Characterization of eukaryotic microbial diversity in hypersaline Lake Tyrrell, Australia.

This study describes the community structure of the microbial eukaryotic community from hypersaline Lake Tyrrell, Australia, using near full length 18S rRNA sequences. Water samples were taken in both summer and winter over a 4-year period. The extent of eukaryotic diversity detected was low, with only 35 unique phylotypes using a 97% sequence similarity threshold. The water samples were dominated (91%) by a novel cluster of the Alveolate, Apicomplexa Colpodella spp., most closely related to C. edax. The Chlorophyte, Dunaliella spp. accounted for less than 35% of water column samples. However, the eukaryotic community entrained in a salt crust sample was vastly different and was dominated (83%) by the Dunaliella spp. The patterns described here represent the first observation of microbial eukaryotic dynamics in this system and provide a multiyear comparison of community composition by season. The lack of expected seasonal distribution in eukaryotic communities paired with abundant nanoflagellates suggests that grazing may significantly structure microbial eukaryotic communities in this system

«La relation de limitation et d’exception dans le français d’aujourd’hui : excepté, sauf et hormis comme pivots d’une relation algébrique »

L’analyse des emplois prépositionnels et des emplois conjonctifs d’ “excepté”, de “sauf” et d’ “hormis” permet d’envisager les trois prépositions/conjonctions comme le pivot d’un binôme, comme la plaque tournante d’une structure bipolaire. Placées au milieu du binôme, ces prépositions sont forcées par leur sémantisme originaire dûment métaphorisé de jouer le rôle de marqueurs d’inconséquence systématique entre l’élément se trouvant à leur gauche et celui qui se trouve à leur droite. L’opposition qui surgit entre les deux éléments n’est donc pas une incompatibilité naturelle, intrinsèque, mais extrinsèque, induite. Dans la plupart des cas (emplois limitatifs), cette opposition prend la forme d’un rapport entre une « classe » et le « membre (soustrait) de la classe », ou bien entre un « tout » et une « partie » ; dans d’autres (emplois exceptifs), cette opposition se manifeste au contraire comme une attaque de front portée par un « tout » à un autre « tout ». De plus, l’inconséquence induite mise en place par la préposition/conjonction paraît, en principe, tout à fait insurmontable. Dans l’assertion « les écureuils vivent partout, sauf en Australie » (que l’on peut expliciter par « Les écureuils vivent partout, sauf [qu’ils ne vivent pas] en Australie »), la préposition semble en effet capable d’impliquer le prédicat principal avec signe inverti, et de bâtir sur une telle implication une sorte de sous énoncé qui, à la rigueur, est totalement inconséquent avec celui qui le précède (si « les écureuils ne vivent pas en Australie », le fait qu’ils « vivent partout » est faux). Néanmoins, l’analyse montre qu’alors que certaines de ces oppositions peuvent enfin être dépassées, d’autres ne le peuvent pas. C’est, respectivement, le cas des relations limitatives et des relations exceptives. La relation limitative, impliquant le rapport « tout » - « partie », permet de résoudre le conflit dans les termes d’une somme algébrique entre deux sous énoncés pourvus de différent poids informatif et de signe contraire. Les valeurs numériques des termes de la somme étant déséquilibrées, le résultat est toujours autre que zéro. La relation exceptive, au contraire, qui n’implique pas le rapport « tout » - « partie », n’est pas capable de résoudre le conflit entre deux sous énoncés pourvus du même poids informatif et en même temps de signe contraire : les valeurs numériques des termes de la somme étant symétriques et égales, le résultat sera toujours équivalent à zéro

Towards Protein Crystallization as a Process Step in Downstream Processing of Therapeutic Antibodies: Screening and Optimization at Microbatch Scale

Crystallization conditions of an intact monoclonal IgG4 (immunoglobulin G, subclass 4) antibody were established in vapor diffusion mode by sparse matrix screening and subsequent optimization. The procedure was transferred to microbatch conditions and a phase diagram was built showing surprisingly low solubility of the antibody at equilibrium. With up-scaling to process scale in mind, purification efficiency of the crystallization step was investigated. Added model protein contaminants were excluded from the crystals to more than 95%. No measurable loss of Fc-binding activity was observed in the crystallized and redissolved antibody. Conditions could be adapted to crystallize the antibody directly from concentrated and diafiltrated cell culture supernatant, showing purification efficiency similar to that of Protein A chromatography. We conclude that crystallization has the potential to be included in downstream processing as a low-cost purification or formulation step

The impact of oxygen on the transcriptome of recombinant S. cerevisiae and P. pastoris - a comparative analysis

