Secret Noise: Marcel Duchamp and the (un)sound object

Marcel Duchamp’s enigmatic sculpture With Hidden Noise (1916) is widely known, but its complex relationship to sound has received limited attention. Containing a secret object whose presence and identity is registered only by the noise it makes inside a ball of twine held between metal plates, this performative aspect of the work remains unavailable for contemporary audiences; as such, it participates in what Christof Migone qualifies as the ‘unsound’, the latent aural registers of silence or suppressed noise. Considering the secrecy and sonic capabilities of this object, as well as the work’s collaborative contexts alongside the repeated interest in sound found elsewhere in Duchamp’s activity, gives access to reading With Hidden Noise as a proposition about hidden or embodied knowledge, a knowledge whose complex and hybrid nature is specifically registered through the promise of a performance of sound that remains tacit but resonant

Bacterial riboproteogenomics : the era of N-terminal proteoform existence revealed

With the rapid increase in the number of sequenced prokaryotic genomes, relying on automated gene annotation became a necessity. Multiple lines of evidence, however, suggest that current bacterial genome annotations may contain inconsistencies and are incomplete, even for so-called well-annotated genomes. We here discuss underexplored sources of protein diversity and new methodologies for high-throughput genome re-annotation. The expression of multiple molecular forms of proteins (proteoforms) from a single gene, particularly driven by alternative translation initiation, is gaining interest as a prominent contributor to bacterial protein diversity. In consequence, riboproteogenomic pipelines were proposed to comprehensively capture proteoform expression in prokaryotes by the complementary use of (positional) proteomics and the direct readout of translated genomic regions using ribosome profiling. To complement these discoveries, tailored strategies are required for the functional characterization of newly discovered bacterial proteoforms

Lost and found : re-searching and re-scoring proteomics data aids genome annotation and improves proteome coverage

Prokaryotic genome annotation is heavily dependent on automated gene annotation pipelines that are prone to propagate errors and underestimate genome complexity. We describe an optimized proteogenomic workflow that uses ribosome profiling (ribo-seq) and proteomic data for Salmonella enterica serovar Typhimurium to identify unannotated proteins or alternative protein forms. This data analysis encompasses the searching of cofragmenting peptides and postprocessing with extended peptide-to-spectrum quality features, including comparison to predicted fragment ion intensities. When this strategy is applied, an enhanced proteome depth is achieved, as well as greater confidence for unannotated peptide hits. We demonstrate the general applicability of our pipeline by reanalyzing public Deinococcus radiodurans data sets. Taken together, our results show that systematic reanalysis using available prokaryotic (proteome) data sets holds great promise to assist in experimentally based genome annotation

Klinik und Prognose von 276 Patienten mit einem Karzinoidsyndrom – eine retrospektive multizentrische Studie

Unsere Arbeit zeigte, dass Patienten mit Karzinoidsyndrom eine sehr heterogene Gruppe mit meistens fortgeschrittener metastasierter Tumorerkrankung im Moment der Diagnosestellung darstellen. Die häufigste Primumlokalisation ist Dünndarm gefolgt von CUP-Syndrom. Diffuse Metastasierung (vor allem hepatische Metastasen) konnte bei fast allen Patienten festgestellt werden. Die typischen klinischen Manifestationen des Karzinoid Syndrom wie Diarrhö, Flush sowie Dyspnoe konnte bei 68,8 %, 74,3% und 40,9% dokumentiert werden. Aufgrund von ausgeprägter Symptomatik ist Lebensqualität von Patienten mit Karzinoidsyndrom deutlich eingeschränkt. Fast 75% Patienten gaben mehr als 3 flüssige Stühle pro Tag ab. Gewichtsverlust, Schwäche sowie Schmerzsymptomatik stellt häufiges klinisches Problem dar. Die Gabe von Opiaten war in 13,5 % aller Patienten notwendig. Ein signifikanter Gewichtsverlust trat bei 30,1 % Patienten auf. Eine Karzinoid Herzerkrankung wurde bei ein Drittel aller Patienten diagnostiziert und war verbunden mit signifikant schlechter Gesamtprognose (7 Jahre vs. 9 Jahre). Das charakteristische echokardiographische Merkmal von Karzinoid Herzerkrankung war Trikuspidalinsuffizienz, die bei 84% der Patientenbeschrieben wurde. Die meisten Patienten wurden chirurgisch behandelt. Die OP des Primärtumors erhielten 67% Patienten und 54,3% eine Metastasenchirurgie. Somatostatinanaloga sind von zentraler Bedeutung in der Therapie, allerdings stellt die mit der Zeit zunehmende Resistenz eine große Herausforderung dar. Insgesamt 80,4% Patienten wurden mit Somatostatinanaloga behandelt. Bei unzureichender Diarrhö-Kontrolle 17% brauchten zusätzliche Behandlung mit Loperamid oder Tinctura opii. Viele Patienten wurden mit verschiedenen Methoden zur Tumorkontrolle behandelt (wie lokal ablative Therapien, Chemotherapie, Radiorezeptortherapie). Die mittlere Überlebenszeit von Patienten mit Karzinoidsyndrom betrug 9,05 Jahre. Weibliches Geschlecht, Gewichtverlust, Fehlen von Karzinoid Herzkrankheit waren in unserem Patientenkollektiv mit besserer Überlebenszeit verbunden. Dies wurde auch für Patienten mit Flush und Schwäche beobachtet. Diarrhö sowie Schmerzsymptomatik zeigte für in der Überlebenszeit keinen signifikanten Unterschied

Possibility of using polycrystalline diamond in a medicine

katedra: KMT; přílohy: 1 CD ROM; rozsah: 65 s.The subject of the thesis for Masters is microfluidic devices, which are shown in the theoretical part. The devices have been charekterisaes the properties of natural diamond compering to imitation diamond and produced by technique CVD (Chemical Vapour Deposition). There is also a written description of the process of the creating polycrystalline and the grained diamond by MPCVD (Micro Wave Chemical Vapor Deposition) which were part of experiments which took place. It was proven during practical parts of experiments that they were useful in these kind of devices. By these experiments the measurements, figures and the way they make it is known. These figures have been described numericly, graphicly and there was also a discussion about them in detail.Diplomová práce je věnována tématice mikroprůtokových zařízení. Tyto byly představeny v teoretické části. Byly v ní charakterizovány vlastnosti přírodního diamantu ve srovnání s umělým diamantem, vytvořeným za použití technik CVD. Byl také popsán proces polykrystalického vznikání hrubozrnného diamantu vytvářeného metodou MPCVD, na kterém byly provedeny výzkumy. V praktické části byla představena řada experimentů, které charakterizovaly vlastnosti tohoto materiálu a určily jeho použitelnost pro takovéto zařízení. Byla popsána metodika měření výzkumů, získané údaje, způsob jejich obdržení. Tyto výsledky byly zpracovány číselně a graficky, byla také uskutečněná diskuse výsledků