Resistance response of drought and heat tolerant spring wheat lines against the cereal cyst nematode, heterodera filipjevi

Spot blotch caused by Bipolaris sorokiniana is a destructive disease of wheat worldwide. This study investigated the aggressiveness of B. sorokiniana isolates from different wheat-growing areas of Bolu province in Turkey on the cultivar Seri-82. Host susceptibility of 55 wheat cultivars was evaluated against the most aggressive isolate. Our results indicated that the cultivars Anafarta and Koç-2015 were the most resistant. A specific and sensitive qPCR assay was developed for detecting the pathogen in plant tissues and evaluating wheat plants with different resistance levels. Three primer sets, BsGAPDHF/BsGAPDHR, BsITSF/BsITSR, and BsSSUF/BsSSUR, were designed based on glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, internal transcribed spacers, and 18S rRNA loci of B. sorokiniana with detection limits of 1, 0.1, and 0.1 pg of pathogen DNA, respectively. The qPCR assay was highly sensitive and did not amplify DNA from the other closely related fungal species and host plants. The protocol differentiated wheat plants with varying degrees of resistance. The assay developed a useful tool for the quantification of the pathogen in the early stages of infection and may provide a significant contribution to a more efficient selection of wheat genotypes in breeding studies. In the present study, expression levels of PR proteins, phenylalanine ammonia-lyase, catalase, ascorbate peroxidase, and superoxide dismutase enzymes were upregulated in Anafarta (resistant) and Nenehatun (susceptible) cultivars at different post-infection time points, but more induced in the susceptible cultivar. The results showed considerable variation in the expression levels and timing of defense genes in both cultivars

Bazı yazlık buğday çeşitlerinin pratylenchus thornei sher et allen (tylenchida : pratylenchidae)'ye karşı dayanıklılığının araştırılması

TEZ6688Tez (Doktora) -- Çukurova Üniversitesi, Adana, 2008.Kaynakça (s.93-100) var.xii, 117 s. : rnk.res. ; 29 cm.In this study the yield loss of root lesion nematode (Pratylenchus thornei Sher et Allen) was investigated under natural field conditions in Adana. Under controlled laboratory conditions a P. thornei resistance assay for wheat was optimized, and 181 spring wheat varieties/lines were screened. The genetic control and location of two known different resistant sources (AUS4930 7.2 and the synthetic hexaploid wheat line, CROCBu çalışmada Kök yara nematodu (Pratylenchus thornei Sher et Allen)'nun tarla koşullarında oluşturduğu verim kaybı, 181 yazlık buğday çeşit ve hattının dayanıklılığı ile dayanıklılık denemelerinde kullanılacak en uygun çalışma metodları araştırılmıştır. Ayrıca iki farklı dayanıklılık kaynağı AUS 4930 7.2 ve sentetik hexaploid buğday çeşidi olan CROCBu çalışma Ç.Ü. Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi Tarafından Desteklenmiştir. Proje No:ZF2004D2

Determination of citrus nematode (Tylenchulus semipenetrans Cobb.) biotypes in East Mediterranean Region of Turkey

Bu çalışmada 2003-2004 yıllarında Doğu Akdeniz bölgesinde turunçgil yetiştirilen alanlardan toplanan onbeş turunçgil nematodu popülasyonunun üreme potansiyelleri üç farklı konukçuda (zeytin, turunç ve üçyapraklı) sera koşullarında değerlendirilerek ırkları belirlenmiştir. Bitki başına 5000 larva/ bitki verilerek nematod inokulasyonu gerçekleştirilmiş, 6 ay süre ile nematodların gelişmesi sağlanmıştır. Bu süre sonunda toprak ve köklerde gelişen Turunçgil nematodu popülasyonuna göre ırklar belirlenmiştir. Bu popülasyonlardan, Osmaniye, Dörtyol ve islahiye yörelerinden alınan popülasyonlar Citrus ırkı, diğer illerden alınan popülasyonlar ise Akdeniz ırkı olarak belirlenmiştir. Değerlendirmeye alınan popülasyonların hiçbirinde Poncirus ırkı belirlenememiştir.In this study, the reproductive potentials of fifteen citrus nematode {Tylenchulus semipenetrans Cobb) population, collected from East Mediterranean Region of Turkey,were compared on three different hosts (olive, sour orange and poncirus) between 2003-2004. 5000 juvenile/plant were inoculated in order to determine citrus nematode biotype in 6 months. Roots and soil nematode numbers were evaulated after inoculation. Osmaniye,Dörtyol and islahiye populations were identified as the citrus biotype. Twelve population were identified as the Mediterranean biotype. In this study Poncirus biotype of Citrus nematode was not found

