Mineralogia de luvissolos formados sob gradiente pluviométrico no semiárido paraibano.

Os Luvissolos se destacam como uma das classes de solo mais representativas do Semiárido. Assim, torna-se importante o conhecimento sobre suas características mineralógicas e sobre os diversos fenômenos relacionados à sua pedogênese, bem como sobre a potencial reserva de nutrientes disponível para as plantas. Desse modo, o objetivo do presente trabalho foi conhecer qualitativamente a mineralogia das frações areia, silte e argila de Luvissolos no Semiárido paraibano, desenvolvidos sob um gradiente de pluviosidade. Foram descritos e coletados solos em três condições de umidade distintas de acordo com o índice de precipitação pluviométrica, designadas como muito seca (precipitação < 400 mm), seca (precipitação maior ou igual 400 mm e < 600 mm) e subúmida (precipitação maior ou igual 600 mm). A avaliação da mineralogia das frações do solo, foi feita selecionando amostras dos horizontes superiores, médios e inferiores dos perfis estudados. As amostras de terra fina seca ao ar de cada horizonte foram submetidas ao processo de fracionamento via úmida (areia) e por decantação (silte e argila). A frações foram submetidas a técnica de difratometria de raios-X, para a identificação dos minerais constituintes de cada. Notou-se que a composição mineralógica dos solos apresentou-se homogênea, pois a fração argila em sua constituição mineral foi semelhante nos três Luvissolos estudados, com predomínio de minerais secundários como esmectita, ilita e caulinita e alguns interestratificados desses minerais. De maneira geral, as alterações nos índices de precipitação foram determinantes na formação dos Luvissolos, que, em função do seu material de origem são mais sensíveis aos processos de intemperismo

Caracterização de Planossolos nátricos em um gradiente pluviométrico no Semiárido brasileiro.

O solo é um recurso natural de extrema importância para a humanidade e como tal tem sido amplamente estudado sob diversos aspectos. De modo geral, o solo apresenta grande variabilidade de ambiente, necessário informações sobre a fertilidade, gênese e mineralogia. Assim, o objetivo desse trabalho foi avaliar a influência do gradiente pluviométrico na formação e no desenvolvimento de Planossolos localizados em distintos pedoambientes, no estado da Paraíba, estudando seus atributos morfológicos, físicos e químicos. Foi escolhida parte da região semiárida paraibana e subdivida em três subtipos climáticos de acordo com a precipitação média anual: muito seca ( 400 e 600 mm), foram abertas três trincheiras para descrição morfológica e coleta de amostras de cada perfil dos solos estudados. Essas amostras foram caracterizadas quanto aos seus atributos morfológicos, físicos (granulometria, argila dispersa em água, densidade do solo e de partículas, grau de floculação e porosidade) e químicos (Ca, Mg, Na e K, Al, H+Al, COT, P e pH). Nos perfis dos Planossolos estudados não foi possível observar relação da profundidade com as condições climáticas, por serem solos formados a partir de rochas mais resistentes ao intemperismo. Aparentemente houve pouca influência do clima na profundidade, sendo mais raso o solo da condição seca e mais profundo o da condição muito seca; por outro lado a precipitação foi preponderante na formação dos horizontes diagnósticos (B plânico), com teores de argila proporcionais à precipitação. Os Planossolos apresentaram altos teores de bases trocáveis e quanto a fertilidade, houve uma tendência de lixiviação de bases na condição subúmida. Em alguns horizontes dos solos estudados foram verificados altos níveis de salinidade

Characterization of Neossolos Regolíticos (Psamments) through a pluviometric gradient in Brazilian semiarid.

There is still little information about Neossolos Regoliticos ( Neosols) , therefore, generating information about fertility, genesis and mineralogy is important to define the proper use and management. The work aimed to characterize morphologically, physically, chemically and mineralogically three Neossolos Regoliticos (Psamments) along a pluviometric gradient ( 400 and 600 mm). For this purpose, trenches were opened, where the description and collection of soil samples proceeded. It was not possible to notice rainfall interference in the differentiation of horizons and depth of soils. However, increased clay contents from very dry soil to the sub-humid zone, showing the influence to rainfall that is also reflected in the natural fertility of Neossolos Regoliticos (Psamments). No Brasil, o conhecimento sobre esses solos é escasso, o que demanda geração de informações sobre a sua fertilidade, gênese e mineralogia, entre outros aspectos, para o uso e manejo adequados. O objetivo desse trabalho foi realizar a caracterização morfológica, física, química e mineralógica de Neossolos Regolíticos ao longo de um gradiente pluviométrico no semiárido Paraibano. Para tanto, dividiu-se a região em três zonas de acordo com a precipitação média anual: muito seca (_> 400 e 600 mm) onde foram abertas três trincheiras para coleta e descrição dos solos em cada horizonte. Não foi possível notar interferência da pluviometria na diferenciação dos horizontes e na profundidade dos solos. Os teores de argila aumentaram do solo da zona muito seca para a subúmida, evidenciando a influência das precipitações pluviométricas que também se refletiram na fertilidade natural dos Neossolos Regolíticos. A mineralogia da fração argila mostrou-se relativamente semelhante entre os solos estudados com caulinita, quartzo, feldspato e mica

