Geni potencijalne virulencije i profili antibiotske rezistencije bakterije campylobacter jejuni izolirane iz mačaka

Daily contact with cats is an important risk factor for human campylobacteriosis. The main goal of this study was to investigate the virulence genes and antibiotic resistances of C. jejuni isolated from the stools of cats brought to Erciyes University, Faculty of Veterinary Medicine, Training and Research Hospital Clinics. In the study, feces taken from different breeds and ages (1 month to 9 years) of 200 (116 female, 84 male) cats were examined between May 2017 and April 2018. Campylobacter spp. isolates were identified at genus and species level using genus specific multiplex PCR (mPCR), and the existence of iam, cadF, cdtA, flaA, ceuE, cdtC, cdtB and virB11 genes were found by PCR. The antimicrobial resistance and multidrug resitance (MDR) of the isolates were determined by disc diffusion test. By means of Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR), the genetic relativeness of the isolates were revealed. In this study, 41 (20.5%) of 200 stool samples were shown to be positive for Campylobacter spp. in the isolation of Campylobacter spp. from stool samples. In the positive samples, 14 of 22 (63.6%) were from diarhoeic cats and 27 of 178 (15.1%) were non-diarhoeic cats. Also, in total 71 Campylobacter spp. suspicious isolates were recovered from the 41 positive samples obtained. Phenotypic tests and PCR revealed that 65 isolates (20 from diarrhoeic and 45 from non-diarhoeic cat isolates) were identified as C. jejuni. The differences in isolation rate in relation to sex or age were not statistically significant (P>0.05). In terms of virulence genes, all C. jejuni isolates harbored at least five virulence genes. All isolates were positive for the cadF, cdtC and ceuE genes, respectively. C. jejuni isolates contained iam, cadF, cdtA, flaA, ceuE, cdtC, cdtB and virB11, at the rate of 19 (29.2%), 65 (100%), 64 (98.4), 54 (83%), 65 (100%), 65 (100%), 64 (98.4%) and 22 (33.8%) respectively. Moreover, cdtA and cdtB toxin genes were found in most of the isolates analysed. All C. jejuni isolates were susceptible to amoxicillin clavulanic acid. The highest resistances of the isolates were found as follows; 64 (98.4%), 63 (96.9%), 62 (95.3%) for ciprofloxacin (CIP), trimethoprim sulfamethoxazole (SXT), nalidixic acid (NA) antibiotics, respectively. Multiple resistance of isolates was detected in the present study. Sixty-one (93.8%) out of 65 isolates were resistant to three or more antibiotics, and the highest resistance levels to three and seven antimicrobials were observed in 23.1% and 15.3% of the isolates respectively. In the study, C. jejuni isolates were resistant to most antibiotics currently used, and had extraordinary virulence traits in cats which may constitute a non-negligible risk for public health.Svakodnevni kontakt s mačkama znatan je čimbenik rizika za kampilobakteriozu u ljudi. Glavni je cilj ovoga rada bio istražiti gene virulencije i antibiotsku rezistenciju bakterije C. jejuni izolirane iz izmeta mačaka dovedenih na Erciyes University, Faculty of Veterinary Medicine, Training and Research Hospital Clinics. Izmet je uzet od 200 mačaka (116 ženki i 84 mužjaka) različitih pasmina i dobi (1 mjesec do 9 godina), od svibnja 2017. do travnja 2018. Izolati Campylobacter spp. identificirani su na razini roda i vrste primjenom genski specifičnog multipleks PCR-a (mPCR) kojim je ustanovljena prisutnost gena iam, cadF, cdtA, flaA, ceuE, cdtC, cdtB i virB11. Antimikrobna rezistencija i otpornost na širok spektar lijekova (MDR) izolata određeni su disk-difuzijskim testom. Primjenom Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR) otkriveni su genski srodnici izolata. U ovom je istraživanju 41 (20,5 %) od 200 uzoraka izmeta bio pozitivan na Campylobacter spp. Među pozitivnim uzorcima njih 14 od 22 (63,6 %) potjecalo je od mačaka koje su imale proljev, a 27 od 178 (15,1 %) uzoraka bilo je od mačaka koje nisu imale proljev. Fenotipski testovi i PCR pokazali su da je 65 izolata (20 od njih potjecalo je od mačaka koje su imale proljev i 45 od mačaka koje nisu imale proljev) identificirano kao C. jejuni. Razlike u broju izolata s obzirom na spol i dob nisu bile statistički znakovite (P > 0,05). Svi izolati C. jejuni imali su barem pet gena virulencije i bili pozitivni na gene cadF, cdtC i ceuE. Gen iam sadržavalo je 19 izolata C. jejuni (29,2 %), gen cadF 65 izolata (100 %), gen cdtA 64 izolata (98,4 %), gen flaA 54 izolata (83 %), gen ceu E 65 izolata (100 %), gen cdtC 65 izolata (100 %), gen cdtB 64 izolata (98,4 %) i gen virB11 22 izolata (33,8 %). Geni toksina cdtA i cdtB pronađeni su u većini analiziranih izolata. Svi su izolati C. jejuni bili osjetljivi na amoksicilin-klavulansku kiselinu. Najveća rezistencija bila je: 64 izolata (98, 4 %) na ciprofloksacin (CIP), 63 izolata (96,9 %) na trimetoprim- sulfametoksazol (SXT) i 62 izolata (95,3 %) na nalidiksičnu kiselinu (NA). U ovom je istraživanju ustanovljena višestruka rezistencija izolata. 61 od 65 izolata (93,8 %) bilo je otporno na tri ili više antibiotika, a najveća je otpornost utvrđena na tri antimikrobna lijeka u 23,1 % izolata i na sedam antimikrobnih lijekova u 15,3 % izolata. Istraživanjem je ustanovljena otpornost izolata C. jejuni na većinu antibiotika koji se trenutačno primjenjuju te iznimna svojstva virulencije u mačaka, koja mogu imati određeni rizik za javno zdravstvo

