APLICAÇÃO DA TÉCNICA DO DNA BARCODING NA IDENTIFICAÇÃO DE ESPÉCIES DE MORCEGOS ATROPELADOS NA BR 101 NA RESERVA BIOLÓGICA DE SOORETAMA-ES

O DNA barcoding (código de barras de DNA) é uma técnica muito utilizada em estudos genéticos com animais que utiliza iniciadores universais para amplificar uma região específica do DNA mitocondrial. Esta técnica propicia a identificação de espécies que são encontradas muito danificadas, cuja identificação morfológica é praticamente impossível, principalmente de espécies de pequeno porte. O presente trabalho utilizou o DNA barcoding para a identificação de 33 amostras de espécies de morcegos atropeladas na Reserva Biológica de Sooretama-ES, uma região que tem um grande impacto, devido aos atropelamento causado pelo constante tráfego de carros que passam pela BR 101 que corta transversalmente a mesma. Para a identificação dos animais foi feita uma extração do DNA das amostras, e a subunidade I do gene COI do DNA mitocondrial foi amplificado por PCR, sendo em seguida sequenciado. Posteriormente, as amostras identificadas foram confrontadas no banco de dados BOLD. Foram selecionadas 33 amostras de DNA, e 27 dessas renderam sequenciamento adequado que permitiram a identificação dos animais, após o confronto das sequências de nucleotídeos geradas com o banco de dados BOLD. Deste modo, 17 espécies de morcegos foram identificadas

AVALIAÇÃO MOLECULAR E QUÍMICA DA PFAFFIA SPP. (GINSENG- BRASILEIRO) COMERCIALIZADO NO MERCADO BRASILEIRO POR DNA BARCODING E CROMATOGRAFIA EM CAMADA DELGADA

Plantas da espécie Pfaffia são amplamente comercializadas em território nacional e são popularmente conhecidas como Ginseng-brasileiro. Porém, a falta de identificação correta das espécies comercializadas tem gerado fraudes no comércio e expondo a população ao risco, fazendo-se necessário desenvolvimento de novas metodologias de identificação. Nesse projeto, identificou-se  geneticamente, utilizando o código de barras de DNA, e quimicamente, utilizando a técnica de Cromatografia em Camada Delgada (CCD) espécimes de Ginseng-brasileiro vendidas no mercado nacional e comparaou com espécimes de referências botanicamente identificadas. Foi possível identificar fraude na venda dos fitoterápicos em questão em pelo menos três amostras comerciais, as quais continham uma espécie diferente da descrita no rótulo. As metodologias de análise por CCD e DNA barcoding foram complementares, e podem ser propostas como alternativa no controle de qualidade destes fitoterápicos

Molecular dynamics of the COVID-19 pandemic in Espirito Santo (Brazil) and border States

This study represents the first overview of the epidemiological dynamics of SARS-CoV-2 in Espirito Santo (ES) State, Brazil, filling in knowledge on this topic, observing data collected in the State, and aiming at understanding the epidemiological dynamics of the virus in ES, as well as its possible routes of transmission and dissemination. . Our results highlight that, so far, nine lineages have been identified with ES State. The B.1.1.33 lineage was the first with the highest occurrence in ES, remaining predominant until September 2020. The second predominant lineage was Gamma, representing 45% of the samples. The Delta lineage appears on the State scene, proving to be the next dominant lineage. This research allowed us to understand how the lineages advanced and were distributed in the State, which is important for future work, also making it possible to guide sanitary control measures. Data analyses were made through the GISAID database for ES State showed that the pandemic in the State has been evolving dynamically with lineage replacements over the months since the first notification

