A protein foszfatáz Z szerepének felderítése a patogén gombák jelátviteli folyamataiban = Investigation of the function of protein phosphatase Z in the signal transduction of pathogenic fungi

A protein foszfatáz Z C. albicans ortológját kódoló gén, a CaPPZ1 klónozása és szekvenálása segítségével alátámasztottuk a humán patogén nagyfokú genetikai polimorfizmusát. Legalább 4 CaPPZ1 allélt azonosítottunk, és egy találtunk egy olyan hipervariábilis gén régiót, ami alkalmasnak bizonyult klinikai C. albicans izolátumok genotipizálása. In vitro mutagenézissel azonosítottuk a foszfatáz enzim aktivitását, illetve stabilitását biztosító aminosav oldalláncokat. Molekuláris genetikai módszerekkel bebizonyítottuk, hogy a CaPPZ1 szerepet játszik a gomba kation homeosztázisában, sejtfal bioszintézisében és membrán potenciáljának meghatározásában, valamint fontos a hifa növekedésben, és a patogén gomba fertőzőképességében. Megállapítottuk, hogy az A. fumigatus és az A. nidulans PPZ ortológok szerkezete konzerválódott, és a phzA, illetve a ppzA géntermékekről igazoltuk, hogy funkcionálisan helyettesítik a hiányzó PPZ enzimeket S. cerevisiae és S. pombe mutánsokban. Ennek ellenére a ppzA gén inaktiválása nem járt a várt fenotípusok változásokkal A. nidulansban, viszont érzékenységet okozott oxidálószer kezeléssel szemben. A genetikailag távol álló C. albicans és S. cerevisiae PPZ mutánsokkal történő összehasonlítás alapján arra a következtetésre jutottunk, hogy az PPZ enzimek részt vesznek a gombák oxidatív stressz válaszának modulálásában. Ily módon egy régóta ismert foszfatáz új funkcióját sikerült azonosítanunk. | By cloning and sequencing of the protein phosphatase Z (PPZ) coding CaPPZ1 gene we confirmed the high level of genetic polymorphism of the human pathogen C. albicans. We identified four different alleles of the gene and found a hypervariable DNA segment that was suitable for genotyping of clinical C. albicans isolates. With in vitro mutagenesis we pinpointed the amino acid residues that are important in the activity / stability of the phosphatase. With the aid of molecular genetics we revealed that CaPPZ1 was important in the cation homeostasis, cell wall integrity and membrane potential determination of the fungus. In addition to these general PPZ roles, we also found that CaPPZ1 was involved in the germ tube formation and in the virulence of the pathogen. By extending these results we predicted that the structures of the PPZ ortholog proteins were well conserved in A. fumigatus and A. nidulans, and demonstrated that the corresponding phzA and ppzA phosphatases behaved as the functional replacements of the yeast enzymes in S. cerevisiae and S. pombe deletion mutants. However, the inactivation of the PPZA gene did not result in the expected phenotypes in A. nidulans, but caused sensitivity to oxidative agents. By the comparison with the genetically distantly related C. albicans and S. cereveisiae PPZ mutants we proved that all of these PPZ phosphatases acted in the oxidative stress mediation of fungi. Thus, we identified a novel function for a long known enzyme family

Universal Dependencies and Morphology for Hungarian - and on the Price of Universality

In this paper, we present how the principles of universal dependencies and morphology have been adapted to Hungarian. We report the most challenging grammatical phenomena and our solutions to those. On the basis of the adapted guidelines, we have converted and manually corrected 1,800 sentences from the Szeged Treebank to universal dependency format. We also introduce experiments on this manually annotated corpus for evaluating automatic conversion and the added value of language-specific, i.e. non-universal, annotations. Our results reveal that converting to universal dependencies is not necessarily trivial, moreover, using language-specific morphological features may have an impact on overall performance

A foszfoprotein foszfatáz (PPP) enzimcsalád funkciójának vizsgálata Arabidopsis thalianaban = Functional study of the PPP family of phosphoprotein phosphatases in Arabidopsis thaliana

