Areas homogéneas de producción agrícola en la provincia de Buenos Aires, Argentina

Al considerarse los registros históricos de rendimientos de granos de girasol, maíz, trigo y soja, durante el período 1970-1993, se delimitaron 22 áreas homogéneas de producción agrícola en la provincia de Buenos Aires. Los rendimientos de los cultivos de maíz y de trigo fueron los principales contribuyentes en la definición de estas regiones. La distribución de áreas se vinculó con los grandes grupos de suelos y geoformas predominantes. Las regiones con menor producción de los cultivos se ubicaron hacia el sudoeste y centro-este de la provincia de Buenos Aires. En cambio, las regiones de mayor producción se detectaron hacia el nor-noreste y sudeste, dependiendo de los cultivos considerados.Twenty two homogeneous agricultural areas were delimited in the Buenos Aires province (Argentine). They were grouped considering sunflower, corn, soybean and wheat annual production in each district during 1970-1 993. The areas were mainly defined according to wheat and corn productivity. Regions were grouped in relation to the principal groups of soils and geoforms. Low agricultural production regions were located on the South-West and Central east, and, on the other hand, high agricultural production areas were located on the North-North east and South east, according to the crops that were considered.EEA General VillegasFil: Diaz Zorita, Martin. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria General Villegas; Argentina.Fil: Fernández Canigia, María Virginia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria General Villegas; Argentina

Agricultural homogeneous areas in Buenos Aires province, Argentine

Al considerarse los registros históricos de rendimientos de granos de girasol, maíz, trigo y soja, durante el período 1970-1993, se delimitaron 22 áreas homogéneas de producción agrícola en la provincia de Buenos Aires. Los rendimientos de los cultivos de maíz y de trigo fueron los principales contribuyentes en la definición de estas regiones. La distribución de áreas se vinculó con los grandes grupos de suelos y geoformas predominantes. Las regiones con menor producción de tos cultivos se ubicaron hacia el sudoeste y centro-este de la provincia de Buenos Aires. En cambio, las regiones de mayor producción se detectaron hacia el nor-noreste y sudeste, dependiendo de los cultivos considerados.Twenty two homogeneous agricultural areas were delimitad in the Buenos Aires province (Argentine). Tney were grouped considering sunfíower, corn, soybean and wheat annual production in each district during 1970-1993. The areas were mainiy defined accoraing to wheat and corn productivity. Regions were grouped in irelation to the principal groups of soils and geoforms. Low agricultural production regions were located on the South-West and Central east, and, on the other hand, high agricultural production areas were located on the North-North east and South east, accoraing to the crops that were considerad.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Size and structure of the dog population in San Martín de los Andes (Neuquén)

El tamaño y la estructura de la población canina de San Martín de los Andes se describió utilizando información proveniente de encuestas obtenidas a través de un muestreo estratificado (9 estratos y 624 lotes) y de la selección aleatoria de entrevistados (870). Los estratos se ordenaron de acuerdo al valor fiscal de los lotes (estrato 1 = 7 $/m2, 9 = 127$/m2). El tamaño de la población de perros se estimó en 5.480 y la cantidad de personas por perro en 5. La abundancia y densidad de perros tendió a aumentar en los lotes de menor valor. La edad media de los perros se estimó en 4,9 años, aumentó en los lotes de mayor valor y el 58 % de los animales tenía hasta 5 años de edad. El 21 % de los perros se desparasitaron al menos cada 4 meses y el 2,8 % de la hembras estaban castradas. La cantidad de perros independientes y no castrados fue 39 % y estaban principalmente en los lotes de menor valor (estrato 1 = 46 %, 9 = 26 %). La situación general de los perros en San Martín de los Andes es insatisfactoria según recomendaciones internacionales, y en particular, los sectores más humildes padecen la situación más desfavorable.Size and structure analysis of dog population in San Martín de los Andes was carried out through a questionnaire survey, using stratified sampling techniques (9 strata and 624 urban plots) and random informant selection (870). Strata were ordered according to treasury value of plots (stratum 1 = 7 $/m2, 9 = 127$/m2). Size of dog population was estimated in 5,480 and the amount of inhabitants per dogs was five. Dog abundance and density tend to increase in plots with lower values. Dog mean age was estimated in 4.9 yr., it increased in plots exhibiting higher values, and 58 % of dogs were 5 year old or less. The 21 % of dogs received treatment against parasites every 4 months or less and 28 % of dog females were castrated. The amount of independent and castrated dogs was 39 % of total population and they were located mainly in plots exhibiting lower values (strata 1 = 46 %, 9 = 26 %). The general situation concerning dogs in San Martín de los Andes is unsatisfactory according to international recommendations, and particularly, the humble urban districts are suffering the most disadvantageous conditions.Facultad de Ciencias Veterinaria

