HASAR : mining sequential association rules for atherosclerosis risk factor analysis

International audienceWe present the HASAR method that is an hybrid approach for ex- tracting adaptive sequential association rules. This method extracts association rules between events occurring in subsequent time-intervals using closed itemsets extraction and evolutionary techniques. An important feature is its capacity to consider different time-intervals depending on the attributes semantic. We applied this method for the analysis of long term medical observations of atherosclerosis risk factors for cardio-vascular diseases prevention. Experimental results show that it is well-suited for extracting knowledge from temporal data where interesting patterns have different observation period length.Nous présentons la méthode HASAR qui est une approche hybride pour l’extraction de règles d’assocations séquentilles. Cette méthode extrait des règles association entre des évènements ayant lieu à différent moment en extrayant des itemsets fermés fréquents et en utilisant des techniques évolutionnaires. Une fonctionnalité important de notre méthode est sa capacité à s’adapter à différente échelle de temps en fonction de la sémantique des attributs. Nous avons appliqué cette méthode pour analyser des observations médicales à long terme sur les facteurs de risques de l’artherosclerose. Les résultats expérimentaux ont montré que cette méthode est bien adaptée pour extraire des connaissance à partir de données temporelles ou les motifs intéressants doivent être observés sur différentes périodes de temps

Efficacy of Trastuzumab in Routine Clinical Practice and After Progression for Metastatic Breast Cancer Patients: The Observational Hermine Study

Results of the Hermine study examining the use of trastuzumab for metastatic breast cancer patients in routine practice, including patients who received trastuzumab treatment beyond progression, are reported. The cardiac safety of trastuzumab in this setting is also reported

Convergent genetic and expression data implicate immunity in Alzheimer's disease

Background Late–onset Alzheimer's disease (AD) is heritable with 20 genes showing genome wide association in the International Genomics of Alzheimer's Project (IGAP). To identify the biology underlying the disease we extended these genetic data in a pathway analysis. Methods The ALIGATOR and GSEA algorithms were used in the IGAP data to identify associated functional pathways and correlated gene expression networks in human brain. Results ALIGATOR identified an excess of curated biological pathways showing enrichment of association. Enriched areas of biology included the immune response (p = 3.27×10-12 after multiple testing correction for pathways), regulation of endocytosis (p = 1.31×10-11), cholesterol transport (p = 2.96 × 10-9) and proteasome-ubiquitin activity (p = 1.34×10-6). Correlated gene expression analysis identified four significant network modules, all related to the immune response (corrected p 0.002 – 0.05). Conclusions The immune response, regulation of endocytosis, cholesterol transport and protein ubiquitination represent prime targets for AD therapeutics

Extraction et usages de motifs minimaux en fouille de données, contribution au domaine des hypergraphes

CAEN-BU Sciences et STAPS (141182103) / SudocSudocFranceF

Effect of intensity of gravitational stimulus artificially induced on growth and formation of tension wood in young shoots of poplar (P. euramericana cv. Ghoy).

