Monitoramento da carteira de projetos de PD&I com sinalização de seu impacto e alinhamento ao PDU da Embrapa Florestas.

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Draft genome sequence of the blaOXA-436- and blaNDM-1-harboring Shewanella putrefaciens SA70 isolate

ABSTRACT We sequenced a carbapenem-resistant Shewanella putrefaciens isolate cultured from the sink handle of a Pakistan hospital room. Assembly annotation indicates that the isolate has a chromosomal bla OXA-436 carbapenemase and a plasmid-borne bla NDM-1 gene. To our knowledge, this is the first report of a Shewanella species harboring bla NDM . </jats:p

On the Formation of Copper Linear Atomic Suspended Chains

We report high resolution transmission electron microscopy and classical molecular dynamics simulation results of mechanically stretching copper nanowires conducting to linear atomic suspended chains (LACs) formation. In contrast with some previous experimental and theoretical work in literature that stated that the formation of LACs for copper should not exist our results showed the existence of LAC for the [111], [110], and [100] crystallographic directions, being thus the sequence of most probable occurence.Comment: 4 pages, 3 figure

The nature of dark matter and the density profile and central behavior of relaxed halos

We show that the two basic assumptions of the model recently proposed by Manrique and coworkers for the universal density profile of cold dark matter (CDM) halos, namely that these objects grow inside out in periods of smooth accretion and that their mass profile and its radial derivatives are all continuous functions, are both well understood in terms of the very nature of CDM. Those two assumptions allow one to derive the typical density profile of halos of a given mass from the accretion rate characteristic of the particular cosmology. This profile was shown by Manrique and coworkers to recover the results of numerical simulations. In the present paper, we investigate its behavior beyond the ranges covered by present-day N-body simulations. We find that the central asymptotic logarithmic slope depends crucially on the shape of the power spectrum of density perturbations: it is equal to a constant negative value for power-law spectra and has central cores for the standard CDM power spectrum. The predicted density profile in the CDM case is well fitted by the 3D S\'ersic profile over at least 10 decades in halo mass. The values of the S\'ersic parameters depend on the mass of the structure considered. A practical procedure is provided that allows one to infer the typical values of the best NFW or S\'ersic fitting law parameters for halos of any mass and redshift in any given standard CDM cosmology.Comment: 9 pages, 6 figures, to appear in the ApJ vol. 647, september 20, 2007. Minor changes to match the published versio

Superficieibacter electus gen. nov., sp. nov., an extended-spectrum β-lactamase possessing member of the enterobacteriaceae family, isolated from Intensive Care Unit surfaces

<p>Two Gram-negative bacilli strains, designated BP-1(T) and BP-2, were recovered from two different Intensive Care Unit surfaces during a longitudinal survey in Pakistan. Both strains were unidentified using the bioMerieux VITEK MS IVD v2.3.3 and Bruker BioTyper MALDI-TOF mass spectrometry platforms. To more precisely determine the taxonomic identity of BP-1(T) and BP-2, we employed a biochemical and phylogenomic approach. The 16S rRNA gene sequence of strain BP-1(T) had the highest identity to Citrobacter farmeri CDC 2991-81(T) (98.63%) Citrobacter amalonaticus CECT 863(T) (98.56%), Citrobacter sedlakii NBRC 105722(T) (97.74%) and Citrobacter rodentium NBRC 105723(T) (97.74%). The biochemical utilization scheme of BP-1(T) using the Analytic Profile Index for Enterobacteriaceae (API20E) indicated its enzymatic functions are unique within the Enterobacteriaceae but most closely resemble Kluyvera spp., Enterobacter cloacae and Citrobacter koseri/farmeri. Phylogenomic analysis of the shared genes between BP-1(T), BP-2 and type strains from Kluyvera, Citrobacter, Escherichia, Salmonella, Kosakonia, Siccibacter and Shigella indicate that BP-1(T) and BP-2 isolates form a distinct branch from these genera. Average Nucleotide Identity analysis indicates that BP-1(T) and BP-2 are the same species. The biochemical and phylogenomic analysis indicate strains BP-1(T) and BP-2 represent a novel species from a new genus within the Enterobacteriaceae family, for which the name Superficieibacter electus gen. nov., sp. nov., is proposed. The type strain is BP-1(T) (= ATCC BAA-2937, = NBRC 113412).</p

Patogenicidade de cepas do Oomiceto Phytophthora spp. em mamão.

A cultura do mamoeiro é extensamente cultivada no mundo tendo o Brasil como o maior produtor. Dentre os principais problemas inerentes à cultura, destacam-se as podridões do pé e do fruto, causadas pelo oomiceto Phytophthora palmivora. A planta com esta doença apresenta amarelecimento de folhas, queda prematura de frutos, murcha do topo, tombamento e morte da planta. O fruto verde é mais resistente, porém pode ser afetado caso a infecção se dê no caule, próximo ao pedúnculo. Neste caso, o fruto fica enrugado e cai no solo, liberando esporos do oomiceto. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a patogenicidade de nove cepas de Phytophthora spp. em frutos de mamoeiro das cultivares Sunrise Solo e Calimosa, integrantes do Banco Ativo de Germoplasma de Mamoeiro (BAG-Mamão) da Embrapa Mandioca e Fruticultura. A inoculação do oomiceto foi feita de forma direta, fazendo-se um furo no fruto e colocando, em seguida, um disco de meio de cultura contendo o micélio do patógeno. Todos os frutos de mamoeiro avaliados com as nove cepas apresentaram sintomas da doença causada por Phytophthora spp., demonstrando sua patogenicidade, observando-se um comportamento varietal diferenciado, haja vista que frutos da cultivar Calimosa foram mais suscetíveis à podridão do pé do que frutos da cultivar Sunrise Solo.PDF. T43

Regeneração de Passiflora suberosa em suspensão celular.

O gênero Passiflora é o maior e o mais importante da família Passifloraceae por abrigar as principais espécies exploradas comercialmente no mundo. Muitas espécies são cultivadas para a produção de sucos, consumo in natura, extração de substâncias de interesse farmacológico e fins ornamentais, mas a presença de patógenos de solo que vêm dizimando os cultivos. Uma alternativa é a hibridação interespecífica, ou seja, cruzamentos convencionais, de seleção ou cultivares comerciais, com as espécies silvestres na produção de porta-enxertos resistentes, porém esses híbridos sexuais quando obtidos têm apresentado baixa fertilidade. Desta forma, uma alternativa viável é a produção de porta-enxertos tetraplóides com genes de resistência aos patógenos pela técnica da hibridação somática. Contudo, para isto são necessários protocolos eficientes de regeneração das espécies parentais diplóides a patir de células individuais. Assim, o objetivo desse trabalho foi estabelecer um protocolo de regeneração de plantas a partir de células em suspensão da espécie de P. suberosa. Para tanto, calos MR13 BIO oriundos da Embrapa de Mandioca e Fruticultura Tropical de Cruz das Almas/BA foram submetidos ao meio de cultura MS (Murashige e Skoog) suplementado com os reguladores de crescimento BAP 1,0 mg/L ou 2,0 mg/L; KIN 1,0 mg/L ou 2,0 mg/L para a obtenção de calos friáveis no Laboratório de Cultura de Tecidos Vegetais da unidade experimental Horto Florestal da Universidade Estadual de Feira de Santana/BA. O melhor resultado, BAP 2,0 mg/L, foi submetido aos testes contendo balanço de fitorreguladores: MS + BAP 2,0 mg/L + ANA 0,5 mg/L + Kin 1,0 mg/L ou MS + AIA 2,5 mg/L + ANA 0,5 mg/L +Kin 1,0 mg/L, suplementado com agar 6% e, ao teste de culturas de células em suspensão, na ausência de luz, em meio MS na metade da concentração dos sais, suplementados pelos compostos orgânicos (extrato de malte ou extrato de levedura) e mantidos sob 140 rpm de agitação contínua num volume final de 100 mL em frascos erlenmeyers de 250 mL de capacidade. As células colocadas em suspensão no meio líquido suplementado com extrato de malte foram capazes de regenerar de plantas inteiras de P. suberosa, a partir de células diplóides, num prazo de 60 dias na ausência de luz.Disponível em: Acesso em: 02 mar. 201

Reação de frutos de mamoeiro à inoculação com Phytophthora spp.

O mamoeiro (Carica papaya L.) pode ser afetado por diversas doenças, que constituem o principal fator limitante da cultura, exigindo medidas adequadas de controle, sem as quais podem ocorrer grandes danos na produção e depreciação do produto na comercialização. Dentre as doenças que incidem no mamoeiro, destaca-se a podridão das raízes e dos frutos, causada por Phytophthora palmivora, sendo esta considerada uma das principais doenças da cultura.Em paralelo aconteceram também os seguintes eventos: V Seminário de Pesquisa do Recôncavo da Bahia; V Seminário Estudantil de Pesquisa da UFRB; V Seminário da Pós-Graduação da UFRB; II Seminário Regional de Pesquisa da EBDA; 5ª Jornada Científica da Embrapa Mandioca e Fruticultura; VIII Seminário Estudantil de Pesquisa e Extensão da FAMAM; Semana de Ciência, Tecnologia e Inovação no Agronegócio; Fórum de Gestores de Iniciação Científica e Tecnológica da Bahia; II Simpósio Baiano de Defesa Agropecuária; I Semana de Educação Tutorial da UFRB

Desinfestação de material vegetal para obtenção de colônias puras de Phytophtora palmivora.

O agronegócio do mamão é de suma importância para o Brasil em função de aspectos econômicos e sociais. Os estados com maior produção são a Bahia, responsável por 46% do total produzido no país, e o Espírito Santo, com volume de produção da ordem de 40%. Mesmo com a importância da cultura, a pesquisa visando resistência à podridão das raízes, uma das mais importantes doenças que afetam o mamoeiro, ainda é incipiente. Causada pelo fungo Phytophthora palmivora, essa doença está disseminada por quase todas as regiões produtoras, ocorrendo especialmente nas regiões com altas precipitações pluviométricas e solos mal drenados, com o agravante de que as cultivares plantadas não apresentam resistência. Só recentemente foram iniciados estudos epidemiológicos mais específicos sobre estratégias de controle utilizando fungicidas e a reação de diferentes genótipos à infecção por este patógeno. O fator mais importante na produção de inóculo de Phytophthora relaciona-se ao tipo de propágulo: micélio (conjunto de hifas), clamidósporos (estrutura vegetativa de sobrevivência), esporângios (estruturas reprodutivas assexuais) ou zoósporos (esporos assexuais ). Esse trabalho teve como objetivo estudar procedimentos de desinfestação de material vegetal na obtenção de culturas puras de P. palmivora