MORPHOPHYSIOLOGICAL AND MOLECULAR ANALYSIS IN THE DIFFERENTIATION OF Colletotrichum gloeosporioides ISOLATES FROM CASHEW AND MANGO TREES

A antracnose tem causado significantes danos à produção, necessitando deestudos mais profundos que contribuam para um controle mais eficiente dadoença. O presente trabalho objetivou analisar métodos morfofisiológicos emoleculares para diferenciação de isolados de Colletotrichum gloeosporioidesobtidos de cajueiro e mangueira. Os diferentes métodos taxonômicos usadosmostraram ser eficientes na caracterização intra–específica. Os isoladosexibiram variação na morfologia dos conídios, forma dos apressórios, produçãode setas, crescimento micelial, esporulação e compatibilidade vegetativa,permitindo a caracterização em nível intra–específico, mas não constituemcritérios eficientes para separação em relação a especificidade hospedeira. Apatogenicidade foi o parâmetro que melhor definiu os isolados de C.gloeosporioides de acordo com os hospedeiros. Do mesmo modo, os métodosmoleculares também mostraram sua eficiência na diferenciação dos isoladosde C. gloeosporioides em relação a especificidade hospedeira. Na análise daregião ITS do DNA ribossômico, todos os isolados amplificaram com osprimers CgInt e ITS4, confirmando que eles pertenciam a espécie C.gloeosporioides. Os resultados do presente estudo sugerem que os métodosbaseados na patogenicidade, análises de isoenzimas e RAPD são efetivospara a diferenciação dos isolados de C. gloeosporioides do cajueiro e mangueira

Câncer de esôfago e seus aspectos clínicos e terapêuticos: um relato de caso / Esophageal cancer and its clinical and therapeutic aspects: a case report

O presente artigo objetivou apresentar o caso clínico de um paciente transferido para centro terciário de atenção à saúde com queixas de disfagia, perda ponderal expressiva e rouquidão, sendo, posteriormente, diagnosticado com câncer de esôfago. Trata-se, então, de estudo descritivo, do tipo relato de caso, que visou analisar as principais características clínicas referidas pelo paciente em questão e o manejo terapêutico, além de traçar comparativos com a literatura. O câncer de esôfago (CE) é uma displasia de alta malignidade e ocupa o sétimo lugar entre as neoplasias mais incidentes e, dentre estas, a que detém o sexto lugar em termos de mortalidade. Sintomas como rouquidão, odinofagia, dor retroesternal, náuseas, vômitos, perda ponderal, sensação de empachamento e disfagia são observados em certos casos, sendo que perda do apetite, fadiga e mal-estar são considerados os de maior gravidade por alguns estudos. Diversos estudos são realizados com o intuito de estabelecer o melhor tratamento para o CE. Nessa perspectiva, e observando-se a conduta empregada neste relato de caso, ressalta-se o estudo CROSS, pautado pelo emprego de terapia neoadjuvante, seguida da cirurgia para a ressecção da neoplasia, que apontou uma maior sobrevida global dos doentes, além de incutir em uma menor mortalidade por CE na população analisada. Frente à agressividade do tumor, há perspectivas de que o cuidado do doente seja cada vez mais pautado pelas evidências científicas, trazendo benefícios potenciais para a qualidade de vida do paciente

Rationale, study design, and analysis plan of the Alveolar Recruitment for ARDS Trial (ART): Study protocol for a randomized controlled trial

