Gene discovery for facioscapulohumeral muscular dystrophy by machine learning techniques

Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) is a neuromuscular disorder that shows a preference for the facial, shoulder and upper arm muscles. FSHD affects about one in 20-400,000 people, and no effective therapeutic strategies are known to halt disease progression or reverse muscle weakness or atrophy. Many genes may be incorrectly regulated in affected muscle tissue, but the mechanisms responsible for the progressive muscle weakness remain largely unknown. Although machine learning (ML) has made significant inroads in biomedical disciplines such as cancer research, no reports have yet addressed FSHD analysis using ML techniques. This study explores a specific FSHD data set from a ML perspective. We report results showing a very promising small group of genes that clearly separates FSHD samples from healthy samples. In addition to numerical prediction figures, we show data visualizations and biological evidence illustrating the potential usefulness of these results.Peer ReviewedPostprint (published version

Evidencia Empírica de la Minería de Procesos en la Implantación de CMMI-DEV

Resumen: La minería de procesos tiene como objetivo descubrir, monitorear y mejorar procesos a través del análisis de los diversos registros de eventos generados por los procesos de la organización. El objetivo de este trabajo es presentar la evidencia empírica de la inclusión estratégica de la disciplina de minería de procesos en proyectos de mejora de procesos de software implementados con CMMI. En el proceso de mapeo sistemático de la revisión de la literatura, se establecieron cuatro categorías para clasificar los hallazgos encontrados (Fundamentos teóricos, propuestas, herramientas y sistemas de información y algoritmos) para presentar los estudios que cumplen con el objetivo. Se concluye que la interdisciplinariedad de la minería de procesos con un modelo de referencia de procesos como CMMI-DEV apoya la implementación y evaluación de las áreas de procesos, al aplicar técnicas y algoritmos de minería de procesos que faciliten la exploración y explotación de los registros de eventos relacionados a la ejecución de las actividades almacenados en un repositorio. Palabras clave: Minería de Procesos, Mejora de Procesos de Software, Registro de Eventos

Wydajność energetyczna wykorzystania stali zbrojeniowej podczas budowy kompleksu biznesowego w Meksyku

Much of the energy used in the world is associated with the construction sector, and one of the ways to reduce that energy consumption is to do each constructive process in an energetically efficient way. The aim of this paper is to present results from an energy efficiency program in the construction of a business complex in Hermosillo, Mexico, particularly in the processes of reinforcing steel activities (rebar). Results reveal that appropriate use of equipment and the coordination between engineers and workers help to improve the energyefficiency during the construction phase also reducing material waste. Additionally, attaching the energy efficiency approach to the cleaner production framework is a complicated task due to energy inefficiencies are not easily identified and estimated. Since there is less energy consumption in construction process along the life cycle of buildings compared to operation activities, there is little evidence on energy efficiency studies in that part of the process. Therefore, this paper intends to provide experiences to construction experts in order to have better basis for decisions related to energy efficiency in this industry.Duża część konsumpcji energii na świecie przypada na sektor budowlany, a jedną z metod redukcji tego zużycia jest przeprowadzenie każdego procesu budowlanego w sposób wydajny energetycznie. Celem artykułu jest przedstawienie wyników programu na rzecz wydajności energetycznej związanego z budową kompleksu biznesowego w Hermosillo w Meksyku, a zwłaszcza z użyciem stali zbrojeniowej (prętów zbrojeniowych). Wyniki wskazują, że właściwe wykorzystanie sprzętu oraz koordynacja pomiędzy inżynierami i pracownikami pomaga poprawić wydajność energetyczną w fazie budowy oraz ograniczyć odpady. Co więcej, włączenie podejścia opartego na wydajności energetycznej w ogólne podstawy czystszej produkcji jestskomplikowanym zadaniem z tego powodu, że niewydajność energetyczna jest trudna do zidentyfikowania i oszacowania. Dlatego też mniejsza konsumpcja energii w procesie budowlanym w całym cyklu życia budynków w porównaniu do działalności produkcyjnej nie odzwierciedla się w dowodach w postaci badań nad wydajnością energetyczną w tej części procesu. Niniejszy artykuł ma na celu zaprezentowanie doświadczenia ekspertów budowlanych, aby wesprzeć proces decyzyjny związany z wydajnością energetyczną w analizowanym przemyśle

Wydajność energetyczna wykorzystania stali zbrojeniowej podczas budowy kompleksu biznesowego w Meksyku

