Near-Wake Flow Structure of a Suspended Cylindrical Canopy Patch

Urban stormwater is an important environmental problem, especially for metropolitans worldwide. The most important issue behind this problem is the need to find green infrastructure solutions, which provide water treatment and retention. Floating treatment wetlands, which are porous patches that continue down from the free-surface with a gap between the patch and bed, are innovative instruments for nutrient management in lakes, ponds, and slow-flowing waters. Suspended cylindrical vegetation patches in open channels affect the flow dramatically, which causes a deviation from the logarithmic law. This study considered the velocity measurements along the flow depth, at the axis of the patch, and at the near-wake region of the canopy, for different submerged ratios with different patch porosities. The results of this experimental study provide a comprehensive picture of the effects of different submergence ratios and different porosities on the flow field at the near-wake region of the suspended vegetation patch. The flow field was described with velocity and turbulence distributions along the axis of the patch, both upstream and downstream of the vegetation patch. Mainly, it was found that suspended porous canopy patches with a certain range of densities (SVF20 and SVF36 corresponded to a high density of patches in this study) have considerable impacts on the flow structure, and to a lesser extent, individual patch elements also have a crucial role

Flow Characteristics in the Wake Region of a Finite-Length Vegetation Patch in a Partly Vegetated Channel

Aquatic vegetation in rivers and coastal regions controls the flow structure in terms of mean velocity and turbulence. The vegetation in the flow affects the transportation of nutrients, microbes, dissolved oxygen, sediment, and contaminants; therefore, the flow characteristics of different types of vegetation layers should be examined in order to understand the effects of vegetation on the flow structure. In this paper, the effect of the submergence ratio and SVF (Solid Volume of Fraction) of a vegetation patch, which was present across half of the channel in a spanwise direction, on the flow structure at the wake region was examined. For this purpose, different submergence ratios with different SVFs were considered in the experiments, and velocity measurements were performed in the wake region of the vegetation layer with an Acoustic Doppler Velocimeter (ADV). According to the results, the effect of different vegetation heights and SVFs on the velocity distribution was obtained. Moreover, inflectional velocity distribution over the cross-section in the wake region of the vegetation layer was obtained, and it was concluded that jet flow occurred in the non-vegetated half of the channel due to the vegetation layer.Adnan Menderes University (ADU)Adnan Menderes University [MF-17008]The authors would like to acknowledge the funding of the research project (MF-17008) from Adnan Menderes University (ADU). The authors would also like to thank the ADU Civil Engineering Department students Canberk Karacasu and Ridvan Sarigul who helped during the experiments