Imaging Electronic Correlations in Twisted Bilayer Graphene near the Magic Angle

Twisted bilayer graphene with a twist angle of around 1.1{\deg} features a pair of isolated flat electronic bands and forms a strongly correlated electronic platform. Here, we use scanning tunneling microscopy to probe local properties of highly tunable twisted bilayer graphene devices and show that the flat bands strongly deform when aligned with the Fermi level. At half filling of the bands, we observe the development of gaps originating from correlated insulating states. Near charge neutrality, we find a previously unidentified correlated regime featuring a substantially enhanced flat band splitting that we describe within a microscopic model predicting a strong tendency towards nematic ordering. Our results provide insights into symmetry breaking correlation effects and highlight the importance of electronic interactions for all filling factors in twisted bilayer graphene.Comment: Main text 9 pages, 4 figures; Supplementary Information 25 page

Pan-Cancer Analysis of lncRNA Regulation Supports Their Targeting of Cancer Genes in Each Tumor Context

Long noncoding RNAs (lncRNAs) are commonly dys-regulated in tumors, but only a handful are known toplay pathophysiological roles in cancer. We inferredlncRNAs that dysregulate cancer pathways, onco-genes, and tumor suppressors (cancer genes) bymodeling their effects on the activity of transcriptionfactors, RNA-binding proteins, and microRNAs in5,185 TCGA tumors and 1,019 ENCODE assays.Our predictions included hundreds of candidateonco- and tumor-suppressor lncRNAs (cancerlncRNAs) whose somatic alterations account for thedysregulation of dozens of cancer genes and path-ways in each of 14 tumor contexts. To demonstrateproof of concept, we showed that perturbations tar-geting OIP5-AS1 (an inferred tumor suppressor) andTUG1 and WT1-AS (inferred onco-lncRNAs) dysre-gulated cancer genes and altered proliferation ofbreast and gynecologic cancer cells. Our analysis in-dicates that, although most lncRNAs are dysregu-lated in a tumor-specific manner, some, includingOIP5-AS1, TUG1, NEAT1, MEG3, and TSIX, synergis-tically dysregulate cancer pathways in multiple tumorcontexts

Genomic, Pathway Network, and Immunologic Features Distinguishing Squamous Carcinomas

This integrated, multiplatform PanCancer Atlas study co-mapped and identified distinguishing molecular features of squamous cell carcinomas (SCCs) from five sites associated with smokin

Pan-cancer Alterations of the MYC Oncogene and Its Proximal Network across the Cancer Genome Atlas

Although theMYConcogene has been implicated incancer, a systematic assessment of alterations ofMYC, related transcription factors, and co-regulatoryproteins, forming the proximal MYC network (PMN),across human cancers is lacking. Using computa-tional approaches, we define genomic and proteo-mic features associated with MYC and the PMNacross the 33 cancers of The Cancer Genome Atlas.Pan-cancer, 28% of all samples had at least one ofthe MYC paralogs amplified. In contrast, the MYCantagonists MGA and MNT were the most frequentlymutated or deleted members, proposing a roleas tumor suppressors.MYCalterations were mutu-ally exclusive withPIK3CA,PTEN,APC,orBRAFalterations, suggesting that MYC is a distinct onco-genic driver. Expression analysis revealed MYC-associated pathways in tumor subtypes, such asimmune response and growth factor signaling; chro-matin, translation, and DNA replication/repair wereconserved pan-cancer. This analysis reveals insightsinto MYC biology and is a reference for biomarkersand therapeutics for cancers with alterations ofMYC or the PMN

Spatial Organization and Molecular Correlation of Tumor-Infiltrating Lymphocytes Using Deep Learning on Pathology Images

Beyond sample curation and basic pathologic characterization, the digitized H&E-stained images of TCGA samples remain underutilized. To highlight this resource, we present mappings of tumorinfiltrating lymphocytes (TILs) based on H&E images from 13 TCGA tumor types. These TIL maps are derived through computational staining using a convolutional neural network trained to classify patches of images. Affinity propagation revealed local spatial structure in TIL patterns and correlation with overall survival. TIL map structural patterns were grouped using standard histopathological parameters. These patterns are enriched in particular T cell subpopulations derived from molecular measures. TIL densities and spatial structure were differentially enriched among tumor types, immune subtypes, and tumor molecular subtypes, implying that spatial infiltrate state could reflect particular tumor cell aberration states. Obtaining spatial lymphocytic patterns linked to the rich genomic characterization of TCGA samples demonstrates one use for the TCGA image archives with insights into the tumor-immune microenvironment