LABORATORIO DE INVESTIGACIÓN DE PATERNIDAD FCFAR-UNESP: HISTÓRICO Y ATUALIDADES

O Laboratório de Investigação de Paternidade – FCFAr-UNESP – realiza, desde 2001, uma atividade de extensão universitária conforme o 3º. artigo da Resolução UNESP nº. 53 de 03 de novembro de 2004, classificado na área de Direitos Humanos, o qual envolve prestação de serviços à comunidade, formação de recursos humanos altamente qualificados e desenvolvimento científico institucional. Essa prestação de serviço à comunidade é realizada com recursos tecnológicos avançados e controle de qualidade de padrão internacional, colocando à disposição os resultados de pesquisas de interesse na identificação humana pelo DNA. O laboratório oferece um serviço extremamente qualificado por um preço justo, permitindo que a população de menor poder aquisitivo tenha acesso a exames dessa natureza.  The Laboratory of Investigation on Paternity - FCFAr-UNESP performs an outreach university activity according to 53, UNESP Resolution article 3 , published on November 3, 2004. This article is classified in Human Rights area involving community services, training highly qualified human resources and scientific development. This kind of service is performed with advanced technological resources and quality control similar to the international standard. in human identification by DNA research results are available . The laboratory offers a highly qualified service at a fair price, allowing the low-income population access to such tests.El Laboratorio de Investigación de Paternidad - FCFAr-UNESP realiza una actividad de extensión universitaria de acuerdo con el artículo tercero de la Resolución N. UNESP 53, 03 de noviembre 2004, que se clasifica en el área de Derechos Humanos, que involucra la prestación de servicios comunitarios, la formación de recursos humanos altamente calificados y el desarrollo científico. Este tipo de servicio se realiza con recursos tecnológicos avanzados y control de calidad similar a la norma internacional, poniendo, así, a disposición los resultados de la investigación en la identificación humana por el ADN. El laboratorio ofrece un servicio altamente cualificado a un precio justo, lo que permite el acceso de la población de bajos ingresos a dichas pruebas

LABORATORIO DE INVESTIGACIÓN DE PATERNIDAD FCFAR-UNESP: HISTÓRICO Y ATUALIDADES

O Laboratório de Investigação de Paternidade – FCFAr-UNESP – realiza, desde 2001, uma atividade de extensão universitária conforme o 3º. artigo da Resolução UNESP nº. 53 de 03 de novembro de 2004, classificado na área de Direitos Humanos, o qual envolve prestação de serviços à comunidade, formação de recursos humanos altamente qualificados e desenvolvimento científico institucional. Essa prestação de serviço à comunidade é realizada com recursos tecnológicos avançados e controle de qualidade de padrão internacional, colocando à disposição os resultados de pesquisas de interesse na identificação humana pelo DNA. O laboratório oferece um serviço extremamente qualificado por um preço justo, permitindo que a população de menor poder aquisitivo tenha acesso a exames dessa natureza.  The Laboratory of Investigation on Paternity - FCFAr-UNESP performs an outreach university activity according to 53, UNESP Resolution article 3 , published on November 3, 2004. This article is classified in Human Rights area involving community services, training highly qualified human resources and scientific development. This kind of service is performed with advanced technological resources and quality control similar to the international standard. in human identification by DNA research results are available . The laboratory offers a highly qualified service at a fair price, allowing the low-income population access to such tests.El Laboratorio de Investigación de Paternidad - FCFAr-UNESP realiza una actividad de extensión universitaria de acuerdo con el artículo tercero de la Resolución N. UNESP 53, 03 de noviembre 2004, que se clasifica en el área de Derechos Humanos, que involucra la prestación de servicios comunitarios, la formación de recursos humanos altamente calificados y el desarrollo científico. Este tipo de servicio se realiza con recursos tecnológicos avanzados y control de calidad similar a la norma internacional, poniendo, así, a disposición los resultados de la investigación en la identificación humana por el ADN. El laboratorio ofrece un servicio altamente cualificado a un precio justo, lo que permite el acceso de la población de bajos ingresos a dichas pruebas

Laboratório de Investigação de Paternidade FCFAr-UNESP: Histórico e Atualidades

Normal 0 21 MicrosoftInternetExplorer4 O Laboratório de Investigação de Paternidade - FCFAr-UNESP - realiza, desde 2001, uma atividade de extensão universitária conforme o 3º. artigo da Resolução UNESP nº. 53 de 03 de novembro de 2004, classificado na área de Direitos Humanos, o qual envolve prestação de serviços à comunidade, formação de recursos humanos altamente qualificados e desenvolvimento científico institucional. Essa prestação de serviço à comunidade é realizada com recursos tecnológicos avançados e controle de qualidade de padrão internacional, colocando à disposição os resultados de pesquisas de interesse na identificação humana pelo DNA. O laboratório oferece um serviço extremamente qualificado por um preço justo, permitindo que a população de menor poder aquisitivo tenha acesso a exames dessa natureza.  </p