Enzymatic polymerization and biodegradation of polylactic acid

Bu çalışmada, enzimatik halka açılımı polimerizasyon yöntemi kullanılarak polilaktik asit sentezi gerçekleştirilmiş ve elde edilen polimerin proteaz enzimi ile biyobozundurulması incelenmiştir. Candida cylindracea lipaz katalizörlüğünde laktitten halka açılımı reaksiyonunun optimize edilmesi amacıyla, reaksiyon şartları değiştirilerek farklı sıcaklıklarda gerçekleştirilen polimerizasyon işlemlerinde, reaksiyona giren Candida cylindracea lipaz konsantrasyonuna bağlı olarak oluşan polilaktik asitin molekül ağırlığı, polidispersitesi ve dönüşüm verimi değerleri tespit edilmiştir. Elde edilen polilaktik asit, proteaz DSM enzimi ile biyobozundurma işlemine tabii tutulmuş ve polimerin yapısındaki ester grupları ile biyobozundurma mekanizması takip edilmiştir. Biyobozunma süresince molekül ağırlığı kaybı izlenmiş ve orjinal polimerin morfolojik ve termal geçiş özelliklerinin değişimi incelenmiştir. Candida cylindracea lipaz kullanılarak laktitin halka açılımı polimerizasyonunda, yüksek molekül ağırlıklı polimer sentezinde, en uygun reaksiyon şartı, sıcaklığın 80ºC ve lipaz konsantrasyonunun ağırlıkça %4 olduğu durum olarak belirlenmiştir. Bu sıcaklık değerinde, sabit enzim konsantrasyonunda, sürenin artmasıyla birlikte molekül ağırlığı ve monomer dönüşümü belirgin bir şekilde artış göstermiş, polidispersite değerleri yaklaşık 1.5 civarında olan polimerler sentezlenmiştir. Proteaz DSM ile yapılan biyobozundurma işlemi sonucunda ise, ilk 15 günlük süre içersinde, polimerin bozunmasına ilişkin molekül ağırlığı kaybı son derece düşük seviyede olduğu, bu süreden sonra molekül ağırlığı kaybında belirgin bir artış gözlenerek 90 günlük süre sonunda %23’lük bir kayıp meydana geldiği saptanmıştır. Biyobozundurma işlemine tabii tutulan polimerin çeşitli özellikleri incelenerek orijinal polimer ile arasındaki farklar tespit edilmiştir. Anahtar Kelimeler: Lipaz, halka açılımı polimerizasyonu, biyobozunma.Because of its biocompatibility and degradability to non-toxic products, polylactic acid (PLA) based polymers and copolymers have been employed in novel applications, such as absorbable bone plates, artificial skin, tissue scaffolds, and carriers of drugs for controlled release systems. Enzymatic polymerization using lipase has been receiving much attention as one of the new methodologies that provide biodegradable polymer synthesis without toxic catalysts. Lipases are the most versatile biocatalysts because they can be applied to the synthesis of a wide range of substrates with a high stereospecificity and enantioselectivity. In general lipases used in polyester synthesis are of mammalian (Porcine pancreatic lipase (PPL)), fungal (Candida antarctica lipase B (CAL)), or bacterial origin (Pseudomonas cepacia (PCL)). The hydrolytic degradation of PLA polymers has been extensively investigated. It is now well know that degradation of macroscale PLA devices is heterogeneous: it is faster inside than at the surface. This phenomenon has been assigned to an internal autocatalytic effect of carboxyl end groups. Biodegradation of PLA polymers in soil under natural conditions has also been examined. It was reported that degradation by-products resulting from the hydrolytic degradation can be totally assimilated by microorganisms such as fungi, bacteria, or earthworms, thus indicating that PLA polymers are environmentally benign materials. Hydrolysis reactions may be catalyzed by enzymes known as hydrolases, which include proteases, esterases, glycosidases, and phosphatases, among others. This class of enzymes comprises cell-derived proteins that are responsible for the catalysis of several reactions in the human body. The degradation of PLA in the presence of enzymes has been investigated by many groups. Early in 1981, it was found that proteases showed strong effects on PLLA degradation. In this work, polylactic acid was prepared by lipase catalyzed ring opening polymerization of lactide. Enzymatic polymerization was performed with Candida cylindracea lipase, enzyme and the effect of enzyme concentration, temperature and time parameters on polymerization mechanisms were investigated in detail.  A typical procedure for the polymerization of lactide using Candida cylindracea lipase is described as follow. To a mixture of lactide (2.50 mmol) and toluene (0.72 mL) at 80 and 100oC was added Candida cylindracea (2 and 4 wt.-%) under nitrogen atmosphere at different time (1-7 days). After the reaction, the enzyme was removed by filtration and the polymer was isolated by precipitation in choloform. Then degradation mechanisms were examined. PLLA films were prepared using a solvent casting method. One gram of PLLA was dissolved in 20 mL of chloroform while mixing vigorously at room temperature. The dissolved solution was poured onto a leveled Teflon film coated glass plate, spread evenly with a bent glass rod and then allowed to dry for about 24 h at room temperature. The resultant film was peeled from the casting surface. Each of polymeric films were placed in test tubes and dipped in 5 mL of DSM protease solution (50 mM Tris-HCl buffer, pH 8.6). The test tube was sealed and kept constant at 37°C for a predetermined period and enzyme solutions were added every 48 h so that enzyme activity remained at a desired level throughout the experiment. The time course of the weight loss and enzymatic degradation were evaluated and the appearance of the samples was examined. It was found that the L-lactide was polymerized in bulk by Candida cylindracea lipase between 3 and 7 days, in a temperature range 80-100oC to yield the polylactide with an Mw of up to 69800 g.mol-1. Both the conversion and Mw of the resultant polymeric fraction increased with increasing reaction time 3 days to 7 days respectively at constant lipase concentrations. The chemical structures of the degraded polymer samples were characterized using DSC, FTIR and XRD. The molecular weight of the polymer samples after enzymatic degradation process with protease DSM, decreased 25% after 2 months degradation period. PLA polymers investigated in this study showed degradation as illustrated by the decrease in molecular weight, disappearance of amorphous phase and formation of micro fractures and acicular structures. After detailed evaluation of biocompatibility and toxicity of PLAs, it is expected that they will take the petroleum-based plastics' place in future. Keywords: Lipase, ring opening polymerization, biodegradation

