Descrição da frequência de variantes genéticas no gene da endoglina em uma população do Nordeste do Brasil

Introdução: A endoglina (ENG, CD105) é um co-receptor da família transforming growth factor-beta e participa da regulação de processos celulares como proliferação, diferenciação, migração e apoptose. ENG é mais conhecida por sua expressão em células endoteliais, desempenhando papel importante na angiogênese e vasculogênese, porém sua expressão já foi associada a diferentes desfechos patogênicos, inclusive devido a mutações no gene ENG. Objetivos: Descrever a frequência de variantes genéticas no gene ENG, comparar com populações ancestrais e analisar as variantes genéticas que possam estar envolvidas em processos patogênicos em outras populações.  Metodologia: Foi utilizado o banco de dados do programa SCAALA (Social Change Asthma and Allergy in Latin America) para a população do estudo, sendo genotipado 1309 indivíduos usando o chip Illumina 2.5 Human Omni Bead e feitas análises in silico utilizando plataformas on-line. Resultados: As variantes genéticas rs10987746, rs10121110, rs11792480 e rs16930129 apresentaram frequência de menor alelo entre 16 a 48% na população estudada, as quais foram mais reiteradamente próximas do padrão africano que do europeu. Os SNVs foram relacionados aos mecanismos regulatórios genéticos conhecidos, pressupondo que essas variantes não estejam envolvidas diretamente em processos funcionais. Conclusão: São necessárias maiores investigações referentes aos mecanismos funcionais deste gene, visto que a endoglina participa de uma gama de processos celulares importantes e mais esforços devem ser feitos para estudos genéticos na população brasileira, considerando a mistura de populações

Caracterização de polimorfismos nos genes OPG, RANK e RANKL em uma população brasileira

Introdução: o sistema RANKL (receptor-ativador do fator nuclear-ligante κB)/RANK (receptor ativador do NF-kB)/OPG (osteoprotegrina) regula os processos fisiológicos e patológicos da remodelação óssea. Polimorfismos genéticos nos genes RANK, RANKL e OPG têm sido associados a doenças, em diferentes populações. Objetivo: descrever a frequência e o potencial regulatório dos polimorfismos do sistema RANK, RANKL e OPG, em uma população brasileira; avaliar o seu potencial como marcadores genéticos informativos de ancestralidade; comparar com patologias associadas em outras populações. Metodologia: neste estudo, 506 indivíduos adultos, participantes de uma coorte acometidos de asma e periodontite, tiveram o DNA genômico extraído e genotipado, utilizando-se a plataforma Illumina. As plataformas NCBI, RegulomeDB, Haploview 4.2 e rSNPBase foram consultadas e utilizadas para análises. Resultados e Discussão: os polimorfismos mais frequentes na população estudada foram o rs3102724 no gene OPG, com frequência de menor alelo (MAF) de 46%; o rs4941129 em RANK, MAF 50%; e o rs9525641 em RANKL, MAF 46%. Os rs3134063 (1f) em OPG e rs2200287 (1d) em RANKL apresentaram maior impacto funcional. Em OPG e RANK, nove polimorfismos se caracterizaram como marcadores genéticos informativos de ancestralidade, com predomínio nas populações YRI (africanos) e CEU (europeus). Os nove polimorfismos, com função intrônica, apresentaram MAF entre 2 a 46% na população-alvo e foram associados a patologias do metabolismo ósseo em outras populações. Conclusão: polimorfismos dos genes estudados se mostraram frequentes na população estudada e tiveram seus alelos mais frequentes associados a doenças em populações ancestrais. Sugere-se que sejam realizados mais estudo

Frequência de polimorfismos do gene TMEM18 numa população de crianças participantes de um estudo de coorte em Salvador – BA

Introdução: O TMEM18 é um gene localizado no cromossomo 2p25.3. A recente ligação deste gene à obesidade tem sido replicada em diversos estudos de associação genômica para algumas variantes alélicas. O presente artigo analisou as frequências alélicas e genotípicas de polimorfismos no gene TMEM18 numa amostra da população de Salvador – BA, e a diferença das MAFs encontradas em relação às principais populações que respondem pela composição étnica do Brasil – ameríndios, africanos e europeus. Metodologia: participaram deste estudo 1308 crianças com idade entre 4 a 11 anos, integrantes de um estudo de coorte do projeto Social Changes, Asthmaand Allergy in LatinAmerica (SCAALA). Para a genotipagem dos indivíduos foi utilizado o painel comercial Illumina Human Omni 2, com aproximadamente 2.5 milhões de marcadores. Utilizamos os softwares PLINK (PURCELL et al., 2007)  e Haploview (BROAD Institute) para controle de qualidade dos SNPs e análise de agregação de haplótipos (Linkage Desequilibrium - LD>4.2%), respectivamente. Resultados: As variantes do gene TMEM18 encontradas localizam-se na região 3´UTR (rs17729501, rs17042334, rs3187671) e intrônica (rs73153245, rs73153246, rs4241323, rs12990777, e rs2293084). Todos os polimorfismos estão em equilíbrio de Hardy-Weinberg. As frequências dos alelos menos frequentes (MAFs) observadas (9% e 9,3%) foram para os SNPs rs17729501 ers17042334, respectivamente.  Os polimorfismos com as menores MAFs - s17729501 (9%) e rs17729501 (9,3%) - apresentaram, simultaneamente, as menores frequências genotípicas para homozigose, 0,5% (C/C) e 0,8% (T/T), respectivamente. As maiores taxas de heterozigose observadas na população foram de 44% (A/C - rs2293084) e 47,3% (G/A -rs12990777) e correspondem às maiores frequências alélicas (rs2293084 – 34,9%; rs12990777 - 47,3%). Os SNPs rs3187671, rs73153245 e rs73153246 estão em desequilíbrio de ligação. Conclusão: As frequências alélicas obtidas para os SNPs, de uma forma geral, diferiram das frequências registradas para populações de referência. O presente trabalho contribuiu com informações sobre a ocorrência de polimorfismos no TMEM18 na população brasileira, bem como com as frequências alélicas dos SNPs analisadas para os futuros estudos do tipo GWAS.

Frequência alélica e potencial regulatório de polimorfismos no gene NELL1 em uma população da Bahia – Brasil

Introdução: o gene NELL1 codifica a proteína semelhante ao fator de crescimento epidérmico (do inglês Epidermal Growth factor (EGF)-like). GWASs e estudos de associação com genes candidatos têm sido utilizados ​​para estabelecer a conexão entre polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) no NELL1 e diversas doenças. Objetivo: descrever a frequência alélica e o potencial regulador dos polimorfismos do gene NELL1, estudados em uma população de Salvador (Bahia, Brasil) e descrever a frequência desses polimorfismos e a associação com diversas doenças, em populações africana, ameríndia, asiática e europeia. Metodologia: 1094 participantes foram recrutados através do Programa de Controle da Asma e da Rinite Alérgica no Estado da Bahia (ProAR). Os indivíduos tiveram o DNA genômico extraído e genotipado, utilizando-se a plataforma Illumina. Os SNP foram consultados através da plataforma SeattleSec Annotation. As bases de dados NCBI, RegulomeDB e Haploview 4.2 foram utilizadas para as análises. Resultados: foram analisados 346 SNPs do gene NELL1. Desses, 53 SNPs tiveram o MAF variando entre 50% e 40% e função intrônica. Os SNPs rs10833465 (alelo A), rs908944 (alelo C), rs1516766 (alelo A), rs10766739 (alelo G) e rs11025878 (alelo G) apresentam uma pontuação de 3, de acordo com o banco do RegulomeDB. O SNP rs7117671, com pontuação 2b, pode ter impacto regulatório e funcional. 101 SNPs apresentaram o MAF entre 39% e 20%. Dos polimorfismos menos frequentes nessa população, 192 apresentaram um MAF entre 19% e 2%. Discussão: alguns SNPs, com diferentes frequências, apresentaram alta probabilidade de impacto funcional. Foram encontrados, na literatura, estudos de associação dos SNPs e osteoporose, doenças metabólicas, condições inflamatórias, doenças neuropsiquiátricas e tumores malignos.  Conclusão: os polimorfismos do gene NELL1 estudados apresentaram diferentes frequências na população desse estudo e tiveram seus alelos associados a doenças em diferentes populações. Sugere-se que sejam realizados mais estudos

Spontaneous cytokine production in children according to biological characteristics and environmental exposures.

BACKGROUND: Environmental factors are likely to have profound effects on the development of host immune responses, with serious implications for infectious diseases and inflammatory disorders such as asthma. OBJECTIVE: This study was designed to investigate the effects of environmental exposures on the cytokine profile of children. METHODS: The study involved measurement of T helper (Th) 1 (interferon-gamma), 2 [interleukin (IL)-5 and IL-13], and the regulatory cytokine IL-10 in unstimulated peripheral blood leukocytes from 1,376 children 4-11 years of age living in a poor urban area of the tropics. We also assessed the impact of environmental exposures in addition to biological characteristics recorded at the time of blood collection and earlier in childhood (0-3 years before blood collection). RESULTS: The proportion of children producing IL-10 was greater among those without access to drinking water [p < 0.05, chi-square test, odds ratio (OR) = 1.67]. The proportion of children producing IL-5 and IL-10 (OR = 10.76) was significantly greater in households that had never had a sewage system (p < 0.05, trend test). CONCLUSIONS: These data provide evidence for the profound effects of environmental exposures in early life as well as immune homeostasis in later childhood. Decreased hygiene (lack of access to clean drinking water and sanitation) in the first 3 years of life is associated with higher spontaneous IL-10 production up to 8 years later in life

Toxocara Seropositivity, Atopy and Wheezing in Children Living in Poor Neighbourhoods in Urban Latin American

Background Toxocara canis and T. cati are parasites of dogs and cats, respectively, that infect humans and cause human toxocariasis. Infection may cause asthma-like symptoms but is often asymptomatic and is associated with a marked eosinophilia. Previous epidemiological studies indicate that T. canis infection may be associated with the development of atopy and asthma. Objectives To investigate possible associations between Toxocara spp. seropositivity and atopy and childhood wheezing in a population of children living in non-affluent areas of a large Latin American city. Methods The study was conducted in the city of Salvador, Brazil. Data on wheezing symptoms were collected by questionnaire, and atopy was measured by the presence of aeroallergen-specific IgE (sIgE). Skin prick test (SPT), total IgE and peripheral eosinophilia were measured. Toxocara seropositivity was determined by the presence of anti-Toxocara IgG antibodies, and intestinal helminth infections were determined by stool microscopy. Findings Children aged 4 to 11 years were studied, of whom 47% were seropositive for anti-Toxocara IgG; eosinophilia >4% occurred in 74.2% and >10% in 25.4%; 59.6% had elevated levels of total IgE; 36.8% had sIgE≥0.70 kU/L and 30.4% had SPT for at least one aeroallergen; 22.4% had current wheezing symptoms. Anti-Toxocara IgG was positively associated with elevated eosinophils counts, total IgE and the presence of specific IgE to aeroallergens but was inversely associated with skin prick test reactivity. Conclusion The prevalence of Toxocara seropositivity was high in the studied population of children living in conditions of poverty in urban Brazil. Toxocara infection, although associated with total IgE, sIgE and eosinophilia, may prevent the development of skin hypersensitivity to aeroallergens, possibly through increased polyclonal IgE and the induction of a modified Th2 immune reaction

Avaliação dos efeitos do extrato do cha verde (Camellia sinensis (L.) Kuntze) sobre a resposta imunohematopoetica de camundongos infectados com Listeria monocytogenes

