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    Shannon Informational Entropies and Chemical Reactivity

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    Teoría de Información Cuántica como lenguaje conceptual en Química

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    Hasta hace relativamente poco tiempo la preocupación acerca de la caracterización de los sistemas físicos giraba en torno a averiguar cómo evolucionarían con el tiempo. Para caracterizar estos sistemas de una manera adecuada fueron surgiendo conceptos, magnitudes, para representarlos sin necesidad de referirnos directamente a ellos. Sin embargo, aunque inconscientemente, al hacer esto se fue desarrollando un lenguaje orientado a la información que se puede extraer de los sistemas, sin que ello implicase al sistema propiamente dicho. Una propiedad responsable del extraordinario comportamiento de los sistemas cuánticos es el “entanglement” o entrelazado. El entrelazado es un recurso que se pretende aprovechar en la computación cuántica, por ello, es necesario poder cuantificar y clasificar una propiedad tan importante como esta. En el presente trabajo se introduce un nuevo tipo de entropías informacionales cuánticas definidas en el espacio de Hilbert que hemos clasificado en términos de la marginalidad y la no marginalidad, las cuales siempre pueden detectar el entrelazado que está relacionado a la separabilidad y la no separabilidad de los sistemas. Dichas entropías fueron implementadas, caracterizadas y aplicadas en la descripción de sistemas y procesos químicos. También se muestra que estas entropías son mejores descriptores que las entropías de Shannon, Fisher y que los correspondientes descriptores de complejidad que se derivan de estas medidas clásicas. A lo largo de la Tesis se muestra que existe un lenguaje conceptual químico que resulta más general en el sentido de la Teoría de Información Cuántica. Los resultados de este trabajo se presentan en el siguiente orden: 1. Se introduce el lenguaje de la Teoría de Información Cuántica en la Química. 2. Se definen nuevos tipos de entropías cuánticas marginales y no marginales. 3. Se analiza el comportamiento general de las entropías marginales y no marginales, verificando las cotas a las que se encuentran sujetas, mediante un modelo sencillo de llenado electrónico con información total constante para medir la interacción (entrelazado) entre subsistemas. Estos resultados se muestran en el capítulo 6, pág. 55. 4. Se analizan algunos sistemas químicos, en los cuales se muestra que el entrelazado puede ser empleado para caracterizarlos, asimismo se muestra que algunos de los conceptos de reactividad empleados habitualmente están relacionados con ciertas magnitudes informacionales. Estos resultados se presentan en el capítulo 7, pág. 67. 5. Se estudian algunos procesos de disociación de sistemas diatómicos homo- y heteronucleares mediante medidas de información propuestas en este trabajo con lo que se muestra que los cambios detectados por las entropías marginales y no marginales están vinculados 5 con los cambios de los observables del sistema y con propiedades que no son observables directamente tales como regiones de acumulación o remoción de carga, ruptura de enlace, etc. Asimismo se verifica que es posible detectar el entrelazado en este tipo de procesos. Estos resultados se muestran en la sección 8.1, pág. 77. 6. Se analizan algunos procesos químicos más complejos tales como reacciones químicas (de las cuales sólo se presenta una de ellas) y se verifica que los puntos críticos de la estructura que se encuentran en las tendencias de las entropías están relacionados a los cambios físicos y químicos del sistema. También encontramos que la estructura de cualquiera de las entropías propuestas nos brinda más información que cualquiera de los descriptores comúnmente empleados en la Química Teórica, tales como: La energía total del sistema, energía de correlación, parámetros geométricos, frecuencias, momento dipolar, dureza, blandura, cargas, potencial electrostático molecular y laplaciano de la densidad. Tal situación hace que las entropías marginales y no marginales sean excelentes candidatos para ser empleadas como descriptores de complejidad. Estos resultados se muestran en la sección 8.4, pág. 103. 7. Se comparan las tendencias obtenidas con las entropías de von Neumann propuestas (en espacio de Hilbert) con las entropías clásicas (Shannon y Fisher). De lo cual logramos establecer que la versatilidad de las entropías propuestas, así como su excelente concordancia con los puntos críticos que presentan las tendencias de algunos de los parámetros físicos y químicos aunado a su bajo costo computacional, son superiores a las medidas de información clásicas y pueden emplearse como mejores descriptores de complejidad. Estos resultados se muestran en la sección 8.5, pág. 131

    Variant-specific pathophysiological mechanisms of AFF3 differently influence transcriptome profiles