Plant Parasitic and Virus Vector Nematodes Associated with Vineyards in the Central Anatolia Region of Turkey

WOS: 000338176400035Grapevines is host for many plant parasitic nematode species and virus transmission species. Surveys were undertaken in 15 vineyards in Turkey. Samples were taken from each vineyard older than 10 years, from depth of 0-30 cm and 30-60 cm. Totally 300 subsamples were examined. In this study, 22 species were identified belonging to 16 genus within Tylenchida, Aphelenchida, Dorylaimida and Triplonchida orders from soil and root samples of vine (Vitis vinifera L.) in the Central Anatolia Region (Nevsehir, Karaman, Konya, Isparta and Burdur provinces). Malenchus fusiformis, Aphelenchoides clarus, A. confusus, Rotylenchus (R.) colbrani, Xiphinema diversicaudatum and Trichodorus similis were found for the first time in Turkey. The species most frequently encountered were X pachtaicum and Helicotylenchus crenacauda.General Directorate of Agricultural Research and Policies (GDAR), Food, Agriculture and Livestock Ministry [TAGEM/BS/96/06/09/502]This study is part of a research project "The vineyards of Central Anatolia Region Integrated Pest Management Research, Practice and Training Project" TAGEM/BS/96/06/09/502, supported by the General Directorate of Agricultural Research and Policies (GDAR), Food, Agriculture and Livestock Ministry

Biber seralarında kök-ur nematodlarına karşı farklı sulama sistemleri ile alternatif mücadele yöntemlerinin belirlenmesi

Kök-ur nematodları geniş bir konukçu dizisine sahip olup önemli kültür bitkilerinde ağır verim kayıplarına neden olmaktadır. Türkiye’de nematodlar ile mücadelede nematisit kullanımına önemli kısıtlamalar getirilmekte bunun yanında mücadelede yeni metotlar ortaya konması gerekmektedir. Bu yüzden biber seralarında Kök-ur nematodları ile mücadelede alternatif mücadele programlarının geliştirilmesi büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada toprak solarizasyonu ile birlikte iki farklı kimyasal ve toprak fumigantının iki ve dört hat şeklinde damla sulama sistemi ile kombine edilerek nematodlarla ile mücadele programlarında kullanılabilirliği araştırılmıştır. Çalışmada solarizasyon + metam sodyum + iprodione uygulaması, dört lateral hatlı damla sulama sisteminde verime ve nematodun kökteki urlanması üzerine etkili bulunmuştur. Bitki boyu ve nematodun üreme gücüne solarizasyon + iprodione uygulamasının dört lateral hatlı damla sulama sisteminde en yüksek etkiye sahip olduğu saptanmıştır.Root-knot nematodes possess a wide group of hosts and cause significant yield losses in many economically important plant species. Restrictions on the use of nematicides in Turkey have increased; hence it is needed to discover new control methods for managing Root-knot nematodes. Therefore, establishing alternative control programme to comba

Evaluation of Turkish wild Emmers (Triticum dicoccoides Koern.) and wheat varieties for resistance to the root lesion nematodes (Pratylenchus thornei and Pratylenchus neglectus)