A szerin/treonin-specifikus foszfoprotein foszfatázok (PPP-k) minden eukariótában megtalálhatók, szabályozó szerepük azonban növényekben alig ismert. Az Arabidopsis genom 26 PPP katalitikus alegységet kódol, PP1- és PP2A-típusú, újtípusú és ismétlődő kelch motívumot tartalmazó foszfatázokat. Az Arabidopsis PPP-k funkciójának tanulmányozása céljából azonosítottuk a PP6At1(AtFyPP1), PP7, BSL3 és TOPP1(PP1) foszfatáz génekben T-DNS inszerciót hordozó mutánsokat. A pp6at1 mutáns csírázási és növekedési tesztekben hiperszenzitív volt nagy koncentrációjú sóra, ozmotikumokra és abszcizinsavra (ABA). Gyengült prolinfelhalmozó képessége és csökkent benne a prolin bioszintézisét reguláló, stressz-és ABA-indukált P5CS1 gén expressziója. A fentiek alapján a PP6At1 a környezeti stresszekre adott metabolikus válaszokat szabályozza. A pp7 mutáns hipokotilmegnyúlása kék fényben fokozott volt, vörös vagy fehér fényben nem. Úgy tűnik, hogy a PP7 a kék fény jelátvitelének fontos eleme. A BSL3, TOPP1 génekben, valamint a PP2A enzim PP2A-2 katalitikus alegységének és egy B" regulátor alegységének génjében levő inszerciókra (GABI-Kat vonalak) homozigóta növényeknek nem volt észlelhető fenotípusa. A PP2A hőstabil inhibitor fehérjékkel asszociálódhat. Azonosítottuk a SET Arabidopsis homológját (AtSET), amely a PP2A hatékony inhibitora. A rekombináns AtSET gátolja a hiszton H3 Ser-10 oldalláncának defoszforilációját, így szerepe lehet a transzkripció szabályozásában. | Serine/threonine specific phosphoprotein phosphatases (PPPs) are ubiquitous enzymes in all eukaryotes, but their regulatory functions are largely unknown in plants. The Arabidopsis genome encodes 26 catalytic subunits of PPPs related to PP1, PP2A, novel PPPs, and phosphatases with kelch-repeats. To study the function of Arabidopsis PPPs, we have identified T-DNA insertion mutants in the genes encoding PP6At1(AtFyPP1), PP7, BSL3, and TOPP1(PP1) phosphatases. The pp6at1 mutant was hypersensitive to high salt, osmotics and abscizic acid (ABA) as defined by germination and plant growth assays. Moreover, its impaired proline accumulation and reduced expression of the stress and ABA-induced P5CS1 gene, which controls proline biosynthesis, suggest that PP6At1 controls metabolic responses to environmental stress. The pp7 mutant showed increased hypocotyl elongation upon blue light irradiation, but not under red, or white light. Thus, PP7 appears to be an important factor in blue light signalling. Homozygous plants for the insertions in BSL3, TOPP1 and in genes encoding the PP2A-2 catalytic and a B" regulatory subunit of PP2A (GABI-Kat lines) had no observable phenotype. PP2A can be associated with heat stable inhibitory proteins.We identified the Arabidopsis homolog of SET (AtSET), which is a potent inhibitor of PP2A. Recombinant AtSet inhibits the dephosphorylation of Ser-10 in histone H3 and might be involved in the regulation of transcription

Effects of Land Use and Management on Soil Hydraulic Properties

Abstract Soil hydraulic properties are among the most importantparameters that determine soil quality and its capabilityto serve the ecosystem. Land use can significantlyinfluence soil properties, including its hydraulic conditions;however, additional factors, such as changes in climate(temperature and precipitation), can further influencethe land use effects on soil hydraulic properties. Inorder to develop possible adaptation measures and mitigateany negative effects of land use and climatic changes,it is important to study the impact of land use and changesin land use on soil hydraulic properties. In this paper,we summarize recent studies examining the effect of landuse/land cover and the associated changes in soil hydraulicproperties, mainly focusing on agricultural scenariosof cultivated croplands and different tillage systems.</jats:p