Laboratório de investigação de paternidade – FCF-UNESP: histórico e atualidades

Introdução: Desde os primórdios da civilização, o homem busca suas raízes biológicas, hoje, a determinação de vínculo biológico é direito do cidadão. A identificação humana pelo DNA tornou-se ferramenta importantíssima na determinação de paternidade e/ou vínculo biológico em perícias forenses. O laboratório iniciou suas atividades de extensão à comunidade em março de 2001, realizando perícias de investigação de paternidade com tecnologia avançada na análise de DNA, uma prestação de serviços necessária devido à grande procura por parte do Poder Público para esclarecimento de processos jurídicos para determinação da identidade biológica do indivíduo e relação de vínculo genético com os ascendentes. Objetivos: O laboratório oferece um serviço extremamente qualificado e por um preço justo, permitindo que a população de menor poder aquisitivo também tenha acesso a esses tipos de exames, usufruindo dos recursos humanos altamente qualificados envolvidos na elaboração das perícias. A equipe do Laboratório (bolsistas de iniciação científica, mestrandos e doutorandos) também desenvolve pesquisas na área de genética de populações, publicadas em revistas internacionais de alto impacto, incrementando as informações técnico-científicas na área de identificação humana pelo DNA e ampliando os dados estatísticos da população de Araraquara e região, ainda muito incipientes no Brasil. Métodos: A metodologia e reagentes empregados no exame obedecem aos padrões consensuais na área de Identificação Humana. Anualmente participamos do controle de qualidade do GEP-ISFG (Grupo Espanhol e Português da International Society of Forensic Genetics). O Laboratório oferece distintas possibilidades técnicas para a determinação de paternidade, uma vez que esta pode ser realizada utilizando-se amostra do suposto pai ou de indivíduos relacionados a este. Para tanto, utiliza as análises de 16 STRs autossômicos, e sempre que necessário, as regiões 12 Y-STRs, 10 X-STRs e do DNA mitocondrial. Todo o recurso arrecadado é recolhido pela Seção de Finanças, sendo 15% do montante repassado para o PADC-CPP. Resultados: Até o momento: 210 Perícias para determinação do vínculo genético: 45% judiciais e 55% particulares, 82,96% Trio completo, 6,6% Ausência da Mãe e Reconstrução, 3,84% Perícias Criminais e Coleta de sangue para o MESC: mais de 2.200 indivíduos e 2 mutirões (400 famílias/ mutirão). Publicações Internacionais - 10, Eventos Científicos – 31: 08 Internacionais, 03 Prêmios.Resumo: O Laboratório de Investigação de Paternidade – FCF-UNESP trata-se de atividade de extensão universitária envolvendo a prestação de serviços à comunidade, a formação de recursos humanos altamente qualificados e o desenvolvimento científico institucional

