil: Vega Luzuriaga, Patricio. Ministerio de Salud Publica. Instituto Nacional de Investigacion En Salud Publica Dr. Leopoldo Izquieta Perez; Ecuado

Caracterización del promotor del TNF-α en primates del género Sapajus.: Genética de primates Neotropicales del género Sapajus de la Provincia de Misiones, Argentina

El Factor de Necrosis Tumoral alfa es una citoquina pro-inflamatoria que juega un rol central en la respuesta inmune innata y adaptativa de los primates. Los niveles de expresión del gen se encuentran estrechamente regulados a través de un promotor que se extiende 1,2Kb río arriba del inicio de la transcripción. Los análisis de genómica comparada entre promotores de 5 especies de Platirrinos y 25 especies de Catarrinos, han indicado la presencia de una región de 200pb altamente conservadas entre primates. Este phylogenetic footprinting sería clave para la activación del gen; además los autores indicaron que, por fuera de este segmento, numerosos SNPs se acumulan respetando un modelo de evolución neutral; de las 332 diferencias o sustituciones fijas encontradas respecto del consenso humano, 41 podrían tener valor taxonómico por ser especie-específicas. Se caracterizó la secuencia del promotor del TNF-α en primates del género Sapajus de Argentina: Sapajus nigritus y S. cay. Este trabajo permitió generar el primer reporte de TNF-α en primates neotropicales de la Argentina. Estos datos podrían ser útiles en estudios de genética comparada y evolución del sistema inmune.Tumor Necrosis Factor alpha is a proinflammatory cytokine that plays a central role in the innate and adaptive immune responses in primates. The gene expression levels are tightly regulated by a promoter extending 1.2 kb upstream from the transcription start. The comparative genomic analysis of promoters between 5 Platyrrhine and 25 species of Catarrhini species (including Homo sapiens) have indicated the presence of a 200bp region highly conserved between primates. This phylogenetic footprinting would be key to gene activation. Authors also indicated that variation in genomic regions neighboring this segment, accumulate a number of SNPs under the neutral model of evolution, where 41 SNP, out of 332 substitutions compare with the human genome referes, could be valuable taxonomic being species-specific. The objective of this work is to characterize the promoter sequence of Tumor Necrosis Factor alpha in primates of Sapajus genus in Argentina: Sapajus nigritus (Cebus apella nigritus) and S. cay (Cebus apella Cebus paraguayanus = libidinosus). This study generates the first report of TNF-α neotropical primate of Argentina. These data may be useful in genetic studies and comparative evolution of the immune system.Fil: Sánchez Fernández, Candelaria. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; ArgentinaFil: Badano, Ines. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; ArgentinaFil: Kowalewski, Miguel Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia". Estación Biológica de Usos Múltiples (Sede Corrientes); Argentin

Molecular epidemiology of hepatitis B virus in Misiones, Argentina

Hepatitis B virus (HBV) infection is a major public health problem worldwide. The aims of this study were to describe the molecular epidemiology of HBV in the Province of Misiones, Argentina and estimate the phylodynamic of the main groups in a Bayesian coalescent framework. To this end, partial or complete genome sequences were obtained from 52 blood donor candidates.The phylogenetic analysis based on partial sequences of S/P region showed a predominance of genotype D (65.4%), followed by genotype F (30.8%) and genotype A as a minority (3.8%). At subgenotype level, the circulation of subgenotypes D3 (42.3%), D2 (13.5%), F1b (11.5%) and F4 (9.6%) was mainly identified.The Bayesian coalescent analysis of 29 complete genome sequences for the main groups revealed that the subgenotypes D2 and D3 had several introductions to the region, with ancestors dating back from 1921 to 1969 and diversification events until the late '70s. The genotype F in Misiones has a more recent history; subgenotype F4 isolates were intermixed with sequences from Argentina and neighboring countries and only one significant cluster dated back in 1994 was observed. Subgenotype F1b isolates exhibited low genetic distance and formed a closely related monophyletic cluster, suggesting a very recent introduction.In conclusion, the phylogenetic and coalescent analyses showed that the European genotype D has a higher circulation, a longer history of diversification and may be responsible for the largest proportion of chronic HBV infections in the Province of Misiones. Genotype F, especially subgenotype F1b, had a more recent introduction and its diversification in the last 20 years might be related to its involvement in new transmission events.Fil: Mojsiejczuk, Laura Noelia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Torres, Carolina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Sevic, Ina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Ministerio de Ciencia. Tecnología e Innovación Productiva. Agencia Nacional de Promoción Cientifíca y Tecnológica; ArgentinaFil: Badano, Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; ArgentinaFil: Malan, Richard. Banco de Sangre Central de Misiones; ArgentinaFil: Flichman, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; ArgentinaFil: Liotta, Domingo Javier. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales. Laboratorio de Biología Molecular Aplicada; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Campos, Rodolfo Hector. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin