Molecular Carbon Chains and Rings in TMC-1

We present mapping results in several rotational transitions of HC3N, C6H, both cyclic and linear C3H2 and C3H, towards the cyanopolyyne peak of the filamentary dense cloud TMC-1 using the IRAM 30m and MPIfR 100m telescopes. The spatial distribution of the cumulene carbon chain propadienylidene H2C3 (hereafter l-C3H2) is found to deviate significantly from the distributions of the cyclic isomer c-C3H2, HC3N, and C6H which in turn look very similar. The cyclic over linear abundance ratio of C3H2 increases by a factor of 3 across the filament, with a value of 28 at the cyanopolyyne peak. This abundance ratio is an order of magnitude larger than the range (3 to 5) we observed in the diffuse interstellar medium. The cyclic over linear abundance ratio of C3H also varies by ~2.5 in TMC-1, reaching a maximum value (13) close to the cyanopolyyne peak. These behaviors might be related to competitive processes between ion-neutral and neutral-neutral reactions for cyclic and linear species.Comment: Accepted for publication in The Astrophysical Journal, part I. 24 pages, including 4 tables, 7 figures, and figure caption

Biodistribution et toxicité des nanocapsules chargées en 188Re après injection intratumorale par convection enhanced delivery chez la souris

Objectifs Déterminer la faisabilité, l’intérêt et la toxicité hématologique de l’administration intratumorale par convection enhanced delivery (CED) de nanocapsules chargées en 188Re (NCL-188Re). Matériels et méthodes L’étude de biodistribution des NCL-188Re vs perrhénate (188ReO4−) a été réalisée sur des souris nude (n = 30). Les animaux ont été séparés en 2 groupes : injection intratumorale de 188ReO4− pour le premier groupe (n = 15, 3 MBq) et de NCL-188Re pour le second groupe (n = 15, 3 MBq). Les animaux ont été sacrifiés à 1 h (n = 10), 24 h (n = 10) et 72 h (n = 10) après l’injection, les organes prélevés et comptés. La toxicité hématologique des NCL-188Re a été évaluée par prises de sang de 50 μL (sinus rétro-orbitaire) réalisées à j2, j7, j14 et j21 après traitement par NaCl (n = 4), NCL-188Re (3 MBq, n = 4), NCL-188Re (6 MBq, n = 4) et NCL-188Re (12 MBq, n = 4). Résultats La vectorisation par NCL a permis de limiter l’élimination urinaire du 188Re puisque dès 24 h post-IV 0,1 ± 0,1 % de la dose injectée (%D.I.) vs 81,9 ± 7,5 % D.I. sont retrouvés dans les urines pour les formes NCL188Re-SSS et 188ReO4-, respectivement, (p = 0,016). Celle-ci permet également de retrouver une activité significativement supérieure dans la tumeur à tous les temps de l’étude. L’administration unique de NCL-188Re a induit une toxicité modérée pour les activités injectées les plus élevées (12 MBq) se manifestant principalement par une thrombopénie transitoire de nadir j14–j18. Il n’a pas été observé de toxicité au niveau des autres lignées cellulaires pour les activités administrées de 3 et 6 MBq. Conclusions Les résultats obtenus montrent la faisabilité de l’injection intratumorale par CED et l’intérêt de la vectorisation du 188Re par les NCL. Les premiers signes de toxicité hématologiques sont en faveur du fractionnement des doses administrées et d’un meilleur ciblage par fonctionnalisation des NCL aux oestrogènes pour permettre une meilleure rétention tumorale

Revisiting the S-matrix approach to the open superstring low energy effective lagrangian

The conventional S-matrix approach to the (tree level) open string low energy effective lagrangian assumes that, in order to obtain all its bosonic ${\alpha'}^N$ order terms, it is necessary to know the open string (tree level) $(N+2)$-point amplitude of massless bosons, at least expanded at that order in $\alpha'$. In this work we clarify that the previous claim is indeed valid for the bosonic open string, but for the supersymmetric one the situation is much more better than that: there are constraints in the kinematical bosonic terms of the amplitude (probably due to Spacetime Supersymmetry) such that a much lower open superstring $n$-point amplitude is needed to find all the ${\alpha'}^N$ order terms. In this `revisited' S-matrix approach we have checked that, at least up to ${\alpha'}^4$ order, using these kinematical constraints and only the known open superstring 4-point amplitude, it is possible to determine all the bosonic terms of the low energy effective lagrangian. The sort of results that we obtain seem to agree completely with the ones achieved by the method of BPS configurations, proposed about ten years ago. By means of the KLT relations, our results can be mapped to the NS-NS sector of the low energy effective lagrangian of the type II string theories implying that there one can also find kinematical constraints in the $N$-point amplitudes and that important informations can be inferred, at least up to ${\alpha'}^4$ order, by only using the (tree level) 4-point amplitude.Comment: 34 pages, 3 figure, Submitted on Aug 4, 2012, Published on Oct 15, 201

