Genetic selection of Calophyllum brasiliense for seed orchards

As populações de Calophyllum brasiliense encontram-se sob severa depleção e, portanto, são necessários critérios para melhorar a produção e a qualidade do material propagativo da espécie. Índices genéticos têm o potencial para orientar a redução de consangüinidade e de maximizar a representação alélica dentro das populações de interesse. Neste artigo exploramos valores genéticos para esta espécie em um pequeno relicto de floresta natural no Estado do Rio de Janeiro (Brasil). O objetivo foi o de avaliar o potencial de algumas medidas genéticas para o estabelecimento de pomares de sementes. Desde que informações genômicas de árvores nativas ainda são escassas optamos pelo uso de um marcador dominante: RAPD. O DNA de 17 árvores fenotipicamente superiores foi obtido através do método CTAB e encaminhado para amplificação por PCR. Eletroforese e documentação eletrônica foram então conduzidas. Calculamos a porcentagem de bandas polimórficas (PPB), diversidade genética (Ht), índice de informação de Shannon (i), distância genética (UPGMA) e análise de parcimônia. Seis iniciadores foram avaliados gerando 34 loci. Encontramos alta diversidade genética PPB=70,6% com Ht=0,28 e i=0,41. As relações genéticas foram apresentadas em dendrogramas (Máxima parcimônia e distância). Amostragem simulada dentro e entre agrupamentos sugerem que a amostragem dentro de grupamentos é mais eficiente para melhor capturar a diversidade genética.Calophyllum brasiliense populations are under severe depletion and criteria to improve production and quality of propagative material are therefore necessary. Genetic measures have the potential to reduce consanguinity and maximize allelic representation within target populations. Here, we explored genetic values for this species in a small relic of natural forest in Rio de Janeiro State (Brazil). The objective was to evaluate the potential of some genetic measures for seed orchard establishment. As genomic information of native trees is still scarce, we opted to use a dominant marker: RAPD. DNA from 17 phenotypically superior trees was obtained through the CTAB method and submitted for amplification by PCR. Electrophoresis and electronic documentation was then conducted. We calculated the percentage of polymorphic bands (PPB), gene diversity (Ht), Shannon’s information index (i), genetic distance (UPGMA) and parsimony analysis. Six primers were evaluated generating 34 loci. We found high genetic diversity PPB=70.6% with Ht=0.28 and i=0.41. Genetic relationships were reported in dendrograms (maximum parsimony and distance). Simulated sampling within and among clusters suggests that inter cluster sampling is more effective to capture the genetic diversity