Aflatoxin M1 levels in raw sheep, goat and cow milks in Niğde Province

Bu çalışmada, Niğde ilinde tüketime sunulan çiğ inek, koyun ve keçi sütlerinde aflatoksin M1 (AFM1) varlığının araştırılması, yasal düzenlemeler dikkate alınarak halk sağlığı yönünden tehlike oluşturup oluşturmadığının belirlenmesi ve sütlerdeki toksin içeriklerinin karşılaştırılması amaçlandı. Çalışmada, 90 çiğ süt örneği toplanarak ELISA tekniği ile analiz edildi. İncelenen tüm süt örneklerinin AFM1 ile kontamine olduğu koyun ve keçi sütlerindeki AFM1 düzeyinin yasal limitlerin altında, çiğ inek sütü örneklerinin 3'ünde (%10) ise bu limitlerin üzerinde (50 ng/L) olduğu belirlendi. Ayrıca farklı hayvan türlerinin sütlerindeki AFM1 düzeyleri arasında istatistiksel olarak anlamlı farklılıklar gözlemlendi (p <0.05). Sonuç olarak, Niğde'de koyun ve keçi sütü tüketimi ile AFM1’e maruz kalma potansiyelinin inek sütü tüketimine oranla daha düşük olduğu belirlendi. Bununla birlikte inek sütlerinde yasal limitlerin üzerinde tespit edilen AFM1 varlığının halk sağlığı bakımından önemli olduğu ve bu nedenle sütlerin sistematik olarak kontrol edilmesi gerektiği sonucuna varıldı.This study aimed to investigate the presence of aflatoxin M1 (AFM1) in raw cow, sheep and goat milk consumed in Niğde and to evaluate whether they pose a risk for public health regarding legal limits and to compare the AFM1 levels in milk of different species. In the study, 90 raw milk samples were collected and analysed by ELISA tecnique. All of the milk samples were found to be contaminated with AFM1. On the other hand AFM1 contents of all sheep and goat milk samples were below the legal limits, while 3 of the raw cow milk samples (10%) exceeded the limits of concern (50 ng/L). In addition, statistically significant differences were observed between AFM1 levels in milk of different species (p <0.05). In conclusion, AFM1 exposure risk in case of sheep and goat milk consumption is found to be lower than cow milk consumption in Niğde. However, presence of AFM1 in cow milk samples should be considered as a public health jeopardy, therefore milks should be systematically monitored

