Staphylococcus aureus isolates colonizing and infecting cirrhotic and liver-transplantation patients: comparison of molecular typing and virulence factors

Abstract\ud \ud Background\ud \ud S. aureus is an important agent of colonization and infection in liver transplant patients. It harbors several virulence factors that can increase its pathogenicity. However, studies of virulence and molecular typing of MRSA in cirrhotic and liver transplantation patients are scarce.\ud \ud \ud Results\ud Here we use SCCmec, PFGE, spa typing, MLST and virulence factors to characterize MRSA isolates in pre and post liver transplantation patients. Sixteen (13 %) of 126 cirrhotic and 15 of the 64 liver-transplanted patients (23 %) were colonized by MRSA (p = 0.091). SCCmec types I, II and III that are generally associated with nosocomial infections were identified in 91 % of the isolates. None of the isolates carried PVL, adhesion factors and fib gene. Only three MRSA colonized isolates carried tst gene and were characterized as SCCmec type I and t149. Ten spa types and five STs were identified; t002 and ST105 were the most frequent profiles. Spa types and ST1510 never described in Brazil and a new spa type t14789 were identified. Nineteen PFGE subtypes were found and grouped into nine types. There was a predominant cluster, which was related to the New York/Japanese epidemic clone and harboured SCCmec type II identified in both cirrhotic and post-transplantation patients. Based on SCCmec and virulence factors the MRSA isolates belonged to NY/Jpn clone seen be more similar to the USA100 MRSA isolates.\ud \ud \ud Conclusions\ud Although without significance, liver-transplantation was more frequently colonized by MRSA than cirrhotic patients. The most frequent SCCmec was type II, and the predominant cluster was related to the New York/Japanese clone. A new spa t14789, and ST1510 never reported in Brazil were identified.The authors are grateful to financial support by FAPESP (Fundação de\ud Amparo à pesquisa do Estado de São Paulo) and CNPQ (Conselho Nacional\ud de Desenvolvimento Científico e Tecnológico)

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Para avaliar a sensibilidade da colistina e polimixina B de isolados de P. aeruginosa multirresistentes foram utilizadas diferentes metodologias, como microdiluição, Etest e disco-difusão, cujos resultados evidenciaram que a microdiluição continua sendo o método de referência. Do total de 109 isolados, não houve resistência para colistina e apenas um isolado mostrou-se resistente para a polimixina B. Para determinar a linhagem clonal destes isolados foi empregada a técnica de eletroforese em campo pulsado, a qual evidenciou a existência de um padrão molecular predominante durante o período de estudo e a presença de 7 grupos de isolados de P. aeruginosa multirresistentes em 2003

Molecular characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates obtained from colonized and infected patients with liver diseases and liver transplanted

MRSA é um importante agente de colonização e infecção em pacientes hepatopatas e transplantados de fígado. Este estudo tem como objetivo avaliar a clonalidade e a virulência de isolados MRSA de pacientes hepatopatas atendidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. De agosto de 2010 a janeiro de 2012, foram coletados swabs nasais e inguinais de 190 pacientes (126 pré-transplante e 64 de pós-transplante). Isolados de MRSA foram identificados fenotipicamente e foi realizada detecção de genes de virulência, caracterização do tipo de SCCmec, análise de polimorfismo genômico por PFGE e técnica de microarranjo. Além disso, determinou-se a CIM para dez antimicrobianos pelo método de microdiluição em caldo. MRSA foi detectado em 20% dos pacientes pelo método de cultura e em 82% por PCRs. Apenas três pacientes colonizados desenvolveram infecção após o transplante. Entre os 69 isolados de MRSA, 42,0% (29/69) apresentaram SCCmec tipo II, 20,3% (14/69) SCCmec tipo I, 20,3% (14/69) SCCmec tipo III, 13,0% (9/69) SCCmec tipo IVa, 2,9% (2/69) SCCmec tipo IV e 1,5% (1/69) SCCmec tipo V. O gene tst foi detectado em 5,8% (4/69) dos isolados MRSA e todos eles foram definidos como SCCmec tipo I. Outros genes identificados por PCR foram: lukD (89,9%; 62/69), lukE (89,9%; 62/69), clf (91,3%; 63/69) e fnbA (89,9%; 62/69). A análise por PFGE dos 69 isolados mostrou a presença de um clone predominante chamado cluster A em 36,2% (25/69) e este cluster apresentou 84,6% de similaridade com o clone NewYork/Japan (BK2464). O dendrograma demonstrou também a presença de um cluster relacionado com BEC (Clone Endêmico Brasileiro) HSJ216. Atualmente o tipo de SCCmec mais prevalente em nosso hospital é o tipo II. Neste estudo, observou-se a presença de isolados virulentos tanto em pacientes hepatopatas como em pacientes transplantados. Nossos resultados mostraram que o clone predominante (cluster A) apresentou diferentes genes de virulência (genes fnbA, clf e lukD-lukE) e foi resistente a pelo menos seis diferentes drogas, além de ser caracterizado como HA-MRSA SCCmec tipo II. Em conclusão, a técnica de microarranjo permite a genotipagem e detecção de genes estafilocócicos clinicamente relevantes, e pode, na maioria dos casos, ser utilizada como uma importante ferramenta para a triagem da virulência e resistência a antimicrobianos em isolados de MRSAMRSA is an important agent of colonization and infection in patients with liver disease and liver transplant. This study aims to evaluate clonality and virulence of MRSA isolates from liver diseases patients treated at Hospital of Clinics Faculty of Medicine from University of Sao Paulo. From August 2010 to January 2012, we collected nasal and groin swabs from 190 patients (126 pre-liver and 64 post-liver). MRSA isolates were identified phenotypically and the detection of virulence genes, characterization of SCCmec type, microarray and genomic polymorphism analysis by PFGE were done. In addition, it was determined the MIC for ten antibiotics by broth microdillution method. MRSA was detected in 20% patients by culture method and 82% by PCR. Only three patients colonized developed infection post-transplantation. Among the 69 MRSA isolates, 42.0% (29/69) had type II SCCmec, 20.3% (14/69) SCCmec type I, 20.3% (14/69) SCCmec type III, 13.0% (9/69) SCCmec type IVa, 2.9% (2/69) SCCmec type IV and 1.5% (1/69) SCCmec type V. The tst gene was detected in 5.8% (4/69) of MRSA isolates and all of them were defined as SCCmec type I. Other genes were identified by PCR: lukD (89.9%; 62/69), lukE (89.9%; 62/69), clf (91.3%; 63/69) and fnbA (89.9%; 62/69). The PFGE analysis of 69 isolates showed the presence of a predominant cluster named cluster A in 36.2% (25/69) and this cluster had 84.6% similarity with New York/Japan clone (BK2464). Dendrogram also demonstrated presence of one cluster related with BEC (Brazilian Endemic Clone) HSJ216. Currently the most prevalent SCCmec type in our hospital is type II. In this study, we observed virulent isolates in pre and post-transplantation patients. Our results showed that the predominant clone (cluster A) had different virulence genes (genes fnbA, clf and lukD-lukE) and was resistant to at least six different drugs, in addition to being characterized as HA-MRSA SCCmec type II. In conclusion, microarray profiling allows genotyping and detection of clinically relevant staphylococcal genes, and can, in most cases, be used as an important tool to screening virulence and antibiotic resistance genes in MRSA isolate

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Para avaliar a sensibilidade da colistina e polimixina B de isolados de P. aeruginosa multirresistentes foram utilizadas diferentes metodologias, como microdiluição, Etest e disco-difusão, cujos resultados evidenciaram que a microdiluição continua sendo o método de referência. Do total de 109 isolados, não houve resistência para colistina e apenas um isolado mostrou-se resistente para a polimixina B. Para determinar a linhagem clonal destes isolados foi empregada a técnica de eletroforese em campo pulsado, a qual evidenciou a existência de um padrão molecular predominante durante o período de estudo e a presença de 7 grupos de isolados de P. aeruginosa multirresistentes em 2003

Automação no laboratório de microbiologia

Não se aplic

Immunogenicity of a meningococcal serogroup C conjugate vaccine in HIV-infected children, adolescents, and young adults

Children and adolescents infected with HIV typically have a lower response to immunization than do those in the general population. In most developed countries, meningococcal serogroup C conjugate vaccine is one of the recommended vaccines for such individuals. However, there have been no studies evaluating the antibody response to this vaccine in HIV-infected children, adolescents or young adults. In this study, we evaluated that response using serum bactericidal antibody (SBA) and enzyme-linked immunosorbent assay, comparing HIV-infected with non-HIV-infected patients, as well as analysing the occurrence of side effects. In non-responders, we assessed the antibody response to revaccination. This clinical trial involved 92 patients between 10 and 20 years of age: 43 HIV-infected patients (HIV+ group) and 49 non-HIV-infected patients (HIV- group). After one dose of the vaccine, 72.1% of the HIV+ group patients and 100% of the HIV- group patients were considered protected. Of the HIV+ group patients who received a second dose of the vaccine, only 40% acquired protection. Overall, 81.4% of the HIV+ group patients acquired protection (after one or two doses of the vaccine). Side effects occurred in 16.3% and 44% of the HIV+ group and HIV- group patients, respectively. Therefore, the meningococcal serogroup C conjugate vaccine proved to be safe and effective for use in HIV-infected children, adolescents, and young adults, although their antibody response was weaker than that shown by non-HIV-infected patients. This indicates the need to discuss changes to the immunization schedule for children, adolescents, and young adults infected with HIV, in order to ensure more effective protection against meningococcal disease. (c) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.Brazilian Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico (CNPq, National Council for Scientific and Technological Development) [478687/2008-7]Brazilian Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico (CNPq, National Council for Scientific and Technological Development

Validity of Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) as a correlate of protection of meningococcal C conjugated vaccine in adolescents with HIV infection

The immunological response to meningococcal C conjugated vaccine can be evaluated by two different tests: the serum bactericidal antibody assay (SBA), which evaluates the qualitative bactericidal capacity of the antibodies, and the Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA), which quantifies the specific serogroup C meningococcal immunoglobulin-G. Incompatibilities between the results of both tests have been reported. Technically, ELISA is simpler, safer, and easier to reproduce when compared to the SBA; thus, an assessment of the validity of ELISA as a protective correlate compared to the SBA gold standard should be performed. This study tested the validity of ELISA for the evaluation of the protective response to the C meningococcal conjugate vaccine in adolescents with HIV compared with the gold standard SBA, to evaluate the reliability of ELISA to infer the protection of the individual.&nbsp;Blood samples of 92 individuals were analyzed (43 HIV+ and 49 HIV−). We observed a positive intraclass correlation coefficient between the ELISA and SBA responses for HIV+ after vaccination (ricc=0.97; 95% CI, 0.91 to 0.99), and for HIV− before vaccination (ricc=0.98; 95% CI, 0.95 to 0.99). In the HIV+ group, the sensitivity and specificity were both 100% for SBA, and 93.5% and 91.6%, respectively, for ELISA. The observed concordance between the tests suggests that in the HIV+ group the measures of antibodies by ELISA could be extrapolated to predict an individual’s protection, suggesting ELISA’s reliability. Until now, ELISA was unable substitute the gold standard SBA. Further studies are necessary to reproduce our findings.</p

DETERMINAÇÃO DE UROPATÓGENOS RESISTENTES À FOSFOMICINA ISOLADOS DE PACIENTES ATENDIDOS EM 34 UNIDADES BÁSICAS DE SAÚDE (UBS) E COMPARAÇÃO DOS MÉTODOS PARA DETECÇÃO DE RESISTÊNCIA À FOSFOMICINA

Introdução/Objetivos: As infecções do trato urinário (ITU) são infecções bacterianas comuns e o uso empírico de antimicrobianos na comunidade é crescente, principalmente da fosfomicina oral. Para determinar os principais uropatógenos, avaliamos os resultados de uroculturas de pacientes atendidos em UBS, a suscetibilidade à fosfomicina e aos carbapenêmicos e a frequência da prescrição de fosfomicina oral. Métodos: Os dados da cultura de urina foram obtidos do Programa Matrix Diagnosis durante janeiro a dezembro de 2021. A identificação foi realizada por sistema automatizado BD Phoenix e os antibiogramas interpretados de acordo com BrCAST. A detecção de carbapenemases foi confirmada por método imunocromatográfico RESIST-3 Coris BioConcept. O método de disco-difusão para fosfomicina foi comparado à diluição em ágar. Os dados epidemiológicos e clínicos foram avaliados usando EpiInfo. Resultados: Foram realizadas 56.949 uroculturas em 2021 em 34 UBS, localizadas na cidade de São Bernardo do Campo/SP. Resultados positivos foram detectados em 12,9% de 6.033 pacientes (87,3% mulheres; idade média 49,3; mediana 50). Entre 7.264 culturas positivas, 61,4% apresentaram crescimento de E. coli, 8,6% de K. pneumoniae e 8% de E. faecalis. Um total de 1,1% de isolados bacterianos resistentes à fosfomicina foi obtido de diferentes pacientes (75% mulheres; idade média 57,7). K. pneumoniae foi identificada em 38,75% e E. coli em 30%. 22,5% de Enterobacterales foram resistentes a pelo menos um carbapenêmico, sendo 10% produtores de carbapenemase KPC e 12,5% ESBL positivos. As CIMs da fosfomicina variaram de 0,25 a 256 ug/mL. Apenas 8,75% de erros graves foram encontrados no método de difusão em disco (nenhum erro muito grave). Durante o ano de 2021, foram prescritos 1.917 sachês de fosfomicina oral em dose única em todas as UBS (média de 161,5/mês). Sete isolados resistentes à fosfomicina foram detectados na UBS Alvarenga, onde foram dispensados 161 sachês. Entre 44 pacientes que responderam a um questionário, 68,2% relataram ITU recorrente e 50% usaram antimicrobianos nos últimos 6 meses. Apenas um paciente recebeu fosfomicina oral devido a ITU recorrente. Conclusões: E. coli ainda é o uropatógeno mais frequente e a resistência aos carbapenêmicos foi detectada nas UBS. A triagem para resistência à fosfomicina pode ser feita por difusão em disco, uma técnica boa e simples. A resistência à fosfomicina é incomum e ainda pode ser usada para tratamento de ITU em UBS brasileiras