Integrated mutation, copy number and expression profiling in resectable non-small cell lung cancer

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The aim of this study was to identify critical genes involved in non-small cell lung cancer (NSCLC) pathogenesis that may lead to a more complete understanding of this disease and identify novel molecular targets for use in the development of more effective therapies.</p> <p>Methods</p> <p>Both transcriptional and genomic profiling were performed on 69 resected NSCLC specimens and results correlated with mutational analyses and clinical data to identify genetic alterations associated with groups of interest.</p> <p>Results</p> <p>Combined analyses identified specific patterns of genetic alteration associated with adenocarcinoma vs. squamous differentiation; <it>KRAS </it>mutation; <it>TP53 </it>mutation, metastatic potential and disease recurrence and survival. Amplification of 3q was associated with mutations in <it>TP53 </it>in adenocarcinoma. A prognostic signature for disease recurrence, reflecting <it>KRAS </it>pathway activation, was validated in an independent test set.</p> <p>Conclusions</p> <p>These results may provide the first steps in identifying new predictive biomarkers and targets for novel therapies, thus improving outcomes for patients with this deadly disease.</p

Förbättra produkt - tjänsteutvecklingsprocesser i traditionella tillverkningsföretag : En fallstudie av ett svenskt tillverkningsföretag

Manufacturing companies have begun developing Product Service Systems to provide customers with enhanced product-service offerings. Transitioning to a service-oriented development process allows companies to restructure risks, responsibilities, and costs normally associated with owning products. They potentially allow companies to sell products through different channels and offer additional elements of differentiation to their competitors. However, PSS comes with a lot of challenges that manufacturing companies have struggled to overcome. Some of these challenges include switching away from traditional hardware-focused mindset and the service manufacturing paradox. This thesis focused on challenges regarding integrating services within product development processes. A Swedish manufacturing company was considered as the primary case study for investigation. 14 people from different functions were interviewed. The investigation revealed 17 challenges categorized into five main themes. These themes were lack of clear company messaging regarding services, immature service development process, sub-optimal division of tasks and responsibilities, resources issues, and lack of integration in processes. Additionally, three external companies were interviewed to investigate their service maturity level and how they were able to overcome common challenges in service integration. Based on the insights gained from both internal and external interviews three solutions were created. These solutions are new roles and updated responsibilities, a new integrated service process, and a Product-Service Readiness Level chart. Future considerations for the investigated company were also submitted to provide a guide for further development of these solutions.Tillverkningsföretag har börjat utveckla produktservicesystem för att ge kunderna förbättrade produkttjänster. Övergången till en tjänsteorienterad utvecklingsprocess tillåter företag att omstrukturera risker, ansvar och kostnader som normalt är förknippade med att äga produkter. De tillåter potentiellt företag att sälja produkter genom olika kanaler och erbjuder ytterligare inslag av differentiering till sina konkurrenter. Men PSS kommer med många utmaningar som tillverkande företag har kämpat för att övervinna. Några av dessa utmaningar inkluderar att byta bort från traditionella hårdvarufokuserade tänkesätt och tjänstetillverkningsparadoxen. Detta examensarbete fokuserade på utmaningar när det gäller att integrera tjänster i produktutvecklingsprocesser. Ett svenskt tillverkningsföretag ansågs vara den primära fallstudien för utredning. 14 personer från olika funktioner intervjuades. Undersökningen avslöjade 17 utmaningar kategoriserade i fem huvudteman. Dessa teman var brist på tydliga företagsmeddelanden om tjänster, omogen tjänsteutvecklingsprocess, suboptimal fördelning av uppgifter och ansvar, resursfrågor och bristande integration i processer. Dessutom intervjuades tre externa företag för att undersöka deras mognadsnivå för tjänster och hur de kunde övervinna vanliga utmaningar inom tjänsteintegration. Baserat på insikterna från både interna och externa intervjuer skapades tre lösningar. Dessa lösningar är nya roller och uppdaterade ansvarsområden, en ny integrerad serviceprocess och ett diagram för produkt-tjänstberedskapsnivå. Framtida överväganden för det undersökta företaget lämnades också in för att ge vägledning för vidareutveckling av dessa lösningar