Background: Acute respiratory distress syndrome (ARDS) is associated with high in-hospital mortality. Alveolar recruitment followed by ventilation at optimal titrated PEEP may reduce ventilator-induced lung injury and improve oxygenation in patients with ARDS, but the effects on mortality and other clinical outcomes remain unknown. This article reports the rationale, study design, and analysis plan of the Alveolar Recruitment for ARDS Trial (ART). Methods/Design: ART is a pragmatic, multicenter, randomized (concealed), controlled trial, which aims to determine if maximum stepwise alveolar recruitment associated with PEEP titration is able to increase 28-day survival in patients with ARDS compared to conventional treatment (ARDSNet strategy). We will enroll adult patients with ARDS of less than 72 h duration. The intervention group will receive an alveolar recruitment maneuver, with stepwise increases of PEEP achieving 45 cmH(2)O and peak pressure of 60 cmH2O, followed by ventilation with optimal PEEP titrated according to the static compliance of the respiratory system. In the control group, mechanical ventilation will follow a conventional protocol (ARDSNet). In both groups, we will use controlled volume mode with low tidal volumes (4 to 6 mL/kg of predicted body weight) and targeting plateau pressure <= 30 cmH2O. The primary outcome is 28-day survival, and the secondary outcomes are: length of ICU stay; length of hospital stay; pneumothorax requiring chest tube during first 7 days; barotrauma during first 7 days; mechanical ventilation-free days from days 1 to 28; ICU, in-hospital, and 6-month survival. ART is an event-guided trial planned to last until 520 events (deaths within 28 days) are observed. These events allow detection of a hazard ratio of 0.75, with 90% power and two-tailed type I error of 5%. All analysis will follow the intention-to-treat principle. Discussion: If the ART strategy with maximum recruitment and PEEP titration improves 28-day survival, this will represent a notable advance to the care of ARDS patients. Conversely, if the ART strategy is similar or inferior to the current evidence-based strategy (ARDSNet), this should also change current practice as many institutions routinely employ recruitment maneuvers and set PEEP levels according to some titration method.Hospital do Coracao (HCor) as part of the Program 'Hospitais de Excelencia a Servico do SUS (PROADI-SUS)'Brazilian Ministry of Healt

Avaliação fisiológica e aplicação de ddPCR (differential display PCR) em genótipos diplóides (AA) de bananeira (Musa ssp.) submetidos ao estresse salino