The effect of submerged vegetation on the open channel flow

Son 30 yılda ekosistem ve dünya için vazgeçilmez bir rolü olan bitki tarlalarının kıyı ve akarsu hidroliği üzerindeki etkilerini incelemek çok önem kazanmıştır. Akım ve bitki örtüsü arasındaki girişim, katı madde taşınımını, akarsu jeomorfolojisini ve akarsu bölgesindeki yaşam alanını önemli derecede etkilemektedir. Doğal bitki tarlalarının şüphesiz en önemli özelliği rastgele bir karaktere sahip olmalarıdır. Doğal bir bitki alanında, bitkinin yüksekliği, çapı, şekli, bükülme sertliği ve mekânsal dağılım gibi birçok parametre rastgele olarak olaya etkili olmaktadır [2].Bu nedenlerden dolayı, akım alanı ve bitki örtüsü arasında meydana gelen etkileşimin anlaşılması akarsu düzenlemeleri ve akım kontrol durumları için oldukça önemlidir. Bu çalışmada, kısmi bitki örtüsüne sahip akarsularda bulunan batık bitki örtüsü ve akım arasındaki etkileşim deneysel olarak incelenmiştir. Deneylerde, düşük ve yüksek yoğunlukta (N1=172 IP/m2ve N2=1142 IP/m) olmak üzere iki farklı bitki yoğunluğu kullanılmıştır. Kanalda xekseni yönünde (13 farklı noktada), yanal mesafelerde (11 farklı noktada) ADV (Acoustic Doppler Velocimeter) ile üç farklı derinlikte düşey hız ölçümleri yapılmıştır. Bu çalışmada bitki tabakasının varlığının, akımın hızında bir azalmaya neden olduğu ve bitki yoğunluğunun artışıyla beraber hızdaki azalmanın daha etkin bir hale geldiği görülmüştür. Bu çalışmanın, literatürde art-iz bölgesi ile ilgili sınırlı sayıda olan çalışmalara katkı sağlayacağı düşünülmektedirIn the last 30 years, it has become very important to examine the effects of vegetation fields on the coastal and fluvial areas, which have an indispensable role for the ecosystem and the world. The interference between current and vegetation greatly affects the sediment transport, river geomorphology and habitat in the river area.Doubtlessly, one of the most important features of natural vegetation fields is the randomness. In a natural vegetation field, many parameters such as the diameter and height of the plants, their shape, bending stiffness and spatial distribution can be observed as random parameters [2]. For these reasons the interaction between flow and vegetation should be understand very well in terms of river management and flow control. In this study, interaction between submerged vegetation layer and flow at partially vegetated river flows was investigated experimentally. Rare and dense vegetation intensity (N1=172 IP/m2 and N2=1142 IP/m2) was considered in theexperiments. Velocity measurements were made at three different depths in the channel x-axis direction (at 13 points) and y-axis direction (at 11 points) using ADV (Acoustic Doppler Velocimeter). In this study, it was observed that the presence of the plant caused a decrease in the current speed and with the increase of the plant density, the reduction in speed became more pronounced. It is assumed that this study will contribute to the understanding of wake regio

Yeni Davranış Kazandırma Stratejilerini Kullanmaya Yönelik Öz Yeterlilik Ölçeğinin Geliştirilmesi: Geçerlilik ve Güvenirlik Çalışması

