Productividad científica del Paraguay en el área de biomedicina: un análisis bibliométrico

Para medir la producción científica de un país es usual que se contabilice la cantidad y calidad de artículos científicos publicados por sus investigadores. Con el objetivo de identificar la cantidad de publicaciones de autoras paraguayos indexadas en la base de datos PubMed en los últimos 20 años, determinar su distribución temporal y el aporte de las diferentes instituciones al desarrollo científico del Paraguay; se buscaron las investigaciones publicadas en el periodo 1986-2005 en PubMed, pormedio de frases unidas por conectores booleanos. El 67% (71/106) de los artículos hallados fueron publicados en los últimos 10 años (1996-2005), indicando el fortalecimiento de las ciencias biomédicas. Las tres instituciones paraguayas con mayor número de publicaciones pertenecen a la Universidad Nacional de Asunción y son el Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud (IICS), Facultad de Ciencias Médicas(FCM)y Facultad de Ciencias Químicas (FCQ) con el 39,6%,16% y 15% de todas las publicaciones, respectivamente. Es destacable el gran número de publicaciones de las dos primeras instituciones en los últimos 10 años, registrando 76% y 88% de sus publicaciones, en revistas indexadas al Medline. Finalmente, 82% de los artículos fueronpublicados en revistas que poseen factor de impacto (intervalo 0,191-4,927), dando un promedio de 1,932. Aunque es un valor bajo comparándolo con el de países limítrofes, es aceptable para unpaís en crecimiento científico. Por otra parte, pese al crecimiento lineal del número de las publicaciones anuales de autores paraguayos, la producción científica en biomedicina en el Paraguay es muy baja. Por lo tanto, creemos que es importante fomentarla, ya que la excelenciaeducativa y la salud pública son indispensables para el crecimiento socio-económico del Paraguay

Síntesis y evaluación citotoxica de derivados halogenados y peracetylados de nucleósidos en celulas de cancer de mama

Objectives. To make the synthesis of halogenated derivatives on the nitrogenous base and their respective acyl ester and amide type derivatives for all hydroxyl and amine groups of the uridine and cytarabine nucleosides, and evaluate cytotoxicity against breast cancer cell line. Methods. First, it was accomplished the halogenation reaction on the 5-position of the nitrogenous base, subsequently, the ester and amide derivatives were performed for all hydroxyl and amine group present in the nucleosides. Besides, the uridine acetonide derivatives as prepared by acid catalysis. The products were characterized by nuclear magnetic resonance spectroscopy (1H RMN y 13C RMN) and mass spectrometry in positive mode by direct injection. Derivatives were evaluated in Chinese hamster ovary (CHO-K1) and human breast cancer (MCF-7) cell lines. Results. The four derivatives were obtained with chlorine and bromine for the uridine and cytarabine, respectively, their respective per-acetylated derivatives, the per-acetylated nucleoside and the uridine acetonide; the compounds were obtained with efficiency over 90%. The per-acetylated nucleosides and the halogenated and per-acetylated derivatives did not show inhibitory effects on cell viability in MCF-7 cell line. However, the per-acetylated and halogenated derivatives presented a higher cytotoxic activity than their respective per-acetylated nucleoside. The uridine 3’,4’-acetonide showed a significant cytotoxicity on both cell lines. Conclusions. The per-acetylated nucleoside, and the respective halogenated derivatives with chlorine and bromine were obtained with high yields, nevertheless, these compounds did not exhibit a significant anti-proliferative activity (p˂0.05), possibly due to a low intra-cellular activation.Objetivos: Sintetizar derivados halogenados sobre la base nitrogenada, sus respectivos derivados tipo éster o amida de todos los grupos hidroxilo y amina presentes en los nucleósidos uridina y citarabina, y evaluar su actividad citotóxica sobre una línea celular de cáncer de mama. Metodología: primero se realizó la reacción de halogenación en la posición 5 de la base nitrogenada, posteriormente se formaron los ésteres y amidas de todos los grupos hidroxilos y amino presentes en los nucleósidos. Además, se preparó el derivado acetónido con catálisis ácida. Los compuestos se caracterizaron por espectroscopía de resonancia magnética nuclear (RMN 1H y RMN 13C) y espectrometría de masas por inyección directa en modo positivo. Los derivados se evaluaron sobre líneas celulares de tumor de Ovario de Hámster Chino (CHO) y de cáncer de mamá (MCF-7). Resultados: Se obtuvieron 4 derivados mono-halogenados con cloro y bromo de la uridina y citarabina, respectivamente, sus respectivos derivados per-acetilados, los nucleósidos per-acetilados y el acetónido de la uridina; los compuestos se obtuvieron con rendimientos superiores a 90%. Los nucleósidos per-acetilados, y los derivados per-acetilados y halogenados no exhibieron una inhibición significativa de la viabilidad celular en ambas líneas celulares, sin embargo, de estos, los derivados per-acetilados y halogenados presentaron mayor actividad citotóxica que los respectivos nucleósidos per-acetilados. El derivado acetónido de la uridina mostró citotoxicidad significativa sobre ambas líneas celulares. Conclusiones: se obtuvieron los nucleósidos per-acetilados y los respectivos derivados clorados y bromados de estos, con rendimientos altos, sin embargo, estos compuestos no exhibieron una actividad anti-proliferativa significativa (p˂0,05), posiblemente debido a una baja activación intra-celular de los nucleósidos

