Apparent activation energy during surface evolution by step formation and flow

During growth and etching by step flow as examples of anisotropic surface processing the apparent activation energy of the growth/etch rate depends on orientation, increasing gradually as a principal, terrace-rich surface is approached. This behaviour is traditionally explained as a change in the dominating process from step propagation to island/pit nucleation. We show that the orientation dependence of the activation energy is actually the result of a traditionally disregarded temperature dependence in the number of active step sites and is not attributable to an increasing role of step nucleation nor to a purely geometrical decrease in the number of step sites. This modifies the traditional picture of the apparent energy for a principal surface and explains how the energy can be higher than, equal to or even lower than that for vicinal orientations.Peer reviewe

Colaboración internacional y buenas prácticas en la gestión de enfermedades crónicas complejas a través de herramientas web 2.0: Observatorio de prácticas innovadoras en el manejo de enfermedades crónicas complejas OPIMEC

Ponencias de la Segunda Conferencia internacional sobre brecha digital e inclusión social, celebrada del 28 al 30 de octubre de 2009 en la Universidad Carlos III de MadridLas enfermedades crónicas (EC) constituyen un reto de salud mundial en el siglo XXI. La OMS las define como enfermedades de larga duración por lo general de progresión lenta y prevé que en 2020 serán responsables del 73% de las muertes y del 60% de la carga global de enfermedad (World Health Organization, 2002). Es primordial que la comunidad internacional de salud pública y de gestión sanitaria conozca y comparta información sobre los avances en las prácticas tecnológicas y organizativas más innovadoras en gestión de EC, con énfasis en las EC Complejas (ECC) asociadas a una mayor pérdida de autonomía y grado de dependencia y discapacidad. Con este propósito, a mediados de 2006, la Dirección General de Innovación Sanitaria, Sistemas y Tecnología de la Consejería de Salud de la Junta de Andalucía crea el «Observatorio de Prácticas Innovadoras para el Manejo de Enfermedades Crónicas Complejas» (OPIMEC) que impulsa la participación y generación de conocimiento en información sanitaria para profesionales y una Plataforma de Red en el ámbito de la gestión de ECC para el fomento de alianzas y colaboraciones desde Andalucía basadas en dar y recibir conocimiento abierto entre personas, equipos y organizaciones (Jadad AR, 1999, p. 761-764; Jadad AR, 2000, p.362-365). La Web del Observatorio de Prácticas Innovadoras en el Manejo de Enfermedades Crónicas Complejas (OPIMEC), http://www.opimec.org, va centrada en la creación de una plataforma basada en la Web 2.0. que permite el acceso y la edición colaborativa de contenidos para profesionales. El objetivo fundamental de esta plataforma es compartir y colaborar en la generación y difusión de conocimiento, todo ello facilitado con herramientas innovadoras de la Web 2.0. como son la publicación de contenidos, la votación, comentarios sobre los contenidos, la sindicación de contenidos y la creación de comunidades abiertas de trabajo colaborativo. El proyecto OPIMEC cuenta con una cadena de procesos de gestión de la información de los que podemos destacar su forma colaborativa de crear conocimiento por todas las personas usuarias de la plataforma, un equipo editorial encargado de asegurar la calidad de los contenidos y una evaluación por pares de las prácticas y organizaciones propuestas en la Web. Desde la edición, hasta la publicación y su distribución final el conocimiento es examinado metódicamente. Este proceso es automatizado a través de herramientas de software libre creadas para OPIMEC y asesorado por su Consejo Asesor Internacional. Así pues, la plataforma Web 2.0 que da soporte al observatorio OPIMEC está construida sobre tecnologías libres como: Framework Web Django (impulsado por Google Inc. entre otros), MySQL y GNU/Linux. La elección de esta combinación tecnológica se ha realizado tras un análisis exhaustivo sobre las tecnologías abiertas disponibles, en base a criterios de eficiencia, productividad y adaptabilidad a las necesidades actuales y futuras de OPIMEC. La Web OPIMEC tiene intención y vocación de convertirse en un destacado proyecto a nivel mundial con clara vertiente de cooperación internacional e innovación, mejorando la calidad de vida de la ciudadanía, aprovechando las herramientas que ofrece la difundida red global de Internet y promocionando la participación e iniciativa de los y las profesionales. Nuestra Web OPIMEC está estructurada en espacios que facilitan y propician la participación y consecución de los objetivos del proyecto, con el fin de que la asimilación de sus contenidos por parte de las personas usuarias sea eficiente y efectiva. Podemos encontrar en ella, herramientas existentes en las redes sociales así como algunas nuevas desarrolladas específicamente para OPIMEC, como son los “documentos colaborativos”, que facilitarán el trabajo, la conexión y la participación de profesionales desde cualquier parte del mundo, pudiendo así aprovechar los recursos al máximo, Se dispone por tanto de destacadas herramientas como una base de datos actualizada de eventos, noticias, recursos y documentos, directorios y mapas de organizaciones, prácticas y personas innovadoras, espacios de comunidad en las que los equipos de trabajo pueden desarrollarse, comunicarse y complementarse con otras personas usuarias, compartiendo buenas prácticas, innovación y contenidos novedosos en el manejo de enfermedades crónicas complejas. El aspecto importante de la plataforma es que las personas usuarias son de forma democrática, creadores, evaluadores y consumidores de los contenidos publicados, siendo así una herramienta de trabajo construida, ampliada, valorada y seguida por toda la comunidad de profesionales; facilitando la difusión del conocimiento construido por y para todos y todas los profesionales sanitarios, personal investigador, ciudadanos y ciudadanas en general en el manejo de enfermedades crónicas complejas. Un conocimiento ampliamente compartido es la clave para aumentar y mejorar el bienestar social y la calidad de vida

