Caracterización de Acidovorax avenae en el agroecosistema caña de azúcar. Estudios moleculares y análisis de secuencias relacionadas con la respuesta a estría roja en genotipos diferenciales

Tesis de doctorado para obtener el grado de Doctora en Ciencias Biológicas, presentada en la Universidad Nacional de Tucumán, Facultad de Agronomía y Zootecnia en diciembre de 2018En Argentina, la actividad cañera está concentrada en la región noroeste (98%), y representa la segunda actividad económica y social más importante, influyendo en la historia política y económica de toda la región. La actividad demanda una constante investigación y experimentación, para dar respuesta a las principales problemáticas que afectan al desarrollo del cultivo. En particular, cuando se habla de procesos infecciosos en las plantas se concentra toda la atención en el binomio planta-agente causal, dejando de lado una serie de conceptos indispensables para comprender el patosistema como algo integral. En el caso de la estría roja, una enfermedad causada por una bacteria denominada Acidovorax avenae, que afecta las principales regiones cañeras del mundo, mostró en nuestro país, durante los últimos diez años, un marcado aumento en su incidencia y severidad en lotes comerciales, probablemente favorecida por la cosecha en verde y la rotación con soja como practicas agronómicas más frecuentes. El objetivo de este trabajo de tesis Doctoral fue establecer las características del patógeno mediante la secuencia de genes específicos y explorar, con un enfoque de interacción suelo-planta, las relaciones entre la microbiota principal acompañante en un sistema de manejo de caña con rotación con soja, y el desarrollo de la enfermedad. Para ello, se llevó a cabo el aislamiento y caracterización microbiológica clásica, y posteriormente el estudio de la diversidad genética, de las cepas de A. avenae aisladas de las regiones NEA y NOA se realizó mediante RAPD-PCR y MLST. Se determinó la presencia de cinco genotipos multilocus, muy emparentadas entre sí que forman un complejo clonal único y derivan de un origen común y cercano. Una alta especificidad cepa-hospedante fue demostrada en base a la marcada separación de las cepas de A. avenae de caña de azúcar del resto de las especies de Acidovorax. Como modelo de estudio, se describió además en este trabajo la secuenciación del genoma de A. avenae T10_61 aislada en Tucumán. Métodos independientes de cultivo, DGGE y Metagenómica ayudaron a estimar la composición microbiana, presente en hojas y suelo de caña de azúcar. El enfoque de secuenciación de alto rendimiento (HTS) de metagenómica, arrojó una gran cantidad de información de Unidades taxonómicas (OTUs) siendo los órdenes más abundantes Bacillales, Rhyzobiales, Rhodospirilliales, Xanthomonadales, Acidobacteriales, Sphingomonadales. Los datos obtenidos aportan valiosa información para profundizar en el conocimiento y estudio del patosistema caña de azúcar-A. avenae.EEA FamailláFil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentin

Estría roja en caña de azúcar. Caracterización y análisis molecular del agente etiológico

Tesis de maestría para obtener el grado de Magister en Ciencias Agropecuarias, Mención: Protección Vegetal presentada en la Universidad Nacional de Córdoba, Facultad de Ciencias Agropecuarias en noviembre de 2010.La estría roja es una enfermedad bacteriana de la caña de azúcar ocasionada por Acidovorax avenae. Esta enfermedad ha adquirido mayor relevancia en los últimos años, en todas las zonas cañeras de Argentina, registrando pérdidas de hasta 30% de tallos molible y afectando además la calidad de los jugos. Por otro lado la elevada presión de inóculo que se genera en los sitios de selección produce la eliminación de clones avanzados obtenidos con programas de mejoramiento genético. Debido a esto, es necesario determinar las características del agente causal para contar con un diagnóstico seguro y preciso que permita diseñar estrategias de manejo más efectivas. El objetivo del presente trabajo fue la caracterización del agente responsable de la estría roja en caña de azúcar proveniente de diferentes zonas productoras de Tucumán y Salta. Mediante la combinación de técnicas de microbiología clásica y métodos moleculares como PCR especie-específica, REP-PCR, RAPD y ARDRA se logró aislar, identificar y caracterizar genéticamente a Acidovorax avenae a partir de hojas de caña de azúcar sintomáticas. La identificación fenotípica, como así también la caracterización molecular mediante PCR especieespecífica, brindaron datos contundentes confirmando la identidad del agente causal. El análisis molecular de la diversidad genética mediante REP-PCR y RAPD permitió detectar la presencia de al menos cuatro biotipos diferentes entre los aislamientos analizados. La existencia de diversidad genética resulta un dato más que importante para el diseño de estrategias de control mediante el uso de variedades resistentes, o para la obtención de variedades que evidencien elevada tolerancia a las cepas predominantes mediante programas de mejoramiento genético. Los resultados obtenidos constituyen la primera caracterización realizada en la región cañera de Argentina para esta patología.Fil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentin

Soil microbial community responses to different sugarcane management strategies as revealed by 16S metagenomics

XXX Congress of the ISSCT (International Society of Sugar Cane Technologists), Tucumán, from 31 August to 8 September 2019Sugarcane cultivation in Argentina is distributed in three geographic regions: Tucumán, Northern (Salta and Jujuy) and Littoral (Santa Fe and Misiones), covering about 376,223 ha. Tucumán has traditionally been the most important region with 68% of the total production. Since new agricultural techniques, such as green-cane harvesting and sugarcane crop rotation with soybean, were implemented in the last decade, changes in the agroecosystem of sugarcane, specific pathosystems and epidemiological parameters have been observed. A 16S metagenomics approach to investigate total bacterial communities associated with sugarcane rhizospheric soil when soybean was the predecessor crop in a cultivation area with a high incidence of red stripe disease was applied; soil from sugarcane monoculture was also included. Two commercial sugarcane cultivars (Saccharum spp. hybrids) with differential responses to red stripe infection (tolerant and susceptible) were evaluated. Sampling was carried out in 2013-2014 and in 2014-2015 (first and second ratoon, respectively) at 30, 90 and 180 days after harvest. Total soil DNA was obtained using FastPrep® technology. The 16S RNA gene (variable region V3-V4) was sequenced using a MiSeq platform Illumina. Taxonomic assignment revealed Bacillales, Rhyzobiales, Rhodospirilliales, Xanthomonadales and Acidobacteriales among the most abundant orders in all samples. Soil samples from sugarcane without soybean rotation showed a marked decrease in Bacillaes, Rhizobiales and Sphingomonadales. Cluster analysis grouped together samples from the tolerant genotype, while those from the susceptible genotype formed two subgroups that were distinguished according to sampling time after harvest. The analysis showed that samples from sugarcane under monoculture were grouped distant to the rest of the samples showing different microbiota composition. The sugarcane rhizosphere microbiome and its biotechnological potential open a new opportunity in the concept of sustainable crop management. The data contribute significant knowledge about the microbial diversity in agricultural ecosystems.El cultivo de caña de azúcar en Argentina se distribuye en tres regiones geográficas: Tucumán, Norte (Salta y Jujuy) y Litoral (Santa Fe y Misiones), que cubren alrededor de 376,223 ha. Tucumán ha sido tradicionalmente la región más importante con el 68% de la producción total. En la última década, como consecuencia de los cambios en el manejo como la rotación con soja y la cosecha en verde, se han observado cambios en el agroecosistema de la caña de azúcar, en patosistemas específicos y parámetros epidemiológicos. En el presente estudio, se aplicó un enfoque metagenómica de gen 16S ARNr para investigar las comunidades bacterianas asociadas con el suelo rizosférico de caña de azúcar en un sistema con soja como cultivo predecesor en un área de cultivo con una alta incidencia de estría roja. A fines comparativos, se incluyó en el estudio muestras de suelo monocultivo de caña de azúcar. Se evaluaron dos cultivares comerciales de caña de azúcar (Saccharum spp. híbridos) con respuestas diferenciales a la infección de estría roja (tolerante y susceptible). A partir del ADN total del suelo de muestras obtenidas en las campañas 2013-2014 y en 2014-2015 (soca 1 y 2, respectivamente) a los 30, 90 y 180 días después de la cosecha, se amplificó la región variable V3-V4 del 16S rRNA y se secuenció utilizando una plataforma MiSeq Illumina. La asignación taxonómica de las secuencias, reveló Bacillales, Rhyzobiales, Rhodospirilliales, Xanthomonadales y Acidobacteriales entre las órdenes más abundantes en todas las muestras. Las muestras de suelo de caña de azúcar sin rotación con soja mostraron una marcada disminución en Bacillaes, Rhizobiales y Sphingomonadales. El análisis de conglomerados agrupó las muestras del genotipo tolerante, mientras que las del genotipo susceptible formaron dos subgrupos que se distinguieron según el tiempo de muestreo después de la cosecha. El análisis mostró además que las muestras de caña de azúcar provenientes de un sistema de monocultivo se agruparon distantes del resto de las muestras evidenciando las diferencias en la composición de microbiota. El microbioma de la rizosfera de la caña de azúcar y su potencial biotecnológico abren una nueva oportunidad en el concepto de manejo sostenible de cultivos. Los datos aportan un conocimiento significativo sobre la diversidad microbiana en los ecosistemas agrícolas.La culture de la canne à sucre en Argentine est répartie dans trois régions géographiques: Tucumán, le Nord (Salta et Jujuy) et le Littoral (Santa Fe et Misiones), couvrant environ 376 223 ha. Tucumán est traditionnellement la région la plus importante avec 68% de la production totale. Depuis que de nouvelles techniques agricoles, telles que la récolte de la canne verte et la rotation de la canne à sucre avec le soja, ont été mises en place au cours de la dernière décennie, des changements dans l’écosystème de la canne à sucre, des pathosystèmes spécifiques et des paramètres épidémiologiques ont été observés. Une approche métagénomique 16S pour étudier les communautés bactériennes totales associées au sol rhizosphérique de la canne à sucre lorsque le soja était la culture précédente dans une zone de culture présentant une incidence élevée de maladie à rayures rouges a été appliquée; le sol issu de la monoculture de canne à sucre a également été inclus. Deux cultivars commerciaux de la canne à sucre (hybrides Saccharum spp.) avec des réponses différentielles à l'infection à rayures rouges (tolérants et sensibles) ont été évalués. L'échantillonnage a été réalisé en 2013-2014 et en 2014-2015 (première et deuxième repousses, respectivement) à 30, 90 et 180 jours après la récolte. L'ADN total du sol a été obtenu en utilisant la technologie FastPrep®. Le gène de l'ARN 16S (région variable V3-V4) a été séquence en utilisant une plate-forme MiSeq Illumina. L'analyse taxonomique a révélé que Bacillales, Rhyzobiales, Rhodospirilliales, Xanthomonadales et Acidobacteriales étaient parmi les ordres les plus abondants dans tous les échantillons. Des échantillons de sol de canne à sucre sans rotation de soja ont montré une diminution marquée des bacilles, des rhizobiales et des sphingomonadales. L'analyse a regroupé des échantillons du génotype tolérant, tandis que ceux du génotype sensible ont formé deux sous-groupes qui ont été distingués en fonction de la période d'échantillonnage après la récolte. L'analyse a montré que les échantillons provenant de la canne à sucre en monoculture étaient regroupés à distance du reste des échantillons présentant une composition de microbiote différente. Le microbiome de la rhizosphère de canne à sucre et son potentiel biotechnologique ouvrent une nouvelle opportunité dans le concept de gestion durable des cultures. Les données fournissent des connaissances significatives sur la diversité microbienne dans les écosystèmes agricoles.EEA FamailláFil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Orru, L. Council for Agricultural Research and Economics (CREA). Research Centre for Genomics & Bioinformatics; ItaliaFil: Fontana, Cecilia Alejandra. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Cocconcelli, P.S. Università Cattolica del Sacro Cuore. Dipartimento di Scienze e Tecnologie Alimentari per una filiera agro-alimentare Sostenibile (DISTAS); ItaliaFil: Vignolo, Graciela Margarita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Centro de Referencia Para Lactobacilos; ArgentinaFil: Salazar, Sergio Miguel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentin

Multilocus Sequence Analysis highlights genetic diversity of Acidovorax avenae strains associated with sugarcane red stripe

