38 research outputs found

    The influence of patient characteristics on the alarm rate in intensive care units: a retrospective cohort study

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    Intensive care units (ICU) are often overflooded with alarms from monitoring devices which constitutes a hazard to both staff and patients. To date, the suggested solutions to excessive monitoring alarms have remained on a research level. We aimed to identify patient characteristics that affect the ICU alarm rate with the goal of proposing a straightforward solution that can easily be implemented in ICUs. Alarm logs from eight adult ICUs of a tertiary care university-hospital in Berlin, Germany were retrospectively collected between September 2019 and March 2021. Adult patients admitted to the ICU with at least 24 h of continuous alarm logs were included in the study. The sum of alarms per patient per day was calculated. The median was 119. A total of 26,890 observations from 3205 patients were included. 23 variables were extracted from patients' electronic health records (EHR) and a multivariable logistic regression was performed to evaluate the association of patient characteristics and alarm rates. Invasive blood pressure monitoring (adjusted odds ratio (aOR) 4.68, 95%CI 4.15-5.29, p < 0.001), invasive mechanical ventilation (aOR 1.24, 95%CI 1.16-1.32, p < 0.001), heart failure (aOR 1.26, 95%CI 1.19-1.35, p < 0.001), chronic renal failure (aOR 1.18, 95%CI 1.10-1.27, p < 0.001), hypertension (aOR 1.19, 95%CI 1.13-1.26, p < 0.001), high RASS (aOR 1.22, 95%CI 1.18-1.25, p < 0.001) and scheduled surgical admission (aOR 1.22, 95%CI 1.13-1.32, p < 0.001) were significantly associated with a high alarm rate. Our study suggests that patient-specific alarm management should be integrated in the clinical routine of ICUs. To reduce the overall alarm load, particular attention regarding alarm management should be paid to patients with invasive blood pressure monitoring, invasive mechanical ventilation, heart failure, chronic renal failure, hypertension, high RASS or scheduled surgical admission since they are more likely to have a high contribution to noise pollution, alarm fatigue and hence compromised patient safety in ICUs

    Finishing the euchromatic sequence of the human genome

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    The sequence of the human genome encodes the genetic instructions for human physiology, as well as rich information about human evolution. In 2001, the International Human Genome Sequencing Consortium reported a draft sequence of the euchromatic portion of the human genome. Since then, the international collaboration has worked to convert this draft into a genome sequence with high accuracy and nearly complete coverage. Here, we report the result of this finishing process. The current genome sequence (Build 35) contains 2.85 billion nucleotides interrupted by only 341 gaps. It covers ∌99% of the euchromatic genome and is accurate to an error rate of ∌1 event per 100,000 bases. Many of the remaining euchromatic gaps are associated with segmental duplications and will require focused work with new methods. The near-complete sequence, the first for a vertebrate, greatly improves the precision of biological analyses of the human genome including studies of gene number, birth and death. Notably, the human enome seems to encode only 20,000-25,000 protein-coding genes. The genome sequence reported here should serve as a firm foundation for biomedical research in the decades ahead