Mapping research activity on mental health disorders in Europe: Study protocol for the Mapping_NCD project

© 2016 The Author(s). Background: Mental health disorders (MHDs) constitute a large and growing disease burden in Europe, although they typically receive less attention and research funding than other non-communicable diseases (NCDs). This study protocol describes a methodology for the mapping of MHD research in Europe as part of Mapping_NCD, a 2-year project funded by the European Commission which seeks to map European research funding and impact for five NCDs in order to identify potential gaps, overlaps, synergies and opportunities, and to develop evidence-based policies for future research. Methods: The project aims to develop a multi-focal view of the MHD research landscape across the 28 European Union Member States, plus Iceland, Norway and Switzerland, through a survey of European funding entities, analysis of research initiatives undertaken in the public, voluntary/not-for-profit and commercial sectors, and expert interviews to contextualize the gathered data. The impact of MHD research will be explored using bibliometric analyses of scientific publications, clinical guidelines and newspaper stories reporting on research initiatives. Finally, these research inputs and outputs will be considered in light of various metrics that have been proposed to inform priorities for the allocation of research funds, including burden of disease, treatment gaps and cost of illness. Discussion: Given the growing burden of MHDs, a clear and broad view of the current state of MHD research is needed to ensure that limited resources are directed to evidence-based priority areas. MHDs pose a particular challenge in mapping the research landscape due to their complex nature, high co-morbidity and varying diagnostic criteria. Undertaking such an effort across 31 countries is further challenged by differences in data collection, healthcare systems, reimbursement rates and clinical practices, as well as cultural and socioeconomic diversity. Using multiple methods to explore the spectrum of MHD research funding activity across Europe, this project aims to develop a broad, high-level perspective to inform priority setting for future research

Evolutionary continuous cellular automaton for the simulation of wet etching of quartz