WOS: 000369882800001Root-lesion nematodes (RLN; Pratylenchus thornei and Pratylenchus neglectus) are serious plant parasitic nematodes that attack wheat roots and cause significant losses in grain quality and quantity worldwide. They are widely distributed in Turkish wheat growing areas and can be only controlled by growing resistant cultivars and non host crops. So far, there is no commercial wheat cultivar identified as completely resistant to the RLN is available. The objective of this research was to evaluate some Turkish wild Emmers (Triticum dicoccoides) and national spring wheat varieties for resistant to P. thornei and P. neglectus. In the experiments, 32 wild Emmers and 42 wheat cultivars were inoculated with P. thornei or P. neglectus individuals and grown under controlled conditions in a growth room for 9 weeks. The results showed that 25 and 35 wheat varieties were moderately resistant to P. thornei and P. neglectus, respectively. In total, 17 lines exhibiting multiple resistance reactions to both nematodes were in the same group with the check lines (P<0.05). The identified resistant wheat accessions showed improved levels of RLN resistance over current parents and could serve as an excellent genetic pool to be used in an efficient Turkish wheat breeding programme.Tubitak Project [112 O 565]This publication was supported by Tubitak Project number 112 O 565. The authors thank Prof. Dr. Hakan Ozkan (University of Cukurova) for selecting and supplying the Emmer wheats and Turkish varieties used in the study

Effect of temperatures on incubation duration of Heterodera avenae Wollenweber (Tylenchida: Heteroderidae) cysts and optimization of some materials and methods

Bu çalışmada, Tahıl kist nematodu, Heterodera avenae’nin Wollenweber yumurtalarının inkübasyonu üzerine sıcaklığın etkisi ile in-vitro koşullarda en uygun deneme test materyallerinin (toprak tipi, inokülasyon oranı ve inokülasyon zamanı) belirlenmesi araştırılmıştır. Sıcaklılığın H. avenae yumurtalarının inkübasyonu üzerine etkisinin araştırıldığı çalışma iki farklı inkübasyon süresinde gerçekleştirilmiş olup, birinci aşamada 4 ºC‘de 66 gün inkübe edilen kistler ikinci aşamada farklı sıcaklıklara (5, 10, 15, 20 and 25 ºC) transfer edilmiştir. Çalışma sonucunda her bir sıcaklık için toplam yüzde larva çıkış oranı hesaplanmış ve 252 günlük inkübasyon süresinde sıcaklığın larva çıkış oranını önemli derece etkilediği görülmüştür. Düşük sıcaklıklardaki (5,15 ve 10 ºC) larva çıkış oranı %46.7, %82.3. ve %45.9 ile yüksek sıcaklıklardaki (20 ve 25 ºC) larva çıkış oranına %30.7 ve %19.0 göre daha yüksek bulunmuştur. En yüksek larva çıkış oranı %82.3 ile 10 ºC’de, en düşük larva çıkış oranı %19.0 ile 25 ºC’de gerçekleşmiştir. İn-vitro koşullarda H.avenae ile yürütülecek denemelerde, yetiştirme ortamı olarak kumlu toprak tipinin (% 29 tarla toprağı, % 70 kum: % 1: organik madde) tercih edilmesi, nematodun bitkiye inokülasyonunun dikimin 1. gününde, inokülasyon yoğunluğunun ise 2,5 adet ikinci dönem larva/gram toprak olacak şekilde yapılması önerilmektedir.In this study, the effect of temperatures on the incubation duration of the cereal cyst nematode cysts, Heterodera avenae Wollenweber and determining of the optimum methods and materials was investigated under invitro conditions. The effect of tempratures on incubation duration of Heterodera avenae cysts was studied on two different incubation stages. First incubation exposured to all cysts was set up 66 days at 4ºC after each samples transfered different temperatures (5, 10, 15, 20 and 25ºC). The cumulative hatching percent was significantly effected by different temperatures at the end of 252 days. Hatching was greater at lower temperatures (5, 10 15 ºC) compared to at higher temperatures of (20, 25ºC) ranging between 46.7, 82.3 and 45.9 % vs and 30.7 and 19.0%, respectively. Although the highest cumulative hatching of 82.3% was obtained at a constant 10ºC at 252 days, the lowest cumulative hatching of 19.0% was obtained to 25ºC at 252 days. The most suitable soil type for the in-vitro conditions was found the sandy soil (70 % sand: 29% field soil: 1% organic matter), best inoculation rate was 2,5 second stage juveniles per gram soil and inoculation time at planting day