    Risk prediction based upon the expression of immunologic relevant genes

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    1 EINLEITUNG 5 1.1 Klinische Definition der Sepsis und sepsisverwandter Erkrankungen 5 1.2 EntzĂŒndungsreaktion und Sepsis 8 1.3 Postoperative Immundepression als Risikofaktor fĂŒr die Entstehung einer Sepsis 15 1.4 Immunomonitoring in septischen und postoperativen Patienten 16 1.5 Immunmodulatorische Strategien in der Sepsistherapie 18 1.6 Epidemiologie und Gesundheitsökonomische Bedeutung der Sepsis 19 2 FRAGESTELLUNG 21 3 MATERIALIEN UND METHODEN 23 3.1 Arbeitsmaterialien 23 3.2 Patienten 25 3.3 RNA-PrĂ€paration 26 3.4 Die cDNA (copyDNA)-Synthese 28 3.5 Die Polymerase- Ketten-Reaktion (PCR) 28 3.6 Statistische Auswertung 39 4 ERGEBNISSE 41 4.1 Patienten 41 4.2 Die Genexpression der proinflammatorischen Zytokine IL-1ÎČ , TNFa und IL-18 46 4.3 Die Expression von T-Zell- und NatĂŒrlichen-Killerzell- Genen 49 4.4 Die Expression der Chemokine IL-8, MIP-1a, IP-10, PF4 und GRO-1 52 4.5 Die Expression des antiinflammatorischen Zytokins TGFÎČ 56 4.6 Die Expression von Calgranulin A (S100A8) 57 4.7 RisikoprĂ€diktion anhand der Genexpression einzelner Gene 58 4.8 Der kombinierte Genexpressionstest zur RisikoprĂ€diktion 61 5 DISKUSSION 64 5.1 Expression von proinflammatorischen Zytokinen 65 5.2 Expression von T-Zell- und NK-Zell-Genen 68 5.3 Expression von Chemokinen 71 5.4 Expression des antiinflammatorischen Zytokins TGFÎČ 73 5.5 Expression von Calgranulin A (S100A8) 74 5.6 Vergleich des Kombinierten Genexpressionstests mit anderen Verfahren zum Immunomonitoring 75 5.7 Klinische Relevanz und Aussagekraft der gewonnenen Daten 77 5.8 Zusammenfassung und Ausblick 80 ZUSAMMENFASSUNG 83 ABKÜRZUNGSVERZEICHNIS 85 REFERENZEN 87 LEBENSLAUF 99 DANKSAGUNG 100Mit einer Inzidenz von ĂŒber 200/100 000 Einwohner und Jahr ist die Sepsis eine der hĂ€ufigsten schwerwiegenden Erkrankungen in Deutschland. Die LetalitĂ€t ist dabei trotz verbesserter Behandlungsstrategien nach wie vor hoch. Bei der Entwicklung einer Sepsis kommt es infolge von eindringenden Mikroorganismen zu einem Ungleichgewicht von pro- und antiinflammatorischen Mechanismen. Aufgrund dieser Fehlregulation des Immunsystems ist die Abwehr von Krankheitserregern hĂ€ufig eingeschrĂ€nkt. Ähnliche immunologische VerĂ€nderungen wie bei der Sepsis nicht nur durch eindringende Mikroorganismen ausgelöst werden, sondern auch durch sterile Traumata, Verbrennungen oder eine akute Pankreatitis, weshalb diese Krankheitsbilder mit einer erhöhten InfektanfĂ€lligkeit einhergehen. Trotz des erweiterten VerstĂ€ndnisses pathophysiologischer VorgĂ€nge sind bisherige AnsĂ€tze einer immunmodulatorischen Therapie weitgehend erfolglos geblieben. Eine wichtige Ursache dafĂŒr liegt in dem Mangel an validierten Instrumenten um die aktuelle Immunfunktion eines Patienten zu ĂŒberwachen und eine mögliche Therapie zu steuern. Mit dem Ziel, Risikopatienten fĂŒr eine Sepsis zu identifizieren wurde in der hier vorgestellten retrospektiven Untersuchung die perioperative Expression von 24 immunologisch relevanten Genen in Vollblutproben untersucht. 20 Patienten, die infolge eines operativen Eingriffs eine Sepsis entwickelten wurden dabei mit 20 Patienten mit Ă€hnlicher Anamnese verglichen (sog. matched-pairs). Postoperativ zeigte sich eine signifikant niedrigere Expression der Botenstoffe IL-8, MIP1-a und IP-10 in beiden Patientengruppen. Zudem waren auch T-Zell- und NK-Zellspezifische Gene postoperativ geringer exprimiert. Die Gruppe von Patienten mit Sepsis im Verlauf zeigte am ersten postoperativen Tag eine signifikant geringere mRNA- Menge von TNFa, IL-1ÎČ, Perforin und CD3 im Vergleich zu den Kontrollpatienten. Basierend auf der Genexpression und einer logistischen Regression wurde ein klinisches Testverfahren entwickelt, welches Risikopatienten mit einer SpezifitĂ€t und SensitivitĂ€t von 85% identifizierte. Eine prospektive Validierung der erhobenen Daten vorausgesetzt, stellt das vorgestellte Verfahren eine aussichtsreiche Erweiterung des bisher bestehenden diagnostischen Spektrums dar.With an incidence of about 200/100 000 citizens per year is sepsis one of the most frequent diseases in Germany. Despite of progress in the treatment of sepsis, lethality still remains high. The development of sepsis is characterized by a dysbalance of pro- and antiinflammatory mechanisms due to invading microorganisms. Resulting from this dysregulation of the immune sytem, the host defense against pathogens often is impaired. Similar immunologic changes can be found not only after infection but after sterile traumata, burns or acute pancreatitis as well, leading to a increased susceptibility for infection in these diseases. Despite of a growing comprehension of the pathophysiologic processes, most attempts for immunomodulatory therapies have failed so far. An important cause is the lack of validated tools for monitoring of the immune function and guidance of possible therapies in the individual patient. With the objective of identification of patients at risk for sepsis, the perioperative expression of 24 immunologic relevant genes in whole blood samples was evaluated in the here presented retrospective study. 20 patients who developed sepsis after major surgery were compared to 20 matched control patients. Postoperatively, a significant lower expression was found in the mediators IL-8, MIP1-a and IP10 in both groups of patients. Additionally, T cell and NK cell related genes were declined postoperatively. The group of patients prone to sepsis showed a significantly reduced amount of mRNA of TNFa, IL-1ß, perforin and CD3 in comparison to control patients. Based upon the gene expression and a logistic regression, a diagnostic test was developed that identified high-risk patients with a specificity and sensitivity of 85%. Under the condition of a prospective validation of this data, the presented method provides a promising extension of existing diagnostic tools

    Gelfand numbers and metric entropy of convex hulls in Hilbert spaces

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    Isotriazene:  A Surprisingly Stable Minimum on the N 3

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