La formation d'un tissu de bois de tension est induite artificiellement au moyen d’un stimulus gravitationnel obtenu en inclinant de jeunes pousses de l’année de Peuplier euraméricain cv ‘Ghoy’ à diverses intensités de 0 à 30° durant la saison de végétation. Au terme de l’expérimentation, il s’avère que l’allongement des pousses ainsi que l’angle de l’arc de bois de tension, ne sont pas affectés par l’intensité du stimulus. Au contraire, le redressement de l’axe, la quantité de fibres gélatineuses, la croissance secondaire sur écorce, la surface de la section et du xylème secondaire, les différents rayons caractéristiques, les diamètres sous écorce et l’excentricité de la moelle, répondent quantitativement à l’inclinaison. La quantité de bois de tension est corrélée au redressement, à la croissance secondaire sur écorce et à la croissance radiale sous écorce. Par ailleurs, la formation du bois de tension et l’excentricité réagissent au stimulus gravitationnel, sans pour autant être liés entre eux par une relation de cause à effet. Enfin, il existe une position naturelle d’équilibre des tiges, différente de la verticale, vers laquelle les pousses qui ont été déplacées, tentent de revenir en formant un tissu de bois de tension.The formation of tension wood tissue is artificially induced by means of a gravitational stimulus obtained by inclining young shoots of poplar at different intensities, from 0 to 30°, during a growing season. At the end of the experiment, it appears that shoot elongation as well as the angle of tension wood arc are not affected by the stimulus intensity. In contrast, the upright reorientation of the axis, the amount of gelatinous fibres, the secondary growth over bark, the cross-section area of the stem and of the secondary xylem, the different rays, the diameter under bark and the pith eccentricity, react quantitatively to the lean intensity. The amount of tension wood is correlated with the upright reorientation, the secondary growth over bark and the radial growth under bark. Tension wood formation and eccentricity react to the gravitational stimulus but they are not causally linked. Finally, it exists a natural equilibrium position, different from the vertical, to which moved shoots try to return via the formation of a tension wood tissue

Effet de l'intensité d'un stimulus gravitationnel induit artificiellement sur la croissance et la formation du bois de tension dans de jeunes pousses de peuplier (Populus euramericana cv 'Ghoy')

La formation d'un tissu de bois de tension est induite artificiellement au moyen d’un stimulus gravitationnel obtenu en inclinant de jeunes pousses de l’année de Peuplier euraméricain cv ‘Ghoy’ à diverses intensités de 0 à 30° durant la saison de végétation. Au terme de l’expérimentation, il s’avère que l’allongement des pousses ainsi que l’angle de l’arc de bois de tension, ne sont pas affectés par l’intensité du stimulus. Au contraire, le redressement de l’axe, la quantité de fibres gélatineuses, la croissance secondaire sur écorce, la surface de la section et du xylème secondaire, les différents rayons caractéristiques, les diamètres sous écorce et l’excentricité de la moelle, répondent quantitativement à l’inclinaison. La quantité de bois de tension est corrélée au redressement, à la croissance secondaire sur écorce et à la croissance radiale sous écorce. Par ailleurs, la formation du bois de tension et l’excentricité réagissent au stimulus gravitationnel, sans pour autant être liés entre eux par une relation de cause à effet. Enfin, il existe une position naturelle d’équili

Radial variation of cellulose microfibrils angle and tracheids length in Douglas fir

Le Douglas (Pseudotsuga menziesii) connaît depuis quelques décennies un essor important en Wallonie, du fait entre autre de son potentiel de croissance supérieur à celui de l’Epicéa. Néanmoins, la sylviculture appliquée à cette essence est généralement calquée sur celle de l’Epicéa, ce qui ne permet pas nécessairement de profiter pleinement du potentiel de l’espèce. Aussi, pour guider l’action des sylviculteurs, une étude visant à évaluer l’impact de la vitesse de croissance sur les propriétés du bois de Douglas a été initiée. Il est admis aujourd’hui que l’angle des microfibrilles de cellulose (AMF) de la paroi des trachéides, ainsi que la longueur des trachéides, en complément de caractéristiques telles que la masse volumique, la largeur des cernes ou la texture, pourraient permettre d’expliquer plus finement le comportement mécanique du bois sans défaut. Afin de tenter de le démontrer, dans un premier temps, l’étude a porté sur les variations de l’AMF et de la longueur des trachéides au sein des arbres en fonction de différents paramètres : la largeur des cernes, l’âge du cerne, la position radiale et la hauteur dans l’arbre. Par la suite, ces résultats seront utilisés pour identifier les relations entre les propriétés mécaniques du bois et ses caractéristiques anatomiques. L’objectif final est de relier les caractéristiques de croissance avec les propriétés du bois produit et d’en déduire des recommandations sylvicoles.Etude des relations sylviculture - qualité du bois de dougla