Nevşehir İlindeki Kesimhanelerden İzole Edilen Staphylococcus aureus İzolatlarının Moleküler Tiplendirilmesi ve Vankomisin Dirençliliğinin İncelenmesi

Bu çalışma, kesimhanelerde Staphylococcus aureus’un mevcudiyetini, izolatların moleküler tiplendirmesini ve izolatların vankomisin antibiyotiğine duyarlılığını tespit etmeyi amaçlamaktadır. Nevşehir ilindeki üç farklı kesimhane-den sıvap ile alınan; sığır karkası, duvar, bıçak, kesme tahtası yüzeyleri ve kesimhane atık su örnekleri çalışma kapsa-mında materyal olarak kullanılmıştır. Her bir kesimhaneden; 10 adet sığır karkası yüzeyi, 10 adet duvar yüzeyi, 10 adet bıçak yüzeyi, 10 adet kesme tahtası yüzeyi ve 10 adet atık su olmak üzere, bir kesimhaneden toplam 50 adet; üç ke-simhaneden toplam 150 adet numune incelenmiştir. Etken izolasyonunu takiben izolatların identifikasyonu fenotipik ve moleküler yöntemlerle (PCR) yapılmıştır. İzolatların vankomisine duyarlılıkları E test ile test edilmiştir. Ayrıca izolatların genetik yakınlıkları Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR) ile araştırılmıştır. Çalışmada 150 örnekten 150 izolat elde edilmiş, bu izolatların 65’i (%43.3) fenotipik olarak koagülaz pozitif stafilokok olarak tespit edilmiştir. Bu 65 izolatın 6’sı (%4) ise PCR sonucu S. aureus olarak identifiye edilmiştir. Elde edilen S. aureus izolatları-nın tümünün (duyarlı: ≤2 μg/ml) vankomisine duyarlı olduğu saptanmıştır. ERIC-PCR analizi sonucu izolatların genoti-pik olarak farklı olduğu saptanmıştır. Hem gıda toksikasyonlarının önüne geçmek hem de karkas kalitesini artırmak ve kırmızı etin raf ömrünü uzatmak için, kesimhanede hijyen koşullarına dikkat edilmelidir. Yapılan antibiyotik duyarlılık test sonucu, direnç tespit edilmemesi olumlu olmakla birlikte, antibiyotiklerin bilinçsiz kullanımından kaçınılmalı ve kul-lanımları kontrol altında tutulmalıdır.This study aims to determine the presence of Staphylococcus aureus in the slaughter houses, the molecu-lar typing of the isolates and the susceptibility of the isolates to the vancomycin antibiotic. The samples collected from cattle carcass, wall, knife, wastewater and cutting board from three different slaughterhouses in the Province of Nevşehir, in the scope of the study, were used as material. Fifty swab samples of 10 beef carcass surfaces, 10 wall surface, 10 blade surface, 10 cutting board surface and 10 waste water were taken from each slaughterhouse; a total of 150 swab samples were analyzed. The identification of the isolates was performed by phenotypic and molecular methods (PCR) following the isolation of the agents. The susceptibility of the isolates to vancomycin was tested by E test. In addition, genetic proximity of the isolates was investigated by Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR). In this study, 150 isolates were obtained from 150 samples. 65 (43.3%) of these isolates were iden-tified as coagulase positive staphylococci and 6 (4%) of 150 isolates were identified as S. aureus. All S. aureus isolates (susceptible: ≤2 μg / ml; moderately sensitive: 4-8 μg / ml; resistant: ≥16 μg / ml) were found to be susceptible to van-comycin. According to the ERIC-PCR analysis, isolates have been determined to be genotypically different. Special attention should be paid to hygiene conditions in slaughterhouses, both to prevent food poisoning and to improve car-cass quality, and to extend the shelf life of red meat. Although it is pleasing that no resistance is detected as a result of our antimicrobial susceptibility test; unconscious use of antibiotics should be avoided, and their use should be kept under control.</p