Background: Saccharomyces cerevisiae and Pichia pastoris are two of the most relevant microbial eukaryotic platforms for the production of recombinant proteins. Their known genome sequences enabled several transcriptomic profiling studies under many different environmental conditions, thus mimicking not only perturbations and adaptations which occur in their natural surroundings, but also in industrial processes. Notably, the majority of such transcriptome analyses were performed using non-engineered strains. In this comparative study, the gene expression profiles of S. cerevisiae and P. pastoris, a Crabtree positive and Crabtree negative yeast, respectively, were analyzed for three different oxygenation conditions (normoxic, oxygen-limited and hypoxic) under recombinant protein producing conditions in chemostat cultivations. Results: The major differences in the transcriptomes of S. cerevisiae and P. pastoris were observed between hypoxic and normoxic conditions, where the availability of oxygen strongly affected ergosterol biosynthesis, central carbon metabolism and stress responses, particularly the unfolded protein response. Steady state conditions under low oxygen set-points seemed to perturb the transcriptome of S. cerevisiae to a much lesser extent than the one of P. pastoris, reflecting the major tolerance of the baker's yeast towards oxygen limitation, and a higher fermentative capacity. Further important differences were related to Fab production, which was not significantly affected by oxygen availability in S. cerevisiae, while a clear productivity increase had been previously reported for hypoxically grown P. pastoris. Conclusions: The effect of three different levels of oxygen availability on the physiology of P. pastoris and S. cerevisiae revealed a very distinct remodelling of the transcriptional program, leading to novel insights into the different adaptive responses of Crabtree negative and positive yeasts to oxygen availability. Moreover, the application of such comparative genomic studies to recombinant hosts grown in different environments might lead to the identification of key factors for efficient protein production

Bilinguisme tardif franco-allemand. Etude de l'attrition d’items lexicaux et sémantiques.

La présente étude traite du phénomène de l'attrition dans le cas du bilinguisme tardif franco-allemand chez l'adulte allemand vivant dans un environnement francophone (France métropolitaine). Un bilan de travaux récents dans le domaine de l'attrition a révélé le caractère sélectif et ordonné du phénomène étudié. Notre cadre de référence renvoie aux hypothèses postulants une organisation modulaire des langues (Fodor, 1983; Paradis, 1997) avec un traitement hiérarchique des différents niveaux linguistiques ('data-/ concept-driven': Durgunoglu & Roedinger, 1987). Il s'appuie notamment sur un modèle de la production orale (Levelt, 1989), adapté à la compréhension par De Bot (1992). La problématique qui occupe notre recherche est double. Conscients du caractère sélectif et ordonné du phénomène étudié, nous cherchons dans un premier temps à distinguer la vulnérabilité des différents niveaux linguistiques, c'est-à-dire l'organisation des deux langues dans le paradigme de la lecture naturelle, afin de mettre à l'épreuve l'hypothèse d'un accès temporairement inhibé (Paradis, 1985, 1993, etc.) et celle proclamant une réorganisation dans un système hautement dynamique (Pavlenko, 2000). Nous utilisons dans un second temps l'enregistrement des mouvements oculaires, une approche psychologique non-intrusive afin d'observer les comportements vis-à-vis d'interférences franco-allemandes aux niveaux orthographique, morphologique et sémantique. La dichotomie entre traitements de bas et de haut niveau s'avérait importante pour comprendre les différents indices oculaires. Les fixations initiales plus longues pour les phrases contenant des interférences indiquent la détection d'une anomalie. Les refixations plus longues et plus probables lors des interférences morphologiques et sémantiques semblent témoigner d'un traitement de haut niveau (concept-driven). Le modèle de Levelt (1989) qui classe les items morphologiques avec les items phonologiques dans le niveau des lexèmes ne peut ainsi être soutenu

Untersuchung des Ermuedungsverhaltens von thermomechanisch behandeltem Verguetungsstahl mit Endumformung im (#gamma#+#alpha#)-Gebiet

Die vorliegende Arbeit befasst sich mit dem Ermuedungsverhalten thermomechanisch behandelter niedriglegierter Verguetungsstaehle auf C-Mn-Si-Basis. Als thermomechanische Behandlung wurde eine dreistufige Technologie gewaehlt, deren Endumformung im (#gamma# + #alpha#)-Gebiet durchgefuehrt wurde. Nach der thermomechanischen Behandlung erfolgte der fuer Verguetungsstaehle typische Anlassprozess. Das Ermuedungsverhalten dieser Staehle wurde mittels Dauerschwingfestigkeits- und Ermuedungsrisswachstumsuntersuchungen charakterisiert. Im Vordergrund stand dabei der Einfluss des Gefueges, insbesondere der Korngroesse und des Anteils an voreutektoidem Ferrit und Anlassmartensit, auf das Ermuedungsverhalten. Zu diesem Zweck wurden Korngroesse und Phasenanteil variiert. Die Ermuedungseigenschaften werden in Verbindung mit den Festigkeits- und Zaehigkeitseigenschaften betrachtet, so dass eine Gesamtcharakterisierung dieser thermomechanisch hergestellten Verguetungsstaehle ermoeglicht wird. (orig.)This work is concerned with the fatigue behaviour of thermo-mechanically treated low alloy heat-treatable steel based on C-Mn-Si. A three stage technique was chosen as the thermo-mechanical treatment, where final reforming was carried out in the (#gamma# + #alpha#) area. After the thermo-mechanical treatment, the typical tempering process for heat-treatable steels was carried out. The fatigue behaviour of these steels was characterized by means of long-term vibration strength and fatigue crack growth investigations. The effect of the structure, particularly the grain size and the proportion of eutectic ferrite and tempering martensite on the fatigue process were to the fore here. For this reason, the grain size and the phase proportion were varied. The fatigue properties were considered together with the strength and toughness properties, so that a total characterisation of these thermomechanically produced heat treatable steels is made possible. (orig.)SIGLEAvailable from TIB Hannover: H93B3011 / FIZ - Fachinformationszzentrum Karlsruhe / TIB - Technische InformationsbibliothekDEGerman

Bilinguisme tardif franco-allemand: Étude de l'attrition d'items lexicaux et sémantiques

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