Tahıl kist nematodu, Heterodera avenae’nın Doğu Akdeniz Bölgesi patotipinin belirlenmesi

Doğu Akdeniz Bölgesi'nde Tahıl kist nematodu, Heterodera avenae patotiplerinin belirlenmesi amacıyla Karlik (Adana-Sarıcam), İmece (Hatay-Kırıkhan) ve Besaslan (Hatay-Reyhanlı) popülasyonları kullanılmıştır. H. avenae’nin patotipleri “Uluslararası konukçu tahıl test ayırım materyalleri” kullanılarak araştırılmıştır. Bu materyaller içerisinde bulunan, yirmi adet arpa, altı adet yulaf ve altı adet buğday çeşit ve hatları ile dört kontrol hattı (milan, seri, silverstar ve croc) denemeye alınmıştır. Test materyalleri içerisinde dayanıklılık genleri (Rha”E”, Rha1, Rha2, Rha3, Cre1) taşıyan ve dayanıklı geni taşımayan çeşit ve hatlara karşı, denemeye alınan 3 popülasyonun gösterdiği reaksiyon esas alınarak gruplandırılmıştır. Çalışma sonuçlarına göre, Rha1 ve Rha3 genleri taşıyan materyaller dayanıklılık göstermesine karşın, Rha2 ve Cre1 genleri taşıyanlar aynı tepkiyi göstermemiştir. Sonuç olarak konukçu test ayrım hatları genellikle benzer reaksiyonlar göstermiş ve denemeye alınan 3 popülasyonun da aynı patotip, Ha1 grubundan Ha21 olduğu saptanmıştır. Bu sonuçlar Türkiye’de H. avanea patotipinin belirlenmesi açısından ilk kayıt niteliğindedir.Karlik (Adana-Sarıcam), Imece (Hatay-Kırıkhan) and Besaslan (Hatay-Reyhanlı) populations were used to determine the pathotype of the cereal cyst nematode, Heterodera avenae, in the Eastern Mediterranean Region of Turkey. The pathotypes of H. avenae were investigated by using &amp;#8220;The International Test Assortment of Cereal Cultivars&amp;#8221;. The test was conducted on twelve barley, six oat, six wheat and four control lines (milan, seri, silverstar and croc). Test materials were grouped by three the nematode populations&amp;#8217; virulence on resistance (Rha&amp;#8221;E&amp;#8221;, Rha1, Rha2, Rha3, Cre1) and nonresistance genes, varieties and lines. According to results, Rha1 and Rha3 genes gave a resistance response but Rha2 and Cre1 did not. As a result, all populations demonstrated similar reactions and the three nematode populations were consistent with reactions for the Ha21 pathotype of the Ha1 group. This result is the first report on determination of the H. avenae pathotype in Turkey

Türkiye'de bulunan yabani Emmer buğdayları (Triticum dicoccoides Koern.) ve buğday çeşitlerinin Kök lezyon nematodları (Pratylenchus thornei and P. neglectus)'na karşı dayanıklılıklarının belirlenmesi

Kök lezyon nematodları (RLN; Pratylenchus thornei ve P. neglectus) buğday köklerine saldırarak, tahıl kalitesi ve miktarında küresel olarak önemli kayıplara neden olan önemli bir bitki paraziti nematod gurubudur. Türkiye'de buğday ekiliş alanlarında yaygın olarak bulunan bu nematodlarla ancak dayanıklı çeşitler ve rotasyonla mücadele etmek mümkündür. Maalesef bugüne kadar bu nematod gurubuna karşı tamamen dayanıklı olarak tanımlanan hiçbir ticari buğday çeşidi bulunamamıştır. Bu nedenle, buğday ıslah programlarında yüksek verimli ve kaliteli buğday çeşitlerine orta derecede (kısmi) dayanıklı ebeveynler kullanılarak dayanıklılık entegre edilmeye çalışılmıştır. Bu araştırmanın amacı bazı Türk yabani Emmer'lerinin (Triticum dicoccoides) ve bazı ulusal yazlık buğday çeşitlerinin P. thornei ve P. neglectus'a karşı dayanıklılık durumlarını ortaya koymaktır. Bu amaçla her iki nematoda karşı yapılan iki farklı denemede, 32 yabani Emmer buğdayı ve 42 buğday çeşidinin, P. thornei veya P. neglectus bireylerine karşı dayanıklıkları 9 hafta boyunca kontrollü koşullar altında testlenmiştir. Sonuç olarak, P. thornei ve P. neglectus'a karşı sırasıyla 25 ve 35 buğday çeşidinin orta derecede dayanıklılık reaksiyonu sağladığı belirlenmiştir. Toplamda 17 çeşit her iki nematoda karşı dayanıklılık göstermiştir (p <0.05). Elde edilen verilere göre, tespit edilen dayanıklı buğday çeşitlerinin mevcut hatlardan daha dayanıklı olduğu belirlenmiş ve bu hatların Türkiye'deki ıslah programlarında mükemmel bir şekilde kullanılabileceği ortaya konmuştur.Root-lesion nematodes (RLN; Pratylenchus thornei and Pratylenchus neglectus) are serious plant parasitic nematodes that attack wheat roots and cause significant losses in grain quality and quantity worldwide. They are widely distributed in Turkish wheat growing areas and can be only controlled by growing resistant cultivars and nonhost crops. So far, there is no commercial wheat cultivar identified as completely resistant to the RLN is available. The objective of this research was to evaluate some Turkish wild Emmers (Triticum dicoccoides) and national spring wheat varieties for resistant to P. thornei and P. neglectus. In the experiments, 32 wild Emmers and 42 wheat cultivars were inoculated with P. thornei or P. neglectus individuals and grown under controlled conditions in a growth room for 9 weeks. The results showed that 25 and 35 wheat varieties were moderately resistant to P. thornei and P. neglectus, respectively. In total, 17 lines exhibiting multiple resistance reactions to both nematodes were in the same group with the check lines (P&lt;0.05). The identified resistant wheat accessions showed improved levels of RLN resistance over current parents and could serve as an excellent genetic pool to be used in an efficient Turkish wheatbreeding programme

Effect of temperatures on incubation duration of Heterodera avenae Wollenweber (Tylenchida: Heteroderidae) cysts and optimization of some materials and methods

WOS: 000317956400014In this study, the effect of temperatures on the incubation duration of the cereal cyst nematode cysts, Heterodera avenae Wollenweber and determining of the optimum methods and materials was investigated under in-vitro conditions. The effect of tempratures on incubation duration of Heterodera avenae cysts was studied on two different incubation stages. First incubation exposured to all cysts was set up 66 days at 4 degrees C after each samples transfered different temperatures (5, 10, 15, 20 and 25 degrees C). The cumulative hatching percent was significantly effected by different temperatures at the end of 252 days. Hatching was greater at lower temperatures (5, 10 15 degrees C) compared to at higher temperatures of (20, 25 degrees C) ranging between 46.7, 82.3 and 45.9% vs and 30.7 and 19.0%, respectively. Although the highest cumulative hatching of 82.3% was obtained at a constant 10 degrees C at 252 days, the lowest cumulative hatching of 19.0% was obtained to 25 degrees C at 252 days. The most suitable soil type for the in-vitro conditions was found the sandy soil (70% sand: 29% field soil: 1% organic matter), best inoculation rate was 2,5 second stage juveniles per gram soil and inoculation time at planting day