Update: Outbreak prediction for Asian soybean rust in Iowa

Last year, Asian soybean rust moved slowly and did not show up in Iowa. Because of the dry weather conditions that prevailed during the 2005 growing season, one cannot draw a meaningful conclusion. Therefore, soybean rust remains a major concern for soybean producers in the northern regions. A common question asked this winter has been: what is the risk of a soybean rust outbreak in the upcoming season

Mapeamento da severidade da ferrugem asiática da soja na região sul do Brasil em cenários de clima atual e futuro.

Dentre as doenças que ocorrem na cultura da soja no Brasil destaca-se em importância a ferrugem asiática, causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi. O trabalho teve como objetivo avaliar o impacto potencial de alterações nos padrões de precipitação em cenários de clima futuro na severidade da ferrugem asiática na Região Sul do Brasil. Um modelo de predição da severidade foi integrado a um sistema de informação geográfica alimentado com dados de clima atual (1961-90) e futuro (2020, 2050 e 2080) predito pelos modelos do IPCC (cenários futuros A2 e B1) para a geração de mapas de severidade. Em cada um dos oito cenários possíveis, foi gerado um mapa mensal com a severidade delineada em cinco classes (0-100%) com base na chuva acumulada para os meses de outubro a abril. Os resultados mostram que, no período de maior ocorrência da ferrugem (dezembro a fevereiro), no cenário atual, o maior percentual de área da região (de 70 a 80% da área) apresentou severidade média entre 40 e 60%. Já nos cenários futuros, os modelos projetam um pequeno incremento na área geográfica nessa mesma classe, variando de 70 a 90%, para o mesmo período, sendo mais alto na década de 2080

Mapeamento da favorabilidade da temperatura para Euschistus heros F. (Heteroptera: Pentatomidae) em soja na região sul do Brasil em cenários de clima atual e futuro.

Dentre as pragas que acometem a cultura da soja no Brasil destaca-se o percevejo-marrom Euschistus heros. O trabalho teve como objetivo avaliar os impactos potenciais das mudanças climáticas sobre E. heros a partir da determinação de faixas de favorabilidade para o aumento populacional deste, por meio do mapeamento de áreas favoráveis na região sul do Brasil em cenários de clima futuros projetados pelos modelos do IPCC. Faixas de temperatura variando de desfavorável a muito favorável foram propostas e integradas a um sistema de informações geográficas alimentados com dados de clima atual e projetados para as décadas de 2020, 2050 e 2080 para a confecção de mapas nos cenários A2 e B1. Com base em dados bibliográficos da biologia da praga, foi determinada a faixa de 26 a 28ºC como a mais favorável ao seu ciclo biológico. Abaixo de 14ºC foi determinado como desfavorável e entre 14 e 20ºC e acima de 30ºC como pouco favorável. Uma vez que os cenários futuros indicam incremento nas condições médias de temperatura, foi predito um aumento na área muito favorável ao estabelecimento de E. heros em relação ao clima atual no sul do Brasil, o qual foi mapeado como favorável entre os meses de dezembro a abril

Heterogeneidade da relação entre produtividade da soja e severidade da ferrugem asiática: uma análise exploratória.

This work aimed to conduct an exploratory, prior to meta-analysis, assessment of the heterogeneity of the linear relationship between soybean yield (Y) and the severity (X) of a foliar fungal disease (soybean rust) from 144 fungicide trials conducted in five years and 45 locations in Brazil. We used graphical analysis to explore the within- and between-trial variability of model parameter estimates (effect sizes) and summary measures for model goodness-of-fit and influence analysis. In the estimation of the weighted mean regression coefficients, following the metaanalysis concept, we propose a method that takes into account the magnitude of influence measures as well as the uncertainties of parameters estimates, usually the inverse of the standard error of for the parameter estimate. High between-trial heterogeneity was observed for parameter estimates, standard errors (within trial variability), determination coefficient and influence measures. Graphical analysis suggested influence of timing of disease onset and control yield class on model slope, which will be quantified further using a meta-analytical approach

Métodos probabilísticos para quantificar a influência do El Niño/oscilação sul sobre o risco de epidemias.

Neste trabalho, apresentamos e discutimos as vantagens e limitações de métodos estatísticos paramétricos e semi-paramétricos para a caracterização da influência do fenômeno El Nino/Oscilação Sul (ENOS) sobre o risco de epidemias de doenças de plantas. Foram utilizados dados simulados de um índice de severidade da ferrugem asiática em soja para Rosário do Sul, RS, local previamente identificado como passível da influência de ENOS na precipitação pluvial no período da safra. A influência ENOS sobre a produtividade agrícola e outras variáveis dependentes da precipitação pluviométrica, como a severidade de doenças, é bem conhecida e documentada em todo o mundo. No entanto, o uso rigoroso de abordagens probabilísticas inferenciais para quantificação da influência de indicadores climáticos sobre o de risco de epidemias ainda é raro

Models and applications for risk assessment and prediction of Asian soybean rust epidemics.