Much of the energy used in the world is associated with the construction sector, and one of the ways to reduce that energy consumption is to do each constructive process in an energetically efficient way. The aim of this paper is to present results from an energy efficiency program in the construction of a business complex in Hermosillo, Mexico, particularly in the processes of reinforcing steel activities (rebar). Results reveal that appropriate use of equipment and the coordination between engineers and workers help to improve the energy efficiency during the construction phase also reducing material waste. Additionally, attaching the energy efficiency approach to the cleaner production framework is a complicated task due to energy inefficiencies are not easily identified and estimated. Since there is less energy consumption in construction process along the life cycle of buildings compared to operation activities, there is little evidence on energy efficiency studies in that part of the process. Therefore, this paper intends to provide experiences to construction experts in order to have better basis for decisions related to energy efficiency in this industry.Duża część konsumpcji energii na świecie przypada na sektor budowlany, a jedną z metod redukcji tego zużycia jest przeprowadzenie każdego procesu budowlanego w sposób wydajny energetycznie. Celem artykułu jest przedstawienie wyników programu na rzecz wydajności energetycznej związanego z budową kompleksu biznesowego w Hermosillo w Meksyku, a zwłaszcza z użyciem stali zbrojeniowej (prętów zbrojeniowych). Wyniki wskazują, że właściwe wykorzystanie sprzętu oraz koordynacja pomiędzy inżynierami i pracownikami pomaga poprawić wydajność energetyczną w fazie budowy oraz ograniczyć odpady. Co więcej, włączenie podejścia opartego na wydajności energetycznej w ogólne podstawy czystszej produkcji jest skomplikowanym zadaniem z tego powodu, że niewydajność energetyczna jest trudna do zidentyfikowania i oszacowania. Dlatego też mniejsza konsumpcja energii w procesie budowlanym w całym cyklu życia budynków w porównaniu do działalności produkcyjnej nie odzwierciedla się w dowodach w postaci badań nad wydajnością energetyczną w tej części procesu. Niniejszy artykuł ma na celu zaprezentowanie doświadczenia ekspertów budowlanych, aby wesprzeć proces decyzyjny związany z wydajnością energetyczną w analizowanym przemyśle

Wydajność energetyczna wykorzystania stali zbrojeniowej podczas budowy kompleksu biznesowego w Meksyku

Much of the energy used in the world is associated with the construction sector, and one of the ways to reduce that energy consumption is to do each constructive process in an energetically efficient way. The aim of this paper is to present results from an energy efficiency program in the construction of a business complex in Hermosillo, Mexico, particularly in the processes of reinforcing steel activities (rebar). Results reveal that appropriate use of equipment and the coordination between engineers and workers help to improve the energyefficiency during the construction phase also reducing material waste. Additionally, attaching the energy efficiency approach to the cleaner production framework is a complicated task due to energy inefficiencies are not easily identified and estimated. Since there is less energy consumption in construction process along the life cycle of buildings compared to operation activities, there is little evidence on energy efficiency studies in that part of the process. Therefore, this paper intends to provide experiences to construction experts in order to have better basis for decisions related to energy efficiency in this industry.Duża część konsumpcji energii na świecie przypada na sektor budowlany, a jedną z metod redukcji tego zużycia jest przeprowadzenie każdego procesu budowlanego w sposób wydajny energetycznie. Celem artykułu jest przedstawienie wyników programu na rzecz wydajności energetycznej związanego z budową kompleksu biznesowego w Hermosillo w Meksyku, a zwłaszcza z użyciem stali zbrojeniowej (prętów zbrojeniowych). Wyniki wskazują, że właściwe wykorzystanie sprzętu oraz koordynacja pomiędzy inżynierami i pracownikami pomaga poprawić wydajność energetyczną w fazie budowy oraz ograniczyć odpady. Co więcej, włączenie podejścia opartego na wydajności energetycznej w ogólne podstawy czystszej produkcji jestskomplikowanym zadaniem z tego powodu, że niewydajność energetyczna jest trudna do zidentyfikowania i oszacowania. Dlatego też mniejsza konsumpcja energii w procesie budowlanym w całym cyklu życia budynków w porównaniu do działalności produkcyjnej nie odzwierciedla się w dowodach w postaci badań nad wydajnością energetyczną w tej części procesu. Niniejszy artykuł ma na celu zaprezentowanie doświadczenia ekspertów budowlanych, aby wesprzeć proces decyzyjny związany z wydajnością energetyczną w analizowanym przemyśle

Tracking the Evolution of the Internet of Things Concept Across Different Application Domains