Bu araştırmada alana, çeşitli disiplin alanlarından öğretmen adaylarının yeni davranış kazandırma stratejilerini kullanmaya yönelik öz yeterliklerini ölçecek geçerli ve güvenilir bir araç kazandırmak amaçlanmıştır. Çalışma grubunu 2022-2023 eğitim-öğretim yılının güz döneminde Sivas Cumhuriyet Üniversitesinin eğitim fakültesine devam eden toplam 938 öğrenci oluşturmaktadır. Çalışmanın Açımlayıcı Faktör Analizi (AFA) aşamasında 705, Doğrulayıcı Faktör Analizi aşamasında 233 üniversite öğrencisi ile çalışılmıştır. Çalışmada taslak ölçeği oluşturmak için ilgili alanyazın taraması ve uzmanlarla bire bir görüşme yoluyla 30 maddelik bir havuz oluşturulmuştur. Uzman görüşlerinin alınması ve Lawshe Tekniği ile yapılan kapsam geçerliği çalışması sonucunda ölçekte 28 madde için .771 şeklinde hesaplanan değerin Lawshe tekniğine göre minimum KGİ değerinin üzerinde olduğu belirlenmiştir. AFA sonucunda faktör yükü düşük ve binişik beş madde ölçekten çıkarılarak, toplam varyansın %54.144 oranında açıklandığı iki faktörlü bir yapıya ulaşılmıştır. Ölçeğin boyutları pekiştireç temelli stratejiler ve ipucu temelli stratejiler olarak adlandırılmıştır. İki faktörlü yapının doğruluğunu test etmek amacıyla birinci düzey ve ikinci düzey DFA yapılmıştır. Bu bağlamda model uyum değerlerinden CMIN/DF değeri iyi uyum; RMSEA, CFI, GFI ve IFI değerleri ise kabul edilebilir uyum düzeyinde olduğu belirlenmiş ve sonuçlar neticesinde AFA ile belirlenen yapının DFA ile doğrulandığı görülmüştür. Güvenirlik analizleri incelendiğinde ise pekiştireç temelli stratejiler boyutunun .937, ipucu temelli stratejiler boyutunun .885 ve genel olarak ölçeğin .952 şeklinde hesaplanan omega düzeyiyle yüksek düzeyde güvenilir olduğu belirlenmiştir. Cronbach alfa değerleri ise pekiştireç temelli stratejiler boyutunda .934, ipucu temelli stratejiler boyutunda .882 ve ölçeğin toplamında .950 şeklinde olup yüksek düzeyde güvenirliğe işaret etmektedir. İki faktörlü 23 maddelik ölçeğin, çeşitli disiplin alanlarından öğretmen adaylarının öğretim sürecinde ve problem davranışların kontrolünde yeni davranış kazandırma stratejilerini kullanmaya yönelik öz yeterliklerini İncelemek için kullanılabilecek geçerli ve güvenilir bir araç olduğu söylenebilir

Typographical/spelling errors in the references, pictures, tables, figures and graphs in the articles submitted to the journal of Adnan Menderes University School of medicine

AMAÇ: Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi’ne yayımlanmak üzere gönderilen makalelerdeki kaynak, resim, tablo, şekil ve grafiklerdeki yazılım hatalarını belirlemek ve daha özenli hazırlanmış, yayın kurallarına uygun yazılmış makalelerin gelmesini sağlamaktır. GEREÇ VE YÖNTEMLER: Bu çalışmaya Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi’ne yayınlanması için online olarak gönderilen makalelerden 80 tanesi dahil edildi. Makalelerde kaynaklar, resim, tablo ve şekillerdeki yazılım hataları değerlendirildi. Makalelerde “kaynakça” için için önce ilk isim ve yıl girilerek makalenin Pubmed’de olup olmadığına bakıldı: varsa tek tek isimler, makale adı, volüm ve sayfa sayısı kontrol edildi; yoksa makale adı girilerek ya da diğer isimler girilerek tarandı. Pubmed’de yayınlanmayan makaleler, kitap, kitaptan bir bölüm ve internetten erişim için Google arama motoru kullanıldı. Yanlış veya atlanmış yazar isimleri, başlık hatası, yanlış dergi ismi, yanlış volüm, yanlış yıl ve sayfa sayısı gibi doğrudan doğruya bilgiye erişimi engelleyen nitelikteki hatalar majör olarak değerlendirildi. BULGULAR: Makalelerden 43’ü (%53,8) klinik araştırma, 26’sı (%32,5) olgu sunumu, 8’i (%10) derleme, 3’ü(%3,8) deneysel araştırma olup makalelerdeki ortalama kaynak sayısı 18±11,96 (dağılım, 3-61) idi. Altmışsekiz makalede tüm kaynaklarda hata mevcuttu. Oniki makalede hatasız kaynak/kaynaklar vardı. Kaynaklardaki hata oranı %95,9, majör hata oranı %6,14 olarak bulundu. En sık hata yapılan kısımlar sayfa numarası (%52,51), yıl (%13,32) ve yazar ismi (%12,35) idi. Sekiz makalede tablo, şekil, grafik ve resim yoktu; 72 makalede toplam 136 tablo, 133 şekil, grafik, resim sayısı vardı. Yalnızca ondört makaledeki 18 tablo, 28 şekil ve resimde hata olmadığı gözlendi. SONUÇ: Kaynaklar, resim, tablo, şekil ve grafiklerde oldukça yüksek oranda yazılım hatası mevcuttur. Dergilere gönderilen yazılarda, kaynaklar, yazım kuralları dikkatle incelenerek yazılmalı; resim, şekil ve grafik yazıları özenli bir şekilde düzenlenmelidir.OBJECTIVE: Aim of this paper is to determine the spelling errors in text, references, pictures, tables, figures and graphs in articles submitted to the Journal of Adnan Menderes University School of Medicine and to encourage submission of articles written according to the rules of publication. MATERIALS AND METHODS: In this study, Adnan Menderes University School of Medicine, published in the Journal of the online article submitted to one of the 80 included in the study. Eighty articles submitted to be published online in the Journal of Adnan Menderes University Medical Faculty were included in this study. In articles, spelling errors in sections of references, pictures and tables were evaluated. First of all, references of each article were checked to see whether the article was present in PubMed by entering the name of the first author and publication year of the reference. If present in PubMed then the article was scanned by entering the names of each co-author(s), article title, numbers of the volumes and pages. If not present in PubMed the article was also scanned entering the article title or the names of other co-authors. For the articles not published in PubMed, the books, the book chapter(s) and for the URL internet references Google search engine was used. Errors such as incorrect or omitted author names, title errors, incorrect journal names, wrong year, volume and page numbers which prevent the access to correct information directly were accepted as major errors. RESULTS: Forty-three (53.8%) of the articles were clinical trials, 26 (32.5%) were case studies, 8 (10%) of them were review articles and 3(3.8%)of them were experimentalresearch. The average number of references in the articles was 18±11.96 (range,3-61). In 68 articles there were errors in allof the references. Only 12 articles had references with no errors. Error ratio of references was determined as 95.9% while 6.14% of these were major errors. The most common errors were in page numbers (52.51%), years (13.32%) and names of the author’s (12.35%). Eight articles did not include any tables, figures, graphics or pictures. A total of 136 tables, 133 figures, graphics and photos were present in the total of 72 articles. Only 18 tables, 28 drawings and pictures did not have errors in total of 14 articles. CONCLUSION: References, pictures, tables, figures and graphs include high rate of typographical/spelling errors. In articles written to be sent to the journals, references, spelling rules should carefully be examined and pictures, figures and graphics should carefully be corrected prior to the submission

Instant determination of the artemisinin from various Artemisia annua L. extracts by LC-ESI-MS/MS and their in-silico modelling and in vitro antiviral activity studies against SARS-CoV-2

Introduction Numerous efforts in natural product drug development are reported for the treatment of Coronavirus. Based on the literature, among these natural plants Artemisia annua L. shows some promise for the treatment of SARS-CoV-2. Objective The main objective of our study was to determine artemisinin content by liquid chromatography electrospray ionisation tandem mass spectrometry (LC-ESI-MS/MS), to investigate the in vitro biological activity of artemisinin from the A. annua plants grown in Turkey with various extracted methods, to elaborate in silico activity against SARS-CoV-2 using molecular modelling. Methodology Twenty-one different extractions were applied. Direct and sequential extractions studies were compared with ultrasonic assisted maceration, Soxhlet, and ultra-rapid determined artemisinin active molecules by LC-ESI-MS/MS methods. The inhibition of spike protein and main protease (3CL) enzyme activity of SARS-CoV-2 virus was assessed by time resolved fluorescence energy transfer (TR-FRET) assay. Results Artemisinin content in the range 0.062-0.066%. Artemisinin showed significant inhibition of 3CL protease activity but not Spike/ACE-2 binding. The 50% effective concentration (EC50) of artemisinin against SARS-CoV-2 Spike pseudovirus was found greater than 50 mu M (EC45) in HEK293T cell line whereas the cell viability was 94% of the control (P < 0.01). The immunosuppressive effects of artemisinin on TNF-alpha production on both pseudovirus and lipopolysaccharide (LPS)-induced THP-1 cells were found significant in a dose dependent manner. Conclusion Further studies of these extracts for COVID-19 treatment will shed light to seek alternative treatment options. Moreover, these natural extracts can be used as an additional treatment option with medicines, as well as prophylactic use can be very beneficial for patients