O Nordeste do Brasil, maior produtor nacional de banana, apresenta como fator limitante a grande extensão de solos salinos. A urgência no desenvolvimento de cultivares tolerantes a salinidade tem levado programas de melhoramento genético da cultura a classificar os genótipos diplóides de bananeira em tolerantes e sensíveis, por serem considerados materiais genéticos viáveis para polinização de cultivares triplóides e tetraplóides. De modo geral, o presente trabalho buscou caracterizar genótipos diplóides pertencentes ao grupo genômico AA de bananeira quanto a salinidade além de identificar genes diferencialmente expressos nos genótipos contrastantes. Na primeira fase desta pesquisa, foi avaliado o crescimento vegetativo e o acúmulo de íons inorgânicos em 19 genótipos diplóides (AA) de bananeiras submetidas a estresse salino. Os genótipos foram cultivados em casa de vegetação e submetidos à irrigação com água não salina (0 mM de NaCl) ou águasalina (100 mM de NaCl) durante um período de 21 dias, quando foi coletado o experimento. Para a avaliação fisiológica, foram considerados os parâmetros de crescimento: área foliar, altura, nº de folhas, diâmetro do pseudocaule, peso da matéria fresca e peso da matéria seca; enquanto que a avaliação química observou a concentração dos íons sódio, potássio, cloro, magnésio e cálcio no limbo foliar, pseudocaule e raiz/rizoma. A adição de NaCl à solução de cultivo, provocou, de modo geral, redução no crescimento expresso pela altura, formação de novas folhas, área foliar, diâmetro do pseudocaule e produção de matéria fresca e seca, provavelmente devido a fatores como: o efeito tóxico dos íons que foram absorvidos; o baixo potencial osmótico e hídrico das células; bem como a utilização de energia metabólica no processo de ajustamento osmótico. Na avaliação química, foi possívelobservar que a concentração dos íons foi preferencialmente no tecido radicular, reafirmando tratar-se de uma cultura moderadamente tolerante a salinidade. Os íonssódio e cloro aumentaram significativamente frente ao incremento salino nas diferentes partes da planta, enquanto o potássio sofreu redução no limbo foliar e no pseudocaule, possivelmente por estar associado a competição com o íon sódio levando a conclusão de que o acúmulo diferencial de íons potencialmente tóxicos (sódio e cloro) e a manutenção do potássio, contribuem para a tolerância à salinidade em bananeira. A partir da análise fisiológica e por meio da sintomatologia de toxidez provocada pelo NaCl, foi possível observar que os efeitos foram menos intensos nos genótipos Birmânia e Khai Nai On, do que no Sowmuk, indicando possíveis plantas a serem utilizadas nos programas de melhoramento da cultura como tolerantes e sensível, respectivamente. Sete genótipos foram selecionados para caracterização por meio de marcadores moleculares RAPD, buscando-se relacionar as respostas fisiológicas ao estresse salino com a formação de grupos.Foram testados 16 primers randômicos. Os resultados moleculares mostram uma ampla variabilidade genética entre os sete genótipos estudados. A formação dos agrupamentos, em parte correspondeu aos dados obtidos na avaliação fisiológica, mantendo em um mesmo grupo os genótipos Birmânia e Khai Nai On. Estes genótipos que apresentaram maior tolerância ao estresse salino, quando comparados com a mais sensível ao sal (Showmuk), mostraram-se distantes geneticamente, o que vem a demonstrar a possibilidade de utilização deste marcador molecular no estudo da diversidade genética para esta espécie. Para o estudo do genoma funcional, ou transcriptoma, o presente trabalho objetivou a detecção das possíveis alterações no padrão de genes expressos nos três genótipos diplóides (AA) de bananeira, Khai Nai On, Birmânia e Sowmuk, com respostascontrastantes quando na ausência e presença de alta concentração salina. A técnica de Differential Display PCR – ddPCR foi utilizada para identificar e comparar regiões de bandas de fragmentos de cDNA em gel de agarose. Um total de 43 fragmentosde cDNA diferencialmente expressos foram gerados a partir da combinação de quatro primers âncoras e seis primers aleatórios. Dentre os transcritos, 30 foram expressos unicamente pelos genótipos Birmânia e Kha Nai On, e 13 apenas pelo genótipo Sowmuk. As regiões de bandas com maior consistência de formação, encontraram-se entre 4000 pb e 150 pb. Pelos resultados deste trabalho, foi possível identificar alguns fragmentos potencialmente envolvidos em respostas à condição de salinidade em bananeira. O isolamento, purificação e sequenciamento destes –Expressed sequence tags - ESTs poderá auxiliar no desenvolvimento de novos cultivares de bananeira, mais adaptados ao estresse salino, além de enriquecer a base de dados de bancos públicos de seqüências de genomas funcionais.The Northeast of Brazil, major national producer of bananas, presents as a major limiting factor the stretch of saline soil. The urgency in the development of tolerant cultivars to salinity has led to breeding programs with the aimed to differ the bananas cultivars in diploid genotypes tolerant and sensitive, to be considered viable genetic material for pollination of triploid and tetraploid cultivars. Generally, the present study aimed to characterize diploid genotypes belonging to the AA banana genomic group on salinity and identify genes differentially expressed in contrasting genotypes. At first, this research assessed the growth and accumulation of inorganic ions in 19 diploid genotypes (AA) of bananas subjected to salt stress. The genotypes were grown in a greenhouse and submitted to irrigation with no saline water (0 mM NaCl) or with saline water (100 mM NaCl) for a period of 21 days, when the experiment was collected. To the physiological evaluation, were considered the parameters of growth:leaf area, height, number of leaves, diameter of the pseudostem, weight of the tax burden of fresh and dry, while the chemical assessment observed the concentration of sodium ions, potassium, chloride, magnesium and calcium in limbo leaf, and root pseudostem / subroot. The addition of NaCl to the cultivar solution has, in general, reduced the growth expressed by height, formation of new leaves, leaf area, diameter of the pseudostem and production of fresh and dry materials. This reduction in growth probably due to factors such as: the toxic effect of ions that have been absorbed, the low osmotic and water potential of the cells as well as the use of metabolic energy in the process of osmotic adjustment. In assessing chemical factors, it was possible to observe that the ions concentration has been preferentially presented in root tissue, showing that it is a culture moderately tolerant to salinity.The sodium and chlorine ions increased significantly with the salt increase in differentparts of the plant, while potassium suffered reduction in the leaf lamina and the pseudostem probably because it is associated to the competition with the sodium ion leading to the conclusion that the differential accumulation of ions potentially toxic (sodium and chlorine) and the maintenance of potassium, contribute to the tolerance to salinity in banana. From the physiological analysis and by means of the toxicity symptoms caused by NaCl, it was possible to observe that the effects were less intense in Birmania and Khai Nai On genotypes, than in Sowmuk, its indicates the possibility of use of this plants in programmes for cultivars improvement as tolerant and sensitive, respectively. Seven genotypes were selected for characterization by means of molecular markers RAPD, with the aim to link the physiological responses to salt stress with the formation of groups. We tested 16 random primers. The resultsshow a broad molecular genetic variability among seven genotypes studied. The formation of groups, in part is related to the data obtained in the physiological assessment, keeping in the same group the Birmania and Khai Nai On genotypes.These genotypes that showed higher tolerance to salt stress, when compared to the more salt-sensitive genotype (Showmuk), became distant genetically, so, it can be noticed the possibility of use of this molecular marker in the study of genetic diversity for this species. For the genome functional study, or transcriptoma, this study aimed the detection of possible changes in the pattern of genes expressed in the three diploid genotypes (AA) of banana, Khai Nai On, Burma and Sowmuk with contrasting results when in the absence and presence of high salt concentrations. The Differential Display PCR - ddPCR technique was used to identify and compareregions of bands from fragments of cDNA on agarose gel. A total of 43 fragments of differentially expressed cDNA was generated from the combination of four primers anchors and six random primers. Among the transcripts, 30 were once expressed by the genotype Burma and Kha Nai On, and 13 only by Sowmuk genotype. Theregions of bands with greater consistency of formation, is between 4000 bp and 150 bp. By the results of this research, it was possible to identify some fragments potentially involved to the condition of salinity in banana. The isolation, purification and sequencing of these - Expressed sequence tags - ESTs can assist in the development of new varieties of banana, more adapted to salt stress, in addition to enriching the database of public functional sequences of genomes banks.Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNP

Temporal expression of the sor1 gene and inhibitory effects of Sorghum bicolor L. Moench on three weed species

The temporal expression of gene sor1 and the inhibitory effect of Sorghum bicolor L. Moench against weeds were studied by semiquantitative polymerase chain reaction and intercropping management, respectively. To quantify sor1 expression, seeds were sown in pots and RNA was collected from the roots at 5, 10, 15, 20 and 30 days after emergence (DAE). In the inhibition assay, cotton and three weeds were evaluated during single cropping and during intercropping with S. bicolor. The assay was completely randomized, with eight replications. We found early expression of sor1 in most S. bicolor accessions by 5 DAE, and a gradual reduction thereafter. Only one of the accessions showed sor1 expression up to 30 DAE. In the inhibition assay, the most significant effects were related to the dry matter production (shoots and roots) of the weeds Cenchrus echinatus and Cynodon dactylon. The intercropping of cotton and S. bicolor had no apparent deleterious effects

Avaliação de diploides de bananeira (Musa spp.) quanto à tolerância a salinidade

A salinidade é um fator comum de estresse abiótico que afeta a produção agrícola onde ela existe. Uma das estratégias para promover a reincorporação de áreas salinizadas e o aumento da produtividade consiste no desenvolvimento e na seleção de genótipos tolerantes, o que permitirá a identificação de parentais a serem utilizados em cruzamentos. Esta pesquisa teve como objetivo identificar genótipos diploides de bananeira tolerantes à salinidade a serem utilizados em futuros trabalhos de melhoramento genético, visando à obtenção de cultivares adaptados a solos salinos. Foram avaliados nove genótipos diploides (AA) de bananeira. Para a avaliação dos parâmetros de crescimento, foram feitas medições de área foliar, altura e contagem do número de folhas. As plantas foram tratadas durante 21 dias com 0 e 100 mM de NaCl, num delineamento experimental inteiramente casualizado, com três repetições. Aos 21 dias, foi feita a determinação do peso da matéria fresca, utilizando-se balança analítica. A obtenção do peso da matéria seca das partes limbo foliar, pseudocaule e raízes+rizoma de cada planta foi feita após secagem em estufa a 60ºC até peso constante. o genótipo Tjau Lagada, que sofreu menor redução da área foliar, possivelmente apresentará uma produção relativamente superior aos genótipos avaliados neste estudo. o genótipo 0116-01, por ter apresentado maior tolerância à salinidade, poderá ser utilizado em futuros cruzamentos, disponibilizando genes a serem incorporados em cultivares produtivas utilizadas em programas de melhoramento que visem à obtenção de cultivares adaptadas às regiões de solos salinos no Nordeste brasileiro

Temporal expression of the sor1 gene and inhibitory effects of Sorghum bicolor L. Moench on three weed species

The temporal expression of gene sor1 and the inhibitory effect of Sorghum bicolor L. Moench against weeds were studied by semiquantitative polymerase chain reaction and intercropping management, respectively. To quantify sor1 expression, seeds were sown in pots and RNA was collected from the roots at 5, 10, 15, 20 and 30 days after emergence (DAE). In the inhibition assay, cotton and three weeds were evaluated during single cropping and during intercropping with S. bicolor. The assay was completely randomized, with eight replications. We found early expression of sor1 in most S. bicolor accessions by 5 DAE, and a gradual reduction thereafter. Only one of the accessions showed sor1 expression up to 30 DAE. In the inhibition assay, the most significant effects were related to the dry matter production (shoots and roots) of the weeds Cenchrus echinatus and Cynodon dactylon. The intercropping of cotton and S. bicolor had no apparent deleterious effects