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    Background: We previously described the KINSSHIP syndrome, an autosomal dominant disorder associated with intellectual disability (ID), mesomelic dysplasia and horseshoe kidney, caused by de novo variants in the degron of AFF3. Mouse knock-ins and overexpression in zebrafish provided evidence for a dominant-negative mode of action, wherein an increased level of AFF3 resulted in pathological effects. Methods: Evolutionary constraints suggest that other modes-of-inheritance could be at play. We challenged this hypothesis by screening ID cohorts for individuals with predicted-to-be damaging variants in AFF3. We used both animal and cellular models to assess the deleteriousness of the identified variants. Results: We identified an individual with a KINSSHIP-like phenotype carrying a de novo partial duplication of AFF3 further strengthening the hypothesis that an increased level of AFF3 is pathological. We also detected seventeen individuals displaying a milder syndrome with either heterozygous Loss-of-Function (LoF) or biallelic missense variants in AFF3. Consistent with semi-dominance, we discovered three patients with homozygous LoF and one compound heterozygote for a LoF and a missense variant, who presented more severe phenotypes than their heterozygous parents. Matching zebrafish knockdowns exhibit neurological defects that could be rescued by expressing human AFF3 mRNA, confirming their association with the ablation of aff3. Conversely, some of the human AFF3 mRNAs carrying missense variants identified in affected individuals did not rescue these phenotypes. Overexpression of mutated AFF3 mRNAs in zebrafish embryos produced a significant increase of abnormal larvae compared to wild-type overexpression further demonstrating deleteriousness. To further assess the effect of AFF3 variation, we profiled the transcriptome of fibroblasts from affected individuals and engineered isogenic cells harboring + / +, KINSSHIP/KINSSHIP, LoF/ +, LoF/LoF or KINSSHIP/LoF AFF3 genotypes. The expression of more than a third of the AFF3 bound loci is modified in either the KINSSHIP/KINSSHIP or the LoF/LoF lines. While the same pathways are affected, only about one third of the differentially expressed genes are common to the homozygote datasets, indicating that AFF3 LoF and KINSSHIP variants largely modulate transcriptomes differently, e.g. the DNA repair pathway displayed opposite modulation. Conclusions: Our results and the high pleiotropy shown by variation at this locus suggest that minute changes in AFF3 function are deleterious.</p

    Variant-specific pathophysiological mechanisms of AFF3 differently influence transcriptome profiles

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    Background: We previously described the KINSSHIP syndrome, an autosomal dominant disorder associated with intellectual disability (ID), mesomelic dysplasia and horseshoe kidney, caused by de novo variants in the degron of AFF3. Mouse knock-ins and overexpression in zebrafish provided evidence for a dominant-negative mode of action, wherein an increased level of AFF3 resulted in pathological effects. Methods: Evolutionary constraints suggest that other modes-of-inheritance could be at play. We challenged this hypothesis by screening ID cohorts for individuals with predicted-to-be damaging variants in AFF3. We used both animal and cellular models to assess the deleteriousness of the identified variants. Results: We identified an individual with a KINSSHIP-like phenotype carrying a de novo partial duplication of AFF3 further strengthening the hypothesis that an increased level of AFF3 is pathological. We also detected seventeen individuals displaying a milder syndrome with either heterozygous Loss-of-Function (LoF) or biallelic missense variants in AFF3. Consistent with semi-dominance, we discovered three patients with homozygous LoF and one compound heterozygote for a LoF and a missense variant, who presented more severe phenotypes than their heterozygous parents. Matching zebrafish knockdowns exhibit neurological defects that could be rescued by expressing human AFF3 mRNA, confirming their association with the ablation of aff3. Conversely, some of the human AFF3 mRNAs carrying missense variants identified in affected individuals did not rescue these phenotypes. Overexpression of mutated AFF3 mRNAs in zebrafish embryos produced a significant increase of abnormal larvae compared to wild-type overexpression further demonstrating deleteriousness. To further assess the effect of AFF3 variation, we profiled the transcriptome of fibroblasts from affected individuals and engineered isogenic cells harboring + / +, KINSSHIP/KINSSHIP, LoF/ +, LoF/LoF or KINSSHIP/LoF AFF3 genotypes. The expression of more than a third of the AFF3 bound loci is modified in either the KINSSHIP/KINSSHIP or the LoF/LoF lines. While the same pathways are affected, only about one third of the differentially expressed genes are common to the homozygote datasets, indicating that AFF3 LoF and KINSSHIP variants largely modulate transcriptomes differently, e.g. the DNA repair pathway displayed opposite modulation. Conclusions: Our results and the high pleiotropy shown by variation at this locus suggest that minute changes in AFF3 function are deleterious.</p

    Cause of Death and Predictors of All-Cause Mortality in Anticoagulated Patients With Nonvalvular Atrial Fibrillation : Data From ROCKET AF

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    M. Kaste on työryhmän ROCKET AF Steering Comm jäsen.Background-Atrial fibrillation is associated with higher mortality. Identification of causes of death and contemporary risk factors for all-cause mortality may guide interventions. Methods and Results-In the Rivaroxaban Once Daily Oral Direct Factor Xa Inhibition Compared with Vitamin K Antagonism for Prevention of Stroke and Embolism Trial in Atrial Fibrillation (ROCKET AF) study, patients with nonvalvular atrial fibrillation were randomized to rivaroxaban or dose-adjusted warfarin. Cox proportional hazards regression with backward elimination identified factors at randomization that were independently associated with all-cause mortality in the 14 171 participants in the intention-to-treat population. The median age was 73 years, and the mean CHADS(2) score was 3.5. Over 1.9 years of median follow-up, 1214 (8.6%) patients died. Kaplan-Meier mortality rates were 4.2% at 1 year and 8.9% at 2 years. The majority of classified deaths (1081) were cardiovascular (72%), whereas only 6% were nonhemorrhagic stroke or systemic embolism. No significant difference in all-cause mortality was observed between the rivaroxaban and warfarin arms (P=0.15). Heart failure (hazard ratio 1.51, 95% CI 1.33-1.70, P= 75 years (hazard ratio 1.69, 95% CI 1.51-1.90, P Conclusions-In a large population of patients anticoagulated for nonvalvular atrial fibrillation, approximate to 7 in 10 deaths were cardiovascular, whereasPeer reviewe