Multiple Skleroz Tanılı Çocukların Demografik ve Klinik Özelliklerinin Retrospektif Olarak Değerlendirilmesi

Amaç: Bu retrospektif çalışma, multiple skleroz (MS) tanısı ile izlenen çocuk ve adölesan hastaların demografik ve klinik özelliklerini sunmak amacıyla yapılmıştır. Yöntem: Araştırma verileri, 10-25 Aralık 2021 tarihleri arasında İzmir’de bulunan üç hastanede izlenen pediatrik MS tanılı olguların, demografik verileri, başvuru yakınmaları, klinik bulguları veuygulanan tedavileri veri toplama formu ile retrospektif olarak elde edilmiştir. Bulgular: Bu retrospektif çalışmada 40 hastanın verileri incelenmiştir. Hastaların %77,5’i kız, yaş ortalaması 16 yaş ± 2,3 ve ilk atak yaş ortalaması 13,9 yaş olarak bulunmuştur. Hastaların yaklaşık yarısı interferon beta 1a subkutan, %27,5’i glatiramer asetat tedavisi aldığı ve ilaç kullanım sürelerinin ortalama 18 ay olduğu görülmüştür. Hastaların %20’si ise herhangi bir tedavi almamıştır. Tedavi alan hastaların %31,2’si ilaçtan dolayı yan etki yaşamış ve %15,6’sı yan etki nedeniyle tedaviye uyum sağlayamamıştır. Uyum sağlayamayan tüm hastaların tedavileri değiştirilmiştir. Çalışmada 3 olguda ailesel MS hastalığı öyküsü bulunmaktadır. Hastaların %72,5’i ilk ataklarında 3-10 gün intravenöz metilprednizolon tedavisi almış, tedavi alanların yarısından fazlası (%79,2) metilprednizolon tedavisi sonrası tama yakın/tamamen düzelme sağlamıştır. Hastaların %80’i relapsing-remitting MS ve %20’si klinik/radyolojik izole sendrom formundadır. Sonuç: Çocukluk çağında MS hastalığı, kızlarda daha sık ve en sık relapsing-remitting formunda görülmektedir. Çocukluk çağı MS tedavisinde büyük oranda interferon beta 1a ve glatiramer asetat kullanılmaktadır. İmmünomodülatör tedavi ile atak sayısında azalma, genişletilmiş özürlülük durum ölçeği puan ortalamasında düşme ile iyilik hali sağlanabilmektedir

Children with Multiple Sclerosis and Nursing Care Approach

Multiple sclerosis is a chronic and progressive disease proceeding with inflammation, demy elination, and degeneration in the central nervous system. Multiple sclerosis is rarely seen in childhood, but it can occur more frequently than it is known in early childhood. Children with multiple sclerosis disease may reach disability levels at an earlier age than adults. Therefore, early diagnosis, optimal treatment, and care management of multiple sclerosis emerging in childhood are important. The goals of this treatment and care management are similar to those of adult multiple sclerosis; however, there are some specific concerns related to pediatric multiple sclerosis. The concerns related to the efficacy and safety of immuno modulatory treatments used by pediatric multiple sclerosis patients, the continuation of the neurodevelopmental process in children, the pharmacokinetic and pharmacodynamic differ ences between pediatric and adult multiple sclerosis patients, the interruption of school life of children, and anticipatory anxiety of children and their families are among the major con cerns. In this traumatic and challenging process, meeting the physical, emotional, cognitive, and social needs of children and their families is very important for disease management and for the adaptation of children to the disease. In light of this information, the aim of our review article is to give information related to multiple sclerosis disease in childhood and to explain the nursing approach to this disease