Both the idea and technology for connecting sensors and actuators to a network to remotely monitor and control physical systems have been known for many years and developed accordingly. However, a little more than a decade ago the concept of the Internet of Things (IoT) was coined and used to integrate such approaches into a common framework. Technology has been constantly evolving and so has the concept of the Internet of Things, incorporating new terminology appropriate to technological advances and different application domains. This paper presents the changes that the IoT has undertaken since its conception and research on how technological advances have shaped it and fostered the arising of derived names suitable to specific domains. A two-step literature review through major publishers and indexing databases was conducted; first by searching for proposals on the Internet of Things concept and analyzing them to find similarities, differences, and technological features that allow us to create a timeline showing its development; in the second step the most mentioned names given to the IoT for specific domains, as well as closely related concepts were identified and briefly analyzed. The study confirms the claim that a consensus on the IoT definition has not yet been reached, as enabling technology keeps evolving and new application domains are being proposed. However, recent changes have been relatively moderated, and its variations on application domains are clearly differentiated, with data and data technologies playing an important role in the IoT landscape

Análisis de Flujos de Conocimiento en Proyectos de Mejora de Procesos Software bajo una perspectiva multi-enfoque

La Gestión de conocimiento (GC) tiene el potencial de proveer diversos beneficios a las organizaciones dedicadas al desarrollo de software. Entre ellos la gestión de activos de conocimiento, el aumento de la productividad o el incremento de la capacidad de sus procesos software. Sin embargo, debido al crecimiento y evolución que ha tenido la industria de software, se requieren nuevos paradigmas asociados a la generación y reutilización de diversos tipos y flujos de conocimiento con el propósito de promover procesos de innovación centrados en la Mejora de procesos software (SPI). En este artículo se presenta un análisis de tres enfoques de flujos de conocimiento, con el cual se ofrece una estrategia para apoyar la creación, transferencia y evolución del conocimiento involucrado en un proyecto SPI. Además, se define un marco de trabajo para la identificación de flujos de conocimiento relacionados con elementos de un modelo de referencia de procesos

Glucose Oxidase Biosensor Modeling and Predictors Optimization by Machine Learning Methods

Biosensors are small analytical devices incorporating a biological recognition element and a physico-chemical transducer to convert a biological signal into an electrical reading. Nowadays, their technological appeal resides in their fast performance, high sensitivity and continuous measuring capabilities; however, a full understanding is still under research. This paper aims to contribute to this growing field of biotechnology, with a focus on Glucose-Oxidase Biosensor (GOB) modeling through statistical learning methods from a regression perspective. We model the amperometric response of a GOB with dependent variables under different conditions, such as temperature, benzoquinone, pH and glucose concentrations, by means of several machine learning algorithms. Since the sensitivity of a GOB response is strongly related to these dependent variables, their interactions should be optimized to maximize the output signal, for which a genetic algorithm and simulated annealing are used. We report a model that shows a good generalization error and is consistent with the optimization

Glucose oxidase biosensor modeling and predictors optimization by machine learning methods

Biosensors are small analytical devices incorporating a biological recognition element and a physico-chemical transducer to convert a biological signal into an electrical reading. Nowadays, their technological appeal resides in their fast performance, high sensitivity and continuous measuring capabilities; however, a full understanding is still under research. This paper aims to contribute to this growing field of biotechnology, with a focus on Glucose-Oxidase Biosensor (GOB) modeling through statistical learning methods from a regression perspective. We model the amperometric response of a GOB with dependent variables under different conditions, such as temperature, benzoquinone, pH and glucose concentrations, by means of several machine learning algorithms. Since the sensitivity of a GOB response is strongly related to these dependent variables, their interactions should be optimized to maximize the output signal, for which a genetic algorithm and simulated annealing are used. We report a model that shows a good generalization error and is consistent with the optimization.Peer Reviewe

Gene discovery for facioscapulohumeral muscular dystrophy by machine learning techniques

Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) is a neuromuscular disorder that shows a preference for the facial, shoulder and upper arm muscles. FSHD affects about one in 20-400,000 people, and no effective therapeutic strategies are known to halt disease progression or reverse muscle weakness or atrophy. Many genes may be incorrectly regulated in affected muscle tissue, but the mechanisms responsible for the progressive muscle weakness remain largely unknown. Although machine learning (ML) has made significant inroads in biomedical disciplines such as cancer research, no reports have yet addressed FSHD analysis using ML techniques. This study explores a specific FSHD data set from a ML perspective. We report results showing a very promising small group of genes that clearly separates FSHD samples from healthy samples. In addition to numerical prediction figures, we show data visualizations and biological evidence illustrating the potential usefulness of these results.Peer Reviewe