Laboratório de investigação de paternidade – FCF-UNESP: histórico e atualidades

Introdução: Desde os primórdios da civilização, o homem busca suas raízes biológicas, hoje, a determinação de vínculo biológico é direito do cidadão. A identificação humana pelo DNA tornou-se ferramenta importantíssima na determinação de paternidade e/ou vínculo biológico em perícias forenses. O laboratório iniciou suas atividades de extensão à comunidade em março de 2001, realizando perícias de investigação de paternidade com tecnologia avançada na análise de DNA, uma prestação de serviços necessária devido à grande procura por parte do Poder Público para esclarecimento de processos jurídicos para determinação da identidade biológica do indivíduo e relação de vínculo genético com os ascendentes. Objetivos: O laboratório oferece um serviço extremamente qualificado e por um preço justo, permitindo que a população de menor poder aquisitivo também tenha acesso a esses tipos de exames, usufruindo dos recursos humanos altamente qualificados envolvidos na elaboração das perícias. A equipe do Laboratório (bolsistas de iniciação científica, mestrandos e doutorandos) também desenvolve pesquisas na área de genética de populações, publicadas em revistas internacionais de alto impacto, incrementando as informações técnico-científicas na área de identificação humana pelo DNA e ampliando os dados estatísticos da população de Araraquara e região, ainda muito incipientes no Brasil. Métodos: A metodologia e reagentes empregados no exame obedecem aos padrões consensuais na área de Identificação Humana. Anualmente participamos do controle de qualidade do GEP-ISFG (Grupo Espanhol e Português da International Society of Forensic Genetics). O Laboratório oferece distintas possibilidades técnicas para a determinação de paternidade, uma vez que esta pode ser realizada utilizando-se amostra do suposto pai ou de indivíduos relacionados a este. Para tanto, utiliza as análises de 16 STRs autossômicos, e sempre que necessário, as regiões 12 Y-STRs, 10 X-STRs e do DNA mitocondrial. Todo o recurso arrecadado é recolhido pela Seção de Finanças, sendo 15% do montante repassado para o PADC-CPP. Resultados: Até o momento: 210 Perícias para determinação do vínculo genético: 45% judiciais e 55% particulares, 82,96% Trio completo, 6,6% Ausência da Mãe e Reconstrução, 3,84% Perícias Criminais e Coleta de sangue para o MESC: mais de 2.200 indivíduos e 2 mutirões (400 famílias/ mutirão). Publicações Internacionais - 10, Eventos Científicos – 31: 08 Internacionais, 03 Prêmios.Resumo: O Laboratório de Investigação de Paternidade – FCF-UNESP trata-se de atividade de extensão universitária envolvendo a prestação de serviços à comunidade, a formação de recursos humanos altamente qualificados e o desenvolvimento científico institucional

Análise de polimorfismos do DNA mitocondrial em indivíduos residentes na grande São Paulo para aplicação na identificação humana

A identificação humana por meio da análise de DNA utiliza o perfil genético de um indivíduo baseado na combinação de diversos marcadores que são herdados de seus progenitores. Estes marcadores são geralmente diferenças nas sequências de DNA nuclear entre os indivíduos (polimorfismos). Em alguns casos, entretanto, a análise do DNA nuclear não pode ser aplicada. Isso ocorre quando o DNA da amostra apresenta-se degradado ou em casos onde o material biológico não apresenta o DNA nuclear. Nestes casos, a análise do DNA mitocondrial (DNA mt) é o método de escolha. Entretanto, em um mesmo indivíduo podem existir populações de DNA mt diferentes, fenômeno denominado heteroplasmia. Este trabalho teve como objetivo o estudo de polimorfismos presentes no DNA mt de indivíduos residentes na Grande São Paulo para aplicação na Identificação Humana. Para isso, foi sequenciada toda a região hipervariável do DNA mt de 160 indivíduos. Além disso, o SNP 3010 foi analisado por discriminação alélica (PCR em tempo real) para estudo do aumento do poder discriminatório quando os indivíduos não puderam ser diferenciados pela análise da região hipervariável. Foi desenvolvido, também, uma reação de SNaPshot em multiplex contendo 42 SNPs que permitiram a classificação das amostras em haplogrupos do DNA mt. Por fim, foram analisadas 100 amostras de cabelo dos mesmos indivíduos para o estudo da frequência de heteroplasmia na região HV3 do DNA mt. De um total de 160 amostras, 144 haplótipos diferentes foram encontrados quando analisamos toda a região hipervariável do DNA mt; 131 haplótipos foram únicos. O SNP 3010 foi suficientemente discriminatório para conseguir distinguir indivíduos que apresentavam o mesmo haplótipo em dois dos treze casos que apresentavam mais de um indivíduo com o mesmo haplótipoThe human identification by DNA analysis uses the genetic profile of an individual based on the combination of diverse markers that are inherited of its ancestors. These markers are generally differences in sequences of nuclear DNA between individuals (polymorphisms). In some cases, however, the analysis of the nuclear DNA cannot be applied. It occurs when the DNA sample is degraded or in cases which the biological material does not content nuclear DNA. In these cases, the mitochondrial DNA (mtDNA) analysis is the choice method. However, inside one individual can exist different mtDNA populations, phenomenon called heteroplasmy. The aim of this work was to study mtDNA polymorphisms in individuals residents in São Paulo metropolitan area for application in Human Identification. For this, we have sequenced the entire hypervariable region of mtDNA for 160 individuals. Furthermore, the SNP 3010 was analyzed by allelic discrimination (Real-Time PCR) to study the increase of the discriminatory power when individuals could not be differentiated by analysis of the hypervariable region. It was developed also, a SNaPshot multiplex reaction containing 42 SNPs that allowed the classification of samples in mtDNA haplogroups. Finally, 100 hair samples, from the same individuals, were analyzed for the study of heteroplasmy frequency in the HV3 region of mtDNA. Among 160 samples, 144 different haplotypes were found when the entire hypervariable region of mtDNA was analyzed; 131 haplotypes were unique. The SNP 3010 SNP was able to distinguish individuals who had the same haplotype in two of thirteen cases with more than one individual with the same haplotype. Our population was classified in 46.6% of African, 27.3% of European, 25.5% of Native American and 0.6% Asian origin using the SNaPshot panel of 42 SNPs in multiplexConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq

Utlização do DNA mitocondrial no contexto forense brasileiro

A identificação humana através da análise de DNA utiliza o perfil genético de um indivíduo baseado na combinação de diversos marcadores que são herdados de seus progenitores. Esses marcadores são geralmente diferenças nas seqüências de DNA nuclear entre os indivíduos (polimorfismos). Em alguns casos, entretanto, a análise do DNA nuclear não pode ser aplicada. Isso ocorre quando o DNA da amostra apresenta-se degradado ou em casos onde o material biológico não apresenta o DNA nuclear. Nestes casos, a análise do DNA mitocondrial (DNA mt) é o método de escolha. Entretanto, em um mesmo indivíduo podem existir populações de DNA mt diferentes, fenômeno denominado heteroplasmia. Este trabalho teve como objetivo o estudo da freqüência de heteroplasmia no DNA mt extraído de amostras de cabelo, quando comparado ao DNA mt contido no sangue dos mesmos indivíduos; análise da terceira região hipervariável (HV3) do DNA mt em amostras de sangue para estudo do seu poder discriminatório em nossa população; e aplicação da técnica de análise do DNA mt em vestígios biológicos. Para isso foram seqüenciadas as regiões hipervariáveis HV1 e HV2 em amostras de cabelo e sangue de 100 indivíduos, além do sequenciamento da região hipervariável HV3 em amostras de 150 indivíduos, todos residentes na Grande São Paulo. Uma freqüência de 10,5% de heteroplasmia foi encontrada em amostras de cabelo, e uma diversidade haplotípica de 0,8233 e probabilidade de semelhança de 0,1822 na região HV3 do DNA mt em amostras de sangue. Os resultados obtidos estão de acordo com os resultados relatados em outras populações e permitem sua aplicação no contexto forense brasileiro.The human identification by DNA analysis uses the genetic profile of an individual based on the combination of diverse markers that are inherited of its ancestors. These markers are generally differences in sequences of nuclear DNA between individuals (polymorphisms). In some cases, however, the analysis of the nuclear DNA cannot be applied. It occurs when the DNA sample is degraded or in cases which the biological material does not content nuclear DNA. In these cases, the mitocondrial DNA (mtDNA) analysis is the choice method. However, inside one individual can exist different mtDNA populations, phenomenon called heteroplasmy. The objective of this work was to study the frequency of heteroplasmy in extracted mtDNA from hair, when compared with mtDNA contained in the blood of the same individuals; and to analysis the third hypervariable region (HV3) of mtDNA in blood samples to study its discriminatory power in our population. For it, hypervariable regions HV1 and HV2 in hair and blood samples from 100 individuals had been sequenced, beyond the sequencing of hypervariable region HV3 in 150 individuals samples, inhabitants of Grande São Paulo. A heteroplasmic frequency of 10.5% was found in hair samples, and a haplotype diversity of 0.8233 and a random match probability of 0.1822 were found in the HV3 region of mtDNA in blood samples. These results are in agreeing with those obtained from other populations and allow its application in the Brazilian forensic context.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES