Molecular modeling of conformational space of the knot protein YibK

Structurally, proteins follow entropy favorable layouts that have high stability while performing their function. Knots are typically not observed due the amount of energy needed to form this structure outweighed the stability of the protein. Despite this, there are several rare proteins whose polypeptide backbone form knotted configurations. YibK is one such protein with a trefoil knot (e.g., 3-1 knot) in its carboxy terminus. These proteins reveal interesting topographies with less entropy than if the protein were compressed. In the present work, we studied the main interactions involved in the folding pathway of YibK, based on molecular dynamics (MD) simulations and computational approaches for the calculation of ion-neutral collision cross section (CCSN2). Briefly, a large pool of identity vectors was generated by MD simulations. Charge assignment was performed based on the scoring of the exposed residues, followed by energy optimization steps. In particular, the specific interactions involved in preserving the knotted structure of the protein were studied. The influence of the charge state was also assessed, as the increasing coulombic repulsion disrupts the structural integrity of the protein. Our results provide a better understanding on the interactions involved in the knotted nature of the protein

History of the Files of Editorial Censorship (1942-2017)

El presente artículo pasa revista a la historia de los expedientes de censura editorial en España desde que empezaron a gozar de tratamiento archivístico durante el verano de 1942. Se da noticia también del personal que formaba parte del Archivo General de la Vicesecretaría de Educación Popular y sus diversas secciones y metamorfosis hasta la Transición.This article reviews the history of the files of editorial censorship in Spain since they began to deserve archival treatment during the summer of 1942. News is also given of the staff that was part of the Archivo General de la Vicesecretaría de Educación Popular and its various sections and metamorphoses until the Transition

Desenvolupament d'aplicacions de realitat virtual per entrenament de les extremitats superiors

En els darrers anys s’ha vist incrementat el nombre de noticies relacionades amb la realitat virtual, la gran majoria d’aplicacions que s’han desenvolupat per a aquesta tecnologia ha sigut per l’oci; però poc a poc han anat apareixent d’altres relacionades amb altres camps d’interès, i un a destacar és el de la biomèdica, que en poc temps ha aconseguit implementar varies aplicacions de realitat virtual en tot un conjunt de camps de la medicina, com la rehabilitació pediàtrica, la rehabilitació de lesions cerebrals traumàtiques, i la rehabilitació per post vessament cerebral, per anomenar-ne algunes. Aquest treball s’emmarca en un projecte, en col·laboració amb l’Associació Diversitat Funcional d’Osona, per personalitzar i posar en marxa tractaments de rehabilitació basats en la utilització de la realitat virtual. La rehabilitació s’orienta a persones que han sofert ictus, ja que malauradament en són més de 13.000 les que ingressen als hospitals catalans cada any. Es va crear un exercici que consisteix en la realització d’un moviment d’abducció horitzontal i d’un joc que permet combinar moviments de flexió i abducció, basant-se en un ambient futurista. Per a dur a terme aquest projecte es van utilitzar varies eines de treball: un programa informàtic anomenat Unity3D (utilitzat per a crear videojocs), el sensor de moviment Kinect de Microsoft, les ulleres de realitat virtual Vive de l’empresa HTC i un programa de creació i edició de bases de dades en l’àmbit informàtic, anomenat phpMyAdmin. Aquesta aplicació, que s’ha provat en quatre persones sanes, és útil tant per pacients (podent dur a terme certs exercicis i jocs) com per professionals mèdics (aquests poden veure certs valors guardats mitjançant el sensor de moviment i així extreure les conclusions corresponents). La finalitat d’aquest projecte és permetre que els exercicis de rehabilitació siguin més lúdics i, per tant, més amens, com també més efectius

Nuevas aplicaciones de la imagen radiológica a la Antropología Física

Las nuevas técnicas de imagen de alta resolución (radiografía digital, TAC multicorte, resonancia magnética y escáner tridimensional), además de las posibilidades diagnóstico-médicas que ya se le conocen, permiten reconstruir y medir, presentándose como un instrumento de gran utilidad investigadora y docente. La aplicación de las nuevas técnicas de imagen es amplia, éstas son útiles en: 1) investigación antropológica y biomédica; 2) identificación forense; 3) realización de autopsias virtuales; 4) el paleodiagnóstico de muchas de las paleopatologías presentadas por restos esqueléticos arqueológicos de animales y humanos; y 5) en la docencia universitaria [...]