Size and structure of the dog population in San Martín de los Andes (Neuquén)

El tamaño y la estructura de la población canina de San Martín de los Andes se describió utilizando información proveniente de encuestas obtenidas a través de un muestreo estratificado (9 estratos y 624 lotes) y de la selección aleatoria de entrevistados (870). Los estratos se ordenaron de acuerdo al valor fiscal de los lotes (estrato 1 = 7 $/m2, 9 = 127$/m2). El tamaño de la población de perros se estimó en 5.480 y la cantidad de personas por perro en 5. La abundancia y densidad de perros tendió a aumentar en los lotes de menor valor. La edad media de los perros se estimó en 4,9 años, aumentó en los lotes de mayor valor y el 58 % de los animales tenía hasta 5 años de edad. El 21 % de los perros se desparasitaron al menos cada 4 meses y el 2,8 % de la hembras estaban castradas. La cantidad de perros independientes y no castrados fue 39 % y estaban principalmente en los lotes de menor valor (estrato 1 = 46 %, 9 = 26 %). La situación general de los perros en San Martín de los Andes es insatisfactoria según recomendaciones internacionales, y en particular, los sectores más humildes padecen la situación más desfavorable.Size and structure analysis of dog population in San Martín de los Andes was carried out through a questionnaire survey, using stratified sampling techniques (9 strata and 624 urban plots) and random informant selection (870). Strata were ordered according to treasury value of plots (stratum 1 = 7 $/m2, 9 = 127$/m2). Size of dog population was estimated in 5,480 and the amount of inhabitants per dogs was five. Dog abundance and density tend to increase in plots with lower values. Dog mean age was estimated in 4.9 yr., it increased in plots exhibiting higher values, and 58 % of dogs were 5 year old or less. The 21 % of dogs received treatment against parasites every 4 months or less and 28 % of dog females were castrated. The amount of independent and castrated dogs was 39 % of total population and they were located mainly in plots exhibiting lower values (strata 1 = 46 %, 9 = 26 %). The general situation concerning dogs in San Martín de los Andes is unsatisfactory according to international recommendations, and particularly, the humble urban districts are suffering the most disadvantageous conditions.Facultad de Ciencias Veterinaria

Changing Epidemiology of KPC Producing Klebsiella pneumoniae in Argentina: Emergence of Hypermucoviscous ST25 and High Risk Clone ST307

Objectives: To assess the epidemiological features of 76 Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing Klebsiella pneumoniae (KPC-Kp) isolates recovered from three hospitals in Buenos Aires, Argentina, during 2015–2017. Methods: Antimicrobial susceptibilities were determined according to CLSI Clinical and Laboratoy Standards guidelines. Molecular typing of KPC-Kp was performed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE)-Xbal and multilocus sequence typing. Plasmid encoded genes involved in carbapenem, fosfomycin and colistin resistance were detected by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. Also, mgrB inactivation was investigated in those colistin-resistant isolates. Genetic platforms involved in horizontal spread of blaKPC were investigated by PCR mapping. Results: Besides β-lactams, high resistance rates were observed for gentamycin, quinolones and trimethoprim-sulfamethoxazole. KPC-Kp sequence type (ST)258 corresponded to 26% of the isolates, while 42% corresponded to ST25. The other isolates were distributed in a diversity of lineages such as ST11 (10.5%), ST392 (10.5%), ST307, ST13, ST101, ST15 and ST551. blaKPC-2 was detected in 75 of 76 isolates, and one ST307 isolate harboured blaKPC-3. Tn4401 was identified as the genetic platform for blaKPC in epidemic lineages such as ST258 and ST307. However, in ST25 and ST392, which are usually not related to blaKPC, a blaKPC-bearing non-Tn4401 element was identified. Alterations in mgrB were detected in seven of 11 colistin-resistant isolates. Conclusions: Despite previous reports in Argentina, ST258 is no longer the absolute clone among KPC-Kp isolates. In the present study, dissemination of more virulent lineages such as the hypermucoviscous ST25 was detected. The emergence of the high-risk clone ST307 and occurrence of blaKPC-3 was noticed for the first time in this region.Fil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Elena, Alan Xavier. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Nuñez, Daiana Guevara. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; ArgentinaFil: Platero, Priscila Sevillano. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Universidad del Salvador; ArgentinaFil: De Paulis, Adriana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; ArgentinaFil: Magariños, Francisco. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Agudos "D. F. Santojanni"; ArgentinaFil: Alfonso, Claudia. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Agudos "D. F. Santojanni"; ArgentinaFil: Berger, María Alejandra. Hospital Aleman; ArgentinaFil: Fernández Canigia, Liliana. Hospital Aleman; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Microbiología, Inmunología y Biotecnología. Cátedra de Microbiología; Argentin

First national survey of antibiotic susceptibility of the Bacteroides fragilis group: emerging resistance to carbapenems in Argentina

The antibiotic susceptibility rates of 363 clinical Bacteroides fragilis group isolates collected from 17 centers in Argentina during the period from 2006 to 2009 were as follows: piperacillin-tazobactam, 99%; ampicillin-sulbactam, 92%; cefoxitin, 72%; tigecycline, 100%; moxifloxacin, 91%; and clindamycin, 52%. No metronidazole resistance was detected in these isolates during this time period. Resistance to imipenem, doripenem, and ertapenem was observed in 1.1%, 1.6%, and 2.3% of B. fragilis group strains, respectively. B. fragilis species showed a resistance profile of 1.5% to imipenem, 1.9% to doripenem, and 2.4% to ertapenem. This is the first report of carbapenem resistance in Argentina. The cfiA gene was present in 8 out of 23 isolates, all of them belonging to the B. fragilis species and displaying reduced susceptibility or resistance to carbapenems (MICs ≥ 4 μg/ml). Three out of eight cfiA-positive isolates were fully resistant to carbapenems, while 5 out of 8 isolates showed low-level resistance (MICs, 4 to 8 μg/ml). The inhibition by EDTA was a good predictor of the presence of metallo-β-lactamases in the fully resistant B. fragilis strains, but discrepant results were observed for low-level resistant isolates. B. fragilis was more susceptible to antimicrobial agents than other Bacteroides species. Bacteroides vulgatus species was the most resistant to ampicillin-sulbactam and piperacillin-tazobactam, and B. thetaiotaomicron/ovatus strains showed the highest level of resistance to carbapenems, with an unknown resistance mechanism. B. vulgatus and the uncommon non-Bacteroides fragilis species were the most resistant to moxifloxacin, showing an overall resistance rate of 15.1%.Fil: Fernández Canigia, Liliana. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Litterio, Mirta. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Legaria, María C.. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Castello, Liliana. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Predari, Silvia C.. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Di Martino, Ana. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Rossetti, Adelaida. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Rollet, Raquel. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Carloni, Graciela. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Bianchini, Hebe. Asociación Argentina de Microbiología; ArgentinaFil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Anaerobe Surveillance Team

Análisis genómico de dos cepas de K. pneumoniae ST11 resistentes a colistina portadoras de blaNDM-5 en una plataforma genética asociada a los integrones complejos de clase 1, con fenotipo de extrema resistencia a antibióticos