Förbättra produkt - tjänsteutvecklingsprocesser i traditionella tillverkningsföretag : En fallstudie av ett svenskt tillverkningsföretag

Manufacturing companies have begun developing Product Service Systems to provide customers with enhanced product-service offerings. Transitioning to a service-oriented development process allows companies to restructure risks, responsibilities, and costs normally associated with owning products. They potentially allow companies to sell products through different channels and offer additional elements of differentiation to their competitors. However, PSS comes with a lot of challenges that manufacturing companies have struggled to overcome. Some of these challenges include switching away from traditional hardware-focused mindset and the service manufacturing paradox. This thesis focused on challenges regarding integrating services within product development processes. A Swedish manufacturing company was considered as the primary case study for investigation. 14 people from different functions were interviewed. The investigation revealed 17 challenges categorized into five main themes. These themes were lack of clear company messaging regarding services, immature service development process, sub-optimal division of tasks and responsibilities, resources issues, and lack of integration in processes. Additionally, three external companies were interviewed to investigate their service maturity level and how they were able to overcome common challenges in service integration. Based on the insights gained from both internal and external interviews three solutions were created. These solutions are new roles and updated responsibilities, a new integrated service process, and a Product-Service Readiness Level chart. Future considerations for the investigated company were also submitted to provide a guide for further development of these solutions.Tillverkningsföretag har börjat utveckla produktservicesystem för att ge kunderna förbättrade produkttjänster. Övergången till en tjänsteorienterad utvecklingsprocess tillåter företag att omstrukturera risker, ansvar och kostnader som normalt är förknippade med att äga produkter. De tillåter potentiellt företag att sälja produkter genom olika kanaler och erbjuder ytterligare inslag av differentiering till sina konkurrenter. Men PSS kommer med många utmaningar som tillverkande företag har kämpat för att övervinna. Några av dessa utmaningar inkluderar att byta bort från traditionella hårdvarufokuserade tänkesätt och tjänstetillverkningsparadoxen. Detta examensarbete fokuserade på utmaningar när det gäller att integrera tjänster i produktutvecklingsprocesser. Ett svenskt tillverkningsföretag ansågs vara den primära fallstudien för utredning. 14 personer från olika funktioner intervjuades. Undersökningen avslöjade 17 utmaningar kategoriserade i fem huvudteman. Dessa teman var brist på tydliga företagsmeddelanden om tjänster, omogen tjänsteutvecklingsprocess, suboptimal fördelning av uppgifter och ansvar, resursfrågor och bristande integration i processer. Dessutom intervjuades tre externa företag för att undersöka deras mognadsnivå för tjänster och hur de kunde övervinna vanliga utmaningar inom tjänsteintegration. Baserat på insikterna från både interna och externa intervjuer skapades tre lösningar. Dessa lösningar är nya roller och uppdaterade ansvarsområden, en ny integrerad serviceprocess och ett diagram för produkt-tjänstberedskapsnivå. Framtida överväganden för det undersökta företaget lämnades också in för att ge vägledning för vidareutveckling av dessa lösningar

Features of chromophobe cell renal carcinoma on 3.0T MR imaging

Objective: To analyze the MRI features of chromophobe cell renal carcinoma. Methods: MRI features of 14 cases with histologically proved chromophobe cell renal carcinoma were studied retrospectively. Tumor size, position, borderline, homogeneousness, pseudo capsule, signal intensity, ADC values and enhancement features were evaluated. Results: All 14 cases were unilateral and single disease. In all cases, 64.28% (9/14) were regular in shape; 85.71% (12/14) had clear borderline; 64.28% (9/14) had pseudo capsule. On T1WI, 50.00% (7/14) showed homointensity, on T2WI, 85.71% (12/14) showed hypointesity. For 13 cases with DWI, the mean ADC value of tumor was 1.38×10-3 mm 2/s, the mean ADC value of kidney was 2.34×10 -3mm2/s. On contrast enhanced images, 72.73% (8/11) showed mild enhancement, 72.73% (8/11) showed homogenous enhancement; 5 cases showed spoke-like enhancement, 2 cases showed flowed-out blood vessels in the tumor. Conclusion: Chromophobe cell renal carcinoma has some unique feature on MR imaging which provides posibility to correct diagnosis.link_to_subscribed_fulltex