Proving termination through conditional termination

We present a constraint-based method for proving conditional termination of integer programs. Building on this, we construct a framework to prove (unconditional) program termination using a powerful mechanism to combine conditional termination proofs. Our key insight is that a conditional termination proof shows termination for a subset of program execution states which do not need to be considered in the remaining analysis. This facilitates more effective termination as well as non-termination analyses, and allows handling loops with different execution phases naturally. Moreover, our method can deal with sequences of loops compositionally. In an empirical evaluation, we show that our implementation VeryMax outperforms state-of-the-art tools on a range of standard benchmarks.Peer ReviewedPostprint (author's final draft

Documentos de Edad Moderna en el Archivo General de la Administración

Este artículo tiene como objetivo presentar al público algunas fuentes documentales custodiadas en el Archivo General de la Administración susceptibles de ser utilizadas para la investigación del Antiguo Régimen en España, tanto en su faceta interior como exterior. Se describen en él las características y posibilidades de utilización de varios conjuntos de documentos relativos a la Deuda, la Beneficencia, las representaciones de la Monarquía en el exterior, el Consejo de Guerra, los Corregimientos de Madrid y Alcalá de Henares y algunos otros recursos de información, que son complementarios de los grandes fondos de Edad Moderna conservados en los Archivos Históricos Estatales

Poder, sujeto y comunicación. La Glorieta LGBT y la marcha del orgullo gay en la provincia de San Juan

Tesis de Doctorado para obtener el título de Doctor en Comunicación Social, Universidad Nacional de Córdoba. Córdoba (inédita).La Glorieta - Espacio LGBTIQ es el colectivo social que nuclea a una parte de los miembros de las minorías sexuales de la provincia de San Juan. Mediante diversas prácticas políticas, los sujetos que pertenecen a esta organización reclaman por la reivindicación y el reconocimiento de sus derechos como ciudadanos, a la vez que luchan en contra de los patrones heteronormativos que estructuran la vida social en San Juan de manera hegemónica. Consideramos que a través de la marcha del orgullo gay, La Glorieta construye una identidad como sujeto político y un modo específico de intervención política. Sin embargo, observamos que la producción discursiva que configura la protesta en la escena pública presentaba algunas fisuras –traducidas en términos de una desarticulación hegemónica– que disminuyen su potencial para redefinir o transformar las condiciones del orden social. A partir de esta hipótesis, nos preguntamos por el modo en que este colectivo social se constituye como sujeto político-hegemónico a través de sus prácticas políticas concretas. Para comprender la lucha en torno a la orientación sexual como una configuración sociopolítica y no meramente cultural, hemos trabajado con enfoques y teorías que nos permitieron analizar cómo las identificaciones sociales/sexuales se articulan en forma dinámica y antagónica, en relación con las condiciones concretas del campo social y en medio de relaciones de poder. Nos propusimos, con nuestra investigación, conocer, analizar y reconstruir los efectos de sentido producidos por la intervención del sujeto político La Glorieta LGBTIQ en el espacio político-hegemónico de San Juan, a partir de su visibilización pública en la marcha del orgullo gay, en un período que va de 2010 a 2017. Para ello recurrimos fundamentalmente a categorías brindadas por el análisis político de discurso de Ernesto Laclau. Este enfoque ha implicado interrogar nuestro objeto de estudio desde la perspectiva de lo político y lo hegemónico como modos de producción del sentido de lo social. Analizamos la marcha del orgullo como un discurso social desde una perspectiva comunicacional que entiende la comunicación como una “puesta en común” y como un espacio común donde se da la vinculación simbólica de los individuos y la posibilidad de construcción de identificaciones y constitución de sujetos políticos. Para interpretar la potencialidad subversivo-política de las configuraciones discursivas articuladas en la protesta pensamos a la comunicación desde los vínculos tensionales que visibilizamos entre el campo político y su exterior constitutivo. Metodológicamente, hemos recurrido a una matriz de tipo cualitativo y analítico justamente para el análisis de la discursividad política en orden de interpretar significaciones y efectos de sentido de construcciones político-discursivas. Nuestro propósito ha sido aportar conocimiento teórico-empírico inexistente, hasta donde sabemos, en la provincia de San Juan y abrir un área de discusión interdisciplinaria sobre la construcción de sujetos políticos. En ese sentido, consideramos que la productividad de esta investigación radica en su contribución para cuestionar el orden social hegemónico desde una producción de conocimientos situados que aportan al análisis y la reflexión crítica sobre la potencialidad de las prácticas político-comunicativas de resistencia