Sensibilidad y especificidad del método inmunocromatográfico utilizado para el diagnóstico de rotavirus

El rotavirus (RV) es el principal agente viral causante de diarrea aguda en niños menores de 5 años y es responsable de aproximadamente el 6% de las muertes en este grupo etáreo, lo que conlleva la necesidad de utilizar métodos de diagnósticos rápidos y confiables.El objetivo del estudio es evaluar la sensibilidad y especificidad del método inmunocromatográfico (ICG), en el que se basan muchos kits comerciales utilizados para el diagnóstico de rotavirus grupo A, tomando como referencia el método de electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE). Se seleccionaron muestras de heces de 317 pacientes con diarrea aguda que concurrieron a un laboratorio privado de mayo a noviembre del 2006, con pedido de análisis de rotavirus y todos los datos de los pacientes fueron manejados de manera confidencial Se utilizaron kits de las marcas comerciales Operónsimple (n=154) o SD Bioline rotavirus (n=163), siguiendo estrictamente las instrucciones del fabricante. Las muestras fueron conservadas en frío y remitidas al IICS para la realización de los estudios moleculares. La sensibilidad obtenida por el método ICG fue de 97,8% y la especificidad de 84%. La concordancia absoluta fue del 90%. Las muestras que dieron resultados discrepantes entre ICG y PAGE, fueron confirmadas por nRT-PCR,resultados que coincidieron con los obtenidos por PAGE. La sensibilidad del método ICG es muy buena, si bien la especificidad es moderada el método puede ser utilizado como screening para el diagnóstico rápido de rotavirus y sería aconsejable utilizar métodos más específicos como los moleculares para estudios epidemiológicos

Estimation of Relevant Variables on High-Dimensional Biological Patterns Using Iterated Weighted Kernel Functions

BACKGROUND The analysis of complex proteomic and genomic profiles involves the identification of significant markers within a set of hundreds or even thousands of variables that represent a high-dimensional problem space. The occurrence of noise, redundancy or combinatorial interactions in the profile makes the selection of relevant variables harder. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS Here we propose a method to select variables based on estimated relevance to hidden patterns. Our method combines a weighted-kernel discriminant with an iterative stochastic probability estimation algorithm to discover the relevance distribution over the set of variables. We verified the ability of our method to select predefined relevant variables in synthetic proteome-like data and then assessed its performance on biological high-dimensional problems. Experiments were run on serum proteomic datasets of infectious diseases. The resulting variable subsets achieved classification accuracies of 99% on Human African Trypanosomiasis, 91% on Tuberculosis, and 91% on Malaria serum proteomic profiles with fewer than 20% of variables selected. Our method scaled-up to dimensionalities of much higher orders of magnitude as shown with gene expression microarray datasets in which we obtained classification accuracies close to 90% with fewer than 1% of the total number of variables. CONCLUSIONS Our method consistently found relevant variables attaining high classification accuracies across synthetic and biological datasets. Notably, it yielded very compact subsets compared to the original number of variables, which should simplify downstream biological experimentation

Swimming Exercise Prevents Fibrogenesis in Chronic Kidney Disease by Inhibiting the Myofibroblast Transdifferentiation

BACKGROUND: The renal function of chronic kidney disease (CKD) patients may be improved by a number of rehabilitative mechanisms. Swimming exercise training was supposed to be beneficial to its recovery. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Doxorubicin-induced CKD (DRCKD) rat model was performed. Swimming training was programmed three days per week, 30 or 60 min per day for a total period of 11 weeks. Serum biochemical and pathological parameters were examined. In DRCKD, hyperlipidemia was observed. Active mesangial cell activation was evidenced by overexpression of PDGFR, P-PDGFR, MMP-2, MMP-9, α-SMA, and CD34 with a huge amount collagen deposition. Apparent myofibroblast transdifferentiation implicating fibrogenesis in the glomerular mesangium, glomerulonephritis and glomeruloscelorosis was observed with highly elevated proteinuria and urinary BUN excretion. The 60-min swimming exercise but not the 30 min equivalent rescued most of the symptoms. To quantify the effectiveness of exercise training, a physical parameter, i.e. "the strenuosity coefficient" or "the myokine releasing coefficient", was estimated to be 7.154 × 10(-3) pg/mL-J. CONCLUSIONS: The 60-min swimming exercise may ameliorate DRCKD by inhibiting the transdifferentiation of myofibroblasts in the glomerular mesangium. Moreover, rehabilitative exercise training to rescue CKD is a personalized remedy. Benefits depend on the duration and strength of exercise, and more importantly, on the individual physiological condition

American palm ethnomedicine: A meta-analysis

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Many recent papers have documented the phytochemical and pharmacological bases for the use of palms (<it>Arecaceae</it>) in ethnomedicine. Early publications were based almost entirely on interviews that solicited local knowledge. More recently, ethnobotanically guided searches for new medicinal plants have proven more successful than random sampling for identifying plants that contain biodynamic ingredients. However, limited laboratory time and the high cost of clinical trials make it difficult to test all potential medicinal plants in the search for new drug candidates. The purpose of this study was to summarize and analyze previous studies on the medicinal uses of American palms in order to narrow down the search for new palm-derived medicines.</p> <p>Methods</p> <p>Relevant literature was surveyed and data was extracted and organized into medicinal use categories. We focused on more recent literature than that considered in a review published 25 years ago. We included phytochemical and pharmacological research that explored the importance of American palms in ethnomedicine.</p> <p>Results</p> <p>Of 730 species of American palms, we found evidence that 106 species had known medicinal uses, ranging from treatments for diabetes and leishmaniasis to prostatic hyperplasia. Thus, the number of American palm species with known uses had increased from 48 to 106 over the last quarter of a century. Furthermore, the pharmacological bases for many of the effects are now understood.</p> <p>Conclusions</p> <p>Palms are important in American ethnomedicine. Some, like <it>Serenoa repens </it>and <it>Roystonea regia</it>, are the sources of drugs that have been approved for medicinal uses. In contrast, recent ethnopharmacological studies suggested that many of the reported uses of several other palms do not appear to have a strong physiological basis. This study has provided a useful assessment of the ethnobotanical and pharmacological data available on palms.</p

A quantitative synthesis of the medicinal ethnobotany of the Malinké of Mali and the Asháninka of Peru, with a new theoretical framework