XXX Congress of the ISSCT (International Society of Sugar Cane Technologists), Tucumán, from 31 August to 8 September 2019Pathogenic species of Acidovorax cause economically important diseases in monocotyledonous and dicotyledonous crops, including sugarcane, corn, rice, oats, millet, foxtail, watermelon and orchids. Sugarcane red stripe, caused by Acidovorax avenae, is present in the main production areas around the world. In Argentina, red stripe affects about 30% of stalks milled with important economic losses when severe infections occur. MLST was used to explore the genetic diversity of this bacterium associated with red stripe in Argentina, as well as their phylogenetic relationships. The MLST analysis included sequences from a total of 118 Acidovorax, 15 A. avenae strains isolated from Argentina sugarcane production areas, A. citrulli (93) from melon and watermelon, A. avenae (9) from rice, millet, corn, vasey grass and sorghum, and A. oryzae (1) from rice. MLST analysis revealed five novel sequence types (STs) for the sugarcane A. avenae strains, constituting a clonal complex with a common and close origin. When genetic relationships with other Acidovorax were explored, sugarcane strains were related to A. avenae from other hosts and more distantly to A. citrulli. Signals of frequent recombination in several lineages of A. avenae were detected and we observed that A. oryzae is closely related to A. avenae strains. This study provides valuable data in the field of epiphytological and evolutionary investigations of A. avenae strains causing sugarcane red stripe. Knowledge of the genetic diversity and host-strain specificity are important to select the genotypes with the best response to red stripe disease.Las especies fitopatógenas de Acidovorax causan enfermedades en cultivos tanto monocotiledóneos y dicotiledóneos, que incluyen caña de azúcar, maíz, arroz, avena, mijo, sandía y orquídeas. La estría roja de caña de azúcar, causada por Acidovorax avenae, está presente en las principales áreas de producción del mundo. En Argentina, esta enfermedad llegó a afectar hasta un 30% de tallos molibles en infecciones severas con importantes pérdidas económicas. Para explorar la diversidad genética de esta bacteria, así como sus relaciones filogenéticas, se aplicó un análisis MLST. El MLST incluyó un total de 118 secuencias de cepas de Acidovorax, 15 A. avenae aisladas de diferentes áreas de producción de caña de azúcar de Argentina, A. citrulli (93) de melón y sandía, A. avenae (9) de arroz, mijo, maíz, pasto vasey y sorgo y A. oryzae (1) de arroz. El análisis de MLST reveló cinco nuevos tipos de secuencia (ST) para las cepas de caña de azúcar A. avenae, que constituyen un complejo clonal con un origen común y cercano. Cuando se investigó la relación genética con otras Acidovorax, las cepas de caña de azúcar se mostraron cercanas con A. avenae de otros huéspedes, pero más distante de A. citrulli. Se evidenciaron señales de recombinación frecuente en varios linajes de A. avenae y observamos que A. oryzae está estrechamente relacionada con las cepas de A. avenae. Este estudio proporciona datos valiosos en el campo de las investigaciones epifitológicas y evolutivas de las cepas de A. avenae que causan estría roja en caña de azúcar. El conocimiento de la diversidad genética y la especificidad cepa-hospedante son importantes para seleccionar genotipos con la mejor respuesta frente a los biotipos más virulentos y predominantes en la región.Les espèces pathogènes d'Acidovorax sont responsables de maladies importantes sur le plan économique dans les cultures monocotylédones et dicotylédones, notamment la canne à sucre, le maïs, le riz, l'avoine, le millet, la sétaire, la pastèque et l’orchidée. Les rayures rouges de la canne à sucre, causée par Acidovorax avena, est présente dans les principales zones de production du monde. En Argentine, les rayures rouges touchent environ 30% des tiges usinables, entraînant d'importantes pertes économiques en cas d'infection grave. Le MLST a été utilisé pour explorer la diversité génétique de cette bactérie associée aux rayures rouges en Argentine, ainsi que leurs relations phylo-génétiques. L'analyse MLST comprenait des séquences provenant d'un total de 118 souches Acidovorax, 15 souches d'A. avenae isolées des zones de production de canne à sucre de l’Argentine, A. citrulli (93) du melon et de pastèque, A. avenae (9) du riz, le mil, le maïs, l’herbe de vasey et le sorgho et A. oryzae (1) obtenue du riz. L'analyse MLST a révélé cinq nouveaux types de séquence (ST) pour les souches de canne à sucre d’A. avenae, constituant un complexe clonal d'origine commune et proche. Lorsque les relations génétiques avec d'autres Acidovorax ont été explorées, les souches provenant de la canne à sucre étaient apparentées à A. avenae provenant d'autres hôtes et plus lointainement à A. citrulli. Des signaux de recombinaison fréquente dans plusieurs lignées d'A. avenae ont été détectés et nous avons observé qu'A. oryzae est étroitement apparenté aux souches d'A. avenae. Cette étude fournit des données précieuses dans le domaine des études épiphytologiques et évolutives des souches d'A. avenae provoquant les rayures rouges de la canne à sucre. La connaissance de la diversité génétique et de la spécificité souche-hôte est importante pour sélectionner les génotypes présentant la meilleure résistance à la maladie des rayures rouges.EEA FamailláFil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Tomasini, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Salta. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Tomasini, Nicolás. Universidad Nacional de Salta. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Fontana, Cecilia Alejandra. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Di Pauli, Valentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Cocconcelli, P.S. Università Cattolica del Sacro Cuore. Dipartimento di Scienze e Tecnologie Alimentari per una filiera agro-alimentare Sostenibile (DISTAS); ItaliaFil: Vignolo, Graciela Margarita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Centro de Referencia Para Lactobacilos; ArgentinaFil: Salazar, Sergio Miguel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentin

Optimized somatic embryogenesis and plant regeneration in elite Argentinian sugarcane (Saccharum spp.) cultivars

Background: Biotechnological breeding of elite sugarcane cultivars is currently limited because of the difficulty of regenerating plants by tissue culture. Here, we report that commercially elite sugarcane genotypes, which are adapted to Argentinian agro-ecological conditions, are capable of being regenerated via indirect somatic embryogenesis. Leaf rolls of five elite genotypes were cultured following two callus induction protocols using different concentrations of 2,4-D as the growth regulator. Embryogenic calluses were regenerated under light conditions. Regenerated plants were subsequently acclimatized in the greenhouse under two acclimatization procedures before being transplanted to the field. Results: Four of the five genotypes were able to form somatic embryos following the two induction protocols. The variables related to embryogenic callus production were influenced by the interaction between genotype and culture conditions. For plant regeneration, the embryogenic calluses were further cultured on an IBA-supplemented medium, where we observed a high genotype dependence. Calluses from the four cultivars regenerated a good number of plants. With the procedures described here, we obtained more than 90% of well-acclimatized plants both in the greenhouse and in the field. Conclusions: This protocol provides a simple way to regenerate sugarcane plants through indirect somatic embryogenesis. Also, the results confirm that tissue culture ability is highly genotype-dependent in sugarcane. Our findings suggest that these elite cultivars could be good candidates for biotechnological breeding.EEA FamailláFil: Di Pauli, Valentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Lewi, Dalia Marcela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; ArgentinaFil: Felipe, Arturo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Erazzú, Luis E. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina

Aquileia and its urban development in the light of recent and ongoing research

Our knowledge regarding the urban planning of Aquileia and its development has significantly increased since the publication of the last comprehensive overview of this subject in the volume Aquileia moenibus et portu celeberrima in 2009. Indeed, over the previous decade, several new research projects have shone new light on the urban planning, function, and development of Aquileia, adding much new data and evidence to our overall knowledge of the ancient colony and Adriatic emporium. This paper presents the most significant results of recent investigations, providing a first updated overview of the city’s urban development, focusing and commenting on the following themes: city walls and town planning, Forum and river port, entertainment and recreational buildings (theatre, amphitheatre and Imperial baths), commercial areas and complexes, private spaces and townhouses

Efecto del etil metanosulfonato sobre la capacidad embriogénica y la regeneración in vitro en caña de azúcar

PosterEl mejoramiento genético de caña de azúcar se enfrenta a su complejo genoma, la estrecha base genética, y la fertilidad deficiente que dificultan la obtención de genotipos superiores.EEA FamailláFil: Di Pauli, Valentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Lewi, Dalia Marcela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; ArgentinaFil: Erazzú, Luis E. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina

Yields and economic results of sugarcane cultivation under an alternative system compared to traditional management

XXX Congress of the ISSCT (International Society of Sugar Cane Technologists), Tucumán, from 31 August to 8 September 2019In the traditional method of managing sugarcane in Argentina, the entire field where the crop will be planted is severely ploughed, requiring large amounts of energy. In addition, during the subsequent maintenance tasks, furrows are worked at depth, reducing their yielding capacity and making them more vulnerable to traffic from farming equipment, harvesters and heavy trucks. The use of this system during prolonged periods of monoculture affects the soil physical integrity, compromising yields and the efficient use of the inputs. It was necessary, therefore, to develop an enhanced alternative management system to the traditional one in order to revert, stop or mitigate soil deterioration and improve crop economic results. A possible solution was to use energy only where it could be harnessed by the roots of the crop and maintain, without disturbing, the traffic lanes throughout the cane cycle. In order to implement this form of controlled-traffic management, an experimental scarifier for deep strip-tillage was developed and manufactured. Since 2013, trials have been carried out at EEA INTA Famaillá (Tucumán) comparing both cultivation technologies. Results indicate that, during the cane production stage, fuel consumption, energy requirements and operating times and costs can be reduced by 60-70% with this new management system. The average gross margin over five harvests was approximately 15% than that of the traditional management system, due to an increase in yields and fewer maintenance tasks required by the new technology. The new system is presented as less operationally complex, economically profitable and a more sustainable management alternative.Instituto de Ingeniería RuralFil: Tesouro, Omar. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Fernandez Ullivarri, Enrique. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Venturelli, Leonardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Roba, Marcos. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Romito, Angel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Donato, Lidia Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; ArgentinaFil: Bongiovanni, Rodolfo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Manfredi; ArgentinaFil: Erazzú, Luis Ernesto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Peralta, Adriana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Ingeniería Rural; Argentin

Digitalization and valorization of the genotypic and phenotypic information retained within the FEM grapevine germplasm

The maintenance and valorization of genetic diversity is an undoubtable resource for the viticulture of the future, since the climate crisis is forcing us to think of new, more resilient varieties. For this reason, the grapevine germplasm of the Fondazione Edmund Mach has been continuously expanded in the last decade to a total of 3,120 accessions, whose trueness-to-type has been verified by means of the universal set of nine microsatellites. About two thirds are V. vinifera subsp. vinifera accessions, while the rest consists of naturalized and selected hybrids, V. vinifera subsp. sylvestris, and pure species. The genetic material has also been characterized over three consecutive years for ampelographic, vine development, and biotic stress response traits to be exploited for experimental purposes. All the data and metadata have been digitalized and hosted in a SQL database, the FEMVitisDB, developed with an ontology driven paradigm to annotate the deposited information. The database was built following the MIAPPE checklist to ensure data FAIRness. A RESTful WebServiceAPI based on BrAPI and a web frontend were developed to easily explore the information in the repository. Findings about the captured genetic diversity, the identified unique profiles, and the scouted unknown and therefore novel genotypes will be discussed. The latter enrich the genetic asset of the grapevine community, towards the feeding of international databases. Where feasible, the first degree of parentage relationship has been reconstructed. Finally, the outcomes regarding the inferred phenological core collections will be introduced to provide an information arsenal for future ’omics analyses

Nuevas variedades de caña de azúcar desarrolladas por el INTA Famaillá

En el trabajo se detallan las características morfológicas, fenológicas y tecnológicas de las variedades L 91-281, INTA NA 89-686, INTA NA 91-209 e INTA CP 98-828, inscriptas en el INASE. El objetivo es reforzar las recomendaciones de cultivares desarrollados por INTA Famailla, que se constituyen como opciones de recambio de las actuales variedades cultivadas o con capacidad para complementarlas en ambientes específicos donde expresan su mejor potencial.Instituto de Patología VegetalFil: Sopena, Roberto Alfredo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Felipe, Arturo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Rago, Alejandro Mario. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Erazzu, Luis Ernesto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Mariotti, Jorge A. Universidad Nacional de Salta; ArgentinaFil: Perez Gomez, Sergio Gregorio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Fontana, Paola Daniela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Di Pauli, Valentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentin