MicroRNAs in the Tumor Biology of Soft Tissue Sarcomas

__Abstract__ Soft tissue sarcomas represent a rare, heterogeneous group of mesenchymal tumors. In sarcomas, histological classification, prediction of clinical behaviour and prognosis, and targeted treatment is often a challenge. A better understanding of the biology of soft tissue sarcomas is necessary to find reliable diagnostic markers, elucidate prognostic and predictive factors, and improve treatment by finding new targets for therapy. Not much is known about the involvement of microRNAs in soft tissue sarcoma biology. These evolutionarily conserved, small, non proteincoding RNA molecules can target (near-)complementary sequences in the 3’UTR of mRNA molecules, thereby inhibiting their translation into functional proteins. This thesis addresses the role of microRNAs in the tumor biology of soft tissue sarcoma. We showed that microRNAs can discriminate diverse liposarcoma subtype, lipomas and normal fat. We identified that miR-145 and miR-451 have a tumor suppressor-like function, which makes them candidates for future liposarcoma therapies. Myxoid/round cell liposarcomas showed a very distinct microRNA expression profile. Overexpression of miR-497 and miR-30a, which are regulated by the myxoid/round cell specific FUS-CHOP fusion protein, inhibited IGF1R-pathway members and sensitized myxoid liposarcoma cells to doxorubicin therapy. In gastrointestinal stromal tumors miR-17/20a/222 inhibited cell proliferation, affected the cell cycle, induced apoptosis, and inhibited the expression of KIT and ETV1, two essential oncogenes in GIST oncogenesis. This could have great implications for the treatment of (imatinib-resistant) GIST. Furthermore we demonstrated that hypoxia inducible microRNAs, miR-210 and miR-485-5p, fine-tune the expression of HIF3α in hypoxic tumor cells. In summary, we identified microRNAs that can potentially be used as diagnostic, prognostic, or predictive biomarkers in soft tissue sarcomas, or could serve as a target for therapy. These results show that microRNAs hold great potential for future management of soft tissue sarcomas

Librarians Opening Up Open Education: A University, Community College, and Public Library Partnership to Increase OER Usage in Texas

Full book available for free download at https://www.ala.org/acrl/sites/ala.org.acrl/files/content/publications/booksanddigitalresources/digital/9780838936566_OA.pdfUT Librarie

Розробка мультиноміальної логіт-моделі вибору виду транспорту для міжміських переміщень

Reducing the share of the use of automobiles in intercity passenger transportation is one of the ways to achieve the goals of sustainable development in transport that could positively affect the environment. The purpose of this work is to determine, based on the analysis of the results of polling conducted in the city of Lviv, Ukraine, trends in the selection of an external transport hub (ETH) by the transportation system users for a subsequent intercity trip. To this end, a multinomial logit model of ETH selection has been constructed, based on calculating the utility of students' choice of a railway and a bus hub. Multi-nominal logit models (MLM) are widely used to simulate the behavior of users, as evidenced by numerous studies. Their correct application requires that a set of factors should be defined that influence making a choice and the MLM coefficients should be calculated, based on studying users' behavior within a specific design area. The factors affecting the choice of a type of an external transport hub are the characteristics of an ETH (the throughput and the number of dispatches in a certain direction) and the duration and cost of a trip. The impact of these factors differs depending on the trip length: we have calculated the MLM coefficients for selecting an ETH type separately for travel up to 100 km in length, from 100 to 200 km, and more than 200 km. In addition, such indicators as the duration of a city trip and the time interval of dispatching were introduced in the model; however, the process of calculating the significance of the logit-model parameters revealed that these indicators did not exert significant influence on the users within the studied group. The result of this study is the defined characteristics of the performed trips with the hub-based distribution. The data obtained would contribute to a better understanding of the behavior of users of this class when they choose the mode of intercity travel and could be used to optimize the functioning of external transport hubsСокращение доли использования автомобильного транспорта в междугороднем сообщении – это один из способов достижения целей устойчивого развития на транспорте, который позитивно повлияет на состояние окружающей среды. Цель этой роботы заключается в анализе результатов опросов, проведенных в городе Львов, и на его основании определении тенденций выбора пользователями транспортной системы вида узла внешнего транспорта (УВТ) для дальнейшего выполнения междугородней поездки. Для этого сформирована мультиномиальная логит-модель выбора УВТ на основание вычисления полезности выбора студентами железнодорожного и автобусного узла. Мультиномиальные логит-модели (МЛМ) широко используются для моделирования поведения пользователей, что подтверждается многочисленными исследованиями. Чтобы их использование было корректным, нужно определить набор факторов, которые влияют на выбор, и рассчитать коэффициенты МЛМ на основании изучения поведения пользователей в пределах определенной территории проектирования. Факторами влияния на выбор узла внешнего транспорта определены характеристики УВТ (пропускная способность та количество отправлений в определенном направлении), а также длительность и стоимость перемещения. Влияние этих факторов отличается в зависимости от длины поездки: рассчитаны коэффициенты МЛМ выбора вида УВТ отдельно для поездок длиной до 100 км, от 100 до 200 км и больше 200 км. Также в модель были введены такие показатели, как длительность перемещения по городу и временной период отправления, но в процессе расчета значимости параметров логит-модели оказалось, что эти показатели не имеют на пользователей исследуемой группы значимого влияния. В результате исследований определены характеристики выполняемых поездок з распределением по виду узла. Полученные данные способствуют лучшему пониманию поведения пользователей этого класса при выборе ими способа выполнения междугороднего перемещения и могут быть использованы для оптимизации функционирования узлов внешнего транспортаЗменшення частки використання автомобільного транспорту для міжміських переміщень є одним зі способів досягнення цілей сталого розвитку на транспорті і позитивно вплине на стан довкілля. Метою роботи є визначення на основі аналізу результатів опитувань, проведених у м. Львові, тенденції вибору користувачами транспортної системи виду вузла зовнішнього транспорту (ВЗТ) для подальшого виконання міжміської поїздки. Для цього сформовано мультиноміальну логіт-модель вибору ВЗТ на основі розрахунку корисності вибору студентами залізничного та автобусного вузла. Мультиноміальні логіт-моделі (МЛМ) широко застосовуються для моделювання поведінки користувачів, що підтверджується численними дослідженнями. Для їх коректного застосування необхідно визначити набір чинників, які впливають на здійснення вибору, та розрахувати коефіцієнти МЛМ на основі вивчення поведінки користувачів в межах конкретної території проектування. Чинниками, що впливають на вибір виду вузла зовнішнього транспорту, є характеристики ВЗТ (пропускна здатність та кількість відправок в певному напрямку) і тривалість та вартість переміщення. Вплив цих чинників відрізняється залежно від довжини поїздки: розраховано коефіцієнти МЛМ вибору виду ВЗТ окремо для поїздок довжиною до 100 км, від 100 до 200 км та більше 200 км. Також в модель було введено такі показники, як тривалість переміщення по місту та часовий період відправки, проте в процесі розрахунку значущості параметрів логіт-моделі виявилося, що ці показники не мають на користувачів досліджуваної групи суттєвого впливу. В результаті досліджень визначено характеристики виконуваних поїздок з розподілом по виду вузла. Отримані дані сприяють кращому розумінню поведінки користувачів цього класу при виборі ними способу виконання міжміської поїздки та можуть бути використані для оптимізації функціонування вузлів зовнішнього транспорт