PloS one

The HIV-1 nucleocapsid protein (NC) is a small basic protein containing two zinc fingers (ZF) separated by a short linker. It is involved in several steps of the replication cycle and acts as a nucleic acid chaperone protein in facilitating nucleic acid strand transfers occurring during reverse transcription. Recent analysis of three-dimensional structures of NC-nucleic acids complexes established a new property: the unpaired guanines targeted by NC are more often inserted in the C-terminal zinc finger (ZF2) than in the N-terminal zinc finger (ZF1). Although previous NMR dynamic studies were performed with NC, the dynamic behavior of the linker residues connecting the two ZF domains remains unclear. This prompted us to investigate the dynamic behavior of the linker residues. Here, we collected 15N NMR relaxation data and used for the first time data at several fields to probe the protein dynamics. The analysis at two fields allows us to detect a slow motion occurring between the two domains around a hinge located in the linker at the G35 position. However, the amplitude of motion appears limited in our conditions. In addition, we showed that the neighboring linker residues R29, A30, P31, R32, K33 displayed restricted motion and numerous contacts with residues of ZF1. Our results are fully consistent with a model in which the ZF1-linker contacts prevent the ZF1 domain to interact with unpaired guanines, whereas the ZF2 domain is more accessible and competent to interact with unpaired guanines. In contrast, ZF1 with its large hydrophobic plateau is able to destabilize the double-stranded regions adjacent to the guanines bound by ZF2. The linker residues and the internal dynamics of NC regulate therefore the different functions of the two zinc fingers that are required for an optimal chaperone activity

Apport de la TEP-FDG dans le staging initial des cancers du sein localement avancés traités par chimiothérapie néo-adjuvante

L’atteinte ganglionnaire axillaire et la présence de métastases à distance sont des facteurs pronostiques majeurs dans la prise en charge du cancer du sein. L’objectif de notre travail a été d’évaluer les performances de la TEP-FDG dans le bilan initial de cancers du sein localement avancés (CSLA) traités par chimiothérapie néo-adjuvante (CNA) et chirurgie, et de comparer les données de la TEP préthérapeutique à celles de l’histologie du curage réalisé après CNA (classification de Sataloff). Cette étude rétrospective a concerné 89 patientes porteuses d’un CSLA, explorées avant mise en route de la CNA par une TEP en complément du bilan d’extension standard (BS). Toutes les patientes ont bénéficié après CNA d’une tumorectomie/mastectomie et d’un curage axillaire. Une atteinte axillaire a été retrouvée chez 58 patientes (65 %) par la TEP et 39 patientes (44 %) par le BS. Comparées à l’histologie du curage axillaire post-CNA, les sensibilité et spécificité de la TEP ont été calculées à 80 % et 63 %. La TEP a révélé une atteinte ganglionnaire extra-axillaire, non suspectée par le BS, chez 25 patientes (28 %). Des lésions métastatiques méconnues par le BS ont été découvertes au niveau osseux chez deux patientes et pulmonaire chez une patiente. Un cas de faux-positif TEP hépatique a été observé (adénomatose). Cette étude confirme l’intérêt de la TEP dans le staging initial des CSLA, notamment au niveau ganglionnaire extra-axillaire. Au niveau axillaire, une TEP positive suggère fortement une atteinte métastatique ; les cas d’interprétation douteuse incitant à réaliser en complément une cytoponction échoguidée

Intrinsic nucleic acid dynamics modulates HIV-1 nucleocapsid protein binding to its targets

HIV-1 nucleocapsid protein (NC) is involved in the rearrangement of nucleic acids occurring in key steps of reverse transcription. The protein, through its two zinc fingers, interacts preferentially with unpaired guanines in single-stranded sequences. In mini-cTAR stem-loop, which corresponds to the top half of the cDNA copy of the transactivation response element of the HIV-1 genome, NC was found to exhibit a clear preference for the TGG sequence at the bottom of mini-cTAR stem. To further understand how this site was selected among several potential binding sites containing unpaired guanines, we probed the intrinsic dynamics of mini-cTAR using (13)C relaxation measurements. Results of spin relaxation time measurements have been analyzed using the model-free formalism and completed by dispersion relaxation measurements. Our data indicate that the preferentially recognized guanine in the lower part of the stem is exempt of conformational exchange and highly mobile. In contrast, the unrecognized unpaired guanines of mini-cTAR are involved in conformational exchange, probably related to transient base-pairs. These findings support the notion that NC preferentially recognizes unpaired guanines exhibiting a high degree of mobility. The ability of NC to discriminate between close sequences through their dynamic properties contributes to understanding how NC recognizes specific sites within the HIV genome