    Cuentos de nunca acabar. Aproximaciones desde la interculturalidad

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    Cuentos de nunca acabar. Aproximaciones desde la interculturalidad, surge después de la pandemia y su imposibilidad de socializar “en persona” con los compañeros de eventuales encuentros, porque la Comprensión Lectora tenía que reinventarse para su nueva reflexión cognitiva, adaptación contextual y reconstrucción del conocimiento. Este renovado enfoque de la realidad postpandemia, concebido en el marco de la educación intercultural comunitaria, busca potencializar los entornos naturales, sociales y culturales como recursos de aprendizaje multidisciplinario a través del lenguaje animado de los cuentos. En este marco, había que dinamizar la asignatura de Comunicación Oral y Escrita, que se dicta en los Primeros Niveles de los Centros de Apoyo de Otavalo, Cayambe, Latacunga y Riobamba, mediante un eje transversal donde los estudiantes escriban fundamentados en valores de la cosmovisión andina, considerando que provienen de varios lugares de la sierra y amazonía ecuatoriana. Todo surgió del encuentro presencial de un sábado cualquiera donde los estudiantes realizaban ejercicios narrativos, logrando una apreciable respuesta de imaginación, más emotiva que la clásica tarea de las Unidades, tanto así que, pasados unos días, seguían llegando sus escritos a mi correo. Entonces nos pusimos manos a la obra, cada estudiante tendría dos opciones como Actividad Integradora, la primera consistía en escribir un cuento de su propia inspiración, y la segunda analizar un clásico para comentar sus valores y antivalores. La mayor parte de estudiantes decidió escribir su propio cuento, de donde se escogieron algunas participaciones que podrían considerarse originales, para una edición que, respetando la transcripción de la tradición oral que prima en los sectores comunitarios, nos concretamos en revisar la puntuación y ortografía para publicarlos. Con esto buscamos innovar la Actividad Integradora, por algo más práctico y operativo para configurar los Objetos de Aprendizaje que buscamos. Así nació, en medio del camino, este libro de Cuentos de nunca acabar. Aproximaciones desde la interculturalidad, que ponemos en sus manos. Hernán Hermosa Mantilla Quito, junio de 202

    Effects of Anacetrapib in Patients with Atherosclerotic Vascular Disease

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    BACKGROUND: Patients with atherosclerotic vascular disease remain at high risk for cardiovascular events despite effective statin-based treatment of low-density lipoprotein (LDL) cholesterol levels. The inhibition of cholesteryl ester transfer protein (CETP) by anacetrapib reduces LDL cholesterol levels and increases high-density lipoprotein (HDL) cholesterol levels. However, trials of other CETP inhibitors have shown neutral or adverse effects on cardiovascular outcomes. METHODS: We conducted a randomized, double-blind, placebo-controlled trial involving 30,449 adults with atherosclerotic vascular disease who were receiving intensive atorvastatin therapy and who had a mean LDL cholesterol level of 61 mg per deciliter (1.58 mmol per liter), a mean non-HDL cholesterol level of 92 mg per deciliter (2.38 mmol per liter), and a mean HDL cholesterol level of 40 mg per deciliter (1.03 mmol per liter). The patients were assigned to receive either 100 mg of anacetrapib once daily (15,225 patients) or matching placebo (15,224 patients). The primary outcome was the first major coronary event, a composite of coronary death, myocardial infarction, or coronary revascularization. RESULTS: During the median follow-up period of 4.1 years, the primary outcome occurred in significantly fewer patients in the anacetrapib group than in the placebo group (1640 of 15,225 patients [10.8%] vs. 1803 of 15,224 patients [11.8%]; rate ratio, 0.91; 95% confidence interval, 0.85 to 0.97; P=0.004). The relative difference in risk was similar across multiple prespecified subgroups. At the trial midpoint, the mean level of HDL cholesterol was higher by 43 mg per deciliter (1.12 mmol per liter) in the anacetrapib group than in the placebo group (a relative difference of 104%), and the mean level of non-HDL cholesterol was lower by 17 mg per deciliter (0.44 mmol per liter), a relative difference of -18%. There were no significant between-group differences in the risk of death, cancer, or other serious adverse events. CONCLUSIONS: Among patients with atherosclerotic vascular disease who were receiving intensive statin therapy, the use of anacetrapib resulted in a lower incidence of major coronary events than the use of placebo. (Funded by Merck and others; Current Controlled Trials number, ISRCTN48678192 ; ClinicalTrials.gov number, NCT01252953 ; and EudraCT number, 2010-023467-18 .)
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