HASAR : mining sequential association rules for atherosclerosis risk factor analysis

International audienceWe present the HASAR method that is an hybrid approach for ex- tracting adaptive sequential association rules. This method extracts association rules between events occurring in subsequent time-intervals using closed itemsets extraction and evolutionary techniques. An important feature is its capacity to consider different time-intervals depending on the attributes semantic. We applied this method for the analysis of long term medical observations of atherosclerosis risk factors for cardio-vascular diseases prevention. Experimental results show that it is well-suited for extracting knowledge from temporal data where interesting patterns have different observation period length.Nous présentons la méthode HASAR qui est une approche hybride pour lextraction de règles dassocations séquentilles. Cette méthode extrait des règles association entre des évènements ayant lieu à différent moment en extrayant des itemsets fermés fréquents et en utilisant des techniques évolutionnaires. Une fonctionnalité important de notre méthode est sa capacité à sadapter à différente échelle de temps en fonction de la sémantique des attributs. Nous avons appliqué cette méthode pour analyser des observations médicales à long terme sur les facteurs de risques de lartherosclerose. Les résultats expérimentaux ont montré que cette méthode est bien adaptée pour extraire des connaissance à partir de données temporelles ou les motifs intéressants doivent être observés sur différentes périodes de temps

HASAR : mining sequential association rules for atherosclerosis risk factor analysis

International audienceWe present the HASAR method that is an hybrid approach for ex- tracting adaptive sequential association rules. This method extracts association rules between events occurring in subsequent time-intervals using closed itemsets extraction and evolutionary techniques. An important feature is its capacity to consider different time-intervals depending on the attributes semantic. We applied this method for the analysis of long term medical observations of atherosclerosis risk factors for cardio-vascular diseases prevention. Experimental results show that it is well-suited for extracting knowledge from temporal data where interesting patterns have different observation period length.Nous présentons la méthode HASAR qui est une approche hybride pour lextraction de règles dassocations séquentilles. Cette méthode extrait des règles association entre des évènements ayant lieu à différent moment en extrayant des itemsets fermés fréquents et en utilisant des techniques évolutionnaires. Une fonctionnalité important de notre méthode est sa capacité à sadapter à différente échelle de temps en fonction de la sémantique des attributs. Nous avons appliqué cette méthode pour analyser des observations médicales à long terme sur les facteurs de risques de lartherosclerose. Les résultats expérimentaux ont montré que cette méthode est bien adaptée pour extraire des connaissance à partir de données temporelles ou les motifs intéressants doivent être observés sur différentes périodes de temps

Variation radiale de l’angle des microfibrilles de cellulose et de la longueur des trachéides chez le Douglas

La sylviculture du douglas (Pseudotsuga menziesii) en Wallonie est récente et présente des modalités opératoires très contrastées. Aussi, pour guider l’action des sylviculteurs, une étude technologique visant à évaluer l’impact du dynamisme de la sylviculture sur les propriétés du bois de douglas a été initiée. Il est accepté aujourd’hui que l’angle des microfibrilles de cellulose (AMF) de la paroi des trachéides, ainsi que la longueur des trachéides, peuvent expliquer largement le comportement du bois sans défaut. Dans un premier temps, l’étude a porté sur les variations de l’AMF et de la longueur des trachéides au sein des arbres en fonction de paramètres tels que leur vitesse de croissance, l’âge du cerne, la position radiale ou la hauteur dans l’arbre. Ultérieurement, ces résultats seront utilisés pour tenter d’expliquer les propriétés mécaniques du bois sur la base de ses caractéristiques anatomiques. Il sera alors possible de relier les caractéristiques de croissance avec les propriétés du bois produit afin de proposer les pratiques sylvicoles les plus pertinentes.ETUDE DES RELATIONS SYLVICULTURE-QUALITE DU BOIS DE DOUGLA