La metalo-β-lactamasa de Nueva Delhi (NDM) otorga resistencia a la mayoría de los antibióticos β-lactámicos, y generalmente se encuentra en aislamientos que poseen otros genes de resistencia (GRA) a otras familias de antibióticos. Estos aislamientos multidroga resistentes o con extrema resistencia, causan una variedad de infecciones asociadas con altas tasas de mortalidad en el ambiente hospitalario. Aunque el alelo NDM-1 es el más prevalente, otras variantes están aumentando su frecuencia en todo el mundo. En nuestro país se reportó recientemente el primer aislamiento clínico de Escherichia coli, Ec265, productora de NDM-5 y RmtB en América Latina. En nuestro estudio, se identificaron ambos genes blaNDM-5, y rmtB en dos cepas de Klebsiella pneumoniae aisladas de una mujer de 83 años en el año 2018. El primer aislamiento correspondió aun hisopado rectal que se tomó el primer día de ingreso al hospital dentro del programa de vigilancia. Se aisló la cepa H30pKpn productora de metalo-β-lactamasa y, en consecuencia, se instalaron las precauciones de contacto. Al cuarto día de hospitalización inició con fiebre, tos productiva y disnea. En este episodio se aisló de una muestra respiratoria la cepa HA31Kpn, también productora de metalo-β-lactamasa. HA30pKpn y HA31Kpn fueron resistentes a β-lactámicos (incluidos carbapenémicos y cefalosporinas de tercera y cuarta generación), gentamicina, amicacina, sulfametoxazol, trimetoprima, cloranfenicol, colistina (mutación R256G en gen pmrB) y ciprofloxacina. La paciente fue tratada con altas dosis de tigeciclina y fosfomicina. Evolucionó con descompensación aguda y coma hiperglucémico hiperosmolar y fallece a los 10 días de internación. Ambas cepas fueron secuenciadas por la tecnología MySeq Illumina. El ensamblado y posterior análisis por Bioinformática reveló que ambas cepas pertenecían al secuenciotipo (ST) 11. Además, al analizar los genomas por ResFinder y CARD, encontramos que ambas cepas compartían 17 genes de resistencia a antibióticos aac(6')-Ib-cr, aadA2, aph(3')-Ia, blaCTX-M-15, blaNDM-5, blaOXA-1, blaSHV-182, catB3, dfrA12, mph(A), oqxA, oqxB, qacE, qnrS1, rmtB, sul1, con 100% de identidad a GRA ya descriptos, y el gen fosA que correspondería a un nuevo alelo. La cepa HA30pKpn poseía además el GRA aph(3')-III. Considerando los resultados genotípicos y fenotipos, ambas cepas solo serían sensibles genéticamente a tigecilina, ya que el gen fosA, aunque presente en ambas cepas, no evidenció resistencia a nivel fenotípico. Ambas cepas poseían al replicón Col440I, y al igual que Ec265, compartían los replicones IncFIB y IncFII. También se realizaron ensayos de conjugación.La epidemiología mundial de K. pneumoniae productora de carbapenemasas muestra que diferentes linajes circulan en diferentes regiones geográficas, siendo el ST258 predominante en Europa y EE. UU., y el ST11 más frecuente en Asia oriental, y recientemente fue descripto también en Brasil y en nuestro pais. Aunque en general estos ST están asociados a la diseminación de la carbapenemasa blaKPC-2, nuestros resultados indican la emergencia del ST11 diseminando blaNDM-5, blaCTX-M-15, y rmtB en una misma cepa, con capacidad de colonizar y luego infectar a pacientes en nuestro país.Fil: Masso, Mariana Guillermina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: García Allende, Natalia. Hospital Alemán; ArgentinaFil: Alvarez, Verónica Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Campos, Josefina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación.Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán"; ArgentinaFil: Fox, Barbara. Hospital Aleman; ArgentinaFil: Carrera Paez, Laura Camila. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Fernández Canigia, Liliana. Hospital Alemán; ArgentinaFil: Quiroga, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaFil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; ArgentinaXIX Jornadas Argentinas de MicrobiologíaArgentinaAsociacion Argentina de Microbiologi

Susceptibility of important Gram-negative pathogens to tigecycline and other antibiotics in Latin America between 2004 and 2010

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The Tigecycline Evaluation and Surveillance Trial (T.E.S.T.) is a global surveillance study of antimicrobial susceptibility. This study reports data from Gram-negative isolates collected from centers in Latin America between 2004 and 2010.</p> <p>Methods</p> <p>Consecutive bacterial isolates were tested at each center using broth microdilution methodology as described by the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI). Susceptibility was determined using the CLSI interpretive criteria. For tigecycline the US Federal Drug Administration (FDA) criteria were used.</p> <p>Results</p> <p>A total of 16 232 isolates were analyzed. Susceptibility to imipenem, meropenem, and tigecycline was >95% against both non-extended-spectrum β-lactamase (ESBL) and ESBL producing <it>Escherichia coli</it>. Susceptibility to amikacin was also >95% for non-ESBL <it>E. coli</it>. 24.3% of <it>E. coli</it> were ESBL producers, ranging from 11.2% (58/519) in Colombia to 40.3% (31/77) in Honduras. Greater than 90% of non-ESBL <it>Klebsiella pneumoniae</it> were susceptible to tigecycline, carbapenems and amikacin. 35.3% of <it>K. pneumoniae</it> were ESBL producers, ranging from 17.2% (36/209) in Venezuela to 73.3% (55/75) in Honduras, with only imipenem and tigecycline maintaining >90% susceptibility. Greater than 90% of <it>Klebsiella oxytoca</it>, <it>Enterobacter</it> spp., and <it>Serratia marcescens</it> were susceptible to amikacin, carbapenems and tigecycline. The highest rates of susceptibility against <it>Acinetobacter baumannii</it> were seen for minocycline (89.4%) and imipenem (62.5%), while 95.8% of the <it>A. baumannii</it> isolates displayed an MIC ≤2 μg/mL for tigecycline.</p> <p>Conclusions</p> <p>In this study carbapenems and tigecycline remain active against Enterobacteriaceae and <it>A. baumannii</it>; however, there is cause for concern with carbapenem non-susceptible isolates reported in all countries included in this study.</p