G-CSF receptor truncations found in SCN/AML relieve SOCS3-controlled inhibition of STAT5 but leave suppression of STAT3 intact

Truncated granulocyte colony-stimulating factor receptors (G-CSF-Rs) are implicated in severe congenital neutropenia (SCN) and the consecutive development of acute myeloid leukemia (AML). Mice expressing G-CSF-R truncation mutants (gcsfr-d715) show defective receptor internalization, an increased signal transducer and activator of transcription 5 (STAT5)/STAT3 activation ratio, and hyperproliferative responses to G-CSF treatment. We determined whether a lack of negative feedback by suppressor of cytokine signaling (SOCS) proteins contributes to the signaling abnormalities of G-CSF-R-d715. Expression of SOCS3 transcripts in bone marrow cells from G-CSF-treated gcsfr-d715 mice was approximately 60% lower than in wild-type (WT) littermates. SOCS3 efficiently suppressed STAT3 and STAT5 activation by WT G-CSF-R in luciferase reporter assays. In contrast, while SOCS3 still inhibited STAT3 activation by G-CSF-R-d715, STAT5 activation was no longer affected. This was due mainly to loss of the SOCS3 recruitment site Tyr729, with an additional contribution of the internalization defects of G-CSF-R-d715. Because Tyr729 is also a docking site for the Src homology 2-containing protein tyrosine phosphatase-2 (SHP-2), which binds to and inactivates STAT5, we suggest a model in which reduced SOCS3 expression, combined with the loss of recruitment of both SOCS3 and SHP-2 to the activated receptor complex, determine the increased STAT5/STAT3 activation ratio and the resulting signaling abnormalities projected by truncated G-CSF-R mutants

Continuous Decline of Toxoplasma gondii Seroprevalence in Hospital: A 1997–2014 Longitudinal Study in Paris, France

Background: The protozoan Toxoplasma gondii presents a risk for reactivation of latent cysts in immunocompromised patients. Anti-T. gondii antibodies are therefore usually screened before chemotherapy or transplantation to propose prophylactic measures against this parasite. We analyzed the results obtained in our hospital to study the epidemiological trend of T. gondii infection.Methods: We collected all the anti-Toxoplasma antibody titers from January 1, 1997 to December 31, 2013 using the Platelia IgG ELISA assay (Bio-Rad). The results were classified as positive when titers reached a concentration of ≥10 UI/ml. Only the first result obtained at entry for each patient was considered. T. gondii seroprevalence was estimated using a multivariate logistic regression model accounting for age, sex, and year in which the sample was collected.Results: A total of 21,480 patient samples were analyzed. The seroprevalence continuously decreased over time, from 64.5% in 1997 to 54.7% in 2013 (i.e., an average of 1.3% per year, p < 0.001). The decrease was 5.0% per year for patients <20 years. After 2013, the model predicts that the seroprevalence would continuously decrease. We also observed a higher proportion of seropositive men than women in the 15- to 45-year-old group (58.5% versus 52.0%, p < 10-3).Conclusion: The overall seroprevalence of toxoplasmosis at our hospital showed an accelerating downward trend over 17 years. The reason for this continuous decline is likely associated with the lower parasite presence within meat. Thus, although young immunocompromised patients are increasingly less at risk of reactivation in the near future, older immunocompromised patients will remain at high risk of reactivation. The reasons of the higher prevalence in men remain to be explored