Nevşehir İlindeki Kesimhanelerden İzole Edilen Staphylococcus aureus İzolatlarının Moleküler Tiplendirilmesi ve Vankomisin Dirençliliğinin İncelenmesi

Bu çalışma, kesimhanelerde Staphylococcus aureus’un mevcudiyetini, izolatların moleküler tiplendirmesini ve izolatların vankomisin antibiyotiğine duyarlılığını tespit etmeyi amaçlamaktadır. Nevşehir ilindeki üç farklı kesimhane-den sıvap ile alınan; sığır karkası, duvar, bıçak, kesme tahtası yüzeyleri ve kesimhane atık su örnekleri çalışma kapsa-mında materyal olarak kullanılmıştır. Her bir kesimhaneden; 10 adet sığır karkası yüzeyi, 10 adet duvar yüzeyi, 10 adet bıçak yüzeyi, 10 adet kesme tahtası yüzeyi ve 10 adet atık su olmak üzere, bir kesimhaneden toplam 50 adet; üç ke-simhaneden toplam 150 adet numune incelenmiştir. Etken izolasyonunu takiben izolatların identifikasyonu fenotipik ve moleküler yöntemlerle (PCR) yapılmıştır. İzolatların vankomisine duyarlılıkları E test ile test edilmiştir. Ayrıca izolatların genetik yakınlıkları Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR) ile araştırılmıştır. Çalışmada 150 örnekten 150 izolat elde edilmiş, bu izolatların 65’i (%43.3) fenotipik olarak koagülaz pozitif stafilokok olarak tespit edilmiştir. Bu 65 izolatın 6’sı (%4) ise PCR sonucu S. aureus olarak identifiye edilmiştir. Elde edilen S. aureus izolatları-nın tümünün (duyarlı: ≤2 μg/ml) vankomisine duyarlı olduğu saptanmıştır. ERIC-PCR analizi sonucu izolatların genoti-pik olarak farklı olduğu saptanmıştır. Hem gıda toksikasyonlarının önüne geçmek hem de karkas kalitesini artırmak ve kırmızı etin raf ömrünü uzatmak için, kesimhanede hijyen koşullarına dikkat edilmelidir. Yapılan antibiyotik duyarlılık test sonucu, direnç tespit edilmemesi olumlu olmakla birlikte, antibiyotiklerin bilinçsiz kullanımından kaçınılmalı ve kul-lanımları kontrol altında tutulmalıdır.This study aims to determine the presence of Staphylococcus aureus in the slaughter houses, the molecu-lar typing of the isolates and the susceptibility of the isolates to the vancomycin antibiotic. The samples collected from cattle carcass, wall, knife, wastewater and cutting board from three different slaughterhouses in the Province of Nevşehir, in the scope of the study, were used as material. Fifty swab samples of 10 beef carcass surfaces, 10 wall surface, 10 blade surface, 10 cutting board surface and 10 waste water were taken from each slaughterhouse; a total of 150 swab samples were analyzed. The identification of the isolates was performed by phenotypic and molecular methods (PCR) following the isolation of the agents. The susceptibility of the isolates to vancomycin was tested by E test. In addition, genetic proximity of the isolates was investigated by Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR). In this study, 150 isolates were obtained from 150 samples. 65 (43.3%) of these isolates were iden-tified as coagulase positive staphylococci and 6 (4%) of 150 isolates were identified as S. aureus. All S. aureus isolates (susceptible: ≤2 μg / ml; moderately sensitive: 4-8 μg / ml; resistant: ≥16 μg / ml) were found to be susceptible to van-comycin. According to the ERIC-PCR analysis, isolates have been determined to be genotypically different. Special attention should be paid to hygiene conditions in slaughterhouses, both to prevent food poisoning and to improve car-cass quality, and to extend the shelf life of red meat. Although it is pleasing that no resistance is detected as a result of our antimicrobial susceptibility test; unconscious use of antibiotics should be avoided, and their use should be kept under control.</p