Asian rust of soybean [Glycine max (L.) Merril] is one of the most important fungal diseases of this crop worldwide. The recent introduction of Phakopsora pachyrhizi Syd. & P. Syd in the Americas represents a major threat to soybean production in the main growing regions, and significant losses have already been reported. P. pachyrhizi is extremely aggressive under favorable weather conditions, causing rapid plant defoliation. Epidemiological studies, under both controlled and natural environmental conditions, have been done for several decades with the aim of elucidating factors that affect the disease cycle as a basis for disease modeling. The recent spread of Asian soybean rust to major production regions in the world has promoted new development, testing and application of mathematical models to assess the risk and predict the disease. These efforts have included the integration of new data, epidemiological knowledge, statistical methods, and advances in computer simulation to develop models and systems with different spatial and temporal scales, objectives and audience. In this review, we present a comprehensive discussion on the models and systems that have been tested to predict and assess the risk of Asian soybean rust. Limitations, uncertainties and challenges for modelers are also discussed

Eficiência do controle da ferrugem asiática da soja em função do momento de aplicação sob condições de epidemia em Londrina, PR.

Com o objetivo de estudar a eficiência do controle da ferrugem asiática da soja em função do momento de aplicação foram conduzidos ensaios em Londrina, PR, Brasil, durante as safras 2005/06 e 2006/07. A mistura de 60 g azoxistrobina há + 24 g ciproconazol há foi aplicada em diferentes estádios fenológicos, iniciando em R2 até R5.5, em aplicações únicas e seqüenciais. A severidade foi estimada periodicamente para o cálculo da área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) e a produtividade avaliada no final do ciclo. Nas duas safras, os sintomas iniciais foram observados no final do estádio vegetativo. Na safra 2005/06, o tratamento com aplicações seqüenciais, em R2 e R5.1, foi o mais eficiente na redução da severidade e da AACPD e apresentou a maior produtividade. Na safra 2006/07, os tratamentos com aplicações seqüenciais, em R2 e R5.1, e a aplicação única em R3 apresentaram as menores severidades, menores AACPD e maiores produtividades. Correlações negativas foram encontradas entre as variáveis severidade em R6 e AACPD e a produtividade (-0,83 e -0,84 em 2005/06 e -0,87 e -0,89 em 2006/07). As aplicações realizadas com níveis elevados de severidade, ao redor de 50%, apresentaram produtividade igual à testemunha não tratada

Meta-analysis of the linear relationship between soybean yield loss and rust severity from uniform fungicide trials.

To quantify yield loss in soybean as affected by rust severity, meta-analysis was used to examine data from uniform fungicide trials (UFTs) conducted across 25 locations and 5 years (2003?2008) in the main soybean production regions of Brazil. Trials (n = 81) were selected based on predefined criteria and examined for the linear relationships between soybean yield loss (%) and rust severity (%) at the R6 growth stage. Slopes of the yield loss × severity relationship were estimated by linear regression. The influence of potential moderator variables on slopes was examined by a random effects model. Forty-one trials were excluded due to the presence of influential observations in the negative linear relationship between yield and severity. There was considerable variation among slope estimates for the increase in yield loss with respect to the change in soybean rust severity (0.31?1.81 p.p./p.p.). A significant and positive relationship between soybean rust severity and yield loss was found. For every increase of 1 p.p. in soybean rust severity, the average increase in yield loss was 0.71 p.p. (95% CI = 0.60?0.82 p.p.). The moderator variable timing of disease onset and severity class accounted for 17 and 16% of the overall and between-trial variability of slopes, respectively. This study provides an approach for quantitative risk assessments of rust-related soybean yield loss, an important step for an economic evaluation of alternative rust management strategies.Edição do Proceedings of the National Soybean Rust Symposium, New Orleans, 2009

Genome Sequence of Fusarium graminearum strain CML3066 isolated from a wheat spike in Southern Brazil

Fusarium graminearum is a global fungal pathogen of wheat and other small grains, causing Fusarium Head Blight (FHB) disease, also known as wheat scab. We report herein the annotated genome of a deoxynivalenol/15-acetyl-deoxynivalenol-producing Brazilian strain called CML3006, isolated from FHB-symptomatic wheat spikes collected in 2009