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Although ethnomedically and taxonomically guided searches for new medicinal plants can improve the percentage of plants found containing active compounds when compared to random sampling, ethnobotany has fulfilled little of its promise in the last few decades to deliver a bounty of new, laboratory-proven medicinal plants and compounds. It is quite difficult to test, isolate, and elucidate the structure and mechanism of compounds from the plethora of new medicinal plant uses described each year with limited laboratory time and resources and the high cost of clinical trials of new drug candidates.</p> <p>Methods</p> <p>A new quantitative theoretical framework of mathematical formulas called "relational efficacy" is proposed that should narrow down this search for new plant-derived medicines based on the hypothesis that closely related plants used to treat closely related diseases in distantly related cultures have a higher probability of being effective because they are more likely to be independent discoveries of similar plant compounds and disease mechanisms. A prerequisite to this hypothesis, the idea that empirical testing in traditional medicine will lead to choosing similar medicinal plants and therefore the medicinal flora of two distant cultures will prove to be more similar than their general flora, is tested using resampling statistics on cross-cultural field data of the plants used by the Malinké of Mali and the Asháninka of Peru to treat the diseases malaria, African sleeping sickness, Chagas' disease, leishmaniasis, diabetes, eczema, asthma, and uterine fibroids.</p> <p>Results</p> <p>In this case, the similarity of the medicinal floras is found to be significantly greater than the similarity of the general floras, but only when the diseases in question are grouped into the categories of parasitic and autoimmune diseases.</p> <p>Conclusion</p> <p>If the central theoretical framework of this hypothesis is shown to be true, it will allow the synthesis of medicinal plant information from around the world to pinpoint the species with the highest potential efficacy to take into the laboratory and analyze further, ultimately saving much field and laboratory time and resources.</p> <p><b>Spanish abstract</b></p> <p>Las búsquedas que utilizan la etnomedicina y la taxonomía para descubrir nuevas plantas medicinales, pueden aumentar la probabilidad de éxito de encontrar compuestos químicos activos en plantas, en comparación con las búsquedas aleatorias. A pesar de lo anterior, en las últimas décadas, la etnobotánica no ha cumplido con las expectativas de proveer numerosas plantas medicinales y químicos nuevos una vez examinados en el laboratorio. Cada año se describen una plétora de plantas medicinales y sus usos, sin embargo las limitaciones de tiempo y recursos en los laboratorios, unidos al alto coste de los ensayos clínicos de las drogas potenciales, hacen muy difícil probar, aislar, y elucidar la estructura y el mecanismo de los compuestos de estas plantas. Se propone un nuevo marco teórico cuantitativo cuyo fin es focalizar la búsqueda de nueva plantas medicinales. Este marco teórico está basado en la hipótesis que las plantas cercanamente relacionadas, usadas para tratar enfermedades cercanamente relacionadas en culturas distantemente relacionadas, tienen una eficacia potencial más alta, debido a que es más probable que estos hallazgos sean descubrimientos independientes de compuestos químicos similares. Parte de esta hipótesis, que las escogencias racionales se hacen para elegir plantas medicinales similares y que la flora medicinal de dos culturas distantes es más similar que su flora general, se probó usando métodos estadísticos de remuestreo con datos de campo de la comunidad Malinké de Malí y de la Asháninka de Perú, y las enfermedades de paludismo, enfermedad africana del sueño, enfermedad de Chagas, leishmania, diabetes, eczema, asma, y fibromas uterinos. Se encontró, en este caso, que la similitud de las floras medicinales es significativamente mayor a la similitud de las floras generales, solamente cuando las enfermedades analizadas se agruparon en las categorías de enfermedades parasitarias y enfermedades autoinmunes. Si se demostrara que las otras partes de esta hipótesis son ciertas, se podría sintetizar la información sobre plantas medicinales alrededor del mundo, para establecer así las plantas potencialmente más eficaces para llevarlas al laboratorio y analizarlas más profundamente.