Orientador: Mary Luci de Souza QueirozTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias MedicasResumo: Esse trabalho investiga o efeito protetor do tratamento com diferentes doses (50, 100 e 250 mg/Kg) do extrato padronizado de Chá Verde (GTE) em camundongos infectados com Listeria monocytogenes (LM). A eficácia terapêutica foi avaliada para uma dose letal de LM por sete dias consecutivos com diferentes doses de GTE. A proteção significativa do extrato foi verificada durante a fase aguda da infecção e um mecanismo de ação foi proposto a partir da análise dos efeitos do GTE sobre o crescimento e a diferenciação de progenitores hematopoéticos para granulócitos e macrófagos (CFU-GM) da medula óssea e do baço, sobre a atividade estimuladora de colônias (CSA) do soro, sobre a atividade lítica de células NK, sobre a proliferação de linfócitos e sobre a produção de citocinas de padrão Thl (IFN-y) / Th2 (IL-10) em animais normais e infectados com LM. Os resultados demonstraram que a resistência dos animais infectados com uma dose letal de LM tratados com GTE está relacionada com a modulação da mielossupressão e diminuição da hematopoese extramedular produzidas pela infecção. Também foi verificado um aumento da atividade lítica de células NK, da capacidade proliferativa de linfócitos e da polarização da resposta imunológica para Thl. O GTE não apresentou toxicidade sobre o estroma medular e estimulou a geração de progenitores para granulócitos-macrófagos em sistema de cultura líquida de longa duração (LTBMC). O mecanismo de ação da atividade imunomoduladora do GTE ainda não está completamente definido. No entanto, os mecanismos de ação apresentados neste trabalho são de fundamental importância para a atividade antibacteriana in vivo do GTEAbstract: In the present study we investigated the protective effects of the oral administration of Green tea (GTE) (50, 100 and 250mg/Kg) in mice infected with Listeria monocytogenes (LM). We demonstrated that GTE protects mice from a lethal dose of LM when administered prophylactically for seven consecutive days. To determine the mechanism of action of GTE, we examined the effect of GTE on the number of granulocyte and macrophage colony-forming units (CFU-GM) from bone marrow and spleen, on the colony-stimulating activity (CSA) of serum, on natural killer (NK) cell activity, on lymphocyte proliferation and on Thl/Th2-based cytokine production in normal and LM infected mice. Myelosuppression and extramedular hematopoiesis/splenomegaly were the major features of LM infection, in association with NK cell activation and alteration of lymphocyte proliferation. The resistance of mice infected with a lethal dose of LM but treated prophylactically with 100 and 250mg/Kg of GTE could be related to the modulation of myelosuppression and extramedular hematopoesis induced by the infection, and to an increase in NK cell activity, lymphocyte proliferation and polarization of the Thl-based immune response. The GTE extract was not toxic to either the stromal cell layer or to GM progenitors generated from long-term bone marrow culture (LTBMC). In this way, the mechanism of action through GTE exerts its pharmacological effect is not completely elucidated, although the parameters mentioned here are essential for its antibacterial effect in vivoDoutoradoDoutor em Farmacologi

Caracterização de polimorfismos genéticos nos genes SEPT7 E FMN1

Introdução: os genes SEPT7 e FMN1 têm sido associados a diversos processos fisiológicos e relacionados a doenças em diferentes populações. Objetivo: Descrever a frequência alélica e o potencial regulatório dos polimorfismos genéticos dos genes SEPT7 e FMN1 em uma população de Salvador, Bahia (Brasil) e investigar patologias descritas, até o momento, associadas a esses polimorfismos. Metodologia: foram recrutados 1094 indivíduos, através do Programa de Controle da Asma e da Rinite Alérgica no Estado da Bahia (ProAR),que tiveram o DNA genômico extraído e genotipado, utilizando-se a plataforma Illumina. &nbsp;Dados dos &nbsp;polimorfismos foram verificados nas plataformas NCBI, SeattleSeq Annotation e RegulomeDB. Resultados: foram analisados 16 SNPs do gene SEPT7 e 422 SNPs do FMNI. No SEPT7, 5 polimorfismos genéticos mais frequentes apresentaram o MAF variando entre 40% e 23%. No FMN1, 8 polimorfismos apresentaram o MAF variando entre 40% e 23%. Foram feitas análises da distribuição de frequências alélicas em populações de africanos, ameríndios, asiáticos e europeus. Discussão: no gene SEPT7, não foram encontrados polimorfismos missenses. O rs113220820, alelo G e rs62452781, alelo G podem estar relacionados à probabilidade de um impacto funcional. Os SNPs rs6462629, rs2893514 e rs10232178, com as maiores frequências de alelos polimórficos, apresentam MAF semelhante aos da população africana. Porém não foram encontrados polimorfismos, desse estudo, relacionando às doenças em outras populações. O FMN1 possui 39 SNPs missenses, que pode gerar alterações funcionais na proteína gerada. A presença do alelo G do rs2306277 (FMN1), também analisado em nossa população (MAF 4,6%), apresenta uma possível participação na formação e predisposição do câncer de próstata, em uma população russa. Conclusão: os conhecimentos sobre a frequência alélica e o potencial regulatório dos polimorfismos estudados permitiu conhecer os mais frequentes na população estudada e a possibilidades de associação a doenças em outras populações. Sugere-se que sejam realizados mais estudos

Teor de fenólicos totais e atividade antioxidante das sementes da Carpotroche brasiliensis (Raddi)

Introdução: A Carpotroche brasiliensis é uma árvore nativa brasileira, utilizada na medicina popular. Objetivo: avaliar a qualidade nutricional, fatores antinutricionais, teor de compostos fenólicos e determinar atividade antioxidante das sementes da planta. Metodologia: As sementes foram divididas em amostra natural (CB) e liofilizada (CBL). A composição centesimal e teor de ácido oxálico foram realizados em triplicata, segundo normas do Instituto Adolfo Lutz. O ácido fítico foi determinado por espectrofotometria, com reagente de Wade. Os fenóis foram determinados nos extratos aquosos e etanólico por Folin-Dennis e expressos em ácido gálico e tânico equivalentes.  A avaliação antioxidante foi determinada pela capacidade em sequestrar radicais livres, utilizando o modelo in vitro do 2,2 difenil-1-picril hidrazil radical (DPPH) e expressa em IC50. Análise de regressão linear foi utilizada como avaliação comparativa da ação antioxidante e teor de fenóis. Resultados: As amostras apresentaram alto teor de lipídios, 25g% para CB e 69g% para CBL. O teor de ácido fítico encontrado foi 1,43g% (dp=0,04) e de ácido oxálico foi de 4,8mg% (dp=0,47) na CBL. O teor de fenóis variou de 367,5 a 598mg% em ambos os extratos. A IC50 nos extratos foi de 2298,0 ìg/mL (dp=9,7) e 4150,7 ìg/mL (dp=43,3) respectivamente para o extrato aquoso e etanólico. O teor de fenóis foi diretamente proporcional ao porcentual da atividade antioxidante das amostras. Conclusão: As sementes apresentaram potencial para extração de óleo para fins farmacêuticos ou nutricionais. Os valores de antinutrientes estão dentro da faixa dos teores encontrados em variados tipos de alimentos, habitualmente consumidos pela população.   Abstract Introduction: Carpotroche brasiliensis is a native Brazilian tree, used in folk medicine. Objective: To evaluate the nutritional quality, antinutritional factors, phenolic content and antioxidant activity from plant seeds. Methodology: The seeds were divided into natural (CB) and lyophilized (CBL) samples. The composition and content of oxalic acid were performed in triplicate, according to the Instituto Adolfo Lutz’s recommendations. Phytic acid was determined by spectrophotometry using Wade reagent. The phenols were determined in aqueous and ethanol extracts by Folin-Dennis and expressed as gallic acid and tannic acid equivalents. Evaluation was determined by the antioxidant capacity to scavenge free radicals using the in vitro model of 2,2 difenil-1-picril hidrazil radical (DPPH) and expressed as IC50. Linear regression analysis was used for a comparative evaluation of antioxidant activity and phenolic content. Results: The samples showed high content of fat, 25g%for CB and 69g% for CBL. The content of phytic acid was found to be 1.43 g% (dp=0.04) and oxalic acid was 4.8 mg% (dp=0.47) in the sample dried by lyophilization. The total phenolic content ranged from 367.5% to 598mg% in both extracts. The IC50 for antioxidant activity was 2298.0 mg/ mL (dp=9.7) and 4150.7 g / mL (dp=43.3), respectively, for the aqueous and ethanolic extracts. The phenol content was directly proportional to the percentage of antioxidant activity of the samples. Conclusion: Based on our results, Carpotroche brasiliensis’s seeds showed potential for oil extraction for pharmaceutical or nutritional uses. The values of antinutrients were equivalents to various types of foods usually consumed by the population