11 research outputs found

    Unconventional surface plasmon resonance signals reveal quantitative inhibition of transcriptional repressor EthR by synthetic ligands

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    International audienceEthR is a mycobacterial repressor that limits the bioactivation of ethionamide, a commonly used anti-tuberculosis second-line drug. Several efforts have been deployed to identify EthR inhibitors abolishing the DNA-binding activity of the repressor. This led to the demonstration that stimulating the bioactivation of ETH through EthR inhibition could be an alternative way to fight Mycobacterium tuberculosis. We propose a new SPR methodology to study the affinity between inhibitors and EthR. Interestingly, the binding between inhibitors and immobilized EthR produced a dose dependent negative SPR signal. We demonstrated that this signal reveals the affinity of the small molecules for the repressor. The affinity constants (KD) correlated with their capacity to inhibit the binding of EthR to DNA. We hypothesize that conformational changes of EthR during ligand interaction could be responsible for this SPR signal. Practically, this unconventional result open perspectives to the development of SPR assay that would at the same time tough on the structural changes of the target upon binding with an inhibitor and on the binding constant of this interaction

    Le recepteur des glucocorticoides : un facteur de transcription dont l'activite de liaison specifique a l'ADN est regulee par le ligand steroidien

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    SIGLECNRS T Bordereau / INIST-CNRS - Institut de l'Information Scientifique et TechniqueFRFranc

    Anomalies de la tolérance au glucose au cours de la grossesse (du phénotype au génotype)

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    Le diabète gestationnel (DG) est défini comme un trouble de la tolérance au glucose survenant pendant la grossesse. Cette pathologie se caractérise par une hétérogénéité clinique avec des formes mineures définies comme l hyperglycémie modérée de la grossesse (HMG). Qu il s agisse d un DG ou d une HMG, la complication materno-fœtale est le plus souvent une macrosomie fœtale. Les données phénotypiques et métaboliques (insulinorésistance et/ou anomalies de l insulinosécrétion) évoquent l hypothèse d un continuum. Par ailleurs il apparaït que l équilibre glycémique n est pas le seul facteur permettant le contrôle de la macrosomie. Ceci laisse penser que des composantes génétiques puissent jour un rôle dans le déterminisme de la macrosomie. Nous nous sommes initialement intéressés dans le DG et l HMG aux principaux marqueurs du diabète de type 1 autoimmun (IDDM1,IDDM2, IDDM12) et du diabète de type 2 (Glucokinase HNF1a). Les résultats ne sont pas en faveur d un diabète autoimmun mais ont montré qu il existe des différences dans la distribution allélique essentiellement dans le groupe HMG. Parmi les marqueurs associés au diabète de type 2, nous n avons identifié aucun polymorphisme associé de façon significative à ces entités cliniques. Dans un deuxième temps, nous nous sommes intéressés au locus du gène de l insuline (IDDM2) ainsi qu à des gènes proches (IGF-II et H19) plutôt impliqués dans la croissance fœtale. Ces gènes étant soumis à l empreinte parentale, nous avions évoqué l hypothèse d une levée d empreinte parentale associée à la macrosomie, hypothèse non vérifiée dans 11 familles informatives. Ce résultat n exclut pas l implication de cette région génique dans la croissance fœtale. Enfin, nous avons analysé de manière plus globale le transcriptome placentaire en relation avec la macrosomie par la technique des biopuces à l aide d une puce orientée (2200 gènes). Nous avons mis en évidence une variation de l expression de certains gènes (surexpression ou sous-expression) en relation avec la macrosomie fœtale. Ces résultats prélimainires seront validés par techniques complémentaires telles que RT-PCR quantitative et analyse des protéines par Western blot.Gestational diabetes mellitus (GDM) is defined as glucose tolerance abnormalities during pregnancy. This pathology is characterized by a clinical heterogenecity with minors forms as mild gestational hyperglycaemia (MGH). In the two cases, the materno-foetal complication is most often a macrosomia. The clinical and metabolic data (insulin resistance and or abnormalities of insulin secretion) are in favour of a continuum. In addition, it appears that glycemic control is not the only factor allowing the control of macrosomia. This lets think that genetic components can play a part in the determinism of macrosomia. We initially were interested in GDM and MGH to the type 1 diabetes markers (IDDM1,IDDM2, IDDM12) and type 2 diabetes (Glucokinase HNF1a). The results are not in favour of an autoimmune diabetes but showed that there are differences in the in the allelic distribution primarily in the group MGH. Among the markers associated to the type 2 diabetes, we identified any polymorphism associated to a significant degree with these clinical entities. In a second time, we were interested in the locus of the insulin gene (IDDM2) like to close genes (IGF-II and H19) rather implied in the fœtal growth. These genes are under parental imprinting, so we had evoked the hypothesis of a loss of imprinting associated to fœtal macrosomia, non verified hypothesis in 11 informative families. This result does not exclude the imlplication from this area in the fœtal growth. At last, we analysed in a more total way the placental transcriptome in relation to macrosomia by microarrays (2200 genes). We highlighted a variation of some genes expression in relation to fœtal macrosomia. These preliminary results will be validated by others techniques such as quantitative RT-PCR and proteins analyses by Western blot.LILLE2-BU Santé-Recherche (593502101) / SudocSudocFranceF

    Resistance of the cell wall to degradation is a critical parameter for isolation of high quality RNA from natural isolates of Bacillus subtilis.

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    Natural isolates of Bacillus subtilis are known for their ability to produce a large panel of bioactive compounds. Unfortunately, their recalcitrance to conventional molecular techniques limits their transcript studies. In this work, difficulties to isolate RNA attributed to the cell wall were overcome, finally authorising powerful RT-PCR's
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