Integrerad 3D modellering av järnoxidfyndigheterna Källfallsgruvan och Persgruvan, Riddarhyttefältet, Bergslagen : [Integrated 3D modelling at the Källfallsgruvan and Persgruvan iron oxide deposits, Riddarhyttan ore field, Bergslagen]

Syfte och mål: I detta 1-års projekt studerar och klassificerar vi SGU:s databas av gamla gruvkartor från Bergslagen, kopplad till lokal fält- och borrkärn-kartering vid två järnoxidfyndigheter, Källfallsgruvan och Persgruvan, som är en del av Riddarhyttefältet. Genom att kombinera dessa olika typer av data kan vi bygga exakta 3D geologiska modeller av dessa malmer som kommer att hjälpa med tolkningar av strukturella kontroller samt malmsystemet, med implikationer för prospektering från fyndighets- till distriktskala. De resulterande 3D modellerna kommer att integreras i regionala modeller som samtidigt utvecklas i karteringsprojekt på SGU, med syftet att bygga multiskaliga 3D modeller av berggrunden både proximalt och distalt till malmerna. Preliminära resultat: 3D modelleringen visar tydliga strukturella kontroller på mineraliseringen vid både Källfallsgruvan och Persgruvan. Enligt våra preliminära tolkningar resulterade den polyfasa deformationen i typ-I veck-interferensmönster med brant stupande axlar mot SÖ som kontrollerar mineraliseringens geometrier vid Källfallsgruvan. Vid Persgruvan liknar linjerade isolerade malmkroppar boudin-strukturer (pinch & swell) vilket tyder på starkt utstretchade malmkroppar i en NÖ-SV riktning. Samhällsnytta:Tre-dimensionella modeller av kända malmfyndigheter hjälper oss att identifiera vektorer mot nya upptäckter och resulterar därmed i effektivare mineralprospektering vilket är ytterst viktigt för att garantera försörjningskedjan i den svenska och europeiska råvarusektorn, såväl som för att bidra till utvecklingen mot ett hållbart samhälle. Projektarbetet utförs som två M.Sc. examensarbeten vilket i sin tur är ett utmärkt tillfälle för unga geologer att bekanta sig med svensk berggrundsgeologi. Detta kommer att hjälpa att lösa välkända problem med kompetensförsörjning som denna sektor kommer att ha i den nära framtiden

Measuring DNA quality by digital PCR using probability calculations

Background: Accurate methods to assess DNA integrity are needed for many biomolecular methods. A multiplex digital PCR (dPCR) method designed for interspaced target sequences can be used to assess sequence integrity of large DNA strands. The ratio of single positive partitions versus double positive partitions is then used to calculate the sheared DNA strands. However, this simple calculation is only valid with low DNA concentration. We here describe a method based on probability calculations which enables DNA quality analysis in a large dynamic range of DNA concentrations. Results: Known DNA integrity percentages were mimicked using artificial double stranded DNA in low, intermediate and high DNA concentration scenarios, respectively 600, 12500 and 30000 copies of DNA per reaction. At low concentrations both methods were similar. However, at the intermediate concentration (12500 copies per reaction) the ratio based method started producing a larger error than the proposed probability calculation method with a mean relative error of 20.7 and 16.7 for the Bruner and the proposed method respectively. At the high concentration (30000 copies per reaction) only the proposed method provided accurate measurements with a mean relative error of 60.9 and 9.3 for the ratio based and the proposed method respectively. Furthermore, while both methods have a bias, it is constant for the proposed method, while it decreases with the integrity of the DNA for the ratio based method. The probability calculation equation was extended to 4 dimensions and a proof of concept experiment was performed, the data suggested that the 4 dimensional equation is valid. Significance and novelty: We here validate a method of estimating DNA integrity with dPCR using multiple probe combinations, allowing fast and flexible DNA integrity analysis. Additionally, we extend the method from 2 to 4 plex for more accurate DNA integrity measurements