</p> <p><b>French abstract</b></p> <p>Par rapport aux recherches menées de façon aléatoire, les recherches effectuées par des critères ethnobotaniques et taxonomiques ont de meilleures chances à découvrir de nouvelles plantes médicinales à produit chimique actifs. Pendant les dernières décennies pourtant, l'ethnobotanique a réalisé peu de ces promesses à révéler un grand nombre de plantes médicinales et de nouveaux produits chimiques, testés au laboratoire. Avec les ressources limitées pour la recherche au laboratoire et le coût élevé des épreuves cliniques pour trouver de nouveaux candidats aux médicaments, il est difficile d'étudier, d'isoler et d'élucider la structure et le mécanisme des produits chimiques de chacune des nombreuses plantes médicinales (et les utilisations de ces plantes) décrites chaque année. Nous proposons une nouvelle technique théorique et quantitative pour préciser la recherche de nouvelles plantes médicinales; elle est basée sur l'hypothèse que les plantes étroitement apparentées, employées pour traiter les maladies étroitement apparentées dans les cultures très éloignées les unes des autres, ont une potentialité d'efficacité supérieure parce qu'elles représentent la découverte indépendante des propriétés chimiques semblables des plantes. Une partie de cette hypothèse-qui démontre que la sélection des plantes médicinales semblables est un choix rationnel et qu'il y a davantage de ressemblance dans la flore médicinale de deux cultures éloignées que dans leur flore générale-est examinée par un re-échantillonnage des données de recherches effectuées parmi les Malinké au Mali et les Asháninka au Pérou, en particulier sur la malaria, la maladie africaine du sommeil, la maladie de Chagas, la leishmania, le diabète, l'eczéma, l'asthme et les fibromes utérins. Dans ces cas précis, la similitude de la flore médicinale s'avère sensiblement plus grande que la similitude de la flore générale, mais seulement quand les maladies en question sont regroupées ensemble comme maladies parasitaires et auto-immunitaires. Si cette hypothèse est prouvée, elle permettra la synthèse des informations recueillies sur les plantes médicinales du monde entier pour en sélectionner de façon plus précise celles qui sont les plus efficaces et qui méritent analyse plus approfondie au laboratoire.</p> <p><b>Asháninka abstract</b></p> <p>Aayiantyarori iròpero aavintane, ontzimatye ancovacovatero ayotero ovaqueraripaye incashi iyoyetziri ashaninka, ayotzityaro aajatzi iyotane viracocha paitachari "quimica" ancantero aaca oshintsinka inchashipaye. Atziri yotacotzirori cametsa, ishtoriajacotzirori iyotane ashaninkapaye te iroñàrantero maaroni ocaratzi yamenacotaqueri laboratorioki. Aaviantyarori cametsa, ayotacotero aavintarontsiyetatsiri osamani antzimaventero ishtoriatacotaro, aajatzi osheki opinata ampinaventero aparopaye inchashi, acoviriqui ayotacotero, osaretsikipaye. Tzimatsi ovaquerari quenquishiriantsitatsiri ero opinata osheki ashitoriatacotero aparopaye inchashi, asampiyetatyrey pashinipaye atziri saicatsiri intaina puitarika inchasshi yavintari, ajatzirica oshiyaro ayotzi aaca, quemetachari atziri saikatsiri nampitsiki malinke aajatzi ishiyari ashaninka saicatsiri peruki, tzimatsi inchashi aajatzi yaavintari osheki okamètsatzi aririka anteri mantsiyarentsi icantaitziri ompetarentsi catsirentsi, pochokirentsi, patsarontsi(matatsi) ashipetate maaroni, ampochavathate, ancainikentsite, oncatsithakite tsinani. Aririka añaker aajatzi ahiyaro inchashi yaavintayetari pashinipaye atziri intainasatzi irdotake ahitoriatacoperoteri anàashityard aavintarontsi ovamairiri shithanentsi, onàshitaavintarontsi tzicaacoventairi ero antane mantsiyarentsi. Omanperotatyarica iròperotzi avintarontsi, oshitovake laboratorioki aritaque iyoitanaquero maaroni quipatsiki iroperori avintarontsi.</p