Anisotropic wet chemical etching of quartz is a bulk micromachining process for the fabrication of micro-electro-mechanical systems (MEMS), such as resonators and temperature sensors. Despite the success of the continuous cellular automaton for the simulation of wet etching of silicon, the simulation of the same process for quartz has received little attention-especially from an atomistic perspective-resulting in a lack of accurate modeling tools. This paper analyzes the crystallographic structure of the main surface orientations of quartz and proposes a novel classification of the surface atoms as well as an evolutionary algorithm to determine suitable values for the corresponding atomistic removal rates. Not only does the presented evolutionary continuous cellular automaton reproduce the correct macroscopic etch rate distribution for quartz hemispheres, but it is also capable of performing fast and accurate 3D simulations of MEMS structures. This is shown by several comparisons between simulated and experimental results and, in particular, by a detailed, quantitative comparison for an extensive collection of trench profiles. © 2012 IOP Publishing Ltd.We are grateful to D Cheng and K Sato (Nagoya University, Japan) for providing part of the experimental data. We acknowledge support by the JAE-Doc grant form the Junta para la Ampliacion de Estudios program co-funded by FSE, the Ramon y Cajal Fellowship Program by the Spanish Ministry of Science and Innovation, NANO-IKER Project (IE11-304) from the ETORTEK program by the Basque Government and the Professor Partnership Program by NVIDIA Corporation.Ferrando Jódar, N.; Gosalvez Ayuso, MA.; Colom Palero, RJ. (2012). Evolutionary continuous cellular automaton for the simulation of wet etching of quartz. Journal of Micromechanics and Microengineering. 22(2). https://doi.org/10.1088/0960-1317/22/2/025021S222Hida, H., Shikida, M., Fukuzawa, K., Murakami, S., Sato, K., Asaumi, K., … Sato, K. (2008). Fabrication of a quartz tuning-fork probe with a sharp tip for AFM systems. Sensors and Actuators A: Physical, 148(1), 311-318. doi:10.1016/j.sna.2008.08.021Oh, H., Kim, G., Seo, H., Song, Y., Lee, K., & Yang, S. S. (2010). Fabrication of micro-lens array using quartz wet etching and polymer. Sensors and Actuators A: Physical, 164(1-2), 161-167. doi:10.1016/j.sna.2010.10.003Xing, Y., Gosálvez, M. A., & Sato, K. (2007). Step flow-based cellular automaton for the simulation of anisotropic etching of complex MEMS structures. New Journal of Physics, 9(12), 436-436. doi:10.1088/1367-2630/9/12/436Zhou, Z., Huang, Q., Li, W., & Deng, W. (2007). A cellular automaton-based simulator for silicon anisotropic etching processes considering high index planes. Journal of Micromechanics and Microengineering, 17(4), S38-S49. doi:10.1088/0960-1317/17/4/s03Gosalvez, M. A., Yan Xing, & Sato, K. (2008). Analytical Solution of the Continuous Cellular Automaton for Anisotropic Etching. Journal of Microelectromechanical Systems, 17(2), 410-431. doi:10.1109/jmems.2008.916339Zhou, Z., Huang, Q., & Li, W. (2009). Modeling and Simulations of Anisotropic Etching of Silicon in Alkaline Solutions with Experimental Verification. Journal of The Electrochemical Society, 156(2), F29. doi:10.1149/1.3031485Rangsten, P., Hedlund, C., Katardjiev, I. V., & Bäcklund, Y. (1998). Etch rates of crystallographic planes inZ-cut quartz - experiments and simulation. Journal of Micromechanics and Microengineering, 8(1), 1-6. doi:10.1088/0960-1317/8/1/001Tellier, C. R., & Leblois, T. G. (2000). Micromachining of quartz plates: determination of a database by combined stereographic analysis and 3-D simulation of etching shapes. IEEE Transactions on Ultrasonics, Ferroelectrics and Frequency Control, 47(5), 1204-1216. doi:10.1109/58.869067Hedlund, C., Lindberg, U., Bucht, U., & Soderkvist, J. (1993). Anisotropic etching of Z-cut quartz. Journal of Micromechanics and Microengineering, 3(2), 65-73. doi:10.1088/0960-1317/3/2/006Liang, J., Kohsaka, F., Matsuo, T., & Ueda, T. (2007). Wet Etched High Aspect Ratio Microstructures on Quartz for MEMS Applications. IEEJ Transactions on Sensors and Micromachines, 127(7), 337-342. doi:10.1541/ieejsmas.127.337Gosálvez, M. A., Xing, Y., Sato, K., & Nieminen, R. M. (2009). Discrete and continuous cellular automata for the simulation of propagating surfaces. Sensors and Actuators A: Physical, 155(1), 98-112. doi:10.1016/j.sna.2009.08.012Zhenjun Zhu, & Chang Liu. (2000). Micromachining process simulation using a continuous cellular automata method. Journal of Microelectromechanical Systems, 9(2), 252-261. doi:10.1109/84.846706Gosálvez, M. A., Xing, Y., Sato, K., & Nieminen, R. M. (2008). Atomistic methods for the simulation of evolving surfaces. Journal of Micromechanics and Microengineering, 18(5), 055029. doi:10.1088/0960-1317/18/5/055029Ferrando, N., Gosálvez, M. A., Cerdá, J., Gadea, R., & Sato, K. (2011). Octree-based, GPU implementation of a continuous cellular automaton for the simulation of complex, evolving surfaces. Computer Physics Communications, 182(3), 628-640. doi:10.1016/j.cpc.2010.11.004Mühlenbein, H., & Schlierkamp-Voosen, D. (1993). Predictive Models for the Breeder Genetic Algorithm I. Continuous Parameter Optimization. Evolutionary Computation, 1(1), 25-49. doi:10.1162/evco.1993.1.1.25Kohsaka, F., Liang, J., Matsuo, T., & Ueda, T. (2007). High Sensitive Tilt Sensor for Quartz Micromachining. IEEJ Transactions on Sensors and Micromachines, 127(10), 431-436. doi:10.1541/ieejsmas.127.43

Hidden heterochromatin: Characterization in the Rodentia species Cricetus cricetus, Peromyscus eremicus (Cricetidae) and Praomys tullbergi (Muridae)

The use of in situ restriction endonuclease (RE) (which cleaves DNA at specific sequences) digestion has proven to be a useful technique in improving the dissection of constitutive heterochromatin (CH), and in the understanding of the CH evolution in different genomes. In the present work we describe in detail the CH of the three Rodentia species, Cricetus cricetus, Peromyscus eremicus (family Cricetidae) and Praomys tullbergi (family Muridae) using a panel of seven REs followed by C-banding. Comparison of the amount, distribution and molecular nature of C-positive heterochromatin revealed molecular heterogeneity in the heterochromatin of the three species. The large number of subclasses of CH identified in Praomys tullbergi chromosomes indicated that the karyotype of this species is the more derived when compared with the other two genomes analyzed, probably originated by a great number of complex chromosomal rearrangements. The high level of sequence heterogeneity identified in the CH of the three genomes suggests the coexistence of